affyfusion-109/README

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
12 13 Sep 07 nicklas 1 $Id$
12 13 Sep 07 nicklas 2
12 13 Sep 07 nicklas 3 This direcotry contains a modified version of the Java source code
12 13 Sep 07 nicklas 4 from Affymetrix Fusion SDK, 
12 13 Sep 07 nicklas 5 http://www.affymetrix.com/support/developer/fusion/index.affx. 
12 13 Sep 07 nicklas 6 The Fusion SDK is released under the GNU Lesser General Public License 
12 13 Sep 07 nicklas 7 version 2.1.
12 13 Sep 07 nicklas 8
12 13 Sep 07 nicklas 9 The modifications are made to enable BASE, http://base.thep.lu.se, to
12 13 Sep 07 nicklas 10 use java.io.InputStream objects instead of java.io.File objects
12 13 Sep 07 nicklas 11 when sending CEL and CDF files to the Fusion API. BASE is released under 
12 13 Sep 07 nicklas 12 GNU Public License version 2.
12 13 Sep 07 nicklas 13
12 13 Sep 07 nicklas 14 The modifications are made by Nicklas Nordborg, nicklas@thep.lu.se
12 13 Sep 07 nicklas 15
12 13 Sep 07 nicklas 16
12 13 Sep 07 nicklas 17 Compilation of the Fusion SDK in an Unix or Unix-like environment.
12 13 Sep 07 nicklas 18
16 18 Sep 07 nicklas 19 i) You must use Java 1.5 and Ant 1.6 or later.
12 13 Sep 07 nicklas 20
12 13 Sep 07 nicklas 21 ii) 'cd' to the root directory of this project
12 13 Sep 07 nicklas 22
12 13 Sep 07 nicklas 23 iii) Do 'ant'. The AffxFusion.jar should be created in the root directory.