src/test/TestReporterCloneTemplate.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5876 15 Nov 11 nicklas 1 /*
5876 15 Nov 11 nicklas 2   $Id $
5876 15 Nov 11 nicklas 3
5876 15 Nov 11 nicklas 4   Copyright (C) 2011 Nicklas Nordborg
5876 15 Nov 11 nicklas 5
5876 15 Nov 11 nicklas 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
5876 15 Nov 11 nicklas 7   Available at http://base.thep.lu.se/
5876 15 Nov 11 nicklas 8
5876 15 Nov 11 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
5876 15 Nov 11 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
5876 15 Nov 11 nicklas 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
5876 15 Nov 11 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
5876 15 Nov 11 nicklas 13
5876 15 Nov 11 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
5876 15 Nov 11 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
5876 15 Nov 11 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
5876 15 Nov 11 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
5876 15 Nov 11 nicklas 18
5876 15 Nov 11 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
5876 15 Nov 11 nicklas 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
5876 15 Nov 11 nicklas 21 */
5876 15 Nov 11 nicklas 22
5876 15 Nov 11 nicklas 23 import net.sf.basedb.core.BaseException;
5885 22 Nov 11 nicklas 24 import net.sf.basedb.core.ClonableProperty;
5876 15 Nov 11 nicklas 25 import net.sf.basedb.core.DbControl;
5886 23 Nov 11 nicklas 26 import net.sf.basedb.core.DynamicReporterQuery;
5886 23 Nov 11 nicklas 27 import net.sf.basedb.core.DynamicResultIterator;
5876 15 Nov 11 nicklas 28 import net.sf.basedb.core.Experiment;
5876 15 Nov 11 nicklas 29 import net.sf.basedb.core.ExtendedProperties;
5876 15 Nov 11 nicklas 30 import net.sf.basedb.core.ExtendedProperty;
5876 15 Nov 11 nicklas 31 import net.sf.basedb.core.Item;
5876 15 Nov 11 nicklas 32 import net.sf.basedb.core.ItemProxy;
5876 15 Nov 11 nicklas 33 import net.sf.basedb.core.ItemResultList;
5876 15 Nov 11 nicklas 34 import net.sf.basedb.core.Permission;
5886 23 Nov 11 nicklas 35 import net.sf.basedb.core.Reporter;
5877 16 Nov 11 nicklas 36 import net.sf.basedb.core.ReporterCloneBatcher;
5876 15 Nov 11 nicklas 37 import net.sf.basedb.core.ReporterCloneTemplate;
5886 23 Nov 11 nicklas 38 import net.sf.basedb.core.ReporterCloneBatcher.CloneSource;
7381 22 May 17 nicklas 39 import net.sf.basedb.core.data.ReporterData;
5886 23 Nov 11 nicklas 40 import net.sf.basedb.core.query.Dynamic;
5886 23 Nov 11 nicklas 41 import net.sf.basedb.core.query.SqlResult;
5876 15 Nov 11 nicklas 42 import net.sf.basedb.util.ConsoleProgressReporter;
5876 15 Nov 11 nicklas 43
5876 15 Nov 11 nicklas 44 import java.util.Date;
5876 15 Nov 11 nicklas 45 import java.util.List;
5876 15 Nov 11 nicklas 46 import java.util.Set;
5876 15 Nov 11 nicklas 47
5876 15 Nov 11 nicklas 48 public class TestReporterCloneTemplate
5876 15 Nov 11 nicklas 49 {
5876 15 Nov 11 nicklas 50
5876 15 Nov 11 nicklas 51   static boolean ok = true;
5876 15 Nov 11 nicklas 52   public static void main(String[] args)
5876 15 Nov 11 nicklas 53   {
5876 15 Nov 11 nicklas 54     TestUtil.checkArgs(args);
5876 15 Nov 11 nicklas 55     TestUtil.begin();
5876 15 Nov 11 nicklas 56     ok = test_all();
5876 15 Nov 11 nicklas 57     TestUtil.stop();
5876 15 Nov 11 nicklas 58   }
5876 15 Nov 11 nicklas 59
5876 15 Nov 11 nicklas 60   static boolean test_all()
