affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/array/ArrayMedia.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.calvin.array;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 /** Defines constants for the media an array is housed. */
11 13 Sep 07 nicklas 24 public class ArrayMedia {
11 13 Sep 07 nicklas 25
11 13 Sep 07 nicklas 26     /** A GeneChip cartridge. */
11 13 Sep 07 nicklas 27     public static final int CartridgeMedia=0;
11 13 Sep 07 nicklas 28     
11 13 Sep 07 nicklas 29     /** A 96 well plate or peg strip. */
11 13 Sep 07 nicklas 30     public static final int PlateOrStripMedia=1;
11 13 Sep 07 nicklas 31     
11 13 Sep 07 nicklas 32     /** The GeneChip cartridge. */
11 13 Sep 07 nicklas 33     private static final String MEDIA_TYPE_CARTRIDGE = "Cartridge";
11 13 Sep 07 nicklas 34
11 13 Sep 07 nicklas 35     /** A 96 well plate or strip. */
11 13 Sep 07 nicklas 36     private static final String MEDIA_TYPE_PLATE_OR_STRIP = "PlateOrStrip";
11 13 Sep 07 nicklas 37
11 13 Sep 07 nicklas 38     /** The type of media of the array. */
11 13 Sep 07 nicklas 39     private int media;
11 13 Sep 07 nicklas 40
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** Gets the media value. */
11 13 Sep 07 nicklas 42     public int getMedia() { return media; }
11 13 Sep 07 nicklas 43     
11 13 Sep 07 nicklas 44     /** Sets the media value. */
11 13 Sep 07 nicklas 45     public void setMedia(int m) { media = m; }
11 13 Sep 07 nicklas 46     
11 13 Sep 07 nicklas 47     /** Converts the media type to a string.
11 13 Sep 07 nicklas 48      * @return The string representation.
11 13 Sep 07 nicklas 49      */
11 13 Sep 07 nicklas 50     public String toString() {
11 13 Sep 07 nicklas 51   switch (media)
11 13 Sep 07 nicklas 52   {
11 13 Sep 07 nicklas 53   case CartridgeMedia:
11 13 Sep 07 nicklas 54             return MEDIA_TYPE_CARTRIDGE;
11 13 Sep 07 nicklas 55
11 13 Sep 07 nicklas 56   case PlateOrStripMedia:
11 13 Sep 07 nicklas 57             return MEDIA_TYPE_PLATE_OR_STRIP;
11 13 Sep 07 nicklas 58   }
11 13 Sep 07 nicklas 59         return null;
11 13 Sep 07 nicklas 60     }
11 13 Sep 07 nicklas 61
11 13 Sep 07 nicklas 62     /** Creates a new instance given a string representation of the media.
11 13 Sep 07 nicklas 63      * @param str The string representation.
11 13 Sep 07 nicklas 64      */
11 13 Sep 07 nicklas 65     public ArrayMedia(String str) {
11 13 Sep 07 nicklas 66   if (str.compareTo(MEDIA_TYPE_CARTRIDGE) == 0)
11 13 Sep 07 nicklas 67             media = CartridgeMedia;
11 13 Sep 07 nicklas 68   
11 13 Sep 07 nicklas 69   else if (str.compareTo(MEDIA_TYPE_PLATE_OR_STRIP) == 0)
11 13 Sep 07 nicklas 70             media = PlateOrStripMedia;
11 13 Sep 07 nicklas 71
11 13 Sep 07 nicklas 72   else
11 13 Sep 07 nicklas 73             media = CartridgeMedia;
11 13 Sep 07 nicklas 74     }
11 13 Sep 07 nicklas 75
11 13 Sep 07 nicklas 76     /** Creates a new instance of ArrayMedia */
11 13 Sep 07 nicklas 77     public ArrayMedia() {
11 13 Sep 07 nicklas 78         media = CartridgeMedia;
11 13 Sep 07 nicklas 79     }
11 13 Sep 07 nicklas 80     
11 13 Sep 07 nicklas 81 }