www/biomaterials/biosources/view_biosource.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1866 30 Jan 06 nicklas 1 <%-- $Id$
1866 30 Jan 06 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
4889 06 Apr 09 nicklas 3   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
3675 16 Aug 07 jari 4   Copyright (C) 2007 Martin Svensson
1866 30 Jan 06 nicklas 5
2304 22 May 06 jari 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 7   Available at http://base.thep.lu.se/
1866 30 Jan 06 nicklas 8
1866 30 Jan 06 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1866 30 Jan 06 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
1866 30 Jan 06 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
1866 30 Jan 06 nicklas 13
1866 30 Jan 06 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1866 30 Jan 06 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1866 30 Jan 06 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1866 30 Jan 06 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
1866 30 Jan 06 nicklas 18
1866 30 Jan 06 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
4510 11 Sep 08 jari 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
1866 30 Jan 06 nicklas 21   ------------------------------------------------------------------
1866 30 Jan 06 nicklas 22
1866 30 Jan 06 nicklas 23   @author Nicklas
1866 30 Jan 06 nicklas 24   @version 2.0
1866 30 Jan 06 nicklas 25 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 26 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
1866 30 Jan 06 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1866 30 Jan 06 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1866 30 Jan 06 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
3547 03 Jul 07 martin 30   import="net.sf.basedb.core.Group"
1866 30 Jan 06 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.Item"
1866 30 Jan 06 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
3547 03 Jul 07 martin 33   import="net.sf.basedb.core.Nameable"
1866 30 Jan 06 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.Permission"
3547 03 Jul 07 martin 35   import="net.sf.basedb.core.MultiPermissions"
1866 30 Jan 06 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.BioSource"
2404 21 Jun 06 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.Sample"
1866 30 Jan 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.User"
2404 21 Jun 06 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.Include"
1866 30 Jan 06 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1866 30 Jan 06 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
1866 30 Jan 06 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
1866 30 Jan 06 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
1866 30 Jan 06 nicklas 44   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
3547 03 Jul 07 martin 45   import="net.sf.basedb.core.Project"
2404 21 Jun 06 nicklas 46   import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
2404 21 Jun 06 nicklas 47   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
1866 30 Jan 06 nicklas 48   import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
3547 03 Jul 07 martin 49   import="net.sf.basedb.core.SharedItem"
1866 30 Jan 06 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
5048 17 Aug 09 nicklas 51   import="net.sf.basedb.clients.web.ChangeHistoryUtil"
2386 15 Jun 06 martin 52   import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
1866 30 Jan 06 nicklas 53   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
2753 20 Oct 06 nicklas 54   import="net.sf.basedb.util.Values"
3547 03 Jul 07 martin 55   import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
3547 03 Jul 07 martin 56   import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
4698 10 Dec 08 nicklas 57   import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
4698 10 Dec 08 nicklas 58   import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
4882 03 Apr 09 nicklas 59   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
4882 03 Apr 09 nicklas 60   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
4882 03 Apr 09 nicklas 61   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
7604 25 Feb 19 nicklas 62   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
4882 03 Apr 09 nicklas 63   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
4882 03 Apr 09 nicklas 64   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
3547 03 Jul 07 martin 65   import="java.util.Collections"
1866 30 Jan 06 nicklas 66   import="java.util.Date"
1866 30 Jan 06 nicklas 67   import="java.util.Map"
1866 30 Jan 06 nicklas 68   import="java.util.Set"
1866 30 Jan 06 nicklas 69   import="java.util.List"
1866 30 Jan 06 nicklas 70 %>
1866 30 Jan 06 nicklas 71 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1866 30 Jan 06 nicklas 72 <%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
1866 30 Jan 06 nicklas 73 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
1866 30 Jan 06 nicklas 74 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
4882 03 Apr 09 nicklas 75 <%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
1866 30 Jan 06 nicklas 76 <%!
