www/common/import/select_plugin.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1730 20 Dec 05 nicklas 1 <%-- $Id$
1730 20 Dec 05 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
4889 06 Apr 09 nicklas 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg
3675 16 Aug 07 jari 5   Copyright (C) 2007 Nicklas Nordborg
1730 20 Dec 05 nicklas 6
2304 22 May 06 jari 7   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 8   Available at http://base.thep.lu.se/
1730 20 Dec 05 nicklas 9
1730 20 Dec 05 nicklas 10   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1730 20 Dec 05 nicklas 11   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 12   as published by the Free Software Foundation; either version 3
1730 20 Dec 05 nicklas 13   of the License, or (at your option) any later version.
1730 20 Dec 05 nicklas 14
1730 20 Dec 05 nicklas 15   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1730 20 Dec 05 nicklas 16   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1730 20 Dec 05 nicklas 17   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1730 20 Dec 05 nicklas 18   GNU General Public License for more details.
1730 20 Dec 05 nicklas 19
1730 20 Dec 05 nicklas 20   You should have received a copy of the GNU General Public License
4510 11 Sep 08 jari 21   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
1730 20 Dec 05 nicklas 22   ------------------------------------------------------------------
1730 20 Dec 05 nicklas 23
1730 20 Dec 05 nicklas 24   @author Nicklas
1730 20 Dec 05 nicklas 25   @version 2.0
1730 20 Dec 05 nicklas 26 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 27 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
1730 20 Dec 05 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1730 20 Dec 05 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1730 20 Dec 05 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Item"
1730 20 Dec 05 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
1730 20 Dec 05 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.PluginConfiguration"
1730 20 Dec 05 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.PluginType"
1730 20 Dec 05 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1730 20 Dec 05 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
1730 20 Dec 05 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.Include"
1787 18 Jan 06 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.Job"
1730 20 Dec 05 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
1730 20 Dec 05 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
1730 20 Dec 05 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
1730 20 Dec 05 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
1730 20 Dec 05 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
1730 20 Dec 05 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
1730 20 Dec 05 nicklas 44   import="net.sf.basedb.core.plugin.InteractivePlugin"
1730 20 Dec 05 nicklas 45   import="net.sf.basedb.core.plugin.AutoDetectingImporter"
1730 20 Dec 05 nicklas 46   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
2753 20 Oct 06 nicklas 47   import="net.sf.basedb.util.Values"
3438 04 Jun 07 nicklas 48   import="net.sf.basedb.util.ContextUtil"
3438 04 Jun 07 nicklas 49   import="net.sf.basedb.util.ContextUtil.ContextResult"
1730 20 Dec 05 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
2430 27 Jun 06 nicklas 51   import="java.util.Set"
1772 16 Jan 06 nicklas 52   import="java.util.Map"
1772 16 Jan 06 nicklas 53   import="java.util.List"
6200 05 Nov 12 nicklas 54   import="org.json.simple.JSONObject"
6200 05 Nov 12 nicklas 55   import="org.json.simple.JSONArray"
1730 20 Dec 05 nicklas 56 %>
