affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/data/CHPBackgroundZone.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.calvin.data;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 /** This class stores a zone's background value */
11 13 Sep 07 nicklas 24 public class CHPBackgroundZone {
11 13 Sep 07 nicklas 25     
11 13 Sep 07 nicklas 26     /** Creates a new instance of CHPBackgroundZone */
11 13 Sep 07 nicklas 27     public CHPBackgroundZone() {
11 13 Sep 07 nicklas 28         clear();
11 13 Sep 07 nicklas 29     }
11 13 Sep 07 nicklas 30
11 13 Sep 07 nicklas 31     /** Creates a new instance of CHPBackgroundZone */
11 13 Sep 07 nicklas 32     public CHPBackgroundZone(float x, float y, float bg, float smooth) {
11 13 Sep 07 nicklas 33         centerX = x;
11 13 Sep 07 nicklas 34   centerY = y;
11 13 Sep 07 nicklas 35   background = bg;
11 13 Sep 07 nicklas 36   smoothFactor = smooth;
11 13 Sep 07 nicklas 37     }
11 13 Sep 07 nicklas 38     
11 13 Sep 07 nicklas 39     /** Creates a new instance of CHPBackgroundZone */
11 13 Sep 07 nicklas 40     public CHPBackgroundZone(CHPBackgroundZone zn) {
11 13 Sep 07 nicklas 41         centerX = zn.getCenterX();
11 13 Sep 07 nicklas 42   centerY = zn.getCenterY();
11 13 Sep 07 nicklas 43   background = zn.getBackground();
11 13 Sep 07 nicklas 44   smoothFactor = zn.getSmoothFactor();
11 13 Sep 07 nicklas 45     }
11 13 Sep 07 nicklas 46     
11 13 Sep 07 nicklas 47     /** The X coordinate of the center of the zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 48     private float centerX;
11 13 Sep 07 nicklas 49
11 13 Sep 07 nicklas 50     /** The Y coordinate of the center of the zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 51     private float centerY;
11 13 Sep 07 nicklas 52
11 13 Sep 07 nicklas 53     /** The zone's background value */
11 13 Sep 07 nicklas 54     private float background;
11 13 Sep 07 nicklas 55
11 13 Sep 07 nicklas 56     /** The smoothing factor used to calculate the zone backgrounds */
11 13 Sep 07 nicklas 57     private float smoothFactor;
11 13 Sep 07 nicklas 58
11 13 Sep 07 nicklas 59     public void clear() {
11 13 Sep 07 nicklas 60   centerX = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 61   centerY = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 62   background = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 63   smoothFactor = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 64     }
11 13 Sep 07 nicklas 65
11 13 Sep 07 nicklas 66     public float getCenterX() { return centerX; }
11 13 Sep 07 nicklas 67
11 13 Sep 07 nicklas 68     public float getCenterY() { return centerY; }
11 13 Sep 07 nicklas 69
11 13 Sep 07 nicklas 70     public float getBackground() { return background; }
11 13 Sep 07 nicklas 71
11 13 Sep 07 nicklas 72     public float getSmoothFactor() { return smoothFactor; }
11 13 Sep 07 nicklas 73
11 13 Sep 07 nicklas 74     public void setCenterX(float p) { centerX = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 75
11 13 Sep 07 nicklas 76     public void setCenterY(float p) { centerY = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 77
11 13 Sep 07 nicklas 78     public void setBackground(float p) { background = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 79
11 13 Sep 07 nicklas 80     public void setSmoothFactor(float p) { smoothFactor = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 81 }

Generated on Thu Jul 20 09:22:23 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)