mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/BlockGraphViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 package org.tigr.microarray.mev;
2 26 Feb 07 jari 2
2 26 Feb 07 jari 3 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 4 import java.awt.Graphics2D;
2 26 Feb 07 jari 5 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 6 import java.awt.RenderingHints;
2 26 Feb 07 jari 7 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 8 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10 import javax.swing.JButton;
2 26 Feb 07 jari 11 import javax.swing.JFrame;
2 26 Feb 07 jari 12 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import org.tigr.graph.GraphBar;
2 26 Feb 07 jari 15 import org.tigr.graph.GraphElement;
2 26 Feb 07 jari 16 import org.tigr.graph.GraphLine;
2 26 Feb 07 jari 17 import org.tigr.graph.GraphPoint;
2 26 Feb 07 jari 18 import org.tigr.graph.GraphTick;
2 26 Feb 07 jari 19 import org.tigr.graph.GraphViewer;
2 26 Feb 07 jari 20 import org.tigr.util.awt.GBA;
2 26 Feb 07 jari 21
2 26 Feb 07 jari 22 public class BlockGraphViewer extends GraphViewer {
2 26 Feb 07 jari 23   
2 26 Feb 07 jari 24   public int maxRows;
2 26 Feb 07 jari 25   public int maxColumns;
2 26 Feb 07 jari 26   
2 26 Feb 07 jari 27   public JPanel buttonPanel;
2 26 Feb 07 jari 28   public JButton button;
2 26 Feb 07 jari 29    
2 26 Feb 07 jari 30   public JButton allButton;
2 26 Feb 07 jari 31   public JButton noneButton;
2 26 Feb 07 jari 32   
2 26 Feb 07 jari 33   private boolean[] visibles;
2 26 Feb 07 jari 34   private Color[] colors = {Color.black, Color.blue, Color.red, Color.yellow, Color.orange, Color.magenta, 
2 26 Feb 07 jari 35                 Color.cyan, Color.pink, Color.green, Color.gray, Color.lightGray, Color.darkGray};
2 26 Feb 07 jari 36
2 26 Feb 07 jari 37   public BlockGraphViewer(JFrame frame, int maxRows, int maxColumns, int startx, int stopx, int starty, int stopy, double graphstartx, double graphstopx, double graphstarty, double graphstopy, int preXSpacing, int postXSpacing, int preYSpacing, int postYSpacing, String title, String xLabel, String yLabel) {
2 26 Feb 07 jari 38     
2 26 Feb 07 jari 39     super(frame, startx, stopx, starty, stopy, graphstartx, graphstopx, graphstarty, graphstopy,
2 26 Feb 07 jari 40         preXSpacing, postXSpacing, preYSpacing, postYSpacing, title, xLabel, yLabel);
2 26 Feb 07 jari 41     
2 26 Feb 07 jari 42     this.maxRows = maxRows;
2 26 Feb 07 jari 43     this.maxColumns = maxColumns;
2 26 Feb 07 jari 44     
2 26 Feb 07 jari 45     generatePalette();
2 26 Feb 07 jari 46     
2 26 Feb 07 jari 47     visibles = new boolean[maxRows * maxColumns];
2 26 Feb 07 jari 48     for (int i = 0; i < visibles.length; i++) {
2 26 Feb 07 jari 49       visibles[i] = true;
2 26 Feb 07 jari 50     }
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     buttonPanel = new JPanel();
2 26 Feb 07 jari 53     buttonPanel.setLayout(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 54     
2 26 Feb 07 jari 55     allButton = new JButton("All");
2 26 Feb 07 jari 56     allButton.addActionListener(new ActionListener() {
2 26 Feb 07 jari 57       public void actionPerformed(ActionEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 58         for (int i = 0; i < visibles.length; i++) {
2 26 Feb 07 jari 59           visibles[i] = true;
2 26 Feb 07 jari 60         }
2 26 Feb 07 jari 61         repaint();
2 26 Feb 07 jari 62       }
2 26 Feb 07 jari 63     });
2 26 Feb 07 jari 64     gba.add(buttonPanel, allButton, 0, 0, 1, 1, 1, 1, GBA.B, GBA.C);
2 26 Feb 07 jari 65     
2 26 Feb 07 jari 66     noneButton = new JButton("None");
2 26 Feb 07 jari 67     noneButton.addActionListener(new ActionListener() {
2 26 Feb 07 jari 68       public void actionPerformed(ActionEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 69         for (int i = 0; i < visibles.length; i++) {
2 26 Feb 07 jari 70           visibles[i] = false;
2 26 Feb 07 jari 71         }
2 26 Feb 07 jari 72         repaint();
2 26 Feb 07 jari 73       }
2 26 Feb 07 jari 74     });
2 26 Feb 07 jari 75     gba.add(buttonPanel, noneButton, 1, 0, 1, 1, 1, 1, GBA.B, GBA.C);
2 26 Feb 07 jari 76     
2 26 Feb 07 jari 77     for (int i = 0; i < maxRows; i++) {
2 26 Feb 07 jari 78       for (int j = 0; j < maxColumns; j++) {
2 26 Feb 07 jari 79         button = new JButton((j + 1) + ", " + (i + 1));
2 26 Feb 07 jari 80         final int location = (maxColumns * i + j);
2 26 Feb 07 jari 81                                 if(i == 0 && j == 0)
2 26 Feb 07 jari 82                                     button.setForeground(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 83         button.setBackground(colors[location]);
