affyfusion-109/src/affymetrix/gcos/cdf/GeneChipQCProbeSetType.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix = 0; Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful = 0; but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not = 0; write to the Free Software Foundation = 0; Inc. = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place = 0; Suite 330 = 0; Boston = 0; MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.gcos.cdf;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 /** Defines the type of QC probe set in a CDF file. */
11 13 Sep 07 nicklas 24 public class GeneChipQCProbeSetType {
11 13 Sep 07 nicklas 25
11 13 Sep 07 nicklas 26     /** Unknown probe set */
11 13 Sep 07 nicklas 27     public static final int UnknownQCProbeSetType = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 28
11 13 Sep 07 nicklas 29     /** Probes used for the checker board patterns for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 30     public static final int CheckerboardNegativeQCProbeSetType = 1;
11 13 Sep 07 nicklas 31
11 13 Sep 07 nicklas 32     /** Probes used for the checker board patterns for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 33     public static final int CheckerboardPositiveQCProbeSetType = 2;
11 13 Sep 07 nicklas 34
11 13 Sep 07 nicklas 35     /** Hybridization control probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 36     public static final int HybNegativeQCProbeSetType = 3;
11 13 Sep 07 nicklas 37
11 13 Sep 07 nicklas 38     /** Hybridization control probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 39     public static final int HybPositiveQCProbeSetType = 4;
11 13 Sep 07 nicklas 40
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** Probes used for text patterns for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 42     public static final int TextFeaturesNegativeQCProbeSetType = 5;
11 13 Sep 07 nicklas 43
11 13 Sep 07 nicklas 44     /** Probes used for text patterns for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 45     public static final int TextFeaturesPositiveQCProbeSetType = 6;
11 13 Sep 07 nicklas 46
11 13 Sep 07 nicklas 47     /** Central probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 48     public static final int CentralNegativeQCProbeSetType = 7;
11 13 Sep 07 nicklas 49
11 13 Sep 07 nicklas 50     /** Central probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 51     public static final int CentralPositiveQCProbeSetType = 8;
11 13 Sep 07 nicklas 52
11 13 Sep 07 nicklas 53     /** Gene expression control probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 54     public static final int GeneExpNegativeQCProbeSetType = 9;
11 13 Sep 07 nicklas 55
11 13 Sep 07 nicklas 56     /** Gene expression control probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 57     public static final int GeneExpPositiveQCProbeSetType = 10;
11 13 Sep 07 nicklas 58
11 13 Sep 07 nicklas 59     /** Cycle fidelity probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 60     public static final int CycleFidelityNegativeQCProbeSetType = 11;
11 13 Sep 07 nicklas 61
11 13 Sep 07 nicklas 62     /** Cycle fidelity probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 63     public static final int CycleFidelityPositiveQCProbeSetType = 12;
11 13 Sep 07 nicklas 64
11 13 Sep 07 nicklas 65     /** Central cross probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 66     public static final int CentralCrossNegativeQCProbeSetType = 13;
11 13 Sep 07 nicklas 67
11 13 Sep 07 nicklas 68     /** Central cross probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 69     public static final int CentralCrossPositiveQCProbeSetType = 14;
11 13 Sep 07 nicklas 70
11 13 Sep 07 nicklas 71     /** X-hyb control probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 72     public static final int CrossHybNegativeQCProbeSetType = 15;
11 13 Sep 07 nicklas 73
11 13 Sep 07 nicklas 74     /** X-hyb control probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 75     public static final int CrossHybPositiveQCProbeSetType = 16;
11 13 Sep 07 nicklas 76
11 13 Sep 07 nicklas 77     /** Space normalization probes for antisense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 78     public static final int SpatialNormalizationNegativeQCProbeSetType = 17;
11 13 Sep 07 nicklas 79
11 13 Sep 07 nicklas 80     /** Space normalization probes for sense arrays. */
11 13 Sep 07 nicklas 81     public static final int SpatialNormalizationPositiveQCProbeSetType = 18;
11 13 Sep 07 nicklas 82
11 13 Sep 07 nicklas 83     /** Creates a new instance of GeneChipQCProbeSetType */
11 13 Sep 07 nicklas 84     public GeneChipQCProbeSetType() {
11 13 Sep 07 nicklas 85     }
11 13 Sep 07 nicklas 86     
11 13 Sep 07 nicklas 87 }

Generated on Thu Jul 20 09:23:10 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)