5876 15 Nov 11 nicklas 61   {
5876 15 Nov 11 nicklas 62     write("++Testing reporter clone templates");
5876 15 Nov 11 nicklas 63     write_header();
5876 15 Nov 11 nicklas 64     // Standard tests: create, load, list
5876 15 Nov 11 nicklas 65     
5876 15 Nov 11 nicklas 66     List<ExtendedProperty> properties = ExtendedProperties.getProperties("ReporterData");
5876 15 Nov 11 nicklas 67     
5885 22 Nov 11 nicklas 68     ClonableProperty symbol = ClonableProperty.createFromRegular(ClonableProperty.SYMBOL);
5885 22 Nov 11 nicklas 69     ClonableProperty ex1 = ClonableProperty.createFromExtended(properties.get(0).getName());
5876 15 Nov 11 nicklas 70     
5876 15 Nov 11 nicklas 71     int id = test_create("Test reporter clone template", symbol, ex1);
5876 15 Nov 11 nicklas 72     test_load(id);
5876 15 Nov 11 nicklas 73     test_list(-1);
5876 15 Nov 11 nicklas 74
5876 15 Nov 11 nicklas 75     boolean wasSetup = TestAnalyzeUtil.setupExperiment();
5876 15 Nov 11 nicklas 76     try
5876 15 Nov 11 nicklas 77     {
5876 15 Nov 11 nicklas 78   
5876 15 Nov 11 nicklas 79       int experimentId = TestAnalyzeUtil.getItemId("experiment.genepix");
5876 15 Nov 11 nicklas 80       if (experimentId == 0)
5876 15 Nov 11 nicklas 81       {
5876 15 Nov 11 nicklas 82         ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 83         write("Test experiment was not setup correctly.");
5876 15 Nov 11 nicklas 84       }
5876 15 Nov 11 nicklas 85
5886 23 Nov 11 nicklas 86       test_clone_reporters(id, experimentId, CloneSource.VIRTUAL, 572);
5886 23 Nov 11 nicklas 87       test_list_cloned_reporters(experimentId);
5886 23 Nov 11 nicklas 88
7381 22 May 17 nicklas 89       test_externalId("B-actin_1/4", experimentId);
7381 22 May 17 nicklas 90       
5886 23 Nov 11 nicklas 91       test_clone_reporters(id, experimentId, CloneSource.RAW, 572);
5886 23 Nov 11 nicklas 92       test_list_cloned_reporters(experimentId);
5886 23 Nov 11 nicklas 93
5876 15 Nov 11 nicklas 94       // Standard test: Delete
5876 15 Nov 11 nicklas 95       if (TestUtil.waitBeforeDelete()) TestUtil.waitForEnter();
5877 16 Nov 11 nicklas 96       test_remove_cloned_reporters(experimentId);
5876 15 Nov 11 nicklas 97       test_delete(id);
5876 15 Nov 11 nicklas 98     }
5876 15 Nov 11 nicklas 99     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 100     {
5876 15 Nov 11 nicklas 101       if (wasSetup) TestAnalyzeUtil.cleanupExperiment();
5876 15 Nov 11 nicklas 102       write("++Testing reporter clone templates "+(ok ? "OK" : "Failed")+"\n");
5876 15 Nov 11 nicklas 103     }
5876 15 Nov 11 nicklas 104     return ok;
5876 15 Nov 11 nicklas 105   }
5876 15 Nov 11 nicklas 106
5885 22 Nov 11 nicklas 107   static int test_create(String name, ClonableProperty... properties)
5876 15 Nov 11 nicklas 108   {
5876 15 Nov 11 nicklas 109     if (!TestUtil.hasPermission(Permission.CREATE, Item.REPORTERCLONETEMPLATE)) return 0;
5876 15 Nov 11 nicklas 110     int id = 0;
5876 15 Nov 11 nicklas 111     DbControl dc = null;
5876 15 Nov 11 nicklas 112     try
5876 15 Nov 11 nicklas 113     {
5876 15 Nov 11 nicklas 114       dc = TestUtil.getDbControl();
5876 15 Nov 11 nicklas 115       ReporterCloneTemplate rct = ReporterCloneTemplate.getNew(dc);
5876 15 Nov 11 nicklas 116       rct.setName(name);
5876 15 Nov 11 nicklas 117       rct.setDescription("Added at "+new Date());
