affyfusion-109/src/affymetrix/fusion/cel/FusionCELFileEntryType.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.fusion.cel;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 import affymetrix.portability.*;
11 13 Sep 07 nicklas 24
11 13 Sep 07 nicklas 25 /** Stores the CEL data for a single feature. */
11 13 Sep 07 nicklas 26 public class FusionCELFileEntryType {
11 13 Sep 07 nicklas 27
11 13 Sep 07 nicklas 28     /** The intensity. */
11 13 Sep 07 nicklas 29     private float intensity;
11 13 Sep 07 nicklas 30     
11 13 Sep 07 nicklas 31     /** Gets the intensity.
11 13 Sep 07 nicklas 32      * @return The intensity.
11 13 Sep 07 nicklas 33      */
11 13 Sep 07 nicklas 34     public float getIntensity() { return intensity; }
11 13 Sep 07 nicklas 35     
11 13 Sep 07 nicklas 36     /** Sets the intensity
11 13 Sep 07 nicklas 37      * @param value The intensity
11 13 Sep 07 nicklas 38      */
11 13 Sep 07 nicklas 39     public void setIntensity(float value) { intensity = value; }
11 13 Sep 07 nicklas 40     
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** The stdv. */
11 13 Sep 07 nicklas 42     private float stdv;
11 13 Sep 07 nicklas 43     
11 13 Sep 07 nicklas 44     /** Gets the stdv.
11 13 Sep 07 nicklas 45      * @return The stdv.
11 13 Sep 07 nicklas 46      */
11 13 Sep 07 nicklas 47     public float getStdv() { return stdv; }
11 13 Sep 07 nicklas 48     
11 13 Sep 07 nicklas 49     /** Sets the stdv
11 13 Sep 07 nicklas 50      * @param value The stdv
11 13 Sep 07 nicklas 51      */
11 13 Sep 07 nicklas 52     public void setStdv(float value) { stdv = value; }
11 13 Sep 07 nicklas 53     
11 13 Sep 07 nicklas 54     /** The pixels. */
11 13 Sep 07 nicklas 55     private short pixels;
11 13 Sep 07 nicklas 56     
11 13 Sep 07 nicklas 57     /** Gets the pixels.
11 13 Sep 07 nicklas 58      * @return The pixels.
11 13 Sep 07 nicklas 59      */
11 13 Sep 07 nicklas 60     public short getPixels() { return pixels; }
11 13 Sep 07 nicklas 61     
11 13 Sep 07 nicklas 62     /** Sets the pixels
11 13 Sep 07 nicklas 63      * @param value The pixels
11 13 Sep 07 nicklas 64      */
11 13 Sep 07 nicklas 65     public void setPixels(short value) { pixels = value; }
11 13 Sep 07 nicklas 66     
11 13 Sep 07 nicklas 67     /** Creates a new instance of CELFileEntryType */
11 13 Sep 07 nicklas 68     public FusionCELFileEntryType() {
11 13 Sep 07 nicklas 69         intensity = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 70         stdv = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 71         pixels = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 72     }
11 13 Sep 07 nicklas 73     
11 13 Sep 07 nicklas 74 }

Generated on Thu Jul 20 09:22:58 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)