1866 30 Jan 06 nicklas 77   private static final Item itemType = Item.BIOSOURCE;
1866 30 Jan 06 nicklas 78   private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.ITEM);
1866 30 Jan 06 nicklas 79 %>
1866 30 Jan 06 nicklas 80 <%
1866 30 Jan 06 nicklas 81 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
1866 30 Jan 06 nicklas 82 final String ID = sc.getId();
1866 30 Jan 06 nicklas 83 final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
1866 30 Jan 06 nicklas 84 final int itemId = cc.getId();
6261 27 Mar 13 nicklas 85 final String tab = Values.getStringOrNull(request.getParameter("tab"));
1866 30 Jan 06 nicklas 86 final float scale = Base.getScale(sc);
7954 12 May 21 nicklas 87 final DbControl dc = sc.newDbControl(":View "+itemType);
1866 30 Jan 06 nicklas 88 try
1866 30 Jan 06 nicklas 89 {
4698 10 Dec 08 nicklas 90   Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
1866 30 Jan 06 nicklas 91   Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
1866 30 Jan 06 nicklas 92
1866 30 Jan 06 nicklas 93   String title = null;
1866 30 Jan 06 nicklas 94   BioSource bioSource = BioSource.getById(dc, itemId);
1866 30 Jan 06 nicklas 95   
2404 21 Jun 06 nicklas 96   final boolean usePermission = bioSource.hasPermission(Permission.USE);
1866 30 Jan 06 nicklas 97   final boolean writePermission = bioSource.hasPermission(Permission.WRITE);
1866 30 Jan 06 nicklas 98   final boolean deletePermission = bioSource.hasPermission(Permission.DELETE);
1866 30 Jan 06 nicklas 99   final boolean sharePermission = bioSource.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
2916 15 Nov 06 nicklas 100   final boolean setOwnerPermission = bioSource.hasPermission(Permission.SET_OWNER);
4003 26 Nov 07 nicklas 101   final boolean isRemoved = bioSource.isRemoved();
4003 26 Nov 07 nicklas 102   final boolean isUsed = isRemoved && bioSource.isUsed();
4003 26 Nov 07 nicklas 103   final boolean deletePermanentlyPermission = deletePermission && !isUsed;
2916 15 Nov 06 nicklas 104   final boolean isOwner = bioSource.isOwner();
4882 03 Apr 09 nicklas 105   JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, bioSource);
7604 25 Feb 19 nicklas 106   ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
1866 30 Jan 06 nicklas 107   %>
6244 25 Feb 13 nicklas 108   <base:page title="<%=title%>" id="view-page">
6245 25 Feb 13 nicklas 109   <base:head scripts="table.js,tabcontrol-2.js,~biosources.js" styles="table.css,toolbar.css,headertabcontrol.css,path.css">
4882 03 Apr 09 nicklas 110     <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
4882 03 Apr 09 nicklas 111     <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
1866 30 Jan 06 nicklas 112   </base:head>
1866 30 Jan 06 nicklas 113   <base:body>
5918 21 Dec 11 nicklas 114     <p:path><p:pathelement 
5918 21 Dec 11 nicklas 115       title="Biosources" href="<%="index.jsp?ID="+ID%>" /><p:pathelement 
5918 21 Dec 11 nicklas 116       title="<%=HTML.encodeTags(bioSource.getName())%>" /></p:path>
6245 25 Feb 13 nicklas 117     <div id="page-data" data-item-id="<%=itemId%>"></div>
1866 30 Jan 06 nicklas 118     
6244 25 Feb 13 nicklas 119     <t:tabcontrol id="main" subclass="content mastertabcontrol" active="<%=tab%>">
1866 30 Jan 06 nicklas 120     <t:tab id="properties" title="Properties">
1866 30 Jan 06 nicklas 121
5918 21 Dec 11 nicklas 122       <div>
5918 21 Dec 11 nicklas 123       <table class="fullform bottomborder">
5918 21 Dec 11 nicklas 124       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 125         <th class="itemstatus">
4003 26 Nov 07 nicklas 126           <base:icon 
5946 03 Feb 12 nicklas 127             image="shared.png" 
5918 21 Dec 11 nicklas 128             visible="<%=bioSource.isShared()%>"
5918 21 Dec 11 nicklas 129             tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects"
5918 21 Dec 11 nicklas 130           />
5918 21 Dec 11 nicklas 131           <base:icon 
6245 25 Feb 13 nicklas 132             id="btnDeletePermanently"
5946 03 Feb 12 nicklas 133             image="deleted.png"
5918 21 Dec 11 nicklas 134             tooltip="This item has been flagged for deletion. Click to delete it now."