1730 20 Dec 05 nicklas 57 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1730 20 Dec 05 nicklas 58 <%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
1730 20 Dec 05 nicklas 59
1730 20 Dec 05 nicklas 60 <%
1730 20 Dec 05 nicklas 61 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
1730 20 Dec 05 nicklas 62 final String ID = sc.getId();
1730 20 Dec 05 nicklas 63 final Item itemType = Item.valueOf(request.getParameter("item_type"));
1945 09 Feb 06 nicklas 64 final String subContext = Values.getString(request.getParameter("subcontext"), "");
1730 20 Dec 05 nicklas 65 final GuiContext.Type contextType = GuiContext.Type.valueOf(request.getParameter("context_type"));
1730 20 Dec 05 nicklas 66 final GuiContext context = new GuiContext(itemType, contextType);
1730 20 Dec 05 nicklas 67 final String title = request.getParameter("title");
1772 16 Jan 06 nicklas 68 final boolean noAutodetect = Values.getBoolean(request.getParameter("noautodetect"));
1772 16 Jan 06 nicklas 69 final String message = request.getParameter("message");
3518 20 Jun 07 nicklas 70 final boolean anotherIsOpen = sc.getSessionSetting("plugin.configure.plugin") != null;
7954 12 May 21 nicklas 71 final DbControl dc = sc.newDbControl(":Import - Select plug-in");
4438 02 Sep 08 nicklas 72 final float scale = Base.getScale(sc);
1730 20 Dec 05 nicklas 73 try
1730 20 Dec 05 nicklas 74 {
1730 20 Dec 05 nicklas 75   final PluginType autoDetectingType = PluginType.getByInterfaceName(dc, AutoDetectingImporter.class.getName());
1730 20 Dec 05 nicklas 76
1787 18 Jan 06 nicklas 77   String jobName = Values.getString(request.getParameter("job_name"), title);
1787 18 Jan 06 nicklas 78   
7605 26 Feb 19 nicklas 79   List<ContextResult> contextResults = sc.getSessionSetting("IMPORTERS");
7605 26 Feb 19 nicklas 80   Set<String> messages = sc.getSessionSetting("MESSAGES");
3438 04 Jun 07 nicklas 81   StringBuilder descriptions = new StringBuilder();
6200 05 Nov 12 nicklas 82   
6200 05 Nov 12 nicklas 83   JSONArray jsonPlugins = new JSONArray();
6200 05 Nov 12 nicklas 84   PluginDefinition lastPlugin = null;
6200 05 Nov 12 nicklas 85   JSONObject jsonPlugin = null;
6200 05 Nov 12 nicklas 86   JSONArray jsonConfigurations = null;
6200 05 Nov 12 nicklas 87   for (ContextResult result : contextResults)
6200 05 Nov 12 nicklas 88   {
6200 05 Nov 12 nicklas 89     if (result.isInContext())
1730 20 Dec 05 nicklas 90     {
6200 05 Nov 12 nicklas 91       PluginDefinition pd = result.getPluginDefinition();
6200 05 Nov 12 nicklas 92       if (!pd.equals(lastPlugin))
3518 20 Jun 07 nicklas 93       {
6200 05 Nov 12 nicklas 94         lastPlugin = pd;
6200 05 Nov 12 nicklas 95         dc.reattachItem(pd, false);
6200 05 Nov 12 nicklas 96         
6200 05 Nov 12 nicklas 97         jsonPlugin = new JSONObject();
6200 05 Nov 12 nicklas 98         jsonConfigurations = new JSONArray();
6200 05 Nov 12 nicklas 99         jsonPlugin.put("id", pd.getId());
6200 05 Nov 12 nicklas 100         jsonPlugin.put("name", pd.getName());
6200 05 Nov 12 nicklas 101         jsonPlugin.put("description", HTML.niceFormat("<b>" + pd.getName() + "</b>\n" + pd.getDescription()));
6200 05 Nov 12 nicklas 102         jsonPlugin.put("autoDetect", !noAutodetect && pd.supports(autoDetectingType));
6200 05 Nov 12 nicklas 103         jsonPlugin.put("supportsConfig", pd.supportsConfigurations());
6200 05 Nov 12 nicklas 104         jsonPlugin.put("requiresConfig", noAutodetect || pd.requiresConfiguration());
6200 05 Nov 12 nicklas 105         jsonPlugin.put("configurations", jsonConfigurations);
6200 05 Nov 12 nicklas 106         jsonPlugins.add(jsonPlugin);
3518 20 Jun 07 nicklas 107       }
6200 05 Nov 12 nicklas 108       PluginConfiguration pc = result.getPluginConfiguration();
6200 05 Nov 12 nicklas 109       if (pc != null)
