www/lims/arrayslides/index.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1666 25 Nov 05 nicklas 1 <%-- $Id$
1666 25 Nov 05 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
5425 23 Sep 10 nicklas 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
1666 25 Nov 05 nicklas 5
2304 22 May 06 jari 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 7   Available at http://base.thep.lu.se/
1666 25 Nov 05 nicklas 8
1666 25 Nov 05 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1666 25 Nov 05 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
1666 25 Nov 05 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
1666 25 Nov 05 nicklas 13
1666 25 Nov 05 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1666 25 Nov 05 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1666 25 Nov 05 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
1666 25 Nov 05 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
1666 25 Nov 05 nicklas 18
1666 25 Nov 05 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
4511 11 Sep 08 jari 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
1666 25 Nov 05 nicklas 21   ------------------------------------------------------------------
1666 25 Nov 05 nicklas 22
1666 25 Nov 05 nicklas 23   @author Nicklas
1666 25 Nov 05 nicklas 24   @version 2.0
1666 25 Nov 05 nicklas 25 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 26 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
1666 25 Nov 05 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1666 25 Nov 05 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1666 25 Nov 05 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.Item"
1812 24 Jan 06 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Include"
5642 26 May 11 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.PhysicalBioAssay  "
1666 25 Nov 05 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.ArraySlide"
1812 24 Jan 06 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.ArrayBatch"
1812 24 Jan 06 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.Protocol"
1666 25 Nov 05 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1666 25 Nov 05 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
1666 25 Nov 05 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.Permission"
1812 24 Jan 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
1812 24 Jan 06 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.MultiPermissions"
4587 15 Oct 08 martin 40   import="net.sf.basedb.core.OwnedItem"
6695 28 Jan 15 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.AnnotatedItem"
6695 28 Jan 15 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.InvalidDataException"
1812 24 Jan 06 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
1812 24 Jan 06 nicklas 44   import="net.sf.basedb.core.ItemAlreadyExistsException"
4220 14 Apr 08 nicklas 45   import="net.sf.basedb.core.HibernateUtil"  
1812 24 Jan 06 nicklas 46   import="net.sf.basedb.util.RemovableUtil"
1812 24 Jan 06 nicklas 47   import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
2919 15 Nov 06 nicklas 48   import="net.sf.basedb.util.OwnableUtil"
1666 25 Nov 05 nicklas 49   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
1812 24 Jan 06 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
2753 20 Oct 06 nicklas 51   import="net.sf.basedb.util.Values"
1666 25 Nov 05 nicklas 52   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
5498 17 Nov 10 nicklas 53   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
5498 17 Nov 10 nicklas 54   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
5498 17 Nov 10 nicklas 55   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5498 17 Nov 10 nicklas 56   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
5498 17 Nov 10 nicklas 57   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.EditUtil"
7604 25 Feb 19 nicklas 58   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.OnSaveAction"
5498 17 Nov 10 nicklas 59   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.OnSaveRenderer"
6039 29 Mar 12 nicklas 60   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnExportRenderer"
7604 25 Feb 19 nicklas 61   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
6039 29 Mar 12 nicklas 62   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
1812 24 Jan 06 nicklas 63   import="java.util.Enumeration"
1812 24 Jan 06 nicklas 64   import="java.util.Set"
1812 24 Jan 06 nicklas 65   import="java.util.HashSet"
4220 14 Apr 08 nicklas 66   import="java.util.TreeSet"
1666 25 Nov 05 nicklas 67   import="java.util.List"
1812 24 Jan 06 nicklas 68   import="java.util.ArrayList"
1812 24 Jan 06 nicklas 69   import="java.util.Collections"
1666 25 Nov 05 nicklas 70 %>
1666 25 Nov 05 nicklas 71 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1666 25 Nov 05 nicklas 72 <%!
