mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/CustomToolbarInitDialog.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 package org.tigr.microarray.mev;
2 26 Feb 07 jari 2 /*
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4  */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * CustomToolbarInitDialog.java
2 26 Feb 07 jari 7  *
2 26 Feb 07 jari 8  * 
2 26 Feb 07 jari 9  */
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 12 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 13 import java.awt.Graphics;
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.GridBagConstraints;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.Image;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.Point;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.Toolkit;
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 21 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 22 import java.awt.event.ItemEvent;
2 26 Feb 07 jari 23 import java.awt.event.ItemListener;
2 26 Feb 07 jari 24 import java.awt.event.WindowEvent;
2 26 Feb 07 jari 25 import java.util.Hashtable;
2 26 Feb 07 jari 26 import java.util.Vector;
2 26 Feb 07 jari 27
2 26 Feb 07 jari 28 import javax.swing.Action;
2 26 Feb 07 jari 29 import javax.swing.BorderFactory;
2 26 Feb 07 jari 30 import javax.swing.ButtonGroup;
2 26 Feb 07 jari 31 import javax.swing.Icon;
2 26 Feb 07 jari 32 import javax.swing.JCheckBox;
2 26 Feb 07 jari 33 import javax.swing.JFrame;
2 26 Feb 07 jari 34 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 35 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 36 import javax.swing.JScrollPane;
2 26 Feb 07 jari 37 import javax.swing.border.BevelBorder;
2 26 Feb 07 jari 38
2 26 Feb 07 jari 39 import org.tigr.microarray.mev.action.ActionManager;
2 26 Feb 07 jari 40 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.IClusterGUI;
2 26 Feb 07 jari 41 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.GUIFactory;
2 26 Feb 07 jari 42 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.AlgorithmDialog;
2 26 Feb 07 jari 43 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.DialogListener;
2 26 Feb 07 jari 44 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.ParameterPanel;
2 26 Feb 07 jari 45 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.dialogHelpUtil.HelpWindow;
2 26 Feb 07 jari 46 import org.tigr.microarray.mev.script.util.ScriptConstants;
2 26 Feb 07 jari 47
2 26 Feb 07 jari 48
2 26 Feb 07 jari 49 public class CustomToolbarInitDialog extends AlgorithmDialog {
2 26 Feb 07 jari 50     
2 26 Feb 07 jari 51     /** result
2 26 Feb 07 jari 52      */    
2 26 Feb 07 jari 53     private int result;    
2 26 Feb 07 jari 54     /** algorithm index
2 26 Feb 07 jari 55      */    
2 26 Feb 07 jari 56     private int algorithmIndex = -1;    
2 26 Feb 07 jari 57    
2 26 Feb 07 jari 58     private String currentAlgorithmName;    
2 26 Feb 07 jari 59     /** main panel for components
2 26 Feb 07 jari 60      */    
2 26 Feb 07 jari 61     private JPanel mainPanel;
2 26 Feb 07 jari 62     /** action manager to accumulate available mev algorithms for presentation
2 26 Feb 07 jari 63      */    
2 26 Feb 07 jari 64     private ActionManager actionManager;    
2 26 Feb 07 jari 65     /** analysis algorithm selection controls
2 26 Feb 07 jari 66      */    
2 26 Feb 07 jari 67     private AlgorithmSelectionPanel algSelPanel;
2 26 Feb 07 jari 68     
2 26 Feb 07 jari 69     private JScrollPane sPane;
2 26 Feb 07 jari 70     /** Creates a new instance of CustomToolbarInitDialog
2 26 Feb 07 jari 71      * @param manager ActionManager to provide available algorithm
2 26 Feb 07 jari 72      */
2 26 Feb 07 jari 73     public CustomToolbarInitDialog(ActionManager manager) {
2 26 Feb 07 jari 74         super(new JFrame(), "Customized MenuToolbar Initialization Dialog", true);
2 26 Feb 07 jari 75         this.actionManager = manager;