5918 21 Dec 11 nicklas 135             enabled="<%=deletePermanentlyPermission %>"
5918 21 Dec 11 nicklas 136             visible="<%=isRemoved%>" 
5918 21 Dec 11 nicklas 137           />
6245 25 Feb 13 nicklas 138           <base:icon 
6245 25 Feb 13 nicklas 139             id="btnUsingItems"
6245 25 Feb 13 nicklas 140             image="used.png" 
5918 21 Dec 11 nicklas 141             tooltip="This item is used by other items and can't be permanently deleted. Show the items that are using this one"
5918 21 Dec 11 nicklas 142             visible="<%=isRemoved && isUsed%>" />
5918 21 Dec 11 nicklas 143         </th>
5918 21 Dec 11 nicklas 144         <td style="padding: 0px;">
6605 18 Nov 14 nicklas 145           <tbl:toolbar subclass="bottomborder bg-filled-50">
5935 26 Jan 12 nicklas 146             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 147               id="btnEdit"
5942 01 Feb 12 nicklas 148               disabled="<%=!writePermission%>" 
5945 02 Feb 12 nicklas 149               image="edit.png" 
5935 26 Jan 12 nicklas 150               title="Edit&hellip;" 
5935 26 Jan 12 nicklas 151               tooltip="<%=writePermission ? "Edit this biosource" : "You do not have permission to edit this biosource"%>" 
5918 21 Dec 11 nicklas 152             />
5935 26 Jan 12 nicklas 153             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 154               id="btnDelete"
5942 01 Feb 12 nicklas 155               disabled="<%=!deletePermission%>" 
5946 03 Feb 12 nicklas 156               image="delete.png" 
5935 26 Jan 12 nicklas 157               title="Delete"
5935 26 Jan 12 nicklas 158               visible="<%=!bioSource.isRemoved()%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 159               tooltip="<%=deletePermission ? "Delete this biosource" : "You do not have permission to delete this biosource"%>" 
5935 26 Jan 12 nicklas 160             />
5935 26 Jan 12 nicklas 161             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 162               id="btnRestore"
5942 01 Feb 12 nicklas 163               disabled="<%=!writePermission%>" 
5946 03 Feb 12 nicklas 164               image="restore.png" 
5935 26 Jan 12 nicklas 165               title="Restore"
5935 26 Jan 12 nicklas 166               visible="<%=bioSource.isRemoved()%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 167               tooltip="<%=writePermission ? "Restore this biosource" : "You do not have permission to restore this biosource"%>" 
5935 26 Jan 12 nicklas 168             />
5935 26 Jan 12 nicklas 169             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 170               id="btnShare"
5942 01 Feb 12 nicklas 171               disabled="<%=!sharePermission%>"
5945 02 Feb 12 nicklas 172               image="share.png"
5935 26 Jan 12 nicklas 173               title="Share&hellip;" 
5935 26 Jan 12 nicklas 174               tooltip="<%=sharePermission ? "Share this biosource to other user, groups and projects" : "You do not have permission to share this biosource"%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 175             />
5935 26 Jan 12 nicklas 176             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 177               id="btnSetOwner"
5942 01 Feb 12 nicklas 178               disabled="<%=!setOwnerPermission%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 179               image="take_ownership.png"
5935 26 Jan 12 nicklas 180               title="Set owner&hellip;"
5935 26 Jan 12 nicklas 181               tooltip="<%=setOwnerPermission ? "Change owner of this item" : "You do not have permission to change ownership of this item"%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 182             />
5935 26 Jan 12 nicklas 183             <tbl:button
6245 25 Feb 13 nicklas 184               id="btnNewSample"
5935 26 Jan 12 nicklas 185               image="add.png"
5935 26 Jan 12 nicklas 186               title="New sample&hellip;"
5935 26 Jan 12 nicklas 187               tooltip="Create a new sample from this biosource"
5935 26 Jan 12 nicklas 188               visible="<%=sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.SAMPLE) && usePermission%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 189             />
5935 26 Jan 12 nicklas 190             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 191               id="btnImport"
5946 03 Feb 12 nicklas 192               image="import.png" 
6245 25 Feb 13 nicklas 193               data-plugin-type="IMPORT"  
5935 26 Jan 12 nicklas 194               title="Import&hellip;" 
5935 26 Jan 12 nicklas 195               tooltip="Import data" 
5935 26 Jan 12 nicklas 196               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 197             />
