doc/src/docbook/user/export_data.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3157 05 Mar 07 martin 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
3159 05 Mar 07 martin 2 <!DOCTYPE chapter PUBLIC 
3200 21 Mar 07 martin 3   "-//Dawid Weiss//DTD DocBook V3.1-Based Extension for XML and graphics inclusion//EN" 
3314 09 May 07 nicklas 4   "../../../../lib/docbook/preprocess/dweiss-docbook-extensions.dtd" 
3314 09 May 07 nicklas 5 [
3314 09 May 07 nicklas 6 <!ENTITY runplugin.configure.common 
3314 09 May 07 nicklas 7   "The top of the window displays the names of the selected plug-in and
3314 09 May 07 nicklas 8   configuration, a list with parameters to the left, an area for input fields to the
3314 09 May 07 nicklas 9   right and buttons to proceed with at the bottom. 
3314 09 May 07 nicklas 10   Click on a parameter in the parameter list to show the form fields
3314 09 May 07 nicklas 11   for entering values for the parameter to the right. Parameters
3314 09 May 07 nicklas 12   with an <guilabel>X</guilabel> in front of their names already have a
3314 09 May 07 nicklas 13   value. Parameters marked with a blue rectangle are required and must
3314 09 May 07 nicklas 14   be given a value before it is possible to proceed."
3314 09 May 07 nicklas 15 >
3314 09 May 07 nicklas 16 ]>
3157 05 Mar 07 martin 17 <!--
3177 08 Mar 07 martin 18   $Id$
3165 06 Mar 07 martin 19   
3675 16 Aug 07 jari 20   Copyright (C) 2007 Peter Johansson, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4889 06 Apr 09 nicklas 21   Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen
3165 06 Mar 07 martin 22   
3157 05 Mar 07 martin 23   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
3157 05 Mar 07 martin 24   Available at http://base.thep.lu.se/
3165 06 Mar 07 martin 25   
3157 05 Mar 07 martin 26   BASE is free software; you can redistribute it and/or
3157 05 Mar 07 martin 27   modify it under the terms of the GNU General Public License
4477 05 Sep 08 jari 28   as published by the Free Software Foundation; either version 3
3157 05 Mar 07 martin 29   of the License, or (at your option) any later version.
3165 06 Mar 07 martin 30   
3157 05 Mar 07 martin 31   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
3157 05 Mar 07 martin 32   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
3157 05 Mar 07 martin 33   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
3157 05 Mar 07 martin 34   GNU General Public License for more details.
3165 06 Mar 07 martin 35   
3157 05 Mar 07 martin 36   You should have received a copy of the GNU General Public License
4509 11 Sep 08 jari 37   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
3157 05 Mar 07 martin 38 -->
4432 01 Sep 08 jari 39 <chapter id="export_data" chunked="0">
5784 05 Oct 11 nicklas 40
4432 01 Sep 08 jari 41   <title>Export of data</title>
3165 06 Mar 07 martin 42   <para>
4443 03 Sep 08 jari 43     Before data stored in BASE can be used outside of BASE, the data must
4432 01 Sep 08 jari 44     first be exported to a file. When the export job finishes the file
4432 01 Sep 08 jari 45     can be downloaded from the BASE file system or optionally
4432 01 Sep 08 jari 46     downloaded immediately. Exporting data is possible for almost all
4432 01 Sep 08 jari 47     kind of data and the export is done by a job that runs an export
4432 01 Sep 08 jari 48     plug-in for the current context. An export job is started by
4432 01 Sep 08 jari 49     clicking on <guibutton>Export&hellip;</guibutton> in the toolbar,
4432 01 Sep 08 jari 50     the click action will open a pop-up window allowing you to select
4432 01 Sep 08 jari 51     plug-in and specify parameters for it.