2 26 Feb 07 jari 76         result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 77         
2 26 Feb 07 jari 78         mainPanel = new JPanel(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 79         mainPanel.setBackground(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 80         this.setResetButtonText("Select All");
2 26 Feb 07 jari 81         //previewPanel = new PreviewPanel();
2 26 Feb 07 jari 82         algSelPanel = new AlgorithmSelectionPanel(actionManager);
2 26 Feb 07 jari 83         sPane=new JScrollPane(algSelPanel);
2 26 Feb 07 jari 84         //mainPanel.add(previewPanel, new GridBagConstraints(0,0,1,1,1,0,GridBagConstraints.CENTER, GridBagConstraints.BOTH, new Insets(0,0,0,0), 0,0));
2 26 Feb 07 jari 85         mainPanel.add(sPane, new GridBagConstraints(0,0,1,2,1,1,GridBagConstraints.CENTER, GridBagConstraints.BOTH, new Insets(0,0,0,0), 0,0));
2 26 Feb 07 jari 86         
2 26 Feb 07 jari 87         Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 88         addWindowListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 89         addContent(mainPanel);
2 26 Feb 07 jari 90         setActionListeners(listener);
2 26 Feb 07 jari 91         pack();
2 26 Feb 07 jari 92         /*
2 26 Feb 07 jari 93         if(!isAffyData)
2 26 Feb 07 jari 94             setSize(new Dimension(510, 587));
2 26 Feb 07 jari 95         else
2 26 Feb 07 jari 96             setSize(new Dimension(510, 665));
2 26 Feb 07 jari 97             */
2 26 Feb 07 jari 98         setSize(new Dimension(520, 665));
2 26 Feb 07 jari 99     }
2 26 Feb 07 jari 100     
2 26 Feb 07 jari 101     /**
2 26 Feb 07 jari 102      * Shows the dialog.
2 26 Feb 07 jari 103      */
2 26 Feb 07 jari 104     public int showModal() {
2 26 Feb 07 jari 105         Dimension screenSize = Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
2 26 Feb 07 jari 106         setLocation((screenSize.width - getSize().width)/2, (screenSize.height - getSize().height)/2);
2 26 Feb 07 jari 107         show();
2 26 Feb 07 jari 108         return result;
2 26 Feb 07 jari 109     }
2 26 Feb 07 jari 110     
2 26 Feb 07 jari 111     
2 26 Feb 07 jari 112     /** Resets the controls
2 26 Feb 07 jari 113      */    
2 26 Feb 07 jari 114     public void onReset() {
2 26 Feb 07 jari 115        TMEV.initCustomerAnalysis(getAlgorithmCount(this.actionManager));
2 26 Feb 07 jari 116       
2 26 Feb 07 jari 117     }
2 26 Feb 07 jari 118     
2 26 Feb 07 jari 119     /** returns algorithm name
2 26 Feb 07 jari 120      */    
2 26 Feb 07 jari 121     public String getAlgorithmName() {
2 26 Feb 07 jari 122         return currentAlgorithmName;
2 26 Feb 07 jari 123     }
2 26 Feb 07 jari 124     
2 26 Feb 07 jari 125     /** returns the algorthms index
2 26 Feb 07 jari 126      */    
2 26 Feb 07 jari 127     public int getAlgorithmIndex() {
2 26 Feb 07 jari 128         int index;
2 26 Feb 07 jari 129         if(currentAlgorithmName != null) {
2 26 Feb 07 jari 130             String number = (String)(algSelPanel.indexHash.get(currentAlgorithmName));
2 26 Feb 07 jari 131             if(number != null) {
2 26 Feb 07 jari 132                 return Integer.parseInt(number);
2 26 Feb 07 jari 133             }
2 26 Feb 07 jari 134         }
2 26 Feb 07 jari 135         return -1;
2 26 Feb 07 jari 136     }
2 26 Feb 07 jari 137     public int getAlgorithmCount(ActionManager actionManager) {
2 26 Feb 07 jari 138         int total=0;
2 26 Feb 07 jari 139         Action action;
2 26 Feb 07 jari 140         while ((action = actionManager.getAction(ActionManager.ANALYSIS_ACTION+String.valueOf(total)))!=null){
2 26 Feb 07 jari 141           total++;
2 26 Feb 07 jari 142         }
2 26 Feb 07 jari 143         return total;
2 26 Feb 07 jari 144     }
2 26 Feb 07 jari 145     public int getSelAlgorithmCount() {
2 26 Feb 07 jari 146         int count=0;
