src/test/TestJep.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1578 08 Nov 05 nicklas 1 /*
1578 08 Nov 05 nicklas 2   $Id$
1578 08 Nov 05 nicklas 3
3675 16 Aug 07 jari 4   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
4889 06 Apr 09 nicklas 5   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg
3675 16 Aug 07 jari 6   Copyright (C) 2007 Nicklas Nordborg
1578 08 Nov 05 nicklas 7
2304 22 May 06 jari 8   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 9   Available at http://base.thep.lu.se/
1578 08 Nov 05 nicklas 10
1578 08 Nov 05 nicklas 11   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1578 08 Nov 05 nicklas 12   modify it under the terms of the GNU General Public License
4480 05 Sep 08 jari 13   as published by the Free Software Foundation; either version 3
1578 08 Nov 05 nicklas 14   of the License, or (at your option) any later version.
1578 08 Nov 05 nicklas 15
1578 08 Nov 05 nicklas 16   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1578 08 Nov 05 nicklas 17   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1578 08 Nov 05 nicklas 18   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1578 08 Nov 05 nicklas 19   GNU General Public License for more details.
1578 08 Nov 05 nicklas 20
1578 08 Nov 05 nicklas 21   You should have received a copy of the GNU General Public License
4514 11 Sep 08 jari 22   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
1578 08 Nov 05 nicklas 23 */
5319 20 Apr 10 nicklas 24 import net.sf.basedb.core.BaseException;
1581 09 Nov 05 nicklas 25 import net.sf.basedb.core.RawDataTypes;
1581 09 Nov 05 nicklas 26 import net.sf.basedb.util.jep.Jep;
1581 09 Nov 05 nicklas 27 import net.sf.basedb.util.jep.RawFunction;
1578 08 Nov 05 nicklas 28 import net.sf.basedb.core.query.Expression;
1581 09 Nov 05 nicklas 29 import net.sf.basedb.core.query.Restriction;
1578 08 Nov 05 nicklas 30
1578 08 Nov 05 nicklas 31 public class TestJep
1578 08 Nov 05 nicklas 32 {
1578 08 Nov 05 nicklas 33
1578 08 Nov 05 nicklas 34   static boolean ok = true;
1578 08 Nov 05 nicklas 35   public static void main(String[] args)
1578 08 Nov 05 nicklas 36   {
1578 08 Nov 05 nicklas 37     TestUtil.checkArgs(args);
1578 08 Nov 05 nicklas 38     TestUtil.begin();
1578 08 Nov 05 nicklas 39     ok = test_all();
1578 08 Nov 05 nicklas 40     TestUtil.stop();
1578 08 Nov 05 nicklas 41   }
1578 08 Nov 05 nicklas 42
1578 08 Nov 05 nicklas 43   static boolean test_all()
1578 08 Nov 05 nicklas 44   {
1578 08 Nov 05 nicklas 45     write("++Testing Java Math Expression Parser");
1578 08 Nov 05 nicklas 46
1581 09 Nov 05 nicklas 47     String expression1 = "raw(ch1FgMean) - raw(ch1BgMean)";
1581 09 Nov 05 nicklas 48     String expression2 = "ln((raw(ch1FgMean) - raw(ch1BgMean)) / (raw(ch2FgMean) - raw(ch2BgMean)))";
3656 13 Aug 07 nicklas 49     String bigExpression = "1+sqrt(2)-exp(3)*abs(-4)/log(5)+ln(5.99)+x+if(a<b, 11, -11)";
1581 09 Nov 05 nicklas 50     String restriction1 = expression1 + " > 0";
1581 09 Nov 05 nicklas 51     String restriction2 = expression2 + " > 2";
1581 09 Nov 05 nicklas 52     String restriction3 = restriction1 + " && " + restriction2;
1581 09 Nov 05 nicklas 53     String restriction4 = "raw(name) == 'Nicklas'";
3604 26 Jul 07 nicklas 54     String bigRestriction = "1 == 1 && 2 > 1 || 2 >= 1 && 3 < 7.0 && 3 <= 9 && !(5 != 5)";
5319 20 Apr 10 nicklas 55     test_parse("x+2", false);
5319 20 Apr 10 nicklas 56     test_parse("2+x", false);