2677 28 Sep 06 nicklas 110       {
6200 05 Nov 12 nicklas 111         JSONObject jsonConfig = new JSONObject();
6200 05 Nov 12 nicklas 112         jsonConfig.put("id", pc.getId());
6200 05 Nov 12 nicklas 113         jsonConfig.put("name", pc.getName());
6200 05 Nov 12 nicklas 114         jsonConfig.put("description", HTML.niceFormat("<b>" + pc.getName() + "</b>\n" +pc.getDescription()));
6200 05 Nov 12 nicklas 115         jsonConfigurations.add(jsonConfig);
2677 28 Sep 06 nicklas 116       }
3438 04 Jun 07 nicklas 117     }
6200 05 Nov 12 nicklas 118   }
6200 05 Nov 12 nicklas 119   %>
6200 05 Nov 12 nicklas 120   <base:page type="popup" title="<%=title%>">
6200 05 Nov 12 nicklas 121   <base:head scripts="~../plugin/select_plugin.js" />
6200 05 Nov 12 nicklas 122   <base:body>
5910 14 Dec 11 nicklas 123     <h1><%=title%> <base:help helpid="import.selectplugin" /></h1>
6200 05 Nov 12 nicklas 124     <div id="page-data" class="datacontainer" 
6200 05 Nov 12 nicklas 125       data-plugins="<%=HTML.encodeTags(jsonPlugins.toJSONString())%>"
6200 05 Nov 12 nicklas 126       data-another-wizard="<%=anotherIsOpen ? 1 : 0%>"></div>
6200 05 Nov 12 nicklas 127     <form name="plugin" action="index.jsp" method="post">
1730 20 Dec 05 nicklas 128     <input type="hidden" name="ID" value="<%=ID%>">
1730 20 Dec 05 nicklas 129     <input type="hidden" name="cmd" value="RunPlugin">
1730 20 Dec 05 nicklas 130     <input type="hidden" name="item_type" value="<%=itemType.name()%>">
1945 09 Feb 06 nicklas 131     <input type="hidden" name="subcontext" value="<%=subContext%>">
1730 20 Dec 05 nicklas 132     <input type="hidden" name="context_type" value="<%=contextType.name()%>">
1730 20 Dec 05 nicklas 133     <input type="hidden" name="title" value="<%=title%>">
3518 20 Jun 07 nicklas 134     <input type="hidden" name="warnIfOpen" value="1">
5372 24 Jun 10 nicklas 135     <input type="hidden" name="plugindefinition_id" value="">
5372 24 Jun 10 nicklas 136     <input type="hidden" name="pluginconfiguration_id" value="">
1730 20 Dec 05 nicklas 137
5910 14 Dec 11 nicklas 138     <div class="content bottomborder">
6607 19 Nov 14 nicklas 139       <div class="absolutefull bg-filled-100" style="height: 4.5em;">
5910 14 Dec 11 nicklas 140         <table style="height: 100%; margin: auto;"><tr><td>
1772 16 Jan 06 nicklas 141             <%
5910 14 Dec 11 nicklas 142             if (anotherIsOpen)
5910 14 Dec 11 nicklas 143             {
5910 14 Dec 11 nicklas 144               %>
5910 14 Dec 11 nicklas 145               <div class="messagecontainer error" style="margin: 0.2em; padding: 0.2em;">
5910 14 Dec 11 nicklas 146                 Another plug-in configuration wizard is open, or it hasn't properly 
5910 14 Dec 11 nicklas 147                 clean up after itself.<br>
5910 14 Dec 11 nicklas 148                 If you continue unsaved settings in the other wizard is lost.
5910 14 Dec 11 nicklas 149               </div>
5910 14 Dec 11 nicklas 150               <%
5910 14 Dec 11 nicklas 151             }
5910 14 Dec 11 nicklas 152             else
5910 14 Dec 11 nicklas 153             {
5910 14 Dec 11 nicklas 154               %>
5910 14 Dec 11 nicklas 155               <%
5910 14 Dec 11 nicklas 156               if (message != null)
5910 14 Dec 11 nicklas 157               {
5910 14 Dec 11 nicklas 158                 %>
5910 14 Dec 11 nicklas 159                 <%=message%>
5910 14 Dec 11 nicklas 160                 <%
5910 14 Dec 11 nicklas 161               }
5910 14 Dec 11 nicklas 162               else
5910 14 Dec 11 nicklas 163               {
5910 14 Dec 11 nicklas 164                 %>
5910 14 Dec 11 nicklas 165                 Please select a plugin and file format to use.