5876 15 Nov 11 nicklas 118       if (properties != null)
5876 15 Nov 11 nicklas 119       {
5885 22 Nov 11 nicklas 120         for (ClonableProperty cp : properties)
5876 15 Nov 11 nicklas 121         {
5885 22 Nov 11 nicklas 122           rct.addClonableProperty(cp);
5876 15 Nov 11 nicklas 123         }
5876 15 Nov 11 nicklas 124       }
5876 15 Nov 11 nicklas 125       dc.saveItem(rct);
5876 15 Nov 11 nicklas 126       dc.commit();
5876 15 Nov 11 nicklas 127       id = rct.getId();
5876 15 Nov 11 nicklas 128       dc = TestUtil.getDbControl();
5876 15 Nov 11 nicklas 129       dc.reattachItem(rct, false);
5876 15 Nov 11 nicklas 130       write_item(0, rct);
5876 15 Nov 11 nicklas 131       write("--Create reporter clone template OK");
5876 15 Nov 11 nicklas 132     }
5876 15 Nov 11 nicklas 133     catch (Throwable ex)
5876 15 Nov 11 nicklas 134     {
5876 15 Nov 11 nicklas 135       write("--Create reporter clone template FAILED");
5876 15 Nov 11 nicklas 136       ex.printStackTrace();
5876 15 Nov 11 nicklas 137       ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 138     }
5876 15 Nov 11 nicklas 139     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 140     {
5876 15 Nov 11 nicklas 141       if (dc != null) dc.close();
5876 15 Nov 11 nicklas 142     }
5876 15 Nov 11 nicklas 143     return id;
5876 15 Nov 11 nicklas 144   }
5876 15 Nov 11 nicklas 145
5876 15 Nov 11 nicklas 146   static void test_load(int id)
5876 15 Nov 11 nicklas 147   {
5876 15 Nov 11 nicklas 148     if (id == 0) return;
5876 15 Nov 11 nicklas 149     DbControl dc = null;
5876 15 Nov 11 nicklas 150     try
5876 15 Nov 11 nicklas 151     {
5876 15 Nov 11 nicklas 152       dc = TestUtil.getDbControl();
5876 15 Nov 11 nicklas 153       ReporterCloneTemplate rct = ReporterCloneTemplate.getById(dc, id);
5876 15 Nov 11 nicklas 154       write_item(0, rct);
5876 15 Nov 11 nicklas 155       write("--Load reporter clone template OK");
5876 15 Nov 11 nicklas 156     }
5876 15 Nov 11 nicklas 157     catch (Throwable ex)
5876 15 Nov 11 nicklas 158     {
5876 15 Nov 11 nicklas 159       write("--Load reporter clone template FAILED");
5876 15 Nov 11 nicklas 160       ex.printStackTrace();
5876 15 Nov 11 nicklas 161       ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 162     }
5876 15 Nov 11 nicklas 163     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 164     {
5876 15 Nov 11 nicklas 165       if (dc != null) dc.close();
5876 15 Nov 11 nicklas 166     }
5876 15 Nov 11 nicklas 167   }
5876 15 Nov 11 nicklas 168
5876 15 Nov 11 nicklas 169   static void test_list(int expectedResults)
5876 15 Nov 11 nicklas 170   {
5876 15 Nov 11 nicklas 171     DbControl dc = null;
5876 15 Nov 11 nicklas 172     try
5876 15 Nov 11 nicklas 173     {
5876 15 Nov 11 nicklas 174       dc = TestUtil.getDbControl();
5876 15 Nov 11 nicklas 175       ItemResultList<ReporterCloneTemplate> l = ReporterCloneTemplate.getQuery().list(dc);
5876 15 Nov 11 nicklas 176       for (int i = 0; i<l.size(); i++)
5876 15 Nov 11 nicklas 177       {
5876 15 Nov 11 nicklas 178         write_item(i, l.get(i));
5876 15 Nov 11 nicklas 179       }
5876 15 Nov 11 nicklas 180       if (expectedResults >= 0 && expectedResults != l.size())
5876 15 Nov 11 nicklas 181       {
5876 15 Nov 11 nicklas 182         throw new BaseException("Expected "+expectedResults+" results, not "+l.size());