5319 20 Apr 10 nicklas 57     test_parse("x(2)", true);
5319 20 Apr 10 nicklas 58     test_parse("x(2)+y()", true);
5319 20 Apr 10 nicklas 59     
5319 20 Apr 10 nicklas 60     test_parse(expression1, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 61     test_parse(expression2, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 62     test_parse(bigExpression, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 63     test_parse(restriction1, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 64     test_parse(restriction2, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 65     test_parse(restriction3, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 66     test_parse(restriction4, false);
5319 20 Apr 10 nicklas 67     test_parse(bigRestriction, false);
1581 09 Nov 05 nicklas 68     test_expression(expression1);
1581 09 Nov 05 nicklas 69     test_expression(expression2);
3604 26 Jul 07 nicklas 70     test_expression(bigExpression);
1581 09 Nov 05 nicklas 71     test_restriction(restriction1);
1581 09 Nov 05 nicklas 72     test_restriction(restriction2);
1581 09 Nov 05 nicklas 73     test_restriction(restriction3);
1581 09 Nov 05 nicklas 74     test_restriction(restriction4);
3604 26 Jul 07 nicklas 75     test_restriction(bigRestriction);
1581 09 Nov 05 nicklas 76
1578 08 Nov 05 nicklas 77     write("++Testing Java Math Expression Parser "+(ok ? "OK" : "Failed")+"\n");
1578 08 Nov 05 nicklas 78     return ok;
1578 08 Nov 05 nicklas 79   }
1578 08 Nov 05 nicklas 80
5319 20 Apr 10 nicklas 81   static void test_parse(String formula, boolean shouldFail)
1578 08 Nov 05 nicklas 82   {
1578 08 Nov 05 nicklas 83     try
1578 08 Nov 05 nicklas 84     {
5319 20 Apr 10 nicklas 85       Throwable t = null;
5319 20 Apr 10 nicklas 86       try
5319 20 Apr 10 nicklas 87       {
5319 20 Apr 10 nicklas 88         Jep.newJep(formula, new RawFunction(null, RawDataTypes.getSafeRawDataType("genepix"), true));
5319 20 Apr 10 nicklas 89       }
5319 20 Apr 10 nicklas 90       catch (Throwable t1)
5319 20 Apr 10 nicklas 91       {
5319 20 Apr 10 nicklas 92         t = t1;
5319 20 Apr 10 nicklas 93       }
5319 20 Apr 10 nicklas 94       if (shouldFail)
5319 20 Apr 10 nicklas 95       {
5319 20 Apr 10 nicklas 96         if (t == null) throw new BaseException("Expected parse failure");
5319 20 Apr 10 nicklas 97         write("--Parse formula: "+formula+" OK [" + t.getMessage() + "]");
5319 20 Apr 10 nicklas 98       }
5319 20 Apr 10 nicklas 99       else
5319 20 Apr 10 nicklas 100       {
5319 20 Apr 10 nicklas 101         if (t != null) throw t;
5319 20 Apr 10 nicklas 102         write("--Parse formula: "+formula+" OK");
5319 20 Apr 10 nicklas 103       }
1578 08 Nov 05 nicklas 104     }
1578 08 Nov 05 nicklas 105     catch (Throwable ex)
1578 08 Nov 05 nicklas 106     {
1578 08 Nov 05 nicklas 107       write("--Parse formula: "+formula+" FAILED");
1578 08 Nov 05 nicklas 108       ex.printStackTrace();
1578 08 Nov 05 nicklas 109       ok = false;
1578 08 Nov 05 nicklas 110     }
1578 08 Nov 05 nicklas 111   }
1578 08 Nov 05 nicklas 112   
1578 08 Nov 05 nicklas 113   static void test_expression(String formula)
1578 08 Nov 05 nicklas 114   {
1578 08 Nov 05 nicklas 115     try
1578 08 Nov 05 nicklas 116     {
4124 04 Feb 08 nicklas 117       Expression e = Jep.formulaToExpression(formula, new RawFunction(null, RawDataTypes.getSafeRawDataType("genepix"), true));