5642 26 May 11 nicklas 73   private static final ItemContext defaultContext = Base.createDefaultContext("name", "name,arrayDesign,physicalBioAssay,description");
1812 24 Jan 06 nicklas 74   private static final Item itemType = Item.ARRAYSLIDE;
1666 25 Nov 05 nicklas 75 %>
1666 25 Nov 05 nicklas 76 <%
1812 24 Jan 06 nicklas 77 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
1666 25 Nov 05 nicklas 78 final String ID = sc.getId();
1812 24 Jan 06 nicklas 79 final String cmd = request.getParameter("cmd");
1812 24 Jan 06 nicklas 80 final String root = request.getContextPath()+"/";
1812 24 Jan 06 nicklas 81 final String mode = request.getParameter("mode");
1812 24 Jan 06 nicklas 82 final String callback = request.getParameter("callback");
1812 24 Jan 06 nicklas 83 final String itemId = request.getParameter("item_id");
1812 24 Jan 06 nicklas 84 final String listPage = "list_slides.jsp?ID="+ID
1812 24 Jan 06 nicklas 85   +(mode == null ? "" : "&mode="+mode)
1812 24 Jan 06 nicklas 86   +(callback == null ? "" : "&callback="+callback)
1812 24 Jan 06 nicklas 87   +(itemId == null ? "" : "&item_id="+itemId);
1812 24 Jan 06 nicklas 88 final String viewPage = "view_slide.jsp?ID="+ID;
1812 24 Jan 06 nicklas 89 final String editPage = "edit_slide.jsp?ID="+ID;
2231 10 May 06 martin 90 final String wizardPage = "create_wizard.jsp?ID="+ID+"&cmd=WizardStep1";
1666 25 Nov 05 nicklas 91
1812 24 Jan 06 nicklas 92 String forward = null;
1812 24 Jan 06 nicklas 93 String redirect = null;
1812 24 Jan 06 nicklas 94 String message = null;
1812 24 Jan 06 nicklas 95 DbControl dc = null;
1812 24 Jan 06 nicklas 96
1666 25 Nov 05 nicklas 97 try
1666 25 Nov 05 nicklas 98 {
1812 24 Jan 06 nicklas 99   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
1666 25 Nov 05 nicklas 100   {
1812 24 Jan 06 nicklas 101     // Display the list page without updatinging the current context
2811 26 Oct 06 nicklas 102     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext, true);
1812 24 Jan 06 nicklas 103     redirect = listPage;
1666 25 Nov 05 nicklas 104   }
1812 24 Jan 06 nicklas 105   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 106   {
1812 24 Jan 06 nicklas 107     // Display the list page after updating the current context from the request parameters
1812 24 Jan 06 nicklas 108     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 109     redirect = listPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 110   }
1812 24 Jan 06 nicklas 111   else if ("LoadContext".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 112   {
1812 24 Jan 06 nicklas 113     // Display the list page after loading a saved context
1812 24 Jan 06 nicklas 114     int contextId = Values.getInt(request.getParameter("context"));
1812 24 Jan 06 nicklas 115     Base.loadContext(sc, contextId, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 116     redirect = listPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 117   }
1666 25 Nov 05 nicklas 118
1812 24 Jan 06 nicklas 119   else if ("ViewItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 120   {
1812 24 Jan 06 nicklas 121     // Display the view page for a single item 
1812 24 Jan 06 nicklas 122     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 123     forward = viewPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 124   }
1812 24 Jan 06 nicklas 125   else if ("EditItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 126   {
1812 24 Jan 06 nicklas 127     // Display the edit page for a single item (should be opened in a popup)
1812 24 Jan 06 nicklas 128     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 129     redirect = editPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 130   }
1812 24 Jan 06 nicklas 131   else if ("NewItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 132   {
1812 24 Jan 06 nicklas 133     // Display the edit page for a new item (should be opened in a popup)
1812 24 Jan 06 nicklas 134     if (!sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType))
1666 25 Nov 05 nicklas 135     {
1812 24 Jan 06 nicklas 136       throw new PermissionDeniedException(Permission.CREATE, itemType.toString());
1666 25 Nov 05 nicklas 137     }
1812 24 Jan 06 nicklas 138     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 139     cc.setId(0);
2449 29 Jun 06 nicklas 140     forward = editPage;
2231 10 May 06 martin 141   }  
1812 24 Jan 06 nicklas 142   else if ("UpdateItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 143   {
1812 24 Jan 06 nicklas 144     // Update the properties on an item (will close the popup)
1812 24 Jan 06 nicklas 145     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext);
2598 28 Aug 06 nicklas 146     final int maxRecent = Base.getMaxRecent(sc);
7954 12 May 21 nicklas 147     dc = sc.newDbControl(":Edit "+itemType);
