src/test/TestPlateGeometry.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
874 05 Jul 05 nicklas 1 /*
874 05 Jul 05 nicklas 2   $Id$
874 05 Jul 05 nicklas 3
3675 16 Aug 07 jari 4   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
4889 06 Apr 09 nicklas 5   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg
874 05 Jul 05 nicklas 6
2304 22 May 06 jari 7   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 8   Available at http://base.thep.lu.se/
874 05 Jul 05 nicklas 9
874 05 Jul 05 nicklas 10   BASE is free software; you can redistribute it and/or
874 05 Jul 05 nicklas 11   modify it under the terms of the GNU General Public License
4480 05 Sep 08 jari 12   as published by the Free Software Foundation; either version 3
874 05 Jul 05 nicklas 13   of the License, or (at your option) any later version.
874 05 Jul 05 nicklas 14
874 05 Jul 05 nicklas 15   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
874 05 Jul 05 nicklas 16   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
874 05 Jul 05 nicklas 17   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
874 05 Jul 05 nicklas 18   GNU General Public License for more details.
874 05 Jul 05 nicklas 19
874 05 Jul 05 nicklas 20   You should have received a copy of the GNU General Public License
4514 11 Sep 08 jari 21   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
874 05 Jul 05 nicklas 22 */
874 05 Jul 05 nicklas 23 import net.sf.basedb.core.*;
5338 07 May 10 nicklas 24 import net.sf.basedb.core.query.Expressions;
5338 07 May 10 nicklas 25 import net.sf.basedb.core.query.Hql;
5338 07 May 10 nicklas 26 import net.sf.basedb.core.query.Restrictions;
874 05 Jul 05 nicklas 27
874 05 Jul 05 nicklas 28 import java.util.Date;
5338 07 May 10 nicklas 29 import java.util.List;
5340 10 May 10 nicklas 30 import java.util.Set;
874 05 Jul 05 nicklas 31
874 05 Jul 05 nicklas 32 public class TestPlateGeometry
874 05 Jul 05 nicklas 33 {
874 05 Jul 05 nicklas 34
874 05 Jul 05 nicklas 35   static boolean ok = true;
874 05 Jul 05 nicklas 36   public static void main(String[] args)
874 05 Jul 05 nicklas 37   {
874 05 Jul 05 nicklas 38     TestUtil.checkArgs(args);
874 05 Jul 05 nicklas 39     TestUtil.begin();
874 05 Jul 05 nicklas 40     ok = test_all();
874 05 Jul 05 nicklas 41     TestUtil.stop();
874 05 Jul 05 nicklas 42   }
874 05 Jul 05 nicklas 43
874 05 Jul 05 nicklas 44   static boolean test_all()
874 05 Jul 05 nicklas 45   {
874 05 Jul 05 nicklas 46     write("++Testing plate geometries");
874 05 Jul 05 nicklas 47     write_header();
874 05 Jul 05 nicklas 48     // Standard tests: create, load, list
874 05 Jul 05 nicklas 49     int id = test_create(5, 10, true);
874 05 Jul 05 nicklas 50     int id2 = test_create(6, 12, false);
874 05 Jul 05 nicklas 51     test_load(id);
874 05 Jul 05 nicklas 52     test_list(-1);
874 05 Jul 05 nicklas 53
874 05 Jul 05 nicklas 54     // Standard test: Delete
1529 27 Oct 05 nicklas 55     if (TestUtil.waitBeforeDelete()) TestUtil.waitForEnter();
874 05 Jul 05 nicklas 56     test_delete(id);
874 05 Jul 05 nicklas 57     test_delete(id2);
874 05 Jul 05 nicklas 58     write("++Testing plate geometries "+(ok ? "OK" : "Failed")+"\n");
874 05 Jul 05 nicklas 59     return ok;
874 05 Jul 05 nicklas 60   }
874 05 Jul 05 nicklas 61
874 05 Jul 05 nicklas 62   static int test_create(int rows, int columns, boolean setAll)
874 05 Jul 05 nicklas 63   {
874 05 Jul 05 nicklas 64     if (!TestUtil.hasPermission(Permission.CREATE, Item.PLATEGEOMETRY)) return 0;
874 05 Jul 05 nicklas 65     int id = 0;
874 05 Jul 05 nicklas 66     DbControl dc = null;
874 05 Jul 05 nicklas 67     try
874 05 Jul 05 nicklas 68     {
874 05 Jul 05 nicklas 69       dc = TestUtil.getDbControl();
874 05 Jul 05 nicklas 70       PlateGeometry pg = PlateGeometry.getNew(dc, rows, columns);
874 05 Jul 05 nicklas 71       if (setAll)
874 05 Jul 05 nicklas 72       {
874 05 Jul 05 nicklas 73         pg.setName("Test plate geometry");
