src/test/TestGenericOverview.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4740 05 Feb 09 nicklas 1 /*
4740 05 Feb 09 nicklas 2   $Id$
4740 05 Feb 09 nicklas 3
4740 05 Feb 09 nicklas 4   Copyright (C) 2009 Nicklas Nordborg
4740 05 Feb 09 nicklas 5
4740 05 Feb 09 nicklas 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
4740 05 Feb 09 nicklas 7   Available at http://base.thep.lu.se/
4740 05 Feb 09 nicklas 8
4740 05 Feb 09 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
4740 05 Feb 09 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
4740 05 Feb 09 nicklas 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
4740 05 Feb 09 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
4740 05 Feb 09 nicklas 13   
4740 05 Feb 09 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
4740 05 Feb 09 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
4740 05 Feb 09 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
4740 05 Feb 09 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
4740 05 Feb 09 nicklas 18   
4740 05 Feb 09 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
4740 05 Feb 09 nicklas 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
4740 05 Feb 09 nicklas 21 */
4740 05 Feb 09 nicklas 22 import java.util.List;
4740 05 Feb 09 nicklas 23
4740 05 Feb 09 nicklas 24 import net.sf.basedb.core.BasicItem;
4740 05 Feb 09 nicklas 25 import net.sf.basedb.core.DataFileType;
4740 05 Feb 09 nicklas 26 import net.sf.basedb.core.DbControl;
5685 04 Aug 11 nicklas 27 import net.sf.basedb.core.DerivedBioAssay;
5641 25 May 11 nicklas 28 import net.sf.basedb.core.Extract;
5630 13 May 11 nicklas 29 import net.sf.basedb.core.Hardware;
4740 05 Feb 09 nicklas 30 import net.sf.basedb.core.Item;
5642 26 May 11 nicklas 31 import net.sf.basedb.core.PhysicalBioAssay;
4740 05 Feb 09 nicklas 32 import net.sf.basedb.core.Platform;
5630 13 May 11 nicklas 33 import net.sf.basedb.core.Protocol;
4740 05 Feb 09 nicklas 34 import net.sf.basedb.core.Quantity;
4740 05 Feb 09 nicklas 35 import net.sf.basedb.core.SessionControl;
5630 13 May 11 nicklas 36 import net.sf.basedb.core.Software;
4740 05 Feb 09 nicklas 37 import net.sf.basedb.core.SystemItems;
4740 05 Feb 09 nicklas 38 import net.sf.basedb.core.Type;
4740 05 Feb 09 nicklas 39 import net.sf.basedb.util.overview.Failure;
4740 05 Feb 09 nicklas 40 import net.sf.basedb.util.overview.GenericOverview;
4740 05 Feb 09 nicklas 41 import net.sf.basedb.util.overview.Node;
4745 10 Feb 09 nicklas 42 import net.sf.basedb.util.overview.OverviewUtil;
4740 05 Feb 09 nicklas 43 import net.sf.basedb.util.overview.loader.BasicItemNodeLoaderFactory;
4740 05 Feb 09 nicklas 44
4740 05 Feb 09 nicklas 45 public class TestGenericOverview
4740 05 Feb 09 nicklas 46 {
4740 05 Feb 09 nicklas 47   static boolean ok = true;
4740 05 Feb 09 nicklas 48
4740 05 Feb 09 nicklas 49   public static void main(String[] args)
4740 05 Feb 09 nicklas 50   {
4740 05 Feb 09 nicklas 51     TestUtil.checkArgs(args);
4740 05 Feb 09 nicklas 52     TestUtil.begin();
4740 05 Feb 09 nicklas 53     ok = test_all();