5910 14 Dec 11 nicklas 166                 <%
5910 14 Dec 11 nicklas 167               }
5910 14 Dec 11 nicklas 168               %>
5910 14 Dec 11 nicklas 169             <%
5910 14 Dec 11 nicklas 170             }
1772 16 Jan 06 nicklas 171           %>
5910 14 Dec 11 nicklas 172         </td></tr></table>
5910 14 Dec 11 nicklas 173       </div>
5910 14 Dec 11 nicklas 174       
5911 15 Dec 11 nicklas 175       <div class="absolutefull topborder" style="top: 4.5em;">
5910 14 Dec 11 nicklas 176         <table class="fullform">
2430 27 Jun 06 nicklas 177         <tr>
5910 14 Dec 11 nicklas 178           <th>Plugin + file format</th>
2430 27 Jun 06 nicklas 179           <td>
6200 05 Nov 12 nicklas 180             <select name="plugins" id="plugins" class="required">
5910 14 Dec 11 nicklas 181             </select>
5910 14 Dec 11 nicklas 182             <%
5910 14 Dec 11 nicklas 183             if (!noAutodetect)
5910 14 Dec 11 nicklas 184             {
5910 14 Dec 11 nicklas 185               %>
5910 14 Dec 11 nicklas 186               × = Supports auto-detection
5910 14 Dec 11 nicklas 187               <%
5910 14 Dec 11 nicklas 188             }
5910 14 Dec 11 nicklas 189             %>
5910 14 Dec 11 nicklas 190           </td>
5910 14 Dec 11 nicklas 191         </tr>
5910 14 Dec 11 nicklas 192         <tr class="dynamic">
5910 14 Dec 11 nicklas 193           <th></th>
5910 14 Dec 11 nicklas 194           <td>
5910 14 Dec 11 nicklas 195             <div id="descriptions" class="messagecontainer help" style="margin-left: 0px;">
2430 27 Jun 06 nicklas 196             </div>
2430 27 Jun 06 nicklas 197           </td>
2430 27 Jun 06 nicklas 198         </tr>
2430 27 Jun 06 nicklas 199         <%
5910 14 Dec 11 nicklas 200         if (messages != null && messages.size() > 0)
5910 14 Dec 11 nicklas 201         {
5910 14 Dec 11 nicklas 202           %>
5910 14 Dec 11 nicklas 203           <tr class="big">
5910 14 Dec 11 nicklas 204             <th></th>
5910 14 Dec 11 nicklas 205             <td>
6200 05 Nov 12 nicklas 206               <base:icon image="bullet.png" id="pluginMessages"
6200 05 Nov 12 nicklas 207                 tooltip="Show/hide the messages from the plugins that couldn't be used"
6200 05 Nov 12 nicklas 208                 >Some plugins couldn't be used</base:icon>
6200 05 Nov 12 nicklas 209               <div id="pluginMessages.content" style="display: none;">
5910 14 Dec 11 nicklas 210               <ul>
5910 14 Dec 11 nicklas 211               <li><%=Values.getString(messages, "<li>", true)%>
5910 14 Dec 11 nicklas 212               </ul>
5910 14 Dec 11 nicklas 213               </div>
5910 14 Dec 11 nicklas 214             </td>
5910 14 Dec 11 nicklas 215           </tr>
5910 14 Dec 11 nicklas 216           <%
5910 14 Dec 11 nicklas 217         }
5910 14 Dec 11 nicklas 218         %>
5910 14 Dec 11 nicklas 219         </table>
2677 28 Sep 06 nicklas 220       </div>
1730 20 Dec 05 nicklas 221     </div>
1730 20 Dec 05 nicklas 222     </form>
1730 20 Dec 05 nicklas 223   
5910 14 Dec 11 nicklas 224     <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
6200 05 Nov 12 nicklas 225       <base:button id="btnNext" title="Next" />
6200 05 Nov 12 nicklas 226       <base:button id="close" title="Cancel" />
5910 14 Dec 11 nicklas 227     </base:buttongroup>
1730 20 Dec 05 nicklas 228   </base:body>
1730 20 Dec 05 nicklas 229   </base:page>
1730 20 Dec 05 nicklas 230   <%
1730 20 Dec 05 nicklas 231 }
1730 20 Dec 05 nicklas 232 finally
1730 20 Dec 05 nicklas 233 {
1730 20 Dec 05 nicklas 234   if (dc != null) dc.close();
1730 20 Dec 05 nicklas 235 }
1730 20 Dec 05 nicklas 236 %>
1730 20 Dec 05 nicklas 237

Generated on Sat Oct  7 02:45:00 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)