www/admin/platforms/variants/variants.js

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
7604 25 Feb 19 nicklas 1 /* $Id $
7604 25 Feb 19 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 3   Copyright (C) 2012 Nicklas Nordborg
7604 25 Feb 19 nicklas 4
7604 25 Feb 19 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7604 25 Feb 19 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
7604 25 Feb 19 nicklas 7
7604 25 Feb 19 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
7604 25 Feb 19 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
7604 25 Feb 19 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
7604 25 Feb 19 nicklas 12
7604 25 Feb 19 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
7604 25 Feb 19 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
7604 25 Feb 19 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
7604 25 Feb 19 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
7604 25 Feb 19 nicklas 17
7604 25 Feb 19 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
7604 25 Feb 19 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 21
7604 25 Feb 19 nicklas 22   @author Nicklas
7604 25 Feb 19 nicklas 23 */
7604 25 Feb 19 nicklas 24 'use strict';
7604 25 Feb 19 nicklas 25
7604 25 Feb 19 nicklas 26 var Variants = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 27 {
7604 25 Feb 19 nicklas 28   var variants = {};
7604 25 Feb 19 nicklas 29   
7604 25 Feb 19 nicklas 30   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 31     Initialize the page.
7604 25 Feb 19 nicklas 32   */
7604 25 Feb 19 nicklas 33   variants.initPage = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 34   {
7604 25 Feb 19 nicklas 35     var pageId = Doc.getPageId();    
7604 25 Feb 19 nicklas 36     if (pageId == 'edit-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 37     {
7604 25 Feb 19 nicklas 38       Buttons.addClickHandler('btnSave', variants.save);
7604 25 Feb 19 nicklas 39       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 40       
7604 25 Feb 19 nicklas 41       // Tab validation
7604 25 Feb 19 nicklas 42       TabControl.addTabValidator('settings.info', variants.validateVariant);
7604 25 Feb 19 nicklas 43       
7604 25 Feb 19 nicklas 44       // File-only
7604 25 Feb 19 nicklas 45       if (Doc.element('fileOnlyNo'))
7604 25 Feb 19 nicklas 46       {
7604 25 Feb 19 nicklas 47         Events.addEventHandler('fileOnlyNo', 'click', variants.fileOnlyOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 48         Events.addEventHandler('fileOnlyYes', 'click', variants.fileOnlyOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 49         variants.fileOnlyOnClick();
7604 25 Feb 19 nicklas 50         
7604 25 Feb 19 nicklas 51         Events.addEventHandler('channels', 'keypress', Events.integerOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 52       }
7604 25 Feb 19 nicklas 53       
7604 25 Feb 19 nicklas 54       // Data file types
7604 25 Feb 19 nicklas 55       Events.addEventHandler('fileTypes', 'change', variants.fileTypesOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 56       Buttons.addClickHandler('btnAddFileTypes', variants.addFileTypesOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 57       Events.addEventHandler('btnAddFileTypes', 'base-selected', variants.fileTypeSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 58       Buttons.addClickHandler('required', variants.requiredOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 59       Buttons.addClickHandler('multiple', variants.requiredOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 60
7604 25 Feb 19 nicklas 61     }
7604 25 Feb 19 nicklas 62     else if (pageId == 'view-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 63     {
7604 25 Feb 19 nicklas 64       var itemId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 65       var attributes = {'item-type': 'PLATFORMVARIANT', 'item-id': itemId};
7604 25 Feb 19 nicklas 66       
7604 25 Feb 19 nicklas 67       Buttons.addClickHandler('btnEdit', Buttons.editItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 68       Buttons.addClickHandler('btnDelete', Buttons.deleteItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 69       Buttons.addClickHandler('btnRestore', Buttons.restoreItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 70       Buttons.addClickHandler('btnUsingItems', Buttons.showUsingItems, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 71       Buttons.addClickHandler('btnDeletePermanently', Buttons.deleteItemPermanently, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 72       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 73       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 74       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runPlugin, attributes);  
7604 25 Feb 19 nicklas 75       Buttons.addClickHandler('btnNewVariant', platforms.newVariant, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 76
7604 25 Feb 19 nicklas 77     }
7604 25 Feb 19 nicklas 78     else if (pageId == 'list-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 79     {
7604 25 Feb 19 nicklas 80       var attributes = {'item-type': 'PLATFORMVARIANT'};
7604 25 Feb 19 nicklas 81       var tableAttributes = {'table-id': 'variants'};