2 26 Feb 07 jari 147         for(int i=0;i<TMEV.getCustomerAnalysisList().length();i++){
2 26 Feb 07 jari 148           if(TMEV.getCustomerAnalysis()[i]==1)
2 26 Feb 07 jari 149             count++;
2 26 Feb 07 jari 150         }
2 26 Feb 07 jari 151         return count;
2 26 Feb 07 jari 152     }
2 26 Feb 07 jari 153     
2 26 Feb 07 jari 154     private class AlgorithmSelectionPanel extends ParameterPanel {
2 26 Feb 07 jari 155       Hashtable descriptions;
2 26 Feb 07 jari 156         //Hashtable locations;
2 26 Feb 07 jari 157         Hashtable indexHash;
2 26 Feb 07 jari 158         JPanel checkboxPanel;
2 26 Feb 07 jari 159         int totalCount;
2 26 Feb 07 jari 160         JCheckBox cbox;
2 26 Feb 07 jari 161         Icon icon;
2 26 Feb 07 jari 162         AlgorithmSelectionPanel(ActionManager actionManager) {
2 26 Feb 07 jari 163             super("Algorithm Selection");
2 26 Feb 07 jari 164             setLayout(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 165             setBackground(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 166             checkboxPanel=new JPanel();
2 26 Feb 07 jari 167             GridBagLayout gridbag=new GridBagLayout();
2 26 Feb 07 jari 168             checkboxPanel.setLayout(gridbag);
2 26 Feb 07 jari 169           Action action;
2 26 Feb 07 jari 170           int algCnt = 0,i=0,j=0;
2 26 Feb 07 jari 171           CheckboxListener cboxListener;
2 26 Feb 07 jari 172           GridBagConstraints gbc = new GridBagConstraints();
2 26 Feb 07 jari 173           while ((action = actionManager.getAction(ActionManager.ANALYSIS_ACTION+String.valueOf(totalCount)))!=null){
2 26 Feb 07 jari 174             totalCount++;
2 26 Feb 07 jari 175           }
2 26 Feb 07 jari 176           while ((action = actionManager.getAction(ActionManager.ANALYSIS_ACTION+String.valueOf(algCnt)))!=null){
2 26 Feb 07 jari 177             boolean select=false;
2 26 Feb 07 jari 178                 if(action != null) {
2 26 Feb 07 jari 179                     int m=0,count=TMEV.getCustomerAnalysis().length;
2 26 Feb 07 jari 180                     if(count!=totalCount){
2 26 Feb 07 jari 181                       TMEV.initCustomerAnalysis(totalCount);
2 26 Feb 07 jari 182                     }
2 26 Feb 07 jari 183                     int mytag[]=new int[count];
2 26 Feb 07 jari 184                     for(m=0;m<count;m++)
2 26 Feb 07 jari 185                       mytag[m]=TMEV.getCustomerAnalysis()[m];
2 26 Feb 07 jari 186                       if(mytag[algCnt]==1)
2 26 Feb 07 jari 187                        select =true;
2 26 Feb 07 jari 188                     
2 26 Feb 07 jari 189                   cbox=new JCheckBox();
2 26 Feb 07 jari 190                   cbox.setIcon((Icon)action.getValue(ActionManager.LARGE_ICON));
2 26 Feb 07 jari 191                   cbox.setBorderPainted(true);
2 26 Feb 07 jari 192                   cbox.setSelected(select);
2 26 Feb 07 jari 193                   cboxListener=new CheckboxListener(totalCount,algCnt); 
2 26 Feb 07 jari 194                   cbox.addItemListener(cboxListener);             
2 26 Feb 07 jari 195                   buildConstraints(gbc,j,i,1,1,25,20);
2 26 Feb 07 jari 196                   gridbag.setConstraints(cbox,gbc);
2 26 Feb 07 jari 197                   checkboxPanel.add(cbox);
2 26 Feb 07 jari 198                   algCnt++;
2 26 Feb 07 jari 199                   if(j<3)
2 26 Feb 07 jari 200                     j++;
2 26 Feb 07 jari 201                   else{
2 26 Feb 07 jari 202                     j=0;
2 26 Feb 07 jari 203                     i++;
2 26 Feb 07 jari 204                     }
2 26 Feb 07 jari 205                 }
2 26 Feb 07 jari 206         }
2 26 Feb 07 jari 207           add(checkboxPanel, new GridBagConstraints(0,0,1,1,1,1,GridBagConstraints.CENTER, GridBagConstraints.BOTH, new Insets(0,0,0,0), 0,0));