5935 26 Jan 12 nicklas 198             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 199               id="btnExport"
6245 25 Feb 13 nicklas 200               image="export.png"
6245 25 Feb 13 nicklas 201               data-plugin-type="EXPORT" 
5935 26 Jan 12 nicklas 202               title="Export&hellip;" 
5935 26 Jan 12 nicklas 203               tooltip="Export data" 
5935 26 Jan 12 nicklas 204               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 205             />
5935 26 Jan 12 nicklas 206             <tbl:button 
6245 25 Feb 13 nicklas 207               id="btnRunPlugin"
6245 25 Feb 13 nicklas 208               image="runplugin.png"  
6245 25 Feb 13 nicklas 209               data-plugin-type="OTHER" 
5935 26 Jan 12 nicklas 210               title="Run plugin&hellip;" 
5935 26 Jan 12 nicklas 211               tooltip="Run a plugin" 
5935 26 Jan 12 nicklas 212               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 213             />
5935 26 Jan 12 nicklas 214             <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
7604 25 Feb 19 nicklas 215               wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
5935 26 Jan 12 nicklas 216             <tbl:button
5935 26 Jan 12 nicklas 217               image="help.png"
6245 25 Feb 13 nicklas 218               subclass="auto-init"
6245 25 Feb 13 nicklas 219               data-auto-init="help"
6245 25 Feb 13 nicklas 220               data-help-id="biosource.view.properties"
5935 26 Jan 12 nicklas 221               title="Help&hellip;"
5935 26 Jan 12 nicklas 222               tooltip="Get help about this page"
5935 26 Jan 12 nicklas 223               />
5935 26 Jan 12 nicklas 224             </tbl:toolbar>
5918 21 Dec 11 nicklas 225         </td>
5918 21 Dec 11 nicklas 226       </tr>
1866 30 Jan 06 nicklas 227       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 228         <th>Name</th>
1866 30 Jan 06 nicklas 229         <td><%=HTML.encodeTags(bioSource.getName())%></td>
1866 30 Jan 06 nicklas 230       </tr>
1866 30 Jan 06 nicklas 231       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 232         <th>Type</th>
5643 26 May 11 nicklas 233         <td><base:propertyvalue item="<%=bioSource%>" property="itemSubtype" /></td>
5643 26 May 11 nicklas 234       </tr>
5643 26 May 11 nicklas 235       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 236         <th>Registered</th>
4698 10 Dec 08 nicklas 237         <td><%=dateFormatter.format(bioSource.getEntryDate())%></td>
4698 10 Dec 08 nicklas 238       </tr>
4698 10 Dec 08 nicklas 239       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 240         <th>External ID</th>
1866 30 Jan 06 nicklas 241         <td><%=HTML.encodeTags(bioSource.getExternalId())%></td>
1866 30 Jan 06 nicklas 242       </tr>
1866 30 Jan 06 nicklas 243       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 244         <th>Owner</th>
2414 22 Jun 06 nicklas 245         <td><base:propertyvalue item="<%=bioSource%>" property="owner" /></td>
1866 30 Jan 06 nicklas 246       </tr>
1866 30 Jan 06 nicklas 247       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 248         <th>Permissions</th>
5918 21 Dec 11 nicklas 249         <td><%=PermissionUtil.getFullPermissionNames(bioSource)%></td>
5918 21 Dec 11 nicklas 250       </tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 251       <tr>
5918 21 Dec 11 nicklas 252         <th>Description</th>
1866 30 Jan 06 nicklas 253         <td><%=HTML.niceFormat(bioSource.getDescription())%></td>
1866 30 Jan 06 nicklas 254       </tr>
1866 30 Jan 06 nicklas 255       </table>
5918 21 Dec 11 nicklas 256       </div>
2404 21 Jun 06 nicklas 257       <%
2404 21 Jun 06 nicklas 258       ItemQuery<Sample> sampleQuery = bioSource.getSamples();
3888 29 Oct 07 nicklas 259       sampleQuery.include(Include.ALL);
2404 21 Jun 06 nicklas 260       sampleQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
2404 21 Jun 06 nicklas 261       ItemResultList<Sample> samples = sampleQuery.list(dc);
5935 26 Jan 12 nicklas 262       %>
5935 26 Jan 12 nicklas 263       <base:section 
5935 26 Jan 12 nicklas 264         id="sampleSection" 
5935 26 Jan 12 nicklas 265         title="<%="Child samples (" + samples.size() + ")"%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 266         context="<%=cc%>"
5935 26 Jan 12 nicklas 267         >
2404 21 Jun 06 nicklas 268         <%
5935 26 Jan 12 nicklas 269         if (samples.size() == 0)
5935 26 Jan 12 nicklas 270         {
5935 26 Jan 12 nicklas 271           %>
5935 26 Jan 12 nicklas 272           <div class="messagecontainer note">
5935 26 Jan 12 nicklas 273           No samples have been created from this biosource
5935 26 Jan 12 nicklas 274           (or, you don't have permission to view them).