4740 05 Feb 09 nicklas 54     TestUtil.stop();
4740 05 Feb 09 nicklas 55   }
4740 05 Feb 09 nicklas 56
4740 05 Feb 09 nicklas 57   static boolean test_all()
4740 05 Feb 09 nicklas 58   {
4740 05 Feb 09 nicklas 59     write("++Testing generic overview");
4740 05 Feb 09 nicklas 60     // Create support items
4740 05 Feb 09 nicklas 61     // Annotation types
4740 05 Feb 09 nicklas 62     int annotationType = TestAnnotationType.test_create("Source", Type.STRING, 0, 
4743 09 Feb 09 nicklas 63         null, null, Item.RAWBIOASSAY, 1, new String[] {"alfa", "beta"}, true);
4740 05 Feb 09 nicklas 64
4740 05 Feb 09 nicklas 65     // Protocols
4740 05 Feb 09 nicklas 66     int scanningProtocol = TestProtocol.test_create(
5630 13 May 11 nicklas 67         SystemItems.getId(Protocol.SCANNING), "Scan protocol", false);
5652 10 Jun 11 nicklas 68     int sequencingProtocol = TestProtocol.test_create(
5652 10 Jun 11 nicklas 69         SystemItems.getId(Protocol.SEQUENCING), "Sequencing protocol", false);
4740 05 Feb 09 nicklas 70     int featureProtocol = TestProtocol.test_create(
5630 13 May 11 nicklas 71         SystemItems.getId(Protocol.FEATURE_EXTRACTION), "Feature protocol", false);
4740 05 Feb 09 nicklas 72     int power = SystemItems.getId(Quantity.POWER);
4740 05 Feb 09 nicklas 73     int milliWatt = TestUnit.test_load_by_symbol(power, "mW");
4740 05 Feb 09 nicklas 74     int scanPower = TestAnnotationType.test_create("Power", Type.FLOAT, milliWatt, 
5685 04 Aug 11 nicklas 75         null, null, Item.DERIVEDBIOASSAY, 1, null, false);
4740 05 Feb 09 nicklas 76     TestProtocol.test_set_protocol_parameter(scanningProtocol, scanPower);
4740 05 Feb 09 nicklas 77
4740 05 Feb 09 nicklas 78     // Hardware and software
4740 05 Feb 09 nicklas 79     int scanner = TestHardware.test_create(
5652 10 Jun 11 nicklas 80         SystemItems.getId(Hardware.SCANNER), "Scanner GO", false);
5652 10 Jun 11 nicklas 81     int sequencer = TestHardware.test_create(
5652 10 Jun 11 nicklas 82         SystemItems.getId(Hardware.SEQUENCER), "Sequencer GO", false);
4740 05 Feb 09 nicklas 83     int software = TestSoftware.test_create(
5652 10 Jun 11 nicklas 84         SystemItems.getId(Software.FEATURE_EXTRACTION), "Feature extraction GO", false);
5652 10 Jun 11 nicklas 85     int alignmentSoftware = TestSoftware.test_create(
5652 10 Jun 11 nicklas 86         SystemItems.getId(Software.ALIGNMENT), "Alignment GO", false);
4740 05 Feb 09 nicklas 87     
4740 05 Feb 09 nicklas 88     // Data files
4740 05 Feb 09 nicklas 89     int genePixFile = TestFile.test_create("data/test.rawdata.import.txt", false, false);
4740 05 Feb 09 nicklas 90     int celFile = TestFile.test_create("data/test.affymetrix.cel", false, false);
4740 05 Feb 09 nicklas 91     int reporterMap = TestFile.test_create("data/test", false, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 92     int samFile = TestFile.test_create("data/test.assembly.sam", false, false);
4740 05 Feb 09 nicklas 93
4740 05 Feb 09 nicklas 94     // Create main items
4740 05 Feb 09 nicklas 95     
