www/lims/arraybatches/index.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1666 25 Nov 05 nicklas 1 <%-- $Id$
1666 25 Nov 05 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
5425 23 Sep 10 nicklas 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
1666 25 Nov 05 nicklas 5
2304 22 May 06 jari 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 7   Available at http://base.thep.lu.se/
1666 25 Nov 05 nicklas 8
1666 25 Nov 05 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1666 25 Nov 05 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
1666 25 Nov 05 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
1666 25 Nov 05 nicklas 13
1666 25 Nov 05 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1666 25 Nov 05 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1666 25 Nov 05 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1666 25 Nov 05 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
1666 25 Nov 05 nicklas 18
1666 25 Nov 05 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
4511 11 Sep 08 jari 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
1666 25 Nov 05 nicklas 21   ------------------------------------------------------------------
1666 25 Nov 05 nicklas 22
1666 25 Nov 05 nicklas 23   @author Nicklas
1666 25 Nov 05 nicklas 24   @version 2.0
1666 25 Nov 05 nicklas 25 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 26 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
1666 25 Nov 05 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1666 25 Nov 05 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1666 25 Nov 05 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.Item"
1813 24 Jan 06 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Include"
1666 25 Nov 05 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.ArrayBatch"
1813 24 Jan 06 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.ArrayDesign"
1813 24 Jan 06 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.Protocol"
1813 24 Jan 06 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.Hardware"
1666 25 Nov 05 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1666 25 Nov 05 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
1666 25 Nov 05 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.Permission"
1813 24 Jan 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
1813 24 Jan 06 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.MultiPermissions"
4587 15 Oct 08 martin 40   import="net.sf.basedb.core.OwnedItem"
6695 28 Jan 15 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.AnnotatedItem"
1813 24 Jan 06 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
1813 24 Jan 06 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.ItemAlreadyExistsException"
1813 24 Jan 06 nicklas 44   import="net.sf.basedb.util.RemovableUtil"
1813 24 Jan 06 nicklas 45   import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
2919 15 Nov 06 nicklas 46   import="net.sf.basedb.util.OwnableUtil"
1666 25 Nov 05 nicklas 47   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
1813 24 Jan 06 nicklas 48   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
2753 20 Oct 06 nicklas 49   import="net.sf.basedb.util.Values"
1666 25 Nov 05 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
1813 24 Jan 06 nicklas 51   import="java.util.Enumeration"
5498 17 Nov 10 nicklas 52   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
5498 17 Nov 10 nicklas 53   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
5498 17 Nov 10 nicklas 54   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5498 17 Nov 10 nicklas 55   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
5498 17 Nov 10 nicklas 56   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.EditUtil"
7604 25 Feb 19 nicklas 57   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.OnSaveAction"
5498 17 Nov 10 nicklas 58   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.OnSaveRenderer"
6039 29 Mar 12 nicklas 59   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnExportRenderer"
7604 25 Feb 19 nicklas 60   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
6039 29 Mar 12 nicklas 61   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
1813 24 Jan 06 nicklas 62   import="java.util.Set"
1813 24 Jan 06 nicklas 63   import="java.util.HashSet"
1666 25 Nov 05 nicklas 64   import="java.util.List"
1813 24 Jan 06 nicklas 65   import="java.util.ArrayList"
1813 24 Jan 06 nicklas 66   import="java.util.Collections"
1666 25 Nov 05 nicklas 67 %>
1666 25 Nov 05 nicklas 68 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1666 25 Nov 05 nicklas 69 <%!