7604 25 Feb 19 nicklas 82       Buttons.addClickHandler('btnNewItem', Buttons.newItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 83       Buttons.addClickHandler('btnDeleteItems', Buttons.deleteItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 84       Buttons.addClickHandler('btnRestoreItems', Buttons.restoreItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 85       Buttons.addClickHandler('btnColumns', Buttons.configureColumns, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 86       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 87       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 88       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 89       
7604 25 Feb 19 nicklas 90       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 91       Buttons.addClickHandler('btnOk', Buttons.returnSelected, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 92
7604 25 Feb 19 nicklas 93       TabControl.addTabActivateListener('main.properties', variants.viewPlatformProperties);
7604 25 Feb 19 nicklas 94     }
7604 25 Feb 19 nicklas 95   }
7604 25 Feb 19 nicklas 96   
7604 25 Feb 19 nicklas 97   variants.viewPlatformProperties = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 98   {
7604 25 Feb 19 nicklas 99     var frm = document.forms['variants'];
7604 25 Feb 19 nicklas 100     var platformId = frm.platform_id.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 101     var url = '../index.jsp?ID='+App.getSessionId();
7604 25 Feb 19 nicklas 102     url += '&cmd=ViewItem&item_id='+platformId;
7604 25 Feb 19 nicklas 103     url += '&tab=properties';
7604 25 Feb 19 nicklas 104     location.replace(url);
7604 25 Feb 19 nicklas 105   }
7604 25 Feb 19 nicklas 106   
7604 25 Feb 19 nicklas 107   variants.validateVariant = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 108   {
7604 25 Feb 19 nicklas 109     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 110     if (Strings.trim(frm.name.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 111     {
7604 25 Feb 19 nicklas 112       Forms.showNotification(frm.name, 'You must enter a name');
7604 25 Feb 19 nicklas 113       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 114     }
7604 25 Feb 19 nicklas 115     if (frm.externalId)
7604 25 Feb 19 nicklas 116     {
7604 25 Feb 19 nicklas 117       var fileOnly = Forms.getCheckedRadio(frm.fileOnly).value == '1';
7604 25 Feb 19 nicklas 118       if (Strings.trim(frm.externalId.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 119       {
7604 25 Feb 19 nicklas 120         Forms.showNotification(frm.externalId, 'You must enter an external ID');
7604 25 Feb 19 nicklas 121         return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 122       }
7604 25 Feb 19 nicklas 123       else if (fileOnly)
7604 25 Feb 19 nicklas 124       {
7604 25 Feb 19 nicklas 125         if (!Numbers.isInteger(frm.channels.value))
7604 25 Feb 19 nicklas 126         {
7604 25 Feb 19 nicklas 127           Forms.showNotification(frm.channels, 'You must enter the number of channels');
7604 25 Feb 19 nicklas 128           return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 129         }
7604 25 Feb 19 nicklas 130         if (parseInt(frm.channels.value) <= 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 131         {
7604 25 Feb 19 nicklas 132           Forms.showNotification(frm.channels, 'The number of channels must be &gt;0');
7604 25 Feb 19 nicklas 133           return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 134         }
7604 25 Feb 19 nicklas 135       }
7604 25 Feb 19 nicklas 136     }
7604 25 Feb 19 nicklas 137     return true;
7604 25 Feb 19 nicklas 138   }
7604 25 Feb 19 nicklas 139
7604 25 Feb 19 nicklas 140   variants.save = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 141   {
7604 25 Feb 19 nicklas 142     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 143     if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
7604 25 Feb 19 nicklas 144     {
7604 25 Feb 19 nicklas 145       Link.exportActions('fileTypes');
7604 25 Feb 19 nicklas 146       frm.submit();
7604 25 Feb 19 nicklas 147     }
7604 25 Feb 19 nicklas 148   }
7604 25 Feb 19 nicklas 149
7604 25 Feb 19 nicklas 150   variants.fileOnlyOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 151   {
7604 25 Feb 19 nicklas 152     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 153     var fileOnly = Forms.getCheckedRadio(frm.fileOnly).value == '1';
7604 25 Feb 19 nicklas 154     frm.rawdatatype.disabled = fileOnly;
7604 25 Feb 19 nicklas 155     frm.channels.disabled = !fileOnly;
7604 25 Feb 19 nicklas 156     Doc.addOrRemoveClass(frm.rawdatatype, 'required', !frm.rawdatatype.disabled);
7604 25 Feb 19 nicklas 157     Doc.addOrRemoveClass(frm.channels, 'required', !frm.channels.disabled);
7604 25 Feb 19 nicklas 158   }
7604 25 Feb 19 nicklas 159   
7604 25 Feb 19 nicklas 160   variants.fileTypesOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 161   {
7604 25 Feb 19 nicklas 162     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 163     var item = frm.fileTypes[frm.fileTypes.selectedIndex].item;
7604 25 Feb 19 nicklas 164     if (item && item.id)
7604 25 Feb 19 nicklas 165     {
7604 25 Feb 19 nicklas 166       frm.required.checked = (item.value & 1) > 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 167       frm.multiple.checked = (item.value & 2) > 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 168     }
7604 25 Feb 19 nicklas 169     else
7604 25 Feb 19 nicklas 170     {
7604 25 Feb 19 nicklas 171       frm.required.checked = false;
7604 25 Feb 19 nicklas 172       frm.multiple.checked = false;
7604 25 Feb 19 nicklas 173     }
7604 25 Feb 19 nicklas 174   }
7604 25 Feb 19 nicklas 175
7604 25 Feb 19 nicklas 176   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 177     Open a popup dialog for selecting related file types.