4740 05 Feb 09 nicklas 96     // Biomaterial
4740 05 Feb 09 nicklas 97     int biosource = TestBioSource.test_create("Test GO", false);
6100 04 Sep 12 nicklas 98     int sample1 = TestSample.test_create(biosource, "Sample GO #1", 0, false);
6100 04 Sep 12 nicklas 99     int sample2 = TestSample.test_create(biosource, "Sample GO #2", 0, false);
5653 13 Jun 11 nicklas 100     int extract1 = TestExtract.test_create(sample1, "Extract GO #1", 0, 0, false);
5653 13 Jun 11 nicklas 101     int extract2 = TestExtract.test_create(sample2, "Extract GO #2", 0, 0, false);
5663 22 Jun 11 nicklas 102     int extractPooled = TestExtract.test_create_pooled("Extract GO #3 (pooled)", extract1, extract2);
4740 05 Feb 09 nicklas 103     
5652 10 Jun 11 nicklas 104     // Array design
5652 10 Jun 11 nicklas 105     int arrayDesign = TestArrayDesign.test_create(Platform.GENERIC, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 106     TestArrayDesign.test_set_file(arrayDesign, DataFileType.GENERIC_REPORTER_MAP, reporterMap);
5652 10 Jun 11 nicklas 107     
5652 10 Jun 11 nicklas 108     // Array batch & slide
5652 10 Jun 11 nicklas 109     int arrayBatch = TestArrayBatch.test_create(arrayDesign, false);
5748 19 Sep 11 nicklas 110     int arraySlide1 = TestArraySlide.test_create(arrayBatch, false);
5748 19 Sep 11 nicklas 111     int arraySlide2 = TestArraySlide.test_create(arrayBatch, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 112     
5652 10 Jun 11 nicklas 113     // ******** Microarray part *******
5652 10 Jun 11 nicklas 114     // Labeled extracts
5632 17 May 11 nicklas 115     int cy3 = TestTag.test_load("cy3");
5632 17 May 11 nicklas 116     int cy5 = TestTag.test_load("cy5");
5641 25 May 11 nicklas 117     int labeledExtract = SystemItems.getId(Extract.LABELED);
5641 25 May 11 nicklas 118     int labeledExtract1 = TestExtract.test_create(extract1, "Labeled GO #1 (cy3)", labeledExtract, cy3, false);
5641 25 May 11 nicklas 119     int labeledExtract2 = TestExtract.test_create(extract2, "Labeled GO #2 (cy3)", labeledExtract, cy3, false);
5641 25 May 11 nicklas 120     int labeledExtract1Ref = TestExtract.test_create(extractPooled, "Labeled GO #1 (cy5)", labeledExtract, cy5, false);
5641 25 May 11 nicklas 121     int labeledExtract2Ref = TestExtract.test_create(extractPooled, "Labeled GO #2 (cy5)", labeledExtract, cy5, false);
4740 05 Feb 09 nicklas 122     
4740 05 Feb 09 nicklas 123     // Hybridization
5748 19 Sep 11 nicklas 124     int hyb1 = TestPhysicalBioAssay.test_create(arraySlide1, "Hyb GO #1", SystemItems.getId(PhysicalBioAssay.HYBRIDIZATION), 1);
5748 19 Sep 11 nicklas 125     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(hyb1, labeledExtract1, 1, null);
5748 19 Sep 11 nicklas 126     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(hyb1, labeledExtract1Ref, 1, null);
4740 05 Feb 09 nicklas 127
5748 19 Sep 11 nicklas 128     int hyb2 = TestPhysicalBioAssay.test_create(arraySlide2, "Hyb GO #2", SystemItems.getId(PhysicalBioAssay.HYBRIDIZATION), 1);