874 05 Jul 05 nicklas 74         pg.setDescription("Added at "+new Date());
874 05 Jul 05 nicklas 75       }
874 05 Jul 05 nicklas 76       dc.saveItem(pg);
874 05 Jul 05 nicklas 77       dc.commit();
874 05 Jul 05 nicklas 78       id = pg.getId();
874 05 Jul 05 nicklas 79       write_item(0, pg);
874 05 Jul 05 nicklas 80       write("--Create plate geometry OK");
874 05 Jul 05 nicklas 81     }
874 05 Jul 05 nicklas 82     catch (Throwable ex)
874 05 Jul 05 nicklas 83     {
874 05 Jul 05 nicklas 84       write("--Create plate geometry FAILED");
874 05 Jul 05 nicklas 85       ex.printStackTrace();
874 05 Jul 05 nicklas 86       ok = false;
874 05 Jul 05 nicklas 87     }
874 05 Jul 05 nicklas 88     finally
874 05 Jul 05 nicklas 89     {
874 05 Jul 05 nicklas 90       if (dc != null) dc.close();
874 05 Jul 05 nicklas 91     }
874 05 Jul 05 nicklas 92     return id;
874 05 Jul 05 nicklas 93   }
874 05 Jul 05 nicklas 94
874 05 Jul 05 nicklas 95   static void test_load(int id)
874 05 Jul 05 nicklas 96   {
874 05 Jul 05 nicklas 97     if (id == 0) return;
874 05 Jul 05 nicklas 98     DbControl dc = null;
874 05 Jul 05 nicklas 99     try
874 05 Jul 05 nicklas 100     {
874 05 Jul 05 nicklas 101       dc = TestUtil.getDbControl();
874 05 Jul 05 nicklas 102       PlateGeometry pg = PlateGeometry.getById(dc, id);
874 05 Jul 05 nicklas 103       write_item(0, pg);
874 05 Jul 05 nicklas 104       write("--Load plate geometry OK");
874 05 Jul 05 nicklas 105     }
874 05 Jul 05 nicklas 106     catch (Throwable ex)
874 05 Jul 05 nicklas 107     {
874 05 Jul 05 nicklas 108       write("--Load plate geometry FAILED");
874 05 Jul 05 nicklas 109       ex.printStackTrace();
874 05 Jul 05 nicklas 110       ok = false;
874 05 Jul 05 nicklas 111     }
874 05 Jul 05 nicklas 112     finally
874 05 Jul 05 nicklas 113     {
874 05 Jul 05 nicklas 114       if (dc != null) dc.close();
874 05 Jul 05 nicklas 115     }
874 05 Jul 05 nicklas 116   }
874 05 Jul 05 nicklas 117
874 05 Jul 05 nicklas 118
874 05 Jul 05 nicklas 119   static void test_list(int expectedResults)
874 05 Jul 05 nicklas 120   {
874 05 Jul 05 nicklas 121     DbControl dc = null;
874 05 Jul 05 nicklas 122     try
874 05 Jul 05 nicklas 123     {
874 05 Jul 05 nicklas 124       dc = TestUtil.getDbControl();
1418 07 Oct 05 nicklas 125       ItemResultList<PlateGeometry> l = PlateGeometry.getQuery().list(dc);
874 05 Jul 05 nicklas 126       for (int i = 0; i<l.size(); i++)
874 05 Jul 05 nicklas 127       {
874 05 Jul 05 nicklas 128         write_item(i, l.get(i));
874 05 Jul 05 nicklas 129       }
874 05 Jul 05 nicklas 130       if (expectedResults >= 0 && expectedResults != l.size())
874 05 Jul 05 nicklas 131       {
874 05 Jul 05 nicklas 132         throw new BaseException("Expected "+expectedResults+" results, not "+l.size());
874 05 Jul 05 nicklas 133       }
874 05 Jul 05 nicklas 134       write("--List plate geometries OK ("+l.size()+")");
874 05 Jul 05 nicklas 135     }
874 05 Jul 05 nicklas 136     catch (Throwable ex)
874 05 Jul 05 nicklas 137     {
874 05 Jul 05 nicklas 138       write("--List plate geometries FAILED");
874 05 Jul 05 nicklas 139       ex.printStackTrace();
874 05 Jul 05 nicklas 140       ok = false;
874 05 Jul 05 nicklas 141     }
874 05 Jul 05 nicklas 142     finally
874 05 Jul 05 nicklas 143     {
874 05 Jul 05 nicklas 144       if (dc != null) dc.close();
874 05 Jul 05 nicklas 145     }
874 05 Jul 05 nicklas 146   }
874 05 Jul 05 nicklas 147
874 05 Jul 05 nicklas 148
874 05 Jul 05 nicklas 149   static void test_delete(int id)
874 05 Jul 05 nicklas 150   {
874 05 Jul 05 nicklas 151     if (id == 0) return;
874 05 Jul 05 nicklas 152     DbControl dc = null;
874 05 Jul 05 nicklas 153     try
874 05 Jul 05 nicklas 154     {
874 05 Jul 05 nicklas 155       dc = TestUtil.getDbControl();
874 05 Jul 05 nicklas 156       PlateGeometry pg = PlateGeometry.getById(dc, id);
874 05 Jul 05 nicklas 157       dc.deleteItem(pg);
