affyfusion-109/src/affymetrix/fusion/chp/FusionUniversalProbeSetResults.java

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11 13 Sep 07 nicklas 22 package affymetrix.fusion.chp;
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11 13 Sep 07 nicklas 24 import affymetrix.gcos.chp.*;
11 13 Sep 07 nicklas 25 import affymetrix.calvin.data.*;
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11 13 Sep 07 nicklas 27 /** Stores results for a universal probe set. */
11 13 Sep 07 nicklas 28 public class FusionUniversalProbeSetResults {
11 13 Sep 07 nicklas 29     
11 13 Sep 07 nicklas 30     /** The GCOS probe set results object. */
11 13 Sep 07 nicklas 31     private UniversalProbeSetResults gcosResult;
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11 13 Sep 07 nicklas 33     /** Sets the GCOS probe set results object.
11 13 Sep 07 nicklas 34      * @param r The GCOS probe set results object.
11 13 Sep 07 nicklas 35      */
11 13 Sep 07 nicklas 36     public void setGCOSObject(UniversalProbeSetResults r) { gcosResult=r; }
11 13 Sep 07 nicklas 37     
11 13 Sep 07 nicklas 38     /** The calvin probe set results object. */
11 13 Sep 07 nicklas 39     private CHPUniversalEntry calvinResult;
11 13 Sep 07 nicklas 40     
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** Sets the calvin object.
11 13 Sep 07 nicklas 42      * @param r The calvin probe set object.
11 13 Sep 07 nicklas 43      */
11 13 Sep 07 nicklas 44     public void setCalvinObject(CHPUniversalEntry r) { calvinResult=r; }
11 13 Sep 07 nicklas 45     
11 13 Sep 07 nicklas 46     /** Clears the members. */
11 13 Sep 07 nicklas 47     public void clear() {
11 13 Sep 07 nicklas 48         gcosResult = null;
11 13 Sep 07 nicklas 49         calvinResult = null;
11 13 Sep 07 nicklas 50     }
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11 13 Sep 07 nicklas 52     /** Gets the background value.
11 13 Sep 07 nicklas 53      * @return The background value.
11 13 Sep 07 nicklas 54      */
11 13 Sep 07 nicklas 55     public float getBackground() {
11 13 Sep 07 nicklas 56         if (gcosResult != null)
11 13 Sep 07 nicklas 57             return gcosResult.getBackground();
11 13 Sep 07 nicklas 58         else if (calvinResult != null)
11 13 Sep 07 nicklas 59             return calvinResult.getBackground();
11 13 Sep 07 nicklas 60         return 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 61     }
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11 13 Sep 07 nicklas 63     /** Creates a new instance of UniversalProbeSetResults */
11 13 Sep 07 nicklas 64     public FusionUniversalProbeSetResults() {
11 13 Sep 07 nicklas 65         clear();
11 13 Sep 07 nicklas 66     }
11 13 Sep 07 nicklas 67     
11 13 Sep 07 nicklas 68 }

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