5748 19 Sep 11 nicklas 129     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(hyb2, labeledExtract2, 1, null);
5748 19 Sep 11 nicklas 130     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(hyb2, labeledExtract2Ref, 1, null);
5748 19 Sep 11 nicklas 131
4740 05 Feb 09 nicklas 132     // Scan
5748 19 Sep 11 nicklas 133     int scan1 = TestDerivedBioAssay.test_create_root("Scan GO #1", hyb1, 
6100 04 Sep 12 nicklas 134         SystemItems.getId(DerivedBioAssay.SCAN), 0, scanningProtocol, scanner, 0);
5748 19 Sep 11 nicklas 135     TestAnnotation.test_annotatate(Item.DERIVEDBIOASSAY, scan1, scanPower, 0, 15.0f);
5748 19 Sep 11 nicklas 136     int scan2 = TestDerivedBioAssay.test_create_root("Scan GO #2", hyb2, 
6100 04 Sep 12 nicklas 137         SystemItems.getId(DerivedBioAssay.SCAN), 0, scanningProtocol, scanner, 0);
5748 19 Sep 11 nicklas 138     TestAnnotation.test_annotatate(Item.DERIVEDBIOASSAY, scan2, scanPower, 0, 15.0f);
5748 19 Sep 11 nicklas 139
4740 05 Feb 09 nicklas 140     // Raw bioassay #1
5748 19 Sep 11 nicklas 141     int rawBioAssay1 = TestRawBioAssay.test_create(Platform.GENERIC, "genepix", "RBA #1", scan1, 0, software, featureProtocol, arrayDesign, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 142     TestDataFileType.test_set_file(Item.RAWBIOASSAY, rawBioAssay1, DataFileType.GENERIC_RAW_DATA, genePixFile);
5652 10 Jun 11 nicklas 143     TestDataFileType.test_set_file(Item.RAWBIOASSAY, rawBioAssay1, DataFileType.AFFYMETRIX_CEL, celFile);
4740 05 Feb 09 nicklas 144     TestAnnotation.test_annotatate(Item.RAWBIOASSAY, rawBioAssay1, annotationType, 0, "alfa");
4740 05 Feb 09 nicklas 145
4740 05 Feb 09 nicklas 146     // Raw bioassay #2
5748 19 Sep 11 nicklas 147     int rawBioAssay2 = TestRawBioAssay.test_create(Platform.GENERIC, "genepix", "RBA #2", scan2, 0, software, featureProtocol, arrayDesign, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 148     TestDataFileType.test_set_file(Item.RAWBIOASSAY, rawBioAssay2, DataFileType.GENERIC_RAW_DATA, genePixFile);
4740 05 Feb 09 nicklas 149
5652 10 Jun 11 nicklas 150     // **** Sequencing part ********
5652 10 Jun 11 nicklas 151     // Libraries
5652 10 Jun 11 nicklas 152     int library = SystemItems.getId(Extract.LIBRARY);
5652 10 Jun 11 nicklas 153     int library1 = TestExtract.test_create(extract1, "Library GO #1", library, 0, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 154     int library2 = TestExtract.test_create(extract2, "Library GO #2", library, 0, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 155     
5652 10 Jun 11 nicklas 156     // Flow cell
5739 15 Sep 11 nicklas 157     int flowCell = TestPhysicalBioAssay.test_create(0, "Flow cell GO #1", SystemItems.getId(PhysicalBioAssay.CLONAL_AMPLIFICATION), 2);
5652 10 Jun 11 nicklas 158     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(flowCell, library1, 1, null);
5652 10 Jun 11 nicklas 159     TestPhysicalBioAssay.test_add_extract(flowCell, library2, 2, null);
5652 10 Jun 11 nicklas 160     
5652 10 Jun 11 nicklas 161     // Sequencing
5685 04 Aug 11 nicklas 162     int sequencing = TestDerivedBioAssay.test_create_root("Sequenced GO", flowCell, 