3165 06 Mar 07 martin 52   </para>
4432 01 Sep 08 jari 53
3165 06 Mar 07 martin 54   <para>
4432 01 Sep 08 jari 55     Normally, specific plug-ins handles different type of items, but
4432 01 Sep 08 jari 56     some plug-ins, for example the table exporter plug-in, can work
4432 01 Sep 08 jari 57     with several types of items. BASE ships with a number of export
4432 01 Sep 08 jari 58     plug-ins as a part of the core plug-ins package,
4432 01 Sep 08 jari 59     cf. <xref linkend="coreplugins.export" />. Go to
3200 21 Mar 07 martin 60     <menuchoice>
3200 21 Mar 07 martin 61       <guimenu>Administrate</guimenu>
5784 05 Oct 11 nicklas 62       <guimenuitem>Plug-ins &amp; extensions</guimenuitem>
5784 05 Oct 11 nicklas 63       <guisubmenu>Plug-in definitions</guisubmenu>
3200 21 Mar 07 martin 64     </menuchoice>
4432 01 Sep 08 jari 65     to check which plug-ins are installed on your BASE server. When
4432 01 Sep 08 jari 66     BASE finds a plug-in that supports export of a certain type of
4432 01 Sep 08 jari 67     item an &gbExport; button is displayed in the toolbar on either
4432 01 Sep 08 jari 68     the list view or the single-item view.
3200 21 Mar 07 martin 69   </para>
3200 21 Mar 07 martin 70   <note>
5784 05 Oct 11 nicklas 71     <title>No "Export" button?</title>
3200 21 Mar 07 martin 72     <para>
4432 01 Sep 08 jari 73       If the export button is missing from a page were you would expect
3314 09 May 07 nicklas 74       to find them this usually means that:
3200 21 Mar 07 martin 75     </para>
3314 09 May 07 nicklas 76     <itemizedlist>
3314 09 May 07 nicklas 77       <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 78         <simpara>
3487 13 Jun 07 peter 79           The logged in user does not have permission to use the plug-in.
3314 09 May 07 nicklas 80         </simpara>
3314 09 May 07 nicklas 81       </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 82       <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 83         <simpara>
3314 09 May 07 nicklas 84           The plug-in requires a configuration, but no one has been
3487 13 Jun 07 peter 85           created or the logged in user does not have permission to 
3314 09 May 07 nicklas 86           use any of the existing configurations.
3314 09 May 07 nicklas 87         </simpara>
3314 09 May 07 nicklas 88       </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 89     </itemizedlist>
3314 09 May 07 nicklas 90     <para>
3314 09 May 07 nicklas 91       Contact the server administrator or a similar user that has permission to 
3314 09 May 07 nicklas 92       administrate the plug-ins.
3314 09 May 07 nicklas 93     </para>
3200 21 Mar 07 martin 94   </note>
3314 09 May 07 nicklas 95
4432 01 Sep 08 jari 96     <sect1 id="import_export_data.export.selectplugin">
3314 09 May 07 nicklas 97       <title>Select plug-in and configuration</title>
3314 09 May 07 nicklas 98
3208 23 Mar 07 martin 99       <para>
3314 09 May 07 nicklas 100         This dialog is very similar to the dialog for selecting an 
3314 09 May 07 nicklas 101         import plug-in. See <xref linkend="import_export_data.figures.select_import_plugin" />
3314 09 May 07 nicklas 102         for a screenshot example.
3208 23 Mar 07 martin 103       </para>
3314 09 May 07 nicklas 104     
3314 09 May 07 nicklas 105       <helptext external_id="runplugin.selectplugin" title="Select plug-in">
3314 09 May 07 nicklas 106         <para>
3314 09 May 07 nicklas 107           The first thing in the configuration process is to choose which plug-in 
3314 09 May 07 nicklas 108           to use and a configuration for those plug-ins that require it. More
3314 09 May 07 nicklas 109           information about the plug-ins can be found in each plug-in's documentation.