5876 15 Nov 11 nicklas 183       }
5876 15 Nov 11 nicklas 184       write("--List reporter clone templates OK ("+l.size()+")");
5876 15 Nov 11 nicklas 185     }
5876 15 Nov 11 nicklas 186     catch (Throwable ex)
5876 15 Nov 11 nicklas 187     {
5876 15 Nov 11 nicklas 188       write("--List reporter clone templates FAILED");
5876 15 Nov 11 nicklas 189       ex.printStackTrace();
5876 15 Nov 11 nicklas 190       ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 191     }
5876 15 Nov 11 nicklas 192     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 193     {
5876 15 Nov 11 nicklas 194       if (dc != null) dc.close();
5876 15 Nov 11 nicklas 195     }
5876 15 Nov 11 nicklas 196   }
5876 15 Nov 11 nicklas 197
5876 15 Nov 11 nicklas 198   static void test_delete(int id)
5876 15 Nov 11 nicklas 199   {
5876 15 Nov 11 nicklas 200     if (id == 0) return;
5876 15 Nov 11 nicklas 201     DbControl dc = null;
5876 15 Nov 11 nicklas 202     try
5876 15 Nov 11 nicklas 203     {
5876 15 Nov 11 nicklas 204       dc = TestUtil.getDbControl();
5876 15 Nov 11 nicklas 205       ReporterCloneTemplate rct = ReporterCloneTemplate.getById(dc, id);
5876 15 Nov 11 nicklas 206       dc.deleteItem(rct);
5876 15 Nov 11 nicklas 207       Set<ItemProxy> using = rct.getUsingItems();
5876 15 Nov 11 nicklas 208       if (using.size() > 0) 
5876 15 Nov 11 nicklas 209       {
5876 15 Nov 11 nicklas 210          throw new BaseException(rct + " is used by " + using);
5876 15 Nov 11 nicklas 211       }
5876 15 Nov 11 nicklas 212       dc.commit();
5876 15 Nov 11 nicklas 213       write("--Delete reporter clone template OK");
5876 15 Nov 11 nicklas 214     }
5876 15 Nov 11 nicklas 215     catch (Throwable ex)
5876 15 Nov 11 nicklas 216     {
5876 15 Nov 11 nicklas 217       write("--Delete reporter clone template FAILED");
5876 15 Nov 11 nicklas 218       ex.printStackTrace();
5876 15 Nov 11 nicklas 219       ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 220     }
5876 15 Nov 11 nicklas 221     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 222     {
5876 15 Nov 11 nicklas 223       if (dc != null) dc.close();
5876 15 Nov 11 nicklas 224     }
5876 15 Nov 11 nicklas 225   }
5876 15 Nov 11 nicklas 226
5876 15 Nov 11 nicklas 227   static void write_header()
5876 15 Nov 11 nicklas 228   {
5876 15 Nov 11 nicklas 229     if (!TestUtil.getSilent())
5876 15 Nov 11 nicklas 230     {
5876 15 Nov 11 nicklas 231       write("   \tID \tName      \tDescription\tLocked\tProperties");
5876 15 Nov 11 nicklas 232       write("-- \t-- \t--------- \t-----------\t------\t----------");
5876 15 Nov 11 nicklas 233     }
5876 15 Nov 11 nicklas 234   }
5876 15 Nov 11 nicklas 235   static void write_item(int i, ReporterCloneTemplate rct)
5876 15 Nov 11 nicklas 236     throws BaseException
5876 15 Nov 11 nicklas 237   {
5876 15 Nov 11 nicklas 238     if (!TestUtil.getSilent()) 
5876 15 Nov 11 nicklas 239     {
5876 15 Nov 11 nicklas 240       System.out.println(i+":\t"+rct.getId()+"\t"+rct.getName()+"\t"+rct.getDescription()+
5885 22 Nov 11 nicklas 241           "\t"+rct.isLocked() + "\t" + rct.getClonableProperties());
5876 15 Nov 11 nicklas 242     }
5876 15 Nov 11 nicklas 243   }
5876 15 Nov 11 nicklas 244   static void write(String message)
5876 15 Nov 11 nicklas 245   {
5876 15 Nov 11 nicklas 246     System.out.println(message);
5876 15 Nov 11 nicklas 247   }