7605 26 Feb 19 nicklas 148     ArraySlide slide = cc.getObject("item");
1812 24 Jan 06 nicklas 149     if (slide == null)
1666 25 Nov 05 nicklas 150     {
1812 24 Jan 06 nicklas 151       int batchId = Values.getInt(request.getParameter("arraybatch_id"), -1);
2598 28 Aug 06 nicklas 152       ArrayBatch batch = ArrayBatch.getById(dc, batchId);
2598 28 Aug 06 nicklas 153       slide = ArraySlide.getNew(dc, batch);
1812 24 Jan 06 nicklas 154       message = "Array slide created";
1812 24 Jan 06 nicklas 155       dc.saveItem(slide);
7703 11 Apr 19 nicklas 156       cc.setRecent(Item.ARRAYBATCH, batch, maxRecent);
1666 25 Nov 05 nicklas 157     }
1812 24 Jan 06 nicklas 158     else
1666 25 Nov 05 nicklas 159     {
5060 19 Aug 09 nicklas 160       dc.reattachItem(slide, false);
1812 24 Jan 06 nicklas 161       message = "Array slide updated";
1666 25 Nov 05 nicklas 162     }
5498 17 Nov 10 nicklas 163     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.item(Item.ARRAYSLIDE), slide);
7604 25 Feb 19 nicklas 164     ExtensionsInvoker<OnSaveAction> invoker = EditUtil.useOnSaveExtensions(jspContext);
5498 17 Nov 10 nicklas 165     try
4220 14 Apr 08 nicklas 166     {
5498 17 Nov 10 nicklas 167       slide.setName(Values.getStringOrNull(request.getParameter("name")));
5498 17 Nov 10 nicklas 168       String newBarcode = Values.getStringOrNull(request.getParameter("barcode"));
5498 17 Nov 10 nicklas 169       if (newBarcode != null && !newBarcode.equals(slide.getBarcode()))
4220 14 Apr 08 nicklas 170       {
5498 17 Nov 10 nicklas 171         if (ArraySlide.barcodeExists(dc, newBarcode))
5498 17 Nov 10 nicklas 172         {
5498 17 Nov 10 nicklas 173           throw new ItemAlreadyExistsException("ArraySlide[barcode=" + newBarcode + "]");
5498 17 Nov 10 nicklas 174         }
4220 14 Apr 08 nicklas 175       }
5498 17 Nov 10 nicklas 176       slide.setBarcode(newBarcode);
5498 17 Nov 10 nicklas 177       slide.setBatchIndex(Values.getInt(request.getParameter("batch_index")));
5498 17 Nov 10 nicklas 178       slide.setDestroyed(Values.getBoolean(request.getParameter("destroyed")));
5498 17 Nov 10 nicklas 179       slide.setDescription(Values.getStringOrNull(request.getParameter("description")));
5498 17 Nov 10 nicklas 180       
5498 17 Nov 10 nicklas 181       // Annotations tab
5498 17 Nov 10 nicklas 182       Base.updateAnnotations(dc, slide, slide, request);
5498 17 Nov 10 nicklas 183       
5498 17 Nov 10 nicklas 184       // OnSave extensions
5498 17 Nov 10 nicklas 185       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_SAVE);
5498 17 Nov 10 nicklas 186       dc.commit();
5498 17 Nov 10 nicklas 187       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_COMMIT);
4220 14 Apr 08 nicklas 188     }
5498 17 Nov 10 nicklas 189     catch (Exception ex)
5498 17 Nov 10 nicklas 190     {
5498 17 Nov 10 nicklas 191       invoker.render(OnSaveRenderer.onRollback(ex));
5498 17 Nov 10 nicklas 192       throw ex;
5498 17 Nov 10 nicklas 193     }
5498 17 Nov 10 nicklas 194     finally
5498 17 Nov 10 nicklas 195     {
5498 17 Nov 10 nicklas 196       cc.removeObject("item");
5498 17 Nov 10 nicklas 197     }
1812 24 Jan 06 nicklas 198   }
2231 10 May 06 martin 199   else if ("NewItems".equals(cmd))
2231 10 May 06 martin 200   {
2231 10 May 06 martin 201 //    Display the wizard page for new items wizard(should be open in a popup)
2231 10 May 06 martin 202     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
2231 10 May 06 martin 203     cc.setId(0);
2449 29 Jun 06 nicklas 204     forward = wizardPage;
2231 10 May 06 martin 205   }
2231 10 May 06 martin 206   else if ("CreateItems".equals(cmd))
2231 10 May 06 martin 207   {
2231 10 May 06 martin 208     //Finish the wizard and create the given quantity of Array slides
2231 10 May 06 martin 209     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext);
2598 28 Aug 06 nicklas 210     final int maxRecent = Base.getMaxRecent(sc);
7954 12 May 21 nicklas 211     dc = sc.newDbControl(":Batch create array slides");
2231 10 May 06 martin 212     int quantity = Values.getInt(request.getParameter("quantity"));
5136 15 Oct 09 nicklas 213     int batchId = Values.getInt(request.getParameter("arraybatch_id"));
5136 15 Oct 09 nicklas 214     int startAt = Values.getInt(request.getParameter("start_at"), 1);
2267 17 May 06 nicklas 215     String description = Values.getStringOrNull(request.getParameter("description"));
2267 17 May 06 nicklas 216     ArrayBatch batch = ArrayBatch.getById(dc, batchId);
7703 11 Apr 19 nicklas 217     cc.setRecent(Item.ARRAYBATCH, batch, maxRecent);
4220 14 Apr 08 nicklas 218     boolean caseInsensitive = HibernateUtil.getDbEngine().caseInsensitiveComparison();
4220 14 Apr 08 nicklas 219     Set<String> barcodes = caseInsensitive ? 
