affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/data/ProbeSetQuantificationDetectionData.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2006 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.calvin.data;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 /** Stores data for a quantification/detection of a probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 24 public class ProbeSetQuantificationDetectionData {
11 13 Sep 07 nicklas 25
11 13 Sep 07 nicklas 26     /** The name of the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 27     private String name;
11 13 Sep 07 nicklas 28
11 13 Sep 07 nicklas 29     /** The name of the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 30     public String getName() { return name; }
11 13 Sep 07 nicklas 31
11 13 Sep 07 nicklas 32     /** The name of the probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 33     public void setName(String n) { name = n; }
11 13 Sep 07 nicklas 34
11 13 Sep 07 nicklas 35     /** The probe set id. */
11 13 Sep 07 nicklas 36     private int id;
11 13 Sep 07 nicklas 37     
11 13 Sep 07 nicklas 38     /** The probe set id. */
11 13 Sep 07 nicklas 39     public int getId() { return id; }
11 13 Sep 07 nicklas 40     
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** The probe set id. */
11 13 Sep 07 nicklas 42     public void setId(int n) { id = n; }
11 13 Sep 07 nicklas 43     
11 13 Sep 07 nicklas 44     /** The quantification associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 45     private float quantification;
11 13 Sep 07 nicklas 46
11 13 Sep 07 nicklas 47     /** The quantification associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 48     public float getQuantification() { return quantification; }
11 13 Sep 07 nicklas 49
11 13 Sep 07 nicklas 50     /** The quantification associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 51     public void setQuantification(float q) { quantification = q; }
11 13 Sep 07 nicklas 52
11 13 Sep 07 nicklas 53     /** The detection p-value associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 54     private float pvalue;
11 13 Sep 07 nicklas 55
11 13 Sep 07 nicklas 56     /** The detection p-value associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 57     public float getPValue() { return pvalue; }
11 13 Sep 07 nicklas 58
11 13 Sep 07 nicklas 59     /** The detection p-value associated to the name. */
11 13 Sep 07 nicklas 60     public void setPValue(float p) { pvalue = p; }
11 13 Sep 07 nicklas 61
11 13 Sep 07 nicklas 62     /** Creates a new instance of ProbeSetQuantificationDetectionData */
11 13 Sep 07 nicklas 63     public ProbeSetQuantificationDetectionData() {
11 13 Sep 07 nicklas 64         name = "";
11 13 Sep 07 nicklas 65         id = -1;
11 13 Sep 07 nicklas 66         quantification = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 67         pvalue = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 68     }
11 13 Sep 07 nicklas 69 }

Generated on Thu Jul 20 09:22:35 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)