affyfusion-109/src/affymetrix/gcos/chp/BaseCallType.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
11 13 Sep 07 nicklas 1 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 2 //
11 13 Sep 07 nicklas 3 // Copyright (C) 2005 Affymetrix, Inc.
11 13 Sep 07 nicklas 4 //
11 13 Sep 07 nicklas 5 // This library is free software; you can redistribute it and/or modify
11 13 Sep 07 nicklas 6 // it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published
11 13 Sep 07 nicklas 7 // by the Free Software Foundation; either version 2.1 of the License,
11 13 Sep 07 nicklas 8 // or (at your option) any later version.
11 13 Sep 07 nicklas 9 //
11 13 Sep 07 nicklas 10 // This library is distributed in the hope that it will be useful, but
11 13 Sep 07 nicklas 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
11 13 Sep 07 nicklas 12 // or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 13 // for more details.
11 13 Sep 07 nicklas 14 //
11 13 Sep 07 nicklas 15 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
11 13 Sep 07 nicklas 16 // along with this library; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
11 13 Sep 07 nicklas 17 // 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
11 13 Sep 07 nicklas 18 //
11 13 Sep 07 nicklas 19 /////////////////////////////////////////////////////////////////
11 13 Sep 07 nicklas 20
11 13 Sep 07 nicklas 21
11 13 Sep 07 nicklas 22 package affymetrix.gcos.chp;
11 13 Sep 07 nicklas 23
11 13 Sep 07 nicklas 24 /** Holds a call at a given position. */
11 13 Sep 07 nicklas 25 public class BaseCallType {
11 13 Sep 07 nicklas 26     
11 13 Sep 07 nicklas 27     /** The position (index) of the call. */
11 13 Sep 07 nicklas 28     private int position;
11 13 Sep 07 nicklas 29     
11 13 Sep 07 nicklas 30     /** Gets the position (index) of the call.
11 13 Sep 07 nicklas 31      * @return The position
11 13 Sep 07 nicklas 32      */
11 13 Sep 07 nicklas 33     public int getPosition() { return position; }
11 13 Sep 07 nicklas 34
11 13 Sep 07 nicklas 35     /** Sets the position (index) of the call.
11 13 Sep 07 nicklas 36      * @param p The position
11 13 Sep 07 nicklas 37      */
11 13 Sep 07 nicklas 38     public void setPosition(int p) { position=p; }
11 13 Sep 07 nicklas 39
11 13 Sep 07 nicklas 40     /** The call. */
11 13 Sep 07 nicklas 41     public char call;
11 13 Sep 07 nicklas 42
11 13 Sep 07 nicklas 43     /** Gets the call.
11 13 Sep 07 nicklas 44      * @return The call
11 13 Sep 07 nicklas 45      */
11 13 Sep 07 nicklas 46     public char getCall() { return call; }
11 13 Sep 07 nicklas 47
11 13 Sep 07 nicklas 48     /** Sets the call.
11 13 Sep 07 nicklas 49      * @param c The call
11 13 Sep 07 nicklas 50      */
11 13 Sep 07 nicklas 51     public void setCall(char c) { call=c; }
11 13 Sep 07 nicklas 52
11 13 Sep 07 nicklas 53     /** Creates a new instance of BaseCallType */
11 13 Sep 07 nicklas 54     public BaseCallType() {
11 13 Sep 07 nicklas 55         position = 0;
11 13 Sep 07 nicklas 56         call = ' ';
11 13 Sep 07 nicklas 57     }
11 13 Sep 07 nicklas 58     
11 13 Sep 07 nicklas 59     /** Creates a new instance of BaseCallType */
11 13 Sep 07 nicklas 60     public BaseCallType(BaseCallType b) {
11 13 Sep 07 nicklas 61         position = b.getPosition();
11 13 Sep 07 nicklas 62         call = b.getCall();
11 13 Sep 07 nicklas 63     }
11 13 Sep 07 nicklas 64         
11 13 Sep 07 nicklas 65 }