6100 04 Sep 12 nicklas 163       SystemItems.getId(DerivedBioAssay.SEQUENCES), 0, sequencingProtocol, sequencer, 0);
5685 04 Aug 11 nicklas 164     
6100 04 Sep 12 nicklas 165     int alignedAssayId1 = TestDerivedBioAssay.test_create_child("Aligned GO #1", library1,
6100 04 Sep 12 nicklas 166       SystemItems.getId(DerivedBioAssay.ARRANGEMENT), 0, 0, alignmentSoftware, sequencing);
6100 04 Sep 12 nicklas 167     int alignedAssayId2 = TestDerivedBioAssay.test_create_child("Aligned GO #2", library2,
6100 04 Sep 12 nicklas 168         SystemItems.getId(DerivedBioAssay.ARRANGEMENT), 0, 0, alignmentSoftware, sequencing);
5652 10 Jun 11 nicklas 169     TestDataFileType.test_set_file(Item.DERIVEDBIOASSAY, alignedAssayId1, DataFileType.SAM, samFile);
5652 10 Jun 11 nicklas 170     TestDataFileType.test_set_file(Item.DERIVEDBIOASSAY, alignedAssayId2, DataFileType.SAM, samFile);
5652 10 Jun 11 nicklas 171
5652 10 Jun 11 nicklas 172     // Raw bioassays 
5748 19 Sep 11 nicklas 173     int seqRaw1 = TestRawBioAssay.test_create(Platform.GENERIC, "genepix", "SeqRBA #1", alignedAssayId1, library1, software, 0, arrayDesign, false);
6100 04 Sep 12 nicklas 174     int seqRaw2 = TestRawBioAssay.test_create(Platform.GENERIC, "genepix", "SeqRBA #2", alignedAssayId2, library2, software, 0, arrayDesign, false);
5652 10 Jun 11 nicklas 175     
5652 10 Jun 11 nicklas 176     // **** Experiment ******
4740 05 Feb 09 nicklas 177     int experiment = TestExperiment.test_create("genepix", false);
5653 13 Jun 11 nicklas 178     TestExperiment.test_add_rawbioassay(experiment, rawBioAssay1, rawBioAssay2, seqRaw1, seqRaw2);
4740 05 Feb 09 nicklas 179     TestExperiment.test_add_experimental_factors(experiment, scanPower, annotationType);
4740 05 Feb 09 nicklas 180
4740 05 Feb 09 nicklas 181     // Show some overviews
4740 05 Feb 09 nicklas 182     test_overview(Item.BIOSOURCE, biosource);
5748 19 Sep 11 nicklas 183     test_overview(Item.PHYSICALBIOASSAY, hyb1);
5748 19 Sep 11 nicklas 184     test_overview(Item.PHYSICALBIOASSAY, flowCell);
4740 05 Feb 09 nicklas 185     test_overview(Item.ARRAYDESIGN, arrayDesign);
4740 05 Feb 09 nicklas 186     test_overview(Item.EXPERIMENT, experiment);
4740 05 Feb 09 nicklas 187     
4740 05 Feb 09 nicklas 188     // Delete items
4740 05 Feb 09 nicklas 189     if (TestUtil.waitBeforeDelete()) TestUtil.waitForEnter();
4740 05 Feb 09 nicklas 190     // Main items
4740 05 Feb 09 nicklas 191     TestExperiment.test_delete(experiment);
5652 10 Jun 11 nicklas 192     
5652 10 Jun 11 nicklas 193     TestRawBioAssay.test_delete(seqRaw1);
5652 10 Jun 11 nicklas 194     TestRawBioAssay.test_delete(seqRaw2);
5685 04 Aug 11 nicklas 195     TestDerivedBioAssay.test_delete(alignedAssayId1);
5685 04 Aug 11 nicklas 196     TestDerivedBioAssay.test_delete(alignedAssayId2);
5685 04 Aug 11 nicklas 197     TestDerivedBioAssay.test_delete(sequencing);
5652 10 Jun 11 nicklas 198     TestPhysicalBioAssay.test_delete(flowCell);
5652 10 Jun 11 nicklas 199     TestExtract.test_delete(library1);