5935 26 Jan 12 nicklas 275           </div>
5935 26 Jan 12 nicklas 276           <%
5935 26 Jan 12 nicklas 277         }
5935 26 Jan 12 nicklas 278         else
5935 26 Jan 12 nicklas 279         {
5935 26 Jan 12 nicklas 280           %>
5044 11 Aug 09 martin 281           <tbl:table
5044 11 Aug 09 martin 282             id="samples"
5935 26 Jan 12 nicklas 283             
5044 11 Aug 09 martin 284             columns="all"
5044 11 Aug 09 martin 285             >
3547 03 Jul 07 martin 286           <tbl:columndef 
3547 03 Jul 07 martin 287             id="name"
3547 03 Jul 07 martin 288             title="Name"
3547 03 Jul 07 martin 289           />
3547 03 Jul 07 martin 290           <tbl:columndef 
5663 22 Jun 11 nicklas 291             id="type"
5663 22 Jun 11 nicklas 292             title="Type"
5663 22 Jun 11 nicklas 293           />
5663 22 Jun 11 nicklas 294           <tbl:columndef 
5044 11 Aug 09 martin 295             id="description"
5044 11 Aug 09 martin 296             title="Description"
3547 03 Jul 07 martin 297           />
3547 03 Jul 07 martin 298           <tbl:data>
5949 08 Feb 12 nicklas 299             <tbl:headers>
5949 08 Feb 12 nicklas 300               <tbl:headerrow>
5949 08 Feb 12 nicklas 301                 <tbl:columnheaders />
5949 08 Feb 12 nicklas 302               </tbl:headerrow>
5949 08 Feb 12 nicklas 303             </tbl:headers>
3547 03 Jul 07 martin 304             <tbl:rows>
3547 03 Jul 07 martin 305             <%
5044 11 Aug 09 martin 306             for (Sample item : samples)
3547 03 Jul 07 martin 307             {
5044 11 Aug 09 martin 308               %>
3547 03 Jul 07 martin 309               <tbl:row>
3888 29 Oct 07 nicklas 310                 <tbl:cell column="name"><base:icon 
5946 03 Feb 12 nicklas 311                     image="deleted.png" 
5044 11 Aug 09 martin 312                     tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
5044 11 Aug 09 martin 313                     visible="<%=item.isRemoved()%>"
5044 11 Aug 09 martin 314                   /><%=Base.getLinkedName(ID, item, false, true)%></tbl:cell>
5663 22 Jun 11 nicklas 315                   <tbl:cell column="type"><base:propertyvalue item="<%=item%>" property="itemSubtype" /></tbl:cell>
5044 11 Aug 09 martin 316                 <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
3547 03 Jul 07 martin 317               </tbl:row>
3547 03 Jul 07 martin 318               <%
3547 03 Jul 07 martin 319             }
3547 03 Jul 07 martin 320             %>
3547 03 Jul 07 martin 321             </tbl:rows>
3547 03 Jul 07 martin 322           </tbl:data>
5044 11 Aug 09 martin 323           </tbl:table>
5935 26 Jan 12 nicklas 324           <%
5935 26 Jan 12 nicklas 325         }      
5935 26 Jan 12 nicklas 326         %>
5935 26 Jan 12 nicklas 327       </base:section>
5496 17 Nov 10 nicklas 328       <jsp:include page="../../common/anytoany/list_anytoany.jsp">
5496 17 Nov 10 nicklas 329         <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
5496 17 Nov 10 nicklas 330         <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
5496 17 Nov 10 nicklas 331         <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
5496 17 Nov 10 nicklas 332         <jsp:param name="title" value="Other items related to this biosource" />
5496 17 Nov 10 nicklas 333       </jsp:include>
5044 11 Aug 09 martin 334       
7813 19 May 20 nicklas 335       <jsp:include page="../../common/itemlists/list_membership.jsp">