4220 14 Apr 08 nicklas 220       new TreeSet<String>(String.CASE_INSENSITIVE_ORDER) : new HashSet<String>();
2457 30 Jun 06 nicklas 221     for (int i = 0; i < quantity; ++i)
2267 17 May 06 nicklas 222     {
2267 17 May 06 nicklas 223       ArraySlide slide = ArraySlide.getNew(dc, batch);
2231 10 May 06 martin 224       dc.saveItem(slide);
2267 17 May 06 nicklas 225       slide.setName(Values.getStringOrNull(request.getParameter("name"+i)));
5136 15 Oct 09 nicklas 226       slide.setBatchIndex(startAt + i);
4220 14 Apr 08 nicklas 227       
4220 14 Apr 08 nicklas 228       String newBarcode = Values.getStringOrNull(request.getParameter("barcode" + i));
4220 14 Apr 08 nicklas 229       if (newBarcode != null)
4220 14 Apr 08 nicklas 230       {
4220 14 Apr 08 nicklas 231         if (barcodes.contains(newBarcode))
4220 14 Apr 08 nicklas 232         {
4220 14 Apr 08 nicklas 233           throw new InvalidDataException("Trying to create more than one slide with barcode=" + newBarcode);
4220 14 Apr 08 nicklas 234         }
4220 14 Apr 08 nicklas 235         else if (ArraySlide.barcodeExists(dc, newBarcode))
4220 14 Apr 08 nicklas 236         {
4220 14 Apr 08 nicklas 237           throw new ItemAlreadyExistsException("ArraySlide[barcode=" + newBarcode + "]");
4220 14 Apr 08 nicklas 238         }
4220 14 Apr 08 nicklas 239         barcodes.add(newBarcode);
4220 14 Apr 08 nicklas 240       }
4220 14 Apr 08 nicklas 241       slide.setBarcode(newBarcode);
2231 10 May 06 martin 242       slide.setDescription(description);
2231 10 May 06 martin 243     }
2231 10 May 06 martin 244     dc.commit();
2231 10 May 06 martin 245     message = quantity + " Array slides created";
2231 10 May 06 martin 246   }
1812 24 Jan 06 nicklas 247   else if ("DeleteItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 248   {
1812 24 Jan 06 nicklas 249     // Delete a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 250     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 251     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 252     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), true);
1812 24 Jan 06 nicklas 253     dc.commit();
1812 24 Jan 06 nicklas 254     redirect = viewPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 255   }
1812 24 Jan 06 nicklas 256   else if ("DeleteItems".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 257   {
1812 24 Jan 06 nicklas 258     // Delete all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 259     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 260     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 261     int numTotal = cc.getSelected().size();
1812 24 Jan 06 nicklas 262     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), true);
1812 24 Jan 06 nicklas 263     dc.commit();
1812 24 Jan 06 nicklas 264     if (numTotal != numRemoved)
1666 25 Nov 05 nicklas 265     {
1812 24 Jan 06 nicklas 266       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be deleted, because you have no DELETE permission";
1666 25 Nov 05 nicklas 267     }
6192 31 Oct 12 nicklas 268     redirect = listPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 269   }
1812 24 Jan 06 nicklas 270   else if ("RestoreItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 271   {
1812 24 Jan 06 nicklas 272     // Restore a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 273     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 274     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 275     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), false);
1812 24 Jan 06 nicklas 276     dc.commit();
1812 24 Jan 06 nicklas 277     redirect = viewPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 278   }
1812 24 Jan 06 nicklas 279   else if ("RestoreItems".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 280   {
1812 24 Jan 06 nicklas 281     // Restore all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 282     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 283     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 284     int numTotal = cc.getSelected().size();
1812 24 Jan 06 nicklas 285     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), false);
1812 24 Jan 06 nicklas 286     dc.commit();
1812 24 Jan 06 nicklas 287     if (numTotal != numRemoved)
1666 25 Nov 05 nicklas 288     {
2528 15 Aug 06 martin 289       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be restored, because you have no WRITE permission";
1666 25 Nov 05 nicklas 290     }