5320 21 Apr 10 nicklas 118       Expression e2 = Jep.formulaToExpression(formula, new RawFunction(null, RawDataTypes.getSafeRawDataType("genepix"), true));
5320 21 Apr 10 nicklas 119       if (!e.equals(e2)) throw new RuntimeException("Identical formulas doens't yield equal expressions");
5320 21 Apr 10 nicklas 120       if (e.hashCode() != e2.hashCode()) throw new RuntimeException("Identical formulas doens't yield equal hash codes");
1578 08 Nov 05 nicklas 121       write(e);
1578 08 Nov 05 nicklas 122       write("--Jep to Expression: "+formula+" OK");
1578 08 Nov 05 nicklas 123     }
1578 08 Nov 05 nicklas 124     catch (Throwable ex)
1578 08 Nov 05 nicklas 125     {
1578 08 Nov 05 nicklas 126       write("--Jep to Expression: "+formula+" FAILED");
1578 08 Nov 05 nicklas 127       ex.printStackTrace();
1578 08 Nov 05 nicklas 128       ok = false;
1581 09 Nov 05 nicklas 129     }
1581 09 Nov 05 nicklas 130   }
1578 08 Nov 05 nicklas 131
1581 09 Nov 05 nicklas 132   static void test_restriction(String formula)
1581 09 Nov 05 nicklas 133   {
1581 09 Nov 05 nicklas 134     try
1581 09 Nov 05 nicklas 135     {
2993 01 Dec 06 nicklas 136       Restriction r = Jep.formulaToRestriction(formula, 
4124 04 Feb 08 nicklas 137         new RawFunction(null, RawDataTypes.getSafeRawDataType("genepix"), true));
5320 21 Apr 10 nicklas 138       Restriction r2 = Jep.formulaToRestriction(formula, 
5320 21 Apr 10 nicklas 139           new RawFunction(null, RawDataTypes.getSafeRawDataType("genepix"), true));
5320 21 Apr 10 nicklas 140       if (!r.equals(r2)) throw new RuntimeException("Identical formulas doens't yield equal restrictions");
5320 21 Apr 10 nicklas 141       if (r.hashCode() != r2.hashCode()) throw new RuntimeException("Identical formulas doens't yield equal hash codes");
1581 09 Nov 05 nicklas 142       write(r);
1581 09 Nov 05 nicklas 143       write("--Jep to Restriction: "+formula+" OK");
1578 08 Nov 05 nicklas 144     }
1581 09 Nov 05 nicklas 145     catch (Throwable ex)
1581 09 Nov 05 nicklas 146     {
1581 09 Nov 05 nicklas 147       write("--Jep to Restriction: "+formula+" FAILED");
1581 09 Nov 05 nicklas 148       ex.printStackTrace();
1581 09 Nov 05 nicklas 149       ok = false;
1581 09 Nov 05 nicklas 150     }
1578 08 Nov 05 nicklas 151   }
1578 08 Nov 05 nicklas 152
1578 08 Nov 05 nicklas 153   static void write(String message)
1578 08 Nov 05 nicklas 154   {
1578 08 Nov 05 nicklas 155     System.out.println(message);
1578 08 Nov 05 nicklas 156   }
1578 08 Nov 05 nicklas 157   
1578 08 Nov 05 nicklas 158   static void write(Expression e)
1578 08 Nov 05 nicklas 159   {
1578 08 Nov 05 nicklas 160     if (!TestUtil.getSilent())
1578 08 Nov 05 nicklas 161     {
5320 21 Apr 10 nicklas 162       System.out.println("--Expression [" + e.hashCode() + "]: " + e.toString());
1578 08 Nov 05 nicklas 163     }
1578 08 Nov 05 nicklas 164   }
1578 08 Nov 05 nicklas 165
1581 09 Nov 05 nicklas 166   static void write(Restriction r)
1581 09 Nov 05 nicklas 167   {
1581 09 Nov 05 nicklas 168     if (!TestUtil.getSilent())
1581 09 Nov 05 nicklas 169     {
5320 21 Apr 10 nicklas 170       System.out.println("--Restriction [" + r.hashCode() + "]: " + r.toString());
1581 09 Nov 05 nicklas 171     }
1581 09 Nov 05 nicklas 172   }
1581 09 Nov 05 nicklas 173
1578 08 Nov 05 nicklas 174 }
1578 08 Nov 05 nicklas 175

Generated on Sat Oct  7 02:41:48 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)