2449 29 Jun 06 nicklas 70   private static final ItemContext defaultContext = Base.createDefaultContext("name", "name,arrayDesign,slides,description");
1813 24 Jan 06 nicklas 71   private static final Item itemType = Item.ARRAYBATCH;
1666 25 Nov 05 nicklas 72 %>
1666 25 Nov 05 nicklas 73 <%
1813 24 Jan 06 nicklas 74 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
1666 25 Nov 05 nicklas 75 final String ID = sc.getId();
1813 24 Jan 06 nicklas 76 final String cmd = request.getParameter("cmd");
1813 24 Jan 06 nicklas 77 final String root = request.getContextPath()+"/";
1813 24 Jan 06 nicklas 78 final String mode = request.getParameter("mode");
1813 24 Jan 06 nicklas 79 final String callback = request.getParameter("callback");
1813 24 Jan 06 nicklas 80 final String itemId = request.getParameter("item_id");
1813 24 Jan 06 nicklas 81 final String listPage = "list_batches.jsp?ID="+ID
1813 24 Jan 06 nicklas 82   +(mode == null ? "" : "&mode="+mode)
1813 24 Jan 06 nicklas 83   +(callback == null ? "" : "&callback="+callback)
1813 24 Jan 06 nicklas 84   +(itemId == null ? "" : "&item_id="+itemId);
1813 24 Jan 06 nicklas 85 final String viewPage = "view_batch.jsp?ID="+ID;
1813 24 Jan 06 nicklas 86 final String editPage = "edit_batch.jsp?ID="+ID;
1666 25 Nov 05 nicklas 87
1813 24 Jan 06 nicklas 88 String forward = null;
1813 24 Jan 06 nicklas 89 String redirect = null;
1813 24 Jan 06 nicklas 90 String message = null;
1813 24 Jan 06 nicklas 91 DbControl dc = null;
1813 24 Jan 06 nicklas 92
1666 25 Nov 05 nicklas 93 try
1666 25 Nov 05 nicklas 94 {
1813 24 Jan 06 nicklas 95   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
1667 25 Nov 05 nicklas 96   {
1813 24 Jan 06 nicklas 97     // Display the list page without updatinging the current context
2811 26 Oct 06 nicklas 98     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext, true);
1813 24 Jan 06 nicklas 99     redirect = listPage;
1667 25 Nov 05 nicklas 100   }
1813 24 Jan 06 nicklas 101   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
1667 25 Nov 05 nicklas 102   {
1813 24 Jan 06 nicklas 103     // Display the list page after updating the current context from the request parameters
1813 24 Jan 06 nicklas 104     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 105     redirect = listPage;
1667 25 Nov 05 nicklas 106   }
1813 24 Jan 06 nicklas 107   else if ("LoadContext".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 108   {
1813 24 Jan 06 nicklas 109     // Display the list page after loading a saved context
1813 24 Jan 06 nicklas 110     int contextId = Values.getInt(request.getParameter("context"));
1813 24 Jan 06 nicklas 111     Base.loadContext(sc, contextId, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 112     redirect = listPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 113   }
1666 25 Nov 05 nicklas 114
1813 24 Jan 06 nicklas 115   else if ("ViewItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 116   {
1813 24 Jan 06 nicklas 117     // Display the view page for a single item 
1813 24 Jan 06 nicklas 118     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 119     forward = viewPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 120   }
1813 24 Jan 06 nicklas 121   else if ("EditItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 122   {
1813 24 Jan 06 nicklas 123     // Display the edit page for a single item (should be opened in a popup)
1813 24 Jan 06 nicklas 124     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 125     redirect = editPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 126   }
1813 24 Jan 06 nicklas 127   else if ("NewItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 128   {
1813 24 Jan 06 nicklas 129     // Display the edit page for a new item (should be opened in a popup)
1813 24 Jan 06 nicklas 130     if (!sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType))
1666 25 Nov 05 nicklas 131     {
1813 24 Jan 06 nicklas 132       throw new PermissionDeniedException(Permission.CREATE, itemType.toString());
1666 25 Nov 05 nicklas 133     }
1813 24 Jan 06 nicklas 134     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 135     cc.setId(0);
2449 29 Jun 06 nicklas 136     forward = editPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 137   }
1813 24 Jan 06 nicklas 138   else if ("UpdateItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 139   {
1813 24 Jan 06 nicklas 140     // Update the properties on an item (will close the popup)
1813 24 Jan 06 nicklas 141     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext);
2598 28 Aug 06 nicklas 142     final int maxRecent = Base.getMaxRecent(sc);
7954 12 May 21 nicklas 143     dc = sc.newDbControl(":Edit "+itemType);
7605 26 Feb 19 nicklas 144     ArrayBatch batch = cc.getObject("item");
1813 24 Jan 06 nicklas 145     if (batch == null)
1666 25 Nov 05 nicklas 146     {
1813 24 Jan 06 nicklas 147       int designId = Values.getInt(request.getParameter("arraydesign_id"), -1);