5876 15 Nov 11 nicklas 248
5886 23 Nov 11 nicklas 249   static void test_clone_reporters(int id, int experimentId, CloneSource source, int numClonedExpected)
5876 15 Nov 11 nicklas 250   {
5876 15 Nov 11 nicklas 251     if (id == 0 || experimentId == 0) return;
5876 15 Nov 11 nicklas 252     DbControl dc = null;
5876 15 Nov 11 nicklas 253     try
5876 15 Nov 11 nicklas 254     {
5876 15 Nov 11 nicklas 255       dc = TestUtil.getDbControl();
5886 23 Nov 11 nicklas 256       ReporterCloneTemplate template = ReporterCloneTemplate.getById(dc, id);
5876 15 Nov 11 nicklas 257       Experiment exp = Experiment.getById(dc, experimentId);
5876 15 Nov 11 nicklas 258       
5877 16 Nov 11 nicklas 259       ReporterCloneBatcher batcher = exp.getReporterCloneBatcher(dc);
5886 23 Nov 11 nicklas 260       int numCloned = batcher.cloneReporters(source, template, 
5886 23 Nov 11 nicklas 261         TestUtil.getSilent() ? null : new ConsoleProgressReporter());
5886 23 Nov 11 nicklas 262       if (numCloned != numClonedExpected && numClonedExpected >= 0)
5886 23 Nov 11 nicklas 263       {
5886 23 Nov 11 nicklas 264         throw new BaseException("Expected "+numClonedExpected+" reporters, not "+numCloned);
5886 23 Nov 11 nicklas 265       }
5876 15 Nov 11 nicklas 266       
5876 15 Nov 11 nicklas 267       dc.commit();
5876 15 Nov 11 nicklas 268       if (!TestUtil.getSilent()) write("");
5876 15 Nov 11 nicklas 269       write("--Clone reporters OK");
5876 15 Nov 11 nicklas 270     }
5876 15 Nov 11 nicklas 271     catch (Throwable ex)
5876 15 Nov 11 nicklas 272     {
5876 15 Nov 11 nicklas 273       write("--Clone reporters FAILED");
5876 15 Nov 11 nicklas 274       ex.printStackTrace();
5876 15 Nov 11 nicklas 275       ok = false;
5876 15 Nov 11 nicklas 276     }
5876 15 Nov 11 nicklas 277     finally
5876 15 Nov 11 nicklas 278     {
5876 15 Nov 11 nicklas 279       if (dc != null) dc.close();
5876 15 Nov 11 nicklas 280     }
5877 16 Nov 11 nicklas 281   }
5876 15 Nov 11 nicklas 282   
5877 16 Nov 11 nicklas 283   static void test_remove_cloned_reporters(int experimentId)
5877 16 Nov 11 nicklas 284   {
5877 16 Nov 11 nicklas 285     if (experimentId == 0) return;
5877 16 Nov 11 nicklas 286     DbControl dc = null;
5877 16 Nov 11 nicklas 287     try
5877 16 Nov 11 nicklas 288     {
5877 16 Nov 11 nicklas 289       dc = TestUtil.getDbControl();
5877 16 Nov 11 nicklas 290       Experiment exp = Experiment.getById(dc, experimentId);
5877 16 Nov 11 nicklas 291       
5877 16 Nov 11 nicklas 292       ReporterCloneBatcher batcher = exp.getReporterCloneBatcher(dc);
5877 16 Nov 11 nicklas 293       batcher.dropClonedReporters();
5877 16 Nov 11 nicklas 294       
5877 16 Nov 11 nicklas 295       dc.commit();
5877 16 Nov 11 nicklas 296       write("--Remove cloned reporters OK");
5877 16 Nov 11 nicklas 297     }
5877 16 Nov 11 nicklas 298     catch (Throwable ex)
5877 16 Nov 11 nicklas 299     {
5877 16 Nov 11 nicklas 300       write("--Remove cloned reporters FAILED");
5877 16 Nov 11 nicklas 301       ex.printStackTrace();
5877 16 Nov 11 nicklas 302       ok = false;
5877 16 Nov 11 nicklas 303     }
5877 16 Nov 11 nicklas 304     finally
5877 16 Nov 11 nicklas 305     {
5877 16 Nov 11 nicklas 306       if (dc != null) dc.close();
5877 16 Nov 11 nicklas 307     }
5876 15 Nov 11 nicklas 308   }
5877 16 Nov 11 nicklas 309