7604 25 Feb 19 nicklas 178   */
7604 25 Feb 19 nicklas 179   variants.addFileTypesOnClick = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 180   {
7604 25 Feb 19 nicklas 181     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 182     var currentFileTypes = Link.getIdsInList(frm.fileTypes, 'DATAFILETYPE');
7604 25 Feb 19 nicklas 183     var url = "&exclude="+currentFileTypes.join(',');
7604 25 Feb 19 nicklas 184     Dialogs.selectItem('DATAFILETYPE', event.currentTarget.id, 1, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 185   }
7604 25 Feb 19 nicklas 186   
7604 25 Feb 19 nicklas 187   variants.fileTypeSelected = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 188   {
7604 25 Feb 19 nicklas 189     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 190     var required = frm.required.checked;
7604 25 Feb 19 nicklas 191     var multiple = frm.multiple.checked;
7604 25 Feb 19 nicklas 192     
7604 25 Feb 19 nicklas 193     var detail = event.detail;
7604 25 Feb 19 nicklas 194     var newValue = 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 195     if (required) newValue += 1;
7604 25 Feb 19 nicklas 196     if (multiple) newValue += 2;
7604 25 Feb 19 nicklas 197     
7604 25 Feb 19 nicklas 198     detail.name += required ? ' [×]' : ' [-]';
7604 25 Feb 19 nicklas 199     detail.value = newValue;
7604 25 Feb 19 nicklas 200     
7604 25 Feb 19 nicklas 201     Link.addItem('fileTypes', 'DATAFILETYPE', event.detail);
7604 25 Feb 19 nicklas 202   }
7604 25 Feb 19 nicklas 203
7604 25 Feb 19 nicklas 204   variants.requiredOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 205   {
7604 25 Feb 19 nicklas 206     var frm = document.forms['variant'];
7604 25 Feb 19 nicklas 207     var required = frm.required.checked;
7604 25 Feb 19 nicklas 208     var multiple = frm.multiple.checked;
7604 25 Feb 19 nicklas 209     var newValue = 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 210     if (required) newValue += 1;
7604 25 Feb 19 nicklas 211     if (multiple) newValue += 2;
7604 25 Feb 19 nicklas 212     for (var i = 0; i < frm.fileTypes.length; i++)  // >
7604 25 Feb 19 nicklas 213     {
7604 25 Feb 19 nicklas 214       var option = frm.fileTypes[i];
7604 25 Feb 19 nicklas 215       if (option.selected && option.item.id)
7604 25 Feb 19 nicklas 216       {
7604 25 Feb 19 nicklas 217         option.item.value = newValue;
7604 25 Feb 19 nicklas 218         var text = option.text.replace(/\[.*\]/, '['+(required ? '×' : '-') +']');
7604 25 Feb 19 nicklas 219         option.text = text; 
7604 25 Feb 19 nicklas 220       }
7604 25 Feb 19 nicklas 221     }
7604 25 Feb 19 nicklas 222   }
7604 25 Feb 19 nicklas 223
7604 25 Feb 19 nicklas 224
7604 25 Feb 19 nicklas 225   return variants;
7604 25 Feb 19 nicklas 226 }();
7604 25 Feb 19 nicklas 227
7604 25 Feb 19 nicklas 228 Doc.onLoad(Variants.initPage);