2598 28 Aug 06 nicklas 148       ArrayDesign design = ArrayDesign.getById(dc, designId);
2598 28 Aug 06 nicklas 149       batch = ArrayBatch.getNew(dc, design);
1813 24 Jan 06 nicklas 150       message = "Array batch created";
1813 24 Jan 06 nicklas 151       dc.saveItem(batch);
7703 11 Apr 19 nicklas 152       cc.setRecent(Item.ARRAYDESIGN, design, maxRecent);
1666 25 Nov 05 nicklas 153     }
1813 24 Jan 06 nicklas 154     else
1666 25 Nov 05 nicklas 155     {
5060 19 Aug 09 nicklas 156       dc.reattachItem(batch, false);
1813 24 Jan 06 nicklas 157       message = "Array batch updated";
1666 25 Nov 05 nicklas 158     }
5498 17 Nov 10 nicklas 159     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.item(Item.ARRAYBATCH), batch);
7604 25 Feb 19 nicklas 160     ExtensionsInvoker<OnSaveAction> invoker = EditUtil.useOnSaveExtensions(jspContext);
5498 17 Nov 10 nicklas 161     try
1666 25 Nov 05 nicklas 162     {
5498 17 Nov 10 nicklas 163       batch.setName(Values.getStringOrNull(request.getParameter("name")));
5498 17 Nov 10 nicklas 164       batch.setDescription(Values.getStringOrNull(request.getParameter("description")));
5498 17 Nov 10 nicklas 165       int protocolId = Values.getInt(request.getParameter("protocol_id"), -1);
5498 17 Nov 10 nicklas 166       if (protocolId >= 0) // < 0 = denied or unchanged
5498 17 Nov 10 nicklas 167       {
5498 17 Nov 10 nicklas 168         Protocol pt = protocolId == 0 ? null : Protocol.getById(dc, protocolId);
5498 17 Nov 10 nicklas 169         batch.setProtocol(pt);
7703 11 Apr 19 nicklas 170         cc.setRecent(Item.PROTOCOL, pt, maxRecent);
5498 17 Nov 10 nicklas 171       }
5498 17 Nov 10 nicklas 172       int robotId = Values.getInt(request.getParameter("printrobot_id"), -1);
5498 17 Nov 10 nicklas 173       if (robotId >= 0) // < 0 = denied or unchanged
5498 17 Nov 10 nicklas 174       {
5498 17 Nov 10 nicklas 175         Hardware hw = robotId == 0 ? null : Hardware.getById(dc, robotId);
5498 17 Nov 10 nicklas 176         batch.setPrintRobot(hw);
7703 11 Apr 19 nicklas 177         cc.setRecent(Item.HARDWARE, hw, maxRecent);
5498 17 Nov 10 nicklas 178       }
5498 17 Nov 10 nicklas 179   
5498 17 Nov 10 nicklas 180       // Annotations tab
5498 17 Nov 10 nicklas 181       Base.updateAnnotations(dc, batch, batch, request);
5498 17 Nov 10 nicklas 182       
5498 17 Nov 10 nicklas 183       // OnSave extensions
5498 17 Nov 10 nicklas 184       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_SAVE);
5498 17 Nov 10 nicklas 185       dc.commit();
5498 17 Nov 10 nicklas 186       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_COMMIT);
1666 25 Nov 05 nicklas 187     }
5498 17 Nov 10 nicklas 188     catch (Exception ex)
1666 25 Nov 05 nicklas 189     {
5498 17 Nov 10 nicklas 190       invoker.render(OnSaveRenderer.onRollback(ex));
5498 17 Nov 10 nicklas 191       throw ex;
1666 25 Nov 05 nicklas 192     }
5498 17 Nov 10 nicklas 193     finally
5498 17 Nov 10 nicklas 194     {
5498 17 Nov 10 nicklas 195       cc.removeObject("item");
5498 17 Nov 10 nicklas 196     }
1813 24 Jan 06 nicklas 197   }
1813 24 Jan 06 nicklas 198   else if ("DeleteItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 199   {
1813 24 Jan 06 nicklas 200     // Delete a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 201     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 202     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 203     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), true);
1813 24 Jan 06 nicklas 204     dc.commit();
1813 24 Jan 06 nicklas 205     redirect = viewPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 206   }
1813 24 Jan 06 nicklas 207   else if ("DeleteItems".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 208   {
1813 24 Jan 06 nicklas 209     // Delete all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 210     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 211     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 212     int numTotal = cc.getSelected().size();
1813 24 Jan 06 nicklas 213     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), true);
1813 24 Jan 06 nicklas 214     dc.commit();
1813 24 Jan 06 nicklas 215     if (numTotal != numRemoved)
1666 25 Nov 05 nicklas 216     {
1813 24 Jan 06 nicklas 217       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be deleted, because you have no DELETE permission";
1666 25 Nov 05 nicklas 218     }
6192 31 Oct 12 nicklas 219     redirect = listPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 220   }
1813 24 Jan 06 nicklas 221   else if ("RestoreItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 222   {
1813 24 Jan 06 nicklas 223     // Restore a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 224     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 225     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 226     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), false);
1813 24 Jan 06 nicklas 227     dc.commit();