6192 31 Oct 12 nicklas 291     redirect = listPage;
1812 24 Jan 06 nicklas 292   }
1812 24 Jan 06 nicklas 293   else if ("ShareItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 294   {
1812 24 Jan 06 nicklas 295     // Display a popup window for sharing a single item
7954 12 May 21 nicklas 296     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 297     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 298     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()));
1812 24 Jan 06 nicklas 299     dc.close();
1812 24 Jan 06 nicklas 300     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1812 24 Jan 06 nicklas 301     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1812 24 Jan 06 nicklas 302   }
1812 24 Jan 06 nicklas 303   else if ("ShareItems".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 304   {
1812 24 Jan 06 nicklas 305     // Display a popup window for sharing all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 306     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1812 24 Jan 06 nicklas 307     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 308     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, cc.getSelected());
1812 24 Jan 06 nicklas 309     dc.close();
1812 24 Jan 06 nicklas 310     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1812 24 Jan 06 nicklas 311     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1812 24 Jan 06 nicklas 312   }
4578 13 Oct 08 martin 313   else if ("SetOwnerOfItem".equals(cmd))
2919 15 Nov 06 nicklas 314   {
4578 13 Oct 08 martin 315     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 316     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2919 15 Nov 06 nicklas 317     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 318     OwnedItem item = (OwnedItem)itemType.getById(dc, cc.getId());
4587 15 Oct 08 martin 319     cc.setObject("OwnedItems", Collections.singleton(item));
4578 13 Oct 08 martin 320     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2919 15 Nov 06 nicklas 321   }
4578 13 Oct 08 martin 322   else if ("SetOwnerOfItems".equals(cmd))
2919 15 Nov 06 nicklas 323   {
4578 13 Oct 08 martin 324     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 325     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2919 15 Nov 06 nicklas 326     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 327     Set<OwnedItem> items = new HashSet<OwnedItem>();
4587 15 Oct 08 martin 328     for (Integer id : cc.getSelected())
4587 15 Oct 08 martin 329     {
4587 15 Oct 08 martin 330       if (id != null) items.add((OwnedItem)itemType.getById(dc, id));
4587 15 Oct 08 martin 331     }
4587 15 Oct 08 martin 332     dc.close();
4587 15 Oct 08 martin 333     cc.setObject("OwnedItems", items);
4578 13 Oct 08 martin 334     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2919 15 Nov 06 nicklas 335   }
6695 28 Jan 15 nicklas 336   else if ("InheritAnnotations".equals(cmd))
6695 28 Jan 15 nicklas 337   {
6695 28 Jan 15 nicklas 338     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 339     dc = sc.newDbControl(":Inherit annotations "+itemType);
6695 28 Jan 15 nicklas 340     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
6695 28 Jan 15 nicklas 341     Set<AnnotatedItem> items = new HashSet<AnnotatedItem>();
6695 28 Jan 15 nicklas 342     for (Integer id : cc.getSelected())
6695 28 Jan 15 nicklas 343     {
6695 28 Jan 15 nicklas 344       if (id != null) items.add((AnnotatedItem)itemType.getById(dc, id));
6695 28 Jan 15 nicklas 345     }
6695 28 Jan 15 nicklas 346     dc.close();
6695 28 Jan 15 nicklas 347     cc.setObject("AnnotatedItems", items);
6695 28 Jan 15 nicklas 348     redirect = "../../common/annotations/batch_inherit.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
6695 28 Jan 15 nicklas 349   }
1812 24 Jan 06 nicklas 350   else if ("ExportItems".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 351   {
1812 24 Jan 06 nicklas 352     // Run an export plugin in a list context
1812 24 Jan 06 nicklas 353     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 354     final ItemQuery<ArraySlide> query = ArraySlide.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 355     dc = sc.newDbControl(":Export "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 356     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 357     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
6039 29 Mar 12 nicklas 358     cc.setQuery(query);