2 26 Feb 07 jari 84         button.addActionListener(new ActionListener() {
2 26 Feb 07 jari 85           public void actionPerformed(ActionEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 86             visibles[location] = (! visibles[location]);
2 26 Feb 07 jari 87             repaint();
2 26 Feb 07 jari 88           }
2 26 Feb 07 jari 89         });
2 26 Feb 07 jari 90         
2 26 Feb 07 jari 91         gba.add(buttonPanel, button, j, i + 1, 1, 1, 1, 1, GBA.B, GBA.C);
2 26 Feb 07 jari 92       }
2 26 Feb 07 jari 93     }
2 26 Feb 07 jari 94     
2 26 Feb 07 jari 95     frame.getContentPane().add(buttonPanel);
2 26 Feb 07 jari 96   }
2 26 Feb 07 jari 97   
2 26 Feb 07 jari 98   public void generatePalette() {
2 26 Feb 07 jari 99     
2 26 Feb 07 jari 100     int elements = maxColumns * maxRows;
2 26 Feb 07 jari 101     int strata;
2 26 Feb 07 jari 102     
2 26 Feb 07 jari 103     if (elements != 12) {
2 26 Feb 07 jari 104       for (strata = 0; (strata * strata * strata) < elements; strata++) {;}
2 26 Feb 07 jari 105       colors = new Color[strata * strata * strata];
2 26 Feb 07 jari 106       for (int r = strata - 1; r >= 0; r--) {
2 26 Feb 07 jari 107         for (int g = strata - 1; g >= 0; g--) {
2 26 Feb 07 jari 108           for (int b = strata - 1; b >= 0; b--) {
2 26 Feb 07 jari 109 //      for (int r = 0; r < strata; r++) {
2 26 Feb 07 jari 110 //        for (int g = 0; g < strata; g++) {
2 26 Feb 07 jari 111 //          for (int b = 0; b < strata; b++) {
2 26 Feb 07 jari 112             colors[(r * strata * strata) + (g * strata) + b] = new Color((int) ((double) r * 255 / (strata - 1)), 
2 26 Feb 07 jari 113                                             (int) ((double) g * 255 / (strata - 1)), 
2 26 Feb 07 jari 114                                             (int) ((double) b * 255 / (strata - 1)));
2 26 Feb 07 jari 115           }
2 26 Feb 07 jari 116         }
2 26 Feb 07 jari 117       }
2 26 Feb 07 jari 118     }
2 26 Feb 07 jari 119   }
2 26 Feb 07 jari 120   
2 26 Feb 07 jari 121   public Color[] getColors() {return this.colors;}
2 26 Feb 07 jari 122   public boolean[] getVisibles() {return this.visibles;}
2 26 Feb 07 jari 123   
2 26 Feb 07 jari 124   public void drawGraph(Graphics2D g) {
2 26 Feb 07 jari 125   
2 26 Feb 07 jari 126     GraphElement e;
2 26 Feb 07 jari 127     
2 26 Feb 07 jari 128     g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_OFF);
2 26 Feb 07 jari 129     
2 26 Feb 07 jari 130     drawSystem(g, SYSTEM_BOUNDS);
2 26 Feb 07 jari 131     for (int i = 0; i < graphElements.size(); i++) {
2 26 Feb 07 jari 132       e = (GraphElement) graphElements.elementAt(i);
2 26 Feb 07 jari 133       if (e instanceof GraphPoint) {
2 26 Feb 07 jari 134         for (int j = 0; j < visibles.length; j++) {
2 26 Feb 07 jari 135           if ((visibles[j] == true) && (((GraphPoint) e).getColor() == colors[j])) {
2 26 Feb 07 jari 136             drawPoint(g, (GraphPoint) e);
2 26 Feb 07 jari 137           }
2 26 Feb 07 jari 138         }
2 26 Feb 07 jari 139       } else if (e instanceof GraphBar) {
2 26 Feb 07 jari 140         drawBar(g, (GraphBar) e);
2 26 Feb 07 jari 141       } else if (e instanceof GraphTick) {
2 26 Feb 07 jari 142         drawTick(g, (GraphTick) e);
2 26 Feb 07 jari 143       } else if (e instanceof GraphLine) {
2 26 Feb 07 jari 144         drawLine(g, (GraphLine) e);
2 26 Feb 07 jari 145       }
2 26 Feb 07 jari 146     }
2 26 Feb 07 jari 147     
2 26 Feb 07 jari 148     if (referenceLinesOn) { //Grid tracing is active
2 26 Feb 07 jari 149       int x = getXOldEvent();
2 26 Feb 07 jari 150       int y = getYOldEvent();
2 26 Feb 07 jari 151       
2 26 Feb 07 jari 152       if ((x <= convertX(graphstopx)) && (x >= convertX(graphstartx))) {
2 26 Feb 07 jari 153         g.setColor(Color.magenta);
2 26 Feb 07 jari 154         g.drawLine(x, convertY(graphstarty), x, convertY(graphstopy));
2 26 Feb 07 jari 155       }
2 26 Feb 07 jari 156       if ((y >= convertY(graphstopy)) && (y <= convertY(graphstarty))) {
2 26 Feb 07 jari 157         g.setColor(Color.magenta);
2 26 Feb 07 jari 158         g.drawLine(convertX(graphstartx), y, convertX(graphstopx), y);
2 26 Feb 07 jari 159       }
2 26 Feb 07 jari 160     }
2 26 Feb 07 jari 161     
2 26 Feb 07 jari 162     drawXLabel(g, xLabel, Color.black);
2 26 Feb 07 jari 163     drawYLabel(g, yLabel, Color.black);
2 26 Feb 07 jari 164     drawTitle(g, title, Color.black);
2 26 Feb 07 jari 165   }
2 26 Feb 07 jari 166 }

Generated on Thu Jul 20 09:30:49 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)