3314 09 May 07 nicklas 110         </para>
3314 09 May 07 nicklas 111         <note>
3314 09 May 07 nicklas 112           If there is only one plug-in and configuration available, this
3314 09 May 07 nicklas 113           step is skipped and you are taken directly to next step.
3314 09 May 07 nicklas 114         </note>
3314 09 May 07 nicklas 115         
3314 09 May 07 nicklas 116         <variablelist>
3314 09 May 07 nicklas 117           <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 118             <term>
5372 24 Jun 10 nicklas 119               <guilabel>Plugin + configuration</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 120             </term>
3314 09 May 07 nicklas 121             <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 122               <para>
5372 24 Jun 10 nicklas 123                 Select the plug-in and configuration to use. The list only
5372 24 Jun 10 nicklas 124                 shows combinations that the logged in user has permission 
5372 24 Jun 10 nicklas 125                 to use.
3314 09 May 07 nicklas 126               </para>
3314 09 May 07 nicklas 127             </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 128           </varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 129         </variablelist>
3314 09 May 07 nicklas 130         <para>
3314 09 May 07 nicklas 131           Click on
3394 28 May 07 martin 132           &gbNext;
3314 09 May 07 nicklas 133           to show the configuration of parameters for the job.
3314 09 May 07 nicklas 134         </para>
3314 09 May 07 nicklas 135         
3314 09 May 07 nicklas 136         <seeother>
3314 09 May 07 nicklas 137           <other external_id="runplugin.configure.export">Specify plug-in parameters</other>
3314 09 May 07 nicklas 138         </seeother>
3314 09 May 07 nicklas 139       </helptext>
4432 01 Sep 08 jari 140     </sect1>
3314 09 May 07 nicklas 141     
4432 01 Sep 08 jari 142     <sect1 id="import_export_data.export.pluginparameters">
3314 09 May 07 nicklas 143       <title>Specify plug-in parameters</title>
3314 09 May 07 nicklas 144     
3314 09 May 07 nicklas 145       <helptext external_id="runplugin.configure.export" 
3314 09 May 07 nicklas 146         title="Specify plug-in parameters">
3314 09 May 07 nicklas 147         
3314 09 May 07 nicklas 148       <para>
3314 09 May 07 nicklas 149         &runplugin.configure.common;
3314 09 May 07 nicklas 150       </para>
3314 09 May 07 nicklas 151       
3314 09 May 07 nicklas 152       <para>
3314 09 May 07 nicklas 153         The parameters list is very different from plug-in to plug-in.
3314 09 May 07 nicklas 154         Common parameters for export plug-ins are:
3314 09 May 07 nicklas 155       </para>
3314 09 May 07 nicklas 156       
3208 23 Mar 07 martin 157       <variablelist>
3208 23 Mar 07 martin 158         <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 159           <term><guilabel>Save as</guilabel></term>
3208 23 Mar 07 martin 160           <listitem>
3208 23 Mar 07 martin 161             <para>
4432 01 Sep 08 jari 162               The path and file name in the BASE file system where
3314 09 May 07 nicklas 163               the exported data should be saved. Some plug-ins support immediate 
3314 09 May 07 nicklas 164               download to the local file system if you leave the file parameter 
3314 09 May 07 nicklas 165               empty. For saving the exported data within the BASE file system, 
3314 09 May 07 nicklas 166               it's recommended to use the <guibutton>Browse&hellip;</guibutton>
3314 09 May 07 nicklas 167               button to get the right path and then complement it with the file's name.
3208 23 Mar 07 martin 168             </para>
3208 23 Mar 07 martin 169           </listitem>
3208 23 Mar 07 martin 170         </varlistentry>
3208 23 Mar 07 martin 171       </variablelist>
3208 23 Mar 07 martin 172       <para>
3208 23 Mar 07 martin 173         Click on
3394 28 May 07 martin 174         &gbNext;
3314 09 May 07 nicklas 175         to proceed to next configuration window.
