affyfusion-109/src/affymetrix/calvin/data/TilingSequenceData.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21
11 13 Sep 07 nicklas 22 package affymetrix.calvin.data;
11 13 Sep 07 nicklas 23
11 13 Sep 07 nicklas 24 import java.util.*;
11 13 Sep 07 nicklas 25
11 13 Sep 07 nicklas 26 /** Stores data for a tiling array sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 27 public class TilingSequenceData {
11 13 Sep 07 nicklas 28     
11 13 Sep 07 nicklas 29     /** Creates a new instance of TilingSequenceData */
11 13 Sep 07 nicklas 30     public TilingSequenceData() {
11 13 Sep 07 nicklas 31         name = null;
11 13 Sep 07 nicklas 32         version = null;
11 13 Sep 07 nicklas 33         groupName = null;
11 13 Sep 07 nicklas 34         parameters = null;
11 13 Sep 07 nicklas 35     }
11 13 Sep 07 nicklas 36     
11 13 Sep 07 nicklas 37     /** The name of the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 38     private String name;
11 13 Sep 07 nicklas 39     
11 13 Sep 07 nicklas 40     /** The name of the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 41     public String getName() { return name; }
11 13 Sep 07 nicklas 42     
11 13 Sep 07 nicklas 43     /** The name of the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 44     public void setName(String n) { name = n; }
11 13 Sep 07 nicklas 45
11 13 Sep 07 nicklas 46     /** The version associated to the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 47     private String version;
11 13 Sep 07 nicklas 48     
11 13 Sep 07 nicklas 49     /** The version associated to the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 50     public String getVersion() { return version; }
11 13 Sep 07 nicklas 51     
11 13 Sep 07 nicklas 52     /** The version associated to the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 53     public void setVersion(String v) { version = v; }
11 13 Sep 07 nicklas 54
11 13 Sep 07 nicklas 55     /** The group name for the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 56     private String groupName;
11 13 Sep 07 nicklas 57
11 13 Sep 07 nicklas 58     /** The group name for the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 59     public String getGroupName() { return groupName; }
11 13 Sep 07 nicklas 60
11 13 Sep 07 nicklas 61     /** The group name for the sequence. */
11 13 Sep 07 nicklas 62     public void setGroupName(String g) { groupName=g; }
11 13 Sep 07 nicklas 63
11 13 Sep 07 nicklas 64     /** The parameter name/value array. */
11 13 Sep 07 nicklas 65     private Vector /*ParameterNameValue*/ parameters;
11 13 Sep 07 nicklas 66     
11 13 Sep 07 nicklas 67     /** The parameter name/value array. */
11 13 Sep 07 nicklas 68     public Vector /*ParameterNameValue*/ getParameters() { return parameters; }
11 13 Sep 07 nicklas 69     
11 13 Sep 07 nicklas 70     /** The parameter name/value array. */
11 13 Sep 07 nicklas 71     public void setParameters(Vector v) { parameters=v; }
11 13 Sep 07 nicklas 72 }