7813 19 May 20 nicklas 336         <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
7813 19 May 20 nicklas 337         <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
7813 19 May 20 nicklas 338         <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
7813 19 May 20 nicklas 339         <jsp:param name="title" value="Item lists where this biosource is a member" />
7813 19 May 20 nicklas 340       </jsp:include>
7813 19 May 20 nicklas 341       
5935 26 Jan 12 nicklas 342       <jsp:include page="../../common/share/list_share.jsp">
5935 26 Jan 12 nicklas 343         <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
5935 26 Jan 12 nicklas 344         <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
5935 26 Jan 12 nicklas 345         <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
5935 26 Jan 12 nicklas 346         <jsp:param name="title" value="Shared to" />
5935 26 Jan 12 nicklas 347       </jsp:include>
1866 30 Jan 06 nicklas 348       </t:tab>
1866 30 Jan 06 nicklas 349       
5935 26 Jan 12 nicklas 350       <t:tab id="annotations" title="Annotations" 
5935 26 Jan 12 nicklas 351         tooltip="View annotation values" clazz="white">
6255 22 Mar 13 nicklas 352         <jsp:include page="../../common/annotations/list_frameset.jsp">
1866 30 Jan 06 nicklas 353           <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
1866 30 Jan 06 nicklas 354           <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
1866 30 Jan 06 nicklas 355           <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
1866 30 Jan 06 nicklas 356         </jsp:include>
1866 30 Jan 06 nicklas 357       </t:tab>
4746 10 Feb 09 nicklas 358       <t:tab id="overview" title="Overview" 
6245 25 Feb 13 nicklas 359         tooltip="Display a tree overview of related items">
6242 25 Feb 13 nicklas 360         <jsp:include page="../../common/overview/overview.jsp">
6242 25 Feb 13 nicklas 361           <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
6242 25 Feb 13 nicklas 362           <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
6242 25 Feb 13 nicklas 363           <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
6242 25 Feb 13 nicklas 364         </jsp:include>
4746 10 Feb 09 nicklas 365       </t:tab>      
7166 07 Jun 16 nicklas 366       <t:tab id="history" title="History"
7166 07 Jun 16 nicklas 367         tooltip="Displays a log with the history of this item"
6245 25 Feb 13 nicklas 368         visible="<%=ChangeHistoryUtil.showChangeHistoryTab(sc)%>">
6244 25 Feb 13 nicklas 369         <jsp:include page="../../common/history/frameset.jsp">
6244 25 Feb 13 nicklas 370           <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
6244 25 Feb 13 nicklas 371           <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
6244 25 Feb 13 nicklas 372           <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
6244 25 Feb 13 nicklas 373         </jsp:include>
5048 17 Aug 09 nicklas 374       </t:tab>      
1866 30 Jan 06 nicklas 375       </t:tabcontrol>
1866 30 Jan 06 nicklas 376   </base:body>
1866 30 Jan 06 nicklas 377   </base:page>
1866 30 Jan 06 nicklas 378   <%
1866 30 Jan 06 nicklas 379 }
1866 30 Jan 06 nicklas 380 finally
1866 30 Jan 06 nicklas 381 {
1866 30 Jan 06 nicklas 382   if (dc != null) dc.close();
1866 30 Jan 06 nicklas 383 }
1866 30 Jan 06 nicklas 384
1866 30 Jan 06 nicklas 385 %>

Generated on Sat Oct  7 02:44:11 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)