3208 23 Mar 07 martin 176       </para>
3329 11 May 07 nicklas 177       <seeother>
3329 11 May 07 nicklas 178         <other external_id="runplugin.configure">The plug-in configuration wizard</other>
3329 11 May 07 nicklas 179       </seeother>    
3314 09 May 07 nicklas 180     
3208 23 Mar 07 martin 181     </helptext>
3314 09 May 07 nicklas 182     
3314 09 May 07 nicklas 183     <sect3 id="import_export_data.export.immediatedownload">
3314 09 May 07 nicklas 184       <title>Immediate download of the exported data</title>
3314 09 May 07 nicklas 185       
3314 09 May 07 nicklas 186       <para>
3314 09 May 07 nicklas 187         If the selected plug-in supports immediate download and the file parameter 
4432 01 Sep 08 jari 188         were left empty a new window with a <guibutton>Download</guibutton>
3314 09 May 07 nicklas 189         button is displayed. Click on this button to start the plug-in execution.
3314 09 May 07 nicklas 190         Do not close the window until a message saying that the export
3314 09 May 07 nicklas 191         was successful (or failed) is displayed. Your browser should open a dialog
3314 09 May 07 nicklas 192         asking you were to save the file on your local computer.
3314 09 May 07 nicklas 193       </para>
3314 09 May 07 nicklas 194       
3314 09 May 07 nicklas 195       <figure id="import_export_data.figures.download_immediately">
3314 09 May 07 nicklas 196         <title>Download immediately</title>
3314 09 May 07 nicklas 197         <screenshot>
3314 09 May 07 nicklas 198           <mediaobject>
3314 09 May 07 nicklas 199             <imageobject><imagedata fileref="figures/download_immediately.png" format="PNG" /></imageobject>
3314 09 May 07 nicklas 200           </mediaobject>
3314 09 May 07 nicklas 201         </screenshot>
3314 09 May 07 nicklas 202       </figure>
3314 09 May 07 nicklas 203       
3314 09 May 07 nicklas 204     </sect3>
3314 09 May 07 nicklas 205     
3314 09 May 07 nicklas 206     <sect3 id="import_export_data.export.savetofilesystem">
3314 09 May 07 nicklas 207       <title>Saving the exported data in the BASE file system</title>
3314 09 May 07 nicklas 208
3314 09 May 07 nicklas 209       <para>
3481 13 Jun 07 martin 210         If you choose to save the file within the BASE file system, there will be a window
3481 13 Jun 07 martin 211         where the job should get a name and optionally a description. There are also two
3481 13 Jun 07 martin 212         check boxes in this window.
3481 13 Jun 07 martin 213         <variablelist>
3481 13 Jun 07 martin 214           <varlistentry>
3481 13 Jun 07 martin 215             <term>
3481 13 Jun 07 martin 216               <guilabel>Send message</guilabel>
3481 13 Jun 07 martin 217             </term>
3481 13 Jun 07 martin 218             <listitem>
3481 13 Jun 07 martin 219               <para>
3481 13 Jun 07 martin 220                 Tick this check box if the job should send you a message when it is
3481 13 Jun 07 martin 221                 finished, otherwise untick it
3481 13 Jun 07 martin 222               </para>
3481 13 Jun 07 martin 223             </listitem>
3481 13 Jun 07 martin 224           </varlistentry>
3481 13 Jun 07 martin 225           <varlistentry>
3481 13 Jun 07 martin 226             <term>
3481 13 Jun 07 martin 227               <guilabel>Remove job</guilabel>
3481 13 Jun 07 martin 228             </term>
3481 13 Jun 07 martin 229             <listitem>
3481 13 Jun 07 martin 230               <para>
3481 13 Jun 07 martin 231                 If this is ticked, the job will be marked as removed when it is
3481 13 Jun 07 martin 232                 finished, on condition that it was finished successfully. This is
3481 13 Jun 07 martin 233                 only available for import- and export- plugins.
