affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/data/ProbeSetMultiDataExpressionData.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 ////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2006 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License 
11 13 Sep 07 nicklas 7 // (version 2.1) as published by the Free Software Foundation.
11 13 Sep 07 nicklas 8 // 
11 13 Sep 07 nicklas 9 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 10 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 11 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 12 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 13 // 
11 13 Sep 07 nicklas 14 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 15 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 16 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 17 //
11 13 Sep 07 nicklas 18 ////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 19
11 13 Sep 07 nicklas 20 package affymetrix.calvin.data;
11 13 Sep 07 nicklas 21
11 13 Sep 07 nicklas 22 import java.util.*;
11 13 Sep 07 nicklas 23
11 13 Sep 07 nicklas 24 /** Stores data for a expression result of a probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 25 public class ProbeSetMultiDataExpressionData {
11 13 Sep 07 nicklas 26     
11 13 Sep 07 nicklas 27     /** Creates a new instance of ProbeSetMultiDataExpressionData */
11 13 Sep 07 nicklas 28     public ProbeSetMultiDataExpressionData() {
11 13 Sep 07 nicklas 29         name = null;
11 13 Sep 07 nicklas 30         quantification = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 31         metrics = null;
11 13 Sep 07 nicklas 32     }
11 13 Sep 07 nicklas 33
11 13 Sep 07 nicklas 34     /** The name of the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 35     private String name;
11 13 Sep 07 nicklas 36     
11 13 Sep 07 nicklas 37     /** The name of the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 38     public String getName() { return name; }
11 13 Sep 07 nicklas 39     
11 13 Sep 07 nicklas 40     /** Set the name */
11 13 Sep 07 nicklas 41     public void setName(String n) { name = n; }
11 13 Sep 07 nicklas 42
11 13 Sep 07 nicklas 43     /** The quantification of the call. */
11 13 Sep 07 nicklas 44     private float quantification;
11 13 Sep 07 nicklas 45
11 13 Sep 07 nicklas 46     /** Get the quantification. */
11 13 Sep 07 nicklas 47     public float getQuantification() { return quantification; }
11 13 Sep 07 nicklas 48     
11 13 Sep 07 nicklas 49     /** Set the quantification */
11 13 Sep 07 nicklas 50     public void setQuantification(float c) { quantification = c; }
11 13 Sep 07 nicklas 51     
11 13 Sep 07 nicklas 52     /** Other metrics associated with the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 53     private Vector /*ParameterNameValue*/ metrics;
11 13 Sep 07 nicklas 54     
11 13 Sep 07 nicklas 55     /** Get the other metrics associated with the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 56     public Vector getMetrics() { return metrics; }
11 13 Sep 07 nicklas 57     
11 13 Sep 07 nicklas 58     /** Get the other metrics associated with the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 59     public void setMetrics(Vector v) { metrics = v; }
11 13 Sep 07 nicklas 60     
11 13 Sep 07 nicklas 61 }
11 13 Sep 07 nicklas 62

Generated on Thu Jul 20 09:22:33 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)