affyfusion-109/src/affymetrix/gcos/chp/BackgroundZoneType.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21 package affymetrix.gcos.chp;
11 13 Sep 07 nicklas 22
11 13 Sep 07 nicklas 23 import affymetrix.portability.*;
11 13 Sep 07 nicklas 24
11 13 Sep 07 nicklas 25 /** Defines information about a background zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 26 public class BackgroundZoneType {
11 13 Sep 07 nicklas 27     
11 13 Sep 07 nicklas 28     /** The X coordinate of the center of the zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 29     private float centerX;
11 13 Sep 07 nicklas 30     
11 13 Sep 07 nicklas 31     /** Gets the X coordinate of the center of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 32      * @return The X coordinate.
11 13 Sep 07 nicklas 33      */
11 13 Sep 07 nicklas 34     public float getCenterX() { return centerX; }
11 13 Sep 07 nicklas 35     
11 13 Sep 07 nicklas 36     /** Sets the X coordinate of the center of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 37      * @param x The X coordinate.
11 13 Sep 07 nicklas 38      */
11 13 Sep 07 nicklas 39     public void setCenterX(float x) { centerX = x; }
11 13 Sep 07 nicklas 40     
11 13 Sep 07 nicklas 41     /** The Y coordinate of the center of the zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 42     private float centerY;
11 13 Sep 07 nicklas 43     
11 13 Sep 07 nicklas 44     /** Gets the Y coordinate of the center of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 45      * @return The Y coordinate.
11 13 Sep 07 nicklas 46      */
11 13 Sep 07 nicklas 47     public float getCenterY() { return centerY; }
11 13 Sep 07 nicklas 48     
11 13 Sep 07 nicklas 49     /** Sets the Y coordinate of the center of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 50      * @param y The Y coordinate.
11 13 Sep 07 nicklas 51      */
11 13 Sep 07 nicklas 52     public void setCenterY(float y) { centerY = y; }
11 13 Sep 07 nicklas 53     
11 13 Sep 07 nicklas 54     /** The background value for the zone. */
11 13 Sep 07 nicklas 55     private float background;
11 13 Sep 07 nicklas 56     
11 13 Sep 07 nicklas 57     /** Gets the background.
11 13 Sep 07 nicklas 58      * @return The background value for the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 59      */
11 13 Sep 07 nicklas 60     public float getBackground() { return background; }
11 13 Sep 07 nicklas 61  
11 13 Sep 07 nicklas 62     /** Sets the background.
11 13 Sep 07 nicklas 63      * @param b The background value for the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 64      */
11 13 Sep 07 nicklas 65     public void setBackground(float b) { background = b; }
11 13 Sep 07 nicklas 66     
11 13 Sep 07 nicklas 67     /** Creates a new instance of BackgroundZoneType */
11 13 Sep 07 nicklas 68     public BackgroundZoneType() {
11 13 Sep 07 nicklas 69         centerX = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 70         centerY = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 71         background = 0.0f;
11 13 Sep 07 nicklas 72     }
11 13 Sep 07 nicklas 73     
11 13 Sep 07 nicklas 74     /** Creates a new instance of BackgroundZoneType with values.
11 13 Sep 07 nicklas 75      * @param z The background zone.
11 13 Sep 07 nicklas 76      */
11 13 Sep 07 nicklas 77     public BackgroundZoneType(BackgroundZoneType z) {
11 13 Sep 07 nicklas 78         centerX = z.getCenterX();
11 13 Sep 07 nicklas 79         centerY = z.getCenterY();
11 13 Sep 07 nicklas 80         background = z.getBackground();
11 13 Sep 07 nicklas 81     }
11 13 Sep 07 nicklas 82     
11 13 Sep 07 nicklas 83     /** Creates a new instance of BackgroundZoneType with values.
11 13 Sep 07 nicklas 84      * @param x The x coordinate of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 85      * @param y The y coordinate of the zone.
11 13 Sep 07 nicklas 86      * @param b The background value.
11 13 Sep 07 nicklas 87      */
11 13 Sep 07 nicklas 88     public BackgroundZoneType(float x, float y, float b) {
11 13 Sep 07 nicklas 89         centerX = x;
11 13 Sep 07 nicklas 90         centerY = y;
11 13 Sep 07 nicklas 91         background = b;
11 13 Sep 07 nicklas 92     }
11 13 Sep 07 nicklas 93     
11 13 Sep 07 nicklas 94     /** The number of bytes used to store the zone information in the CHP file. */
11 13 Sep 07 nicklas 95     public static final int ZONE_INFO_TYPE_SIZE = 3*DataSizes.FLOAT_SIZE;
11 13 Sep 07 nicklas 96 }

Generated on Thu Jul 20 09:23:13 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)