3481 13 Jun 07 martin 234               </para>
3481 13 Jun 07 martin 235             </listitem>
3481 13 Jun 07 martin 236           </varlistentry>
3481 13 Jun 07 martin 237         </variablelist>
3481 13 Jun 07 martin 238         By then clicking on &gbFinish; the configuration process will end and the job will
3481 13 Jun 07 martin 239         be put in the job queue. A self-refreshing window appears with information about the
3487 13 Jun 07 peter 240         job's status and execution time. The job is not dependent on the status window to run
3481 13 Jun 07 martin 241         and it therefore be closed without interrupting the execution of the job.
3314 09 May 07 nicklas 242       </para>
3314 09 May 07 nicklas 243       <tip>
3314 09 May 07 nicklas 244         <title>View job status</title>
3314 09 May 07 nicklas 245         <para>
3314 09 May 07 nicklas 246           A job's status can be viewed at any time by opening it from the job list page,
3314 09 May 07 nicklas 247           <menuchoice>
3314 09 May 07 nicklas 248             <guimenuitem>View</guimenuitem>
3314 09 May 07 nicklas 249             <guimenuitem>Jobs</guimenuitem>
3314 09 May 07 nicklas 250           </menuchoice>.
3314 09 May 07 nicklas 251         </para>
3314 09 May 07 nicklas 252       </tip>
3314 09 May 07 nicklas 253     </sect3>
4432 01 Sep 08 jari 254   </sect1>
3314 09 May 07 nicklas 255   
4432 01 Sep 08 jari 256   <sect1 id="import_export_data.export.table_export">
3314 09 May 07 nicklas 257     <title>The table exporter plug-in</title>
3183 12 Mar 07 martin 258     <para>
3314 09 May 07 nicklas 259       The table exporter is a generic export plug-in that works with almost
3314 09 May 07 nicklas 260       all list views in BASE. It can export the lists as an XML-file or a
3314 09 May 07 nicklas 261       tab-separated text file. The table exporter is started,
3314 09 May 07 nicklas 262       like the other export plug-ins, by clicking on
3314 09 May 07 nicklas 263       <guibutton>Export&hellip;</guibutton> in the toolbar.
3183 12 Mar 07 martin 264     </para>
3314 09 May 07 nicklas 265     
3183 12 Mar 07 martin 266     <para>
3314 09 May 07 nicklas 267       Then select the <guilabel>Table exporter</guilabel> and click on
3394 28 May 07 martin 268       the &gbNext; button. The plug-in selection step is
3314 09 May 07 nicklas 269       only displayed if there is more than one export plug-in that can
3314 09 May 07 nicklas 270       be used in the current context. Usually, the table exporter is the
3314 09 May 07 nicklas 271       only plug-in and you will be take directly to the configuration
3314 09 May 07 nicklas 272       dialog.
3183 12 Mar 07 martin 273     </para>
3314 09 May 07 nicklas 274       
3183 12 Mar 07 martin 275     <para>
3487 13 Jun 07 peter 276       Unlike other plug-ins, the table exporter does not use the
3314 09 May 07 nicklas 277       generic parameter input dialog. It has a customized dialog
3314 09 May 07 nicklas 278       that should be easier to use.