1813 24 Jan 06 nicklas 228     redirect = viewPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 229   }
1813 24 Jan 06 nicklas 230   else if ("RestoreItems".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 231   {
1813 24 Jan 06 nicklas 232     // Restore all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 233     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 234     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 235     int numTotal = cc.getSelected().size();
1813 24 Jan 06 nicklas 236     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), false);
1813 24 Jan 06 nicklas 237     dc.commit();
1813 24 Jan 06 nicklas 238     if (numTotal != numRemoved)
1666 25 Nov 05 nicklas 239     {
2528 15 Aug 06 martin 240       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be restored, because you have no WRITE permission";
1666 25 Nov 05 nicklas 241     }
6192 31 Oct 12 nicklas 242     redirect = listPage;
1813 24 Jan 06 nicklas 243   }
1813 24 Jan 06 nicklas 244   else if ("ShareItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 245   {
1813 24 Jan 06 nicklas 246     // Display a popup window for sharing a single item
7954 12 May 21 nicklas 247     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 248     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 249     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()));
1813 24 Jan 06 nicklas 250     dc.close();
1813 24 Jan 06 nicklas 251     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1813 24 Jan 06 nicklas 252     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1813 24 Jan 06 nicklas 253   }
1813 24 Jan 06 nicklas 254   else if ("ShareItems".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 255   {
1813 24 Jan 06 nicklas 256     // Display a popup window for sharing all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 257     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1813 24 Jan 06 nicklas 258     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 259     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, cc.getSelected());
1813 24 Jan 06 nicklas 260     dc.close();
1813 24 Jan 06 nicklas 261     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1813 24 Jan 06 nicklas 262     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1813 24 Jan 06 nicklas 263   }
4578 13 Oct 08 martin 264   else if ("SetOwnerOfItem".equals(cmd))
2919 15 Nov 06 nicklas 265   {
4578 13 Oct 08 martin 266     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 267     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2919 15 Nov 06 nicklas 268     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 269     OwnedItem item = (OwnedItem)itemType.getById(dc, cc.getId());
4587 15 Oct 08 martin 270     cc.setObject("OwnedItems", Collections.singleton(item));
4578 13 Oct 08 martin 271     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2919 15 Nov 06 nicklas 272   }
4578 13 Oct 08 martin 273   else if ("SetOwnerOfItems".equals(cmd))
2919 15 Nov 06 nicklas 274   {
4578 13 Oct 08 martin 275     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 276     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2919 15 Nov 06 nicklas 277     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 278     Set<OwnedItem> items = new HashSet<OwnedItem>();
4587 15 Oct 08 martin 279     for (Integer id : cc.getSelected())
4587 15 Oct 08 martin 280     {
4587 15 Oct 08 martin 281       if (id != null) items.add((OwnedItem)itemType.getById(dc, id));
4587 15 Oct 08 martin 282     }
4587 15 Oct 08 martin 283     dc.close();
4587 15 Oct 08 martin 284     cc.setObject("OwnedItems", items);
4578 13 Oct 08 martin 285     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2919 15 Nov 06 nicklas 286   }
6695 28 Jan 15 nicklas 287   else if ("InheritAnnotations".equals(cmd))
6695 28 Jan 15 nicklas 288   {
6695 28 Jan 15 nicklas 289     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 290     dc = sc.newDbControl(":Inherit annotations "+itemType);
6695 28 Jan 15 nicklas 291     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
6695 28 Jan 15 nicklas 292     Set<AnnotatedItem> items = new HashSet<AnnotatedItem>();
6695 28 Jan 15 nicklas 293     for (Integer id : cc.getSelected())
6695 28 Jan 15 nicklas 294     {
6695 28 Jan 15 nicklas 295       if (id != null) items.add((AnnotatedItem)itemType.getById(dc, id));
6695 28 Jan 15 nicklas 296     }
6695 28 Jan 15 nicklas 297     dc.close();
6695 28 Jan 15 nicklas 298     cc.setObject("AnnotatedItems", items);
6695 28 Jan 15 nicklas 299     redirect = "../../common/annotations/batch_inherit.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
6695 28 Jan 15 nicklas 300   }
1813 24 Jan 06 nicklas 301   else if ("ExportItems".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 302   {
1813 24 Jan 06 nicklas 303     // Run an export plugin in a list context
