affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/data/CHPReseqOrigCall.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.calvin.data;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 /** A structure to hold a base call at a given position (index). */
11 13 Sep 07 nicklas 24 public class CHPReseqOrigCall {
11 13 Sep 07 nicklas 25     
11 13 Sep 07 nicklas 26     public CHPReseqOrigCall() {
11 13 Sep 07 nicklas 27         position = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 28         call = ' ';
11 13 Sep 07 nicklas 29     }
11 13 Sep 07 nicklas 30     
11 13 Sep 07 nicklas 31     /** The position (index) of the call. */
11 13 Sep 07 nicklas 32     private int position;
11 13 Sep 07 nicklas 33     public int getPosition() { return position; }
11 13 Sep 07 nicklas 34     public void setPosition(int p) { position = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 35
11 13 Sep 07 nicklas 36     /** The call at the given position. */
11 13 Sep 07 nicklas 37     private char call;
11 13 Sep 07 nicklas 38     public char getCall() { return call; }
11 13 Sep 07 nicklas 39     public void setCall(char c) { call = c; }
11 13 Sep 07 nicklas 40
11 13 Sep 07 nicklas 41 }