3183 12 Mar 07 martin 279     </para>
3314 09 May 07 nicklas 280       
3314 09 May 07 nicklas 281     <figure id="import_export_data.figures.table_exporter">
3314 09 May 07 nicklas 282       <title>The table exporter configuration dialog</title>
3314 09 May 07 nicklas 283       <screenshot>
3314 09 May 07 nicklas 284         <mediaobject>
3314 09 May 07 nicklas 285           <imageobject><imagedata fileref="figures/table_exporter.png" format="PNG" /></imageobject>
3314 09 May 07 nicklas 286         </mediaobject>
3314 09 May 07 nicklas 287       </screenshot>
3314 09 May 07 nicklas 288     </figure>
3314 09 May 07 nicklas 289     
3314 09 May 07 nicklas 290       
3314 09 May 07 nicklas 291     <helptext external_id="simpleexport.options" title="Export options">
3314 09 May 07 nicklas 292       <variablelist>
3314 09 May 07 nicklas 293         <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 294           <term>
3314 09 May 07 nicklas 295             <guilabel>Format</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 296           </term>
3314 09 May 07 nicklas 297           <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 298             <para>
3314 09 May 07 nicklas 299               The generated file can be either a 
3314 09 May 07 nicklas 300               <guilabel>tab-separated text file</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 301               or an <guilabel>XML</guilabel> file. The
3314 09 May 07 nicklas 302               XML-file option will generate a tag for each item and these
3314 09 May 07 nicklas 303               will contain a child tag with property value for each
3314 09 May 07 nicklas 304               selected column.
3314 09 May 07 nicklas 305             </para>
3314 09 May 07 nicklas 306           </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 307         </varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 308         <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 309           <term>
3314 09 May 07 nicklas 310             <guilabel>Which items?</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 311           </term>
3314 09 May 07 nicklas 312           <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 313             <para>
3314 09 May 07 nicklas 314               This option decide which items that should be included in
3314 09 May 07 nicklas 315               the exported data.
3314 09 May 07 nicklas 316               <itemizedlist>
3200 21 Mar 07 martin 317                 <listitem>
3183 12 Mar 07 martin 318                   <para>
3314 09 May 07 nicklas 319                     <guilabel>Selected items</guilabel>: 
3314 09 May 07 nicklas 320                     Only selected items will be exported. This options
3314 09 May 07 nicklas 321                     is not available if no items have been
3314 09 May 07 nicklas 322                     selected on the list page. 
3183 12 Mar 07 martin 323                   </para>
3200 21 Mar 07 martin 324                 </listitem>
3200 21 Mar 07 martin 325                 <listitem>
3200 21 Mar 07 martin 326                   <para>
3314 09 May 07 nicklas 327                     <guilabel>Current page</guilabel>: Exports all 
3314 09 May 07 nicklas 328                     items viewed on the current list page.
3200 21 Mar 07 martin 329                   </para>
3200 21 Mar 07 martin 330                 </listitem>
3200 21 Mar 07 martin 331                 <listitem>
3200 21 Mar 07 martin 332                   <para>
3314 09 May 07 nicklas 333                     <guilabel>All pages</guilabel>: Items on all pages 
3314 09 May 07 nicklas 334                     will be exported.
3200 21 Mar 07 martin 335                   </para>
3200 21 Mar 07 martin 336                 </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 337               </itemizedlist>
3314 09 May 07 nicklas 338             </para>
3314 09 May 07 nicklas 339           </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 340         </varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 341         <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 342           <term>
3314 09 May 07 nicklas 343             <guilabel>Which columns?</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 344           </term>
3314 09 May 07 nicklas 345           <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 346             <para>
3314 09 May 07 nicklas 347               Names of those columns that should be included in the export
3314 09 May 07 nicklas 348               should be listed in the <guilabel>Exported columns</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 349               to the left. A column name is
3314 09 May 07 nicklas 350               moved to the other list-box by first marking it and then
3314 09 May 07 nicklas 351               clicking on one of the buttons located between the
3314 09 May 07 nicklas 352               list-boxes.
3314 09 May 07 nicklas 353             </para>
3314 09 May 07 nicklas 354             <para>
3314 09 May 07 nicklas 355               The order in which the columns should be exported in can be
3314 09 May 07 nicklas 356               changed with the buttons to the left of the list. Simply
3314 09 May 07 nicklas 357               mark a name of a column and click on the buttons to move the
3314 09 May 07 nicklas 358               name either up or down in the list.