5886 23 Nov 11 nicklas 310   static void test_list_cloned_reporters(int experimentId)
5886 23 Nov 11 nicklas 311   {
5886 23 Nov 11 nicklas 312     if (experimentId == 0) return;
5886 23 Nov 11 nicklas 313     DbControl dc = null;
5886 23 Nov 11 nicklas 314     try
5886 23 Nov 11 nicklas 315     {
5886 23 Nov 11 nicklas 316       dc = TestUtil.getDbControl();
5886 23 Nov 11 nicklas 317       Experiment exp = Experiment.getById(dc, experimentId);
5886 23 Nov 11 nicklas 318       
5886 23 Nov 11 nicklas 319       DynamicReporterQuery query = Reporter.getDynamicQuery(exp);
5886 23 Nov 11 nicklas 320       ReporterCloneTemplate template = exp.getVirtualDb().getReporterCloneTemplate();
5886 23 Nov 11 nicklas 321       
5886 23 Nov 11 nicklas 322       StringBuilder header = new StringBuilder("  ");
5886 23 Nov 11 nicklas 323       int numProperties = 0;
5886 23 Nov 11 nicklas 324       for (ClonableProperty cp : template.getClonableProperties())
5886 23 Nov 11 nicklas 325       {
5886 23 Nov 11 nicklas 326         header.append("\t").append(cp.getTitle());
5886 23 Nov 11 nicklas 327         query.select(Dynamic.selectReporter(cp.getName()));
5886 23 Nov 11 nicklas 328         numProperties++;
5886 23 Nov 11 nicklas 329       }
5886 23 Nov 11 nicklas 330       if (!TestUtil.getSilent()) 
5886 23 Nov 11 nicklas 331       {
5886 23 Nov 11 nicklas 332         write(header.toString());
5886 23 Nov 11 nicklas 333         write(header.toString().replaceAll("[^\t]", "-"));
5886 23 Nov 11 nicklas 334       }
5886 23 Nov 11 nicklas 335       
5886 23 Nov 11 nicklas 336       DynamicResultIterator it = query.iterate(dc);
5886 23 Nov 11 nicklas 337       int num = 1;
5886 23 Nov 11 nicklas 338       while (it.hasNext() && num < 50)
5886 23 Nov 11 nicklas 339       {
5886 23 Nov 11 nicklas 340         SqlResult row = it.next();
5886 23 Nov 11 nicklas 341         StringBuilder data = new StringBuilder();
5886 23 Nov 11 nicklas 342         data.append(num);
5886 23 Nov 11 nicklas 343         for (int index = 1; index <= numProperties; index++)
5886 23 Nov 11 nicklas 344         {
5886 23 Nov 11 nicklas 345           data.append("\t").append(row.getString(index));
5886 23 Nov 11 nicklas 346         }
5886 23 Nov 11 nicklas 347         num++;
5886 23 Nov 11 nicklas 348         if (!TestUtil.getSilent()) write(data.toString());
5886 23 Nov 11 nicklas 349       }
5886 23 Nov 11 nicklas 350       dc.commit();
5886 23 Nov 11 nicklas 351       write("--List cloned reporters OK");
5886 23 Nov 11 nicklas 352     }
5886 23 Nov 11 nicklas 353     catch (Throwable ex)
5886 23 Nov 11 nicklas 354     {
5886 23 Nov 11 nicklas 355       write("--List cloned FAILED");
5886 23 Nov 11 nicklas 356       ex.printStackTrace();
5886 23 Nov 11 nicklas 357       ok = false;
5886 23 Nov 11 nicklas 358     }
5886 23 Nov 11 nicklas 359     finally
5886 23 Nov 11 nicklas 360     {
5886 23 Nov 11 nicklas 361       if (dc != null) dc.close();
5886 23 Nov 11 nicklas 362     }
5886 23 Nov 11 nicklas 363   }
5886 23 Nov 11 nicklas 364
7381 22 May 17 nicklas 365   
7381 22 May 17 nicklas 366   static void test_externalId(String externalId, int experimentId)
7381 22 May 17 nicklas 367   {
7381 22 May 17 nicklas 368     if (experimentId == 0) return;
7381 22 May 17 nicklas 369     DbControl dc = null;
7381 22 May 17 nicklas 370     try
7381 22 May 17 nicklas 371     {
7381 22 May 17 nicklas 372       dc = TestUtil.getDbControl();