7604 25 Feb 19 nicklas 359     ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ArraySlide,?>> listInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
7604 25 Feb 19 nicklas 360     listInvoker.render(new ListColumnExportRenderer<ArraySlide>(cc));
5590 16 Mar 11 nicklas 361     dc.close();
4835 24 Mar 09 nicklas 362     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Export+array+slides";
1812 24 Jan 06 nicklas 363   }
1812 24 Jan 06 nicklas 364   else if ("ExportItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 365   {
1812 24 Jan 06 nicklas 366     // Run an export plugin in single-item context
1812 24 Jan 06 nicklas 367     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4835 24 Mar 09 nicklas 368     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Export+array+slide";
1812 24 Jan 06 nicklas 369   }
1812 24 Jan 06 nicklas 370   else if ("ImportItems".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 371   {
1812 24 Jan 06 nicklas 372     // Run an import plugin in a list context
1812 24 Jan 06 nicklas 373     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 374     final ItemQuery<ArraySlide> query = ArraySlide.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 375     dc = sc.newDbControl(":Import "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 376     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 377     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 378     dc.close();
1812 24 Jan 06 nicklas 379     cc.setQuery(query);
4835 24 Mar 09 nicklas 380     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Import+array+slides";
1812 24 Jan 06 nicklas 381   }
1812 24 Jan 06 nicklas 382   else if ("ImportItem".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 383   {
1812 24 Jan 06 nicklas 384     // Run an import plugin in single-item context
1812 24 Jan 06 nicklas 385     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4835 24 Mar 09 nicklas 386     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Import+array+slide";
1812 24 Jan 06 nicklas 387   }
1812 24 Jan 06 nicklas 388   else if ("RunListPlugin".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 389   {
1812 24 Jan 06 nicklas 390     // Run another plugin in a list context
1812 24 Jan 06 nicklas 391     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 392     final ItemQuery<ArraySlide> query = ArraySlide.getQuery();
7954 12 May 21 nicklas 393     dc = sc.newDbControl(":Run plugin "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 394     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 395     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 396     dc.close();
1812 24 Jan 06 nicklas 397     cc.setQuery(query);
1812 24 Jan 06 nicklas 398     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1812 24 Jan 06 nicklas 399   }
1812 24 Jan 06 nicklas 400   else if ("RunPlugin".equals(cmd))
1812 24 Jan 06 nicklas 401   {
1812 24 Jan 06 nicklas 402     // Run another plugin in single-item context
1812 24 Jan 06 nicklas 403     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1812 24 Jan 06 nicklas 404     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1812 24 Jan 06 nicklas 405   }
1812 24 Jan 06 nicklas 406   else
1812 24 Jan 06 nicklas 407   {
1812 24 Jan 06 nicklas 408     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
1812 24 Jan 06 nicklas 409   }
1666 25 Nov 05 nicklas 410 }
1666 25 Nov 05 nicklas 411 finally
1666 25 Nov 05 nicklas 412 {
1666 25 Nov 05 nicklas 413   if (dc != null) dc.close();
1666 25 Nov 05 nicklas 414 }
1812 24 Jan 06 nicklas 415
1812 24 Jan 06 nicklas 416 if (forward != null)
1812 24 Jan 06 nicklas 417 {
6192 31 Oct 12 nicklas 418   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1812 24 Jan 06 nicklas 419   pageContext.forward(forward);
1812 24 Jan 06 nicklas 420 }
1812 24 Jan 06 nicklas 421 else if (redirect != null)
1812 24 Jan 06 nicklas 422 {
6192 31 Oct 12 nicklas 423   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1812 24 Jan 06 nicklas 424   response.sendRedirect(redirect);
1812 24 Jan 06 nicklas 425 }
1812 24 Jan 06 nicklas 426 else if (message == null)
1812 24 Jan 06 nicklas 427 {
1812 24 Jan 06 nicklas 428   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
1812 24 Jan 06 nicklas 429 }
1812 24 Jan 06 nicklas 430 else
1812 24 Jan 06 nicklas 431 {
1812 24 Jan 06 nicklas 432   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
1812 24 Jan 06 nicklas 433 }
1812 24 Jan 06 nicklas 434 %>
1812 24 Jan 06 nicklas 435

Generated on Sat Oct  7 02:46:26 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)