3314 09 May 07 nicklas 359             </para>
3314 09 May 07 nicklas 360             <tip>
3314 09 May 07 nicklas 361               <title>Using presets</title>
3314 09 May 07 nicklas 362               <para>
3314 09 May 07 nicklas 363                 Use the drop down list of presets, located under the
3314 09 May 07 nicklas 364                 option name, to easily get predefined or own presets of
3314 09 May 07 nicklas 365                 column settings.
3314 09 May 07 nicklas 366               </para>
3314 09 May 07 nicklas 367             </tip>
3314 09 May 07 nicklas 368           </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 369         </varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 370         <varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 371           <term>
5784 05 Oct 11 nicklas 372             <guilabel>Units</guilabel>
5784 05 Oct 11 nicklas 373           </term>
5784 05 Oct 11 nicklas 374           <listitem>
5784 05 Oct 11 nicklas 375             <para>
5784 05 Oct 11 nicklas 376               If the export includes annotation with units, the exporter normally
5784 05 Oct 11 nicklas 377               uses the same unit that was used when annotating each item. This can be
5784 05 Oct 11 nicklas 378               different from item to item. Select this option to force all annotation 
5784 05 Oct 11 nicklas 379               values to use the same unit (=the default unit for the annotation type).
5784 05 Oct 11 nicklas 380             </para>
5784 05 Oct 11 nicklas 381           </listitem>
5784 05 Oct 11 nicklas 382         </varlistentry>
5784 05 Oct 11 nicklas 383         <varlistentry>
5784 05 Oct 11 nicklas 384           <term>
5784 05 Oct 11 nicklas 385             <guilabel>Column prefix</guilabel>
5784 05 Oct 11 nicklas 386           </term>
5784 05 Oct 11 nicklas 387           <listitem>
5784 05 Oct 11 nicklas 388             <para>
5784 05 Oct 11 nicklas 389               Adds a prefix to each column header. This is useful for keeping
5784 05 Oct 11 nicklas 390               column names unique when combining multiple files outside of
5784 05 Oct 11 nicklas 391               BASE.
5784 05 Oct 11 nicklas 392             </para>
5784 05 Oct 11 nicklas 393           </listitem>
5784 05 Oct 11 nicklas 394         </varlistentry>
5784 05 Oct 11 nicklas 395         <varlistentry>
5784 05 Oct 11 nicklas 396           <term>
3314 09 May 07 nicklas 397             <guilabel>Save as</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 398           </term>
3314 09 May 07 nicklas 399           <listitem>
3314 09 May 07 nicklas 400             <para>
4432 01 Sep 08 jari 401               The path and file name where the exported data
3314 09 May 07 nicklas 402               should be saved. Leave the text field empty if the file is
3314 09 May 07 nicklas 403               to be downloaded immediately or enter a path within the BASE
3314 09 May 07 nicklas 404               file system to store the file on the server. Check
3314 09 May 07 nicklas 405               <guilabel>Overwrite existing file</guilabel>
3314 09 May 07 nicklas 406               if an already existing file with the same name should be
3314 09 May 07 nicklas 407               overwritten.
3314 09 May 07 nicklas 408             </para>
3314 09 May 07 nicklas 409           </listitem>
3314 09 May 07 nicklas 410         </varlistentry>
3314 09 May 07 nicklas 411       </variablelist>
3314 09 May 07 nicklas 412       
3314 09 May 07 nicklas 413       <para>
3394 28 May 07 martin 414         Click on &gbOk;
3314 09 May 07 nicklas 415         to proceed when all options have been set for the export.
3314 09 May 07 nicklas 416       </para>
3314 09 May 07 nicklas 417     </helptext>
3314 09 May 07 nicklas 418
4432 01 Sep 08 jari 419     </sect1>
4432 01 Sep 08 jari 420
3675 16 Aug 07 jari 421 </chapter>