1813 24 Jan 06 nicklas 304     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 305     final ItemQuery<ArrayBatch> query = ArrayBatch.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 306     dc = sc.newDbControl(":Export "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 307     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 308     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
6039 29 Mar 12 nicklas 309     cc.setQuery(query);
7604 25 Feb 19 nicklas 310     ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ArrayBatch,?>> listInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
7604 25 Feb 19 nicklas 311     listInvoker.render(new ListColumnExportRenderer<ArrayBatch>(cc));
5590 16 Mar 11 nicklas 312     dc.close();
4835 24 Mar 09 nicklas 313     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Export+array+batches";
1813 24 Jan 06 nicklas 314   }
1813 24 Jan 06 nicklas 315   else if ("ExportItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 316   {
1813 24 Jan 06 nicklas 317     // Run an export plugin in single-item context
1813 24 Jan 06 nicklas 318     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4835 24 Mar 09 nicklas 319     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Export+array+batch";
1813 24 Jan 06 nicklas 320   }
1813 24 Jan 06 nicklas 321   else if ("ImportItems".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 322   {
1813 24 Jan 06 nicklas 323     // Run an import plugin in a list context
1813 24 Jan 06 nicklas 324     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 325     final ItemQuery<ArrayBatch> query = ArrayBatch.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 326     dc = sc.newDbControl(":Import "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 327     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 328     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 329     dc.close();
1813 24 Jan 06 nicklas 330     cc.setQuery(query);
4835 24 Mar 09 nicklas 331     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Import+array+batches";
1813 24 Jan 06 nicklas 332   }
1813 24 Jan 06 nicklas 333   else if ("ImportItem".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 334   {
1813 24 Jan 06 nicklas 335     // Run an import plugin in single-item context
1813 24 Jan 06 nicklas 336     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4835 24 Mar 09 nicklas 337     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Import+array+batch";
1813 24 Jan 06 nicklas 338   }
1813 24 Jan 06 nicklas 339   else if ("RunListPlugin".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 340   {
1813 24 Jan 06 nicklas 341     // Run another plugin in a list context
1813 24 Jan 06 nicklas 342     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 343     final ItemQuery<ArrayBatch> query = ArrayBatch.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 344     dc = sc.newDbControl(":Run plugin "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 345     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 346     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 347     dc.close();
1813 24 Jan 06 nicklas 348     cc.setQuery(query);
1813 24 Jan 06 nicklas 349     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1813 24 Jan 06 nicklas 350   }
1813 24 Jan 06 nicklas 351   else if ("RunPlugin".equals(cmd))
1813 24 Jan 06 nicklas 352   {
1813 24 Jan 06 nicklas 353     // Run another plugin in single-item context
1813 24 Jan 06 nicklas 354     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1813 24 Jan 06 nicklas 355     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1813 24 Jan 06 nicklas 356   }
1813 24 Jan 06 nicklas 357   else
1813 24 Jan 06 nicklas 358   {
1813 24 Jan 06 nicklas 359     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
1813 24 Jan 06 nicklas 360   }
1666 25 Nov 05 nicklas 361 }
1666 25 Nov 05 nicklas 362 finally
1666 25 Nov 05 nicklas 363 {
1666 25 Nov 05 nicklas 364   if (dc != null) dc.close();
1666 25 Nov 05 nicklas 365 }
1813 24 Jan 06 nicklas 366
1813 24 Jan 06 nicklas 367 if (forward != null)
1813 24 Jan 06 nicklas 368 {
6192 31 Oct 12 nicklas 369   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1813 24 Jan 06 nicklas 370   pageContext.forward(forward);
1813 24 Jan 06 nicklas 371 }
1813 24 Jan 06 nicklas 372 else if (redirect != null)
1813 24 Jan 06 nicklas 373 {
6192 31 Oct 12 nicklas 374   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1813 24 Jan 06 nicklas 375   response.sendRedirect(redirect);
1813 24 Jan 06 nicklas 376 }
1813 24 Jan 06 nicklas 377 else if (message == null)
1813 24 Jan 06 nicklas 378 {
1813 24 Jan 06 nicklas 379   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
1813 24 Jan 06 nicklas 380 }
1813 24 Jan 06 nicklas 381 else
1813 24 Jan 06 nicklas 382 {
1813 24 Jan 06 nicklas 383   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
1813 24 Jan 06 nicklas 384 }
1813 24 Jan 06 nicklas 385 %>
1813 24 Jan 06 nicklas 386

Generated on Sat Oct  7 02:46:16 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)