7381 22 May 17 nicklas 373       
7381 22 May 17 nicklas 374       Experiment exp = Experiment.getById(dc, experimentId);
7381 22 May 17 nicklas 375       
7381 22 May 17 nicklas 376       ReporterCloneTemplate template = exp.getVirtualDb().getReporterCloneTemplate();
7381 22 May 17 nicklas 377       StringBuilder header = new StringBuilder("  ");
7381 22 May 17 nicklas 378       int numProperties = 0;
7381 22 May 17 nicklas 379       for (ClonableProperty cp : template.getClonableProperties())
7381 22 May 17 nicklas 380       {
7381 22 May 17 nicklas 381         header.append("\t").append(cp.getTitle());
7381 22 May 17 nicklas 382         numProperties++;
7381 22 May 17 nicklas 383       }
7381 22 May 17 nicklas 384       if (!TestUtil.getSilent()) 
7381 22 May 17 nicklas 385       {
7381 22 May 17 nicklas 386         write(header.toString());
7381 22 May 17 nicklas 387         write(header.toString().replaceAll("[^\t]", "-"));
7381 22 May 17 nicklas 388       }
7381 22 May 17 nicklas 389       
7381 22 May 17 nicklas 390       ReporterData rd = Reporter.getByExternalId(dc, externalId, exp);
7381 22 May 17 nicklas 391       StringBuilder data = new StringBuilder();
7381 22 May 17 nicklas 392       data.append(1);
7381 22 May 17 nicklas 393       for (ClonableProperty cp : template.getClonableProperties())
7381 22 May 17 nicklas 394       {
7381 22 May 17 nicklas 395         Object value = null;
7381 22 May 17 nicklas 396         String propertyName = cp.getName();
7381 22 May 17 nicklas 397         if (cp.isExtendedProperty())
7381 22 May 17 nicklas 398         {
7381 22 May 17 nicklas 399           value = rd.getExtended(propertyName);
7381 22 May 17 nicklas 400         }
7381 22 May 17 nicklas 401         else if (propertyName.equals(ClonableProperty.EXTERNAL_ID))
7381 22 May 17 nicklas 402         {
7381 22 May 17 nicklas 403           value = rd.getExternalId();
7381 22 May 17 nicklas 404         }
7381 22 May 17 nicklas 405         else if (propertyName.equals(ClonableProperty.NAME))
7381 22 May 17 nicklas 406         {
7381 22 May 17 nicklas 407           value = rd.getName();
7381 22 May 17 nicklas 408         }
7381 22 May 17 nicklas 409         else if (propertyName.equals(ClonableProperty.ID))
7381 22 May 17 nicklas 410         {
7381 22 May 17 nicklas 411           value = rd.getId();
7381 22 May 17 nicklas 412         }
7381 22 May 17 nicklas 413         data.append("\t").append(value);
7381 22 May 17 nicklas 414       }
7381 22 May 17 nicklas 415       if (!TestUtil.getSilent()) write(data.toString());
7381 22 May 17 nicklas 416
7381 22 May 17 nicklas 417       write("--Get cloned by external id OK");
7381 22 May 17 nicklas 418     }
7381 22 May 17 nicklas 419     catch (Throwable ex)
7381 22 May 17 nicklas 420     {
7381 22 May 17 nicklas 421       write("--Get cloned by external id FAILED");
7381 22 May 17 nicklas 422       ex.printStackTrace();
7381 22 May 17 nicklas 423       ok = false;
7381 22 May 17 nicklas 424     }
7381 22 May 17 nicklas 425     finally
7381 22 May 17 nicklas 426     {
7381 22 May 17 nicklas 427       if (dc != null) dc.close();
7381 22 May 17 nicklas 428     }
7381 22 May 17 nicklas 429   }
7381 22 May 17 nicklas 430
7381 22 May 17 nicklas 431   
5876 15 Nov 11 nicklas 432 }

Generated on Sat Oct  7 02:42:04 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)