5652 10 Jun 11 nicklas 200     TestExtract.test_delete(library2);
5652 10 Jun 11 nicklas 201     
4740 05 Feb 09 nicklas 202     TestRawBioAssay.test_delete(rawBioAssay1);
4740 05 Feb 09 nicklas 203     TestRawBioAssay.test_delete(rawBioAssay2);
5748 19 Sep 11 nicklas 204     TestDerivedBioAssay.test_delete(scan1);
5748 19 Sep 11 nicklas 205     TestDerivedBioAssay.test_delete(scan2);
5748 19 Sep 11 nicklas 206     TestPhysicalBioAssay.test_delete(hyb1);
5748 19 Sep 11 nicklas 207     TestPhysicalBioAssay.test_delete(hyb2);
5748 19 Sep 11 nicklas 208     TestArraySlide.test_delete(arraySlide1);
5748 19 Sep 11 nicklas 209     TestArraySlide.test_delete(arraySlide2);
4740 05 Feb 09 nicklas 210     TestArrayBatch.test_delete(arrayBatch);
4740 05 Feb 09 nicklas 211     TestArrayDesign.test_delete(arrayDesign);
5641 25 May 11 nicklas 212     TestExtract.test_delete(labeledExtract1);
5641 25 May 11 nicklas 213     TestExtract.test_delete(labeledExtract1Ref);
5641 25 May 11 nicklas 214     TestExtract.test_delete(labeledExtract2);
5641 25 May 11 nicklas 215     TestExtract.test_delete(labeledExtract2Ref);
5652 10 Jun 11 nicklas 216     
4740 05 Feb 09 nicklas 217     TestExtract.test_delete(extractPooled);
4740 05 Feb 09 nicklas 218     TestExtract.test_delete(extract1);
4740 05 Feb 09 nicklas 219     TestExtract.test_delete(extract2);
4740 05 Feb 09 nicklas 220     TestSample.test_delete(sample1);
4740 05 Feb 09 nicklas 221     TestSample.test_delete(sample2);
4740 05 Feb 09 nicklas 222     TestBioSource.test_delete(biosource);
4740 05 Feb 09 nicklas 223     
4740 05 Feb 09 nicklas 224     // Support items
4740 05 Feb 09 nicklas 225     TestSoftware.test_delete(software);
5652 10 Jun 11 nicklas 226     TestSoftware.test_delete(alignmentSoftware);
4740 05 Feb 09 nicklas 227     TestHardware.test_delete(scanner);
5652 10 Jun 11 nicklas 228     TestHardware.test_delete(sequencer);
4740 05 Feb 09 nicklas 229     TestProtocol.test_delete(featureProtocol);
4740 05 Feb 09 nicklas 230     TestProtocol.test_delete(scanningProtocol);
5652 10 Jun 11 nicklas 231     TestProtocol.test_delete(sequencingProtocol);
4740 05 Feb 09 nicklas 232     TestFile.test_delete(celFile);
4740 05 Feb 09 nicklas 233     TestFile.test_delete(genePixFile);
4740 05 Feb 09 nicklas 234     TestFile.test_delete(reporterMap);
5652 10 Jun 11 nicklas 235     TestFile.test_delete(samFile);
4740 05 Feb 09 nicklas 236     TestAnnotationType.test_delete(scanPower);
4740 05 Feb 09 nicklas 237     TestAnnotationType.test_delete(annotationType);
4740 05 Feb 09 nicklas 238     
4740 05 Feb 09 nicklas 239     write("++Testing generic overview "+(ok ? "OK" : "Failed")+"\n");
4740 05 Feb 09 nicklas 240     return ok;
4740 05 Feb 09 nicklas 241   }
4740 05 Feb 09 nicklas 242   
4740 05 Feb 09 nicklas 243
4740 05 Feb 09 nicklas 244   
4740 05 Feb 09 nicklas 245   static void write(String message)
4740 05 Feb 09 nicklas 246   {
4740 05 Feb 09 nicklas 247     System.out.println(message);
4740 05 Feb 09 nicklas 248   }
4740 05 Feb 09 nicklas 249   static void write(GenericOverview go)