5340 10 May 10 nicklas 158       Set<ItemProxy> using = pg.getUsingItems();
5340 10 May 10 nicklas 159       if (using.size() > 0) 
5340 10 May 10 nicklas 160       {
5340 10 May 10 nicklas 161          throw new BaseException(pg + " is used by " + using);
5340 10 May 10 nicklas 162       }
874 05 Jul 05 nicklas 163       dc.commit();
874 05 Jul 05 nicklas 164       write("--Delete plate geometry OK");
874 05 Jul 05 nicklas 165     }
874 05 Jul 05 nicklas 166     catch (Throwable ex)
874 05 Jul 05 nicklas 167     {
874 05 Jul 05 nicklas 168       write("--Delete plate geometry FAILED");
874 05 Jul 05 nicklas 169       ex.printStackTrace();
874 05 Jul 05 nicklas 170       ok = false;
874 05 Jul 05 nicklas 171     }
874 05 Jul 05 nicklas 172     finally
874 05 Jul 05 nicklas 173     {
874 05 Jul 05 nicklas 174       if (dc != null) dc.close();
874 05 Jul 05 nicklas 175     }
874 05 Jul 05 nicklas 176   }
874 05 Jul 05 nicklas 177
874 05 Jul 05 nicklas 178   static void write_header()
874 05 Jul 05 nicklas 179   {
874 05 Jul 05 nicklas 180     if (!TestUtil.getSilent())
874 05 Jul 05 nicklas 181     {
874 05 Jul 05 nicklas 182       System.out.println("   \tID \tName      \tDescription\tRows\tColumns");
874 05 Jul 05 nicklas 183       System.out.println("-- \t-- \t--------- \t-----------\t----\t-------");
874 05 Jul 05 nicklas 184     }
874 05 Jul 05 nicklas 185   }
874 05 Jul 05 nicklas 186   static void write_item(int i, PlateGeometry pg)
874 05 Jul 05 nicklas 187     throws BaseException
874 05 Jul 05 nicklas 188   {
874 05 Jul 05 nicklas 189     if (!TestUtil.getSilent()) System.out.println(i+":\t"+pg.getId()+"\t"+pg.getName()+"\t"+pg.getDescription()+
874 05 Jul 05 nicklas 190       "\t"+pg.getRows()+"\t"+pg.getColumns());
874 05 Jul 05 nicklas 191   }
874 05 Jul 05 nicklas 192   static void write(String message)
874 05 Jul 05 nicklas 193   {
874 05 Jul 05 nicklas 194     System.out.println(message);
874 05 Jul 05 nicklas 195   }
874 05 Jul 05 nicklas 196
5338 07 May 10 nicklas 197   static int test_find_by_size(int rows, int cols)
5338 07 May 10 nicklas 198   {
5338 07 May 10 nicklas 199     DbControl dc = null;
5338 07 May 10 nicklas 200     int id = 0;
5338 07 May 10 nicklas 201     try
5338 07 May 10 nicklas 202     {
5338 07 May 10 nicklas 203       dc = TestUtil.getDbControl();
5338 07 May 10 nicklas 204       ItemQuery<PlateGeometry> query = PlateGeometry.getQuery();
5338 07 May 10 nicklas 205       query.restrict(Restrictions.eq(Hql.property("rows"), Expressions.integer(rows)));
5338 07 May 10 nicklas 206       query.restrict(Restrictions.eq(Hql.property("columns"), Expressions.integer(cols)));
5338 07 May 10 nicklas 207       List<PlateGeometry> list = query.list(dc);
5338 07 May 10 nicklas 208       if (list.size() == 0) 
5338 07 May 10 nicklas 209       {
5338 07 May 10 nicklas 210         throw new ItemNotFoundException("Plate geometry [rows=" + rows + "; cols=" + cols + "]");
5338 07 May 10 nicklas 211       }
5338 07 May 10 nicklas 212       id = list.get(0).getId();  
5338 07 May 10 nicklas 213       write("--Get plate geometry [rows=" + rows + "; cols=" + cols + "] OK");
5338 07 May 10 nicklas 214     }
5338 07 May 10 nicklas 215     catch (Throwable ex)
5338 07 May 10 nicklas 216     {
5338 07 May 10 nicklas 217       write("--Get plate geometry [rows=" + rows + "; cols=" + cols + "] FAILED");
5338 07 May 10 nicklas 218       ex.printStackTrace();
5338 07 May 10 nicklas 219       ok = false;
5338 07 May 10 nicklas 220     }
5338 07 May 10 nicklas 221     finally
5338 07 May 10 nicklas 222     {
5338 07 May 10 nicklas 223       if (dc != null) dc.close();
5338 07 May 10 nicklas 224     }
5338 07 May 10 nicklas 225     return id;
5338 07 May 10 nicklas 226   }
5338 07 May 10 nicklas 227
5338 07 May 10 nicklas 228   
874 05 Jul 05 nicklas 229 }

Generated on Sat Oct  7 02:41:56 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)