4740 05 Feb 09 nicklas 250   {
4740 05 Feb 09 nicklas 251     if (TestUtil.getSilent()) return;
4740 05 Feb 09 nicklas 252     write("--Generating overview...");
4740 05 Feb 09 nicklas 253     write(go.getRootNode(), "");
4740 05 Feb 09 nicklas 254     int i = 0;
4740 05 Feb 09 nicklas 255     for (Failure f : go.getFailures())
4740 05 Feb 09 nicklas 256     {
4740 05 Feb 09 nicklas 257       ++i;
4740 05 Feb 09 nicklas 258       write("--failure " + i + ": " + f.getMessage() + " on node " + f.getNode().getTitle());
4740 05 Feb 09 nicklas 259     }
4740 05 Feb 09 nicklas 260   }
4740 05 Feb 09 nicklas 261   static void write(Node node, String indent)
4740 05 Feb 09 nicklas 262   {
4740 05 Feb 09 nicklas 263     write("  " + indent + node.getName() + ": " + node.getTitle());
4740 05 Feb 09 nicklas 264     List<Node> children = node.getChildren();
4740 05 Feb 09 nicklas 265     if (children != null)
4740 05 Feb 09 nicklas 266     {
4740 05 Feb 09 nicklas 267       for (Node child : children)
4740 05 Feb 09 nicklas 268       {
4740 05 Feb 09 nicklas 269         write(child, "".equals(indent) ? "|-" : "| " + indent);
4740 05 Feb 09 nicklas 270       }
4740 05 Feb 09 nicklas 271     }
4740 05 Feb 09 nicklas 272   }
4740 05 Feb 09 nicklas 273   
4740 05 Feb 09 nicklas 274   
4740 05 Feb 09 nicklas 275   static void test_overview(Item itemType, int id)
4740 05 Feb 09 nicklas 276   {
4740 05 Feb 09 nicklas 277     if (id == 0) return;
4740 05 Feb 09 nicklas 278     DbControl dc = null;
4740 05 Feb 09 nicklas 279     SessionControl sc = TestUtil.getSessionControl();
4740 05 Feb 09 nicklas 280     try
4740 05 Feb 09 nicklas 281     {
4740 05 Feb 09 nicklas 282       dc = TestUtil.getDbControl();
4740 05 Feb 09 nicklas 283       BasicItem item = itemType.getById(dc, id);
4740 05 Feb 09 nicklas 284       
4767 17 Feb 09 nicklas 285       GenericOverview go = OverviewUtil.getNewOverview(dc, item, null);
4740 05 Feb 09 nicklas 286       ((BasicItemNodeLoaderFactory)go.getNodeLoaderFactory()).setUseNullLoaderIfNotFound(true);
4768 18 Feb 09 nicklas 287       go.expand(dc, go.getRootNode(), true);
4740 05 Feb 09 nicklas 288       write(go);
4740 05 Feb 09 nicklas 289       
4740 05 Feb 09 nicklas 290       write("--Load generic overview [root=" + item + "] OK");
4740 05 Feb 09 nicklas 291     }
4740 05 Feb 09 nicklas 292     catch (Throwable ex)
4740 05 Feb 09 nicklas 293     {
4740 05 Feb 09 nicklas 294       write("--Load generic overview [root =" + itemType + "(" + id + ") FAILED");
4740 05 Feb 09 nicklas 295       ex.printStackTrace();
4740 05 Feb 09 nicklas 296       ok = false;
4740 05 Feb 09 nicklas 297     }
4740 05 Feb 09 nicklas 298     finally
4740 05 Feb 09 nicklas 299     {
4740 05 Feb 09 nicklas 300       if (dc != null) dc.close();
4740 05 Feb 09 nicklas 301     }
4740 05 Feb 09 nicklas 302   }
4740 05 Feb 09 nicklas 303
4740 05 Feb 09 nicklas 304   
4740 05 Feb 09 nicklas 305
4740 05 Feb 09 nicklas 306 }

Generated on Sat Oct  7 02:41:43 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)