2 26 Feb 07 jari 208             //descriptions = new Hashtable();
2 26 Feb 07 jari 209             //indexHash = new Hashtable();
2 26 Feb 07 jari 210             // locations = new Hashtable();
2 26 Feb 07 jari 211            
2 26 Feb 07 jari 212         }
2 26 Feb 07 jari 213         void buildConstraints(GridBagConstraints gbc, int gx, int gy,
2 26 Feb 07 jari 214               int gw, int gh, int wx, int wy) {
2 26 Feb 07 jari 215                   
2 26 Feb 07 jari 216                   gbc.gridx = gx;
2 26 Feb 07 jari 217                   gbc.gridy = gy;
2 26 Feb 07 jari 218                   gbc.gridwidth = gw;
2 26 Feb 07 jari 219                   gbc.gridheight = gh;
2 26 Feb 07 jari 220                   gbc.weightx = wx;
2 26 Feb 07 jari 221                   gbc.weighty = wy;
2 26 Feb 07 jari 222               }
2 26 Feb 07 jari 223               
2 26 Feb 07 jari 224     }
2 26 Feb 07 jari 225     private class CheckboxListener implements ItemListener{
2 26 Feb 07 jari 226       //JCheckBox cbox;
2 26 Feb 07 jari 227       int tag;
2 26 Feb 07 jari 228       int count;
2 26 Feb 07 jari 229       CheckboxListener(int i,int j){
2 26 Feb 07 jari 230         count=i;
2 26 Feb 07 jari 231         tag=j;
2 26 Feb 07 jari 232       }
2 26 Feb 07 jari 233       public void itemStateChanged(ItemEvent e){
2 26 Feb 07 jari 234         if(e.getStateChange()==ItemEvent.SELECTED){
2 26 Feb 07 jari 235           TMEV.setCustomerAnalysis(count,tag,1);
2 26 Feb 07 jari 236         }
2 26 Feb 07 jari 237         if(e.getStateChange()==ItemEvent.DESELECTED){
2 26 Feb 07 jari 238           TMEV.setCustomerAnalysis(count,tag,0);
2 26 Feb 07 jari 239         }
2 26 Feb 07 jari 240       }
2 26 Feb 07 jari 241     }
2 26 Feb 07 jari 242  
2 26 Feb 07 jari 243     /**
2 26 Feb 07 jari 244      * The class to listen to the dialog events.
2 26 Feb 07 jari 245      */
2 26 Feb 07 jari 246     private class Listener extends DialogListener {
2 26 Feb 07 jari 247         
2 26 Feb 07 jari 248         public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 249             Object source = e.getSource();
2 26 Feb 07 jari 250             if (source == okButton) {
2 26 Feb 07 jari 251                 result = JOptionPane.OK_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 252                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 253             } else if (source == cancelButton) {
2 26 Feb 07 jari 254                 result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 255                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 256             }
2 26 Feb 07 jari 257             else if (source == resetButton) {
2 26 Feb 07 jari 258                 onReset();
2 26 Feb 07 jari 259             }
2 26 Feb 07 jari 260             else if (source == infoButton){
2 26 Feb 07 jari 261                 HelpWindow hw = new HelpWindow(CustomToolbarInitDialog.this, "Script Algorithm Initialization Dialog");
2 26 Feb 07 jari 262                 if(hw.getWindowContent()){
2 26 Feb 07 jari 263                     hw.setSize(450,650);
2 26 Feb 07 jari 264                     hw.setLocation();
2 26 Feb 07 jari 265                     hw.show();
2 26 Feb 07 jari 266                 }
2 26 Feb 07 jari 267                 else {
2 26 Feb 07 jari 268                     hw.setVisible(false);
2 26 Feb 07 jari 269                     hw.dispose();
2 26 Feb 07 jari 270                 }
2 26 Feb 07 jari 271             }
2 26 Feb 07 jari 272         }
2 26 Feb 07 jari 273         
2 26 Feb 07 jari 274         public void windowClosing(WindowEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 275             result = JOptionPane.CLOSED_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 276             dispose();
2 26 Feb 07 jari 277         }
2 26 Feb 07 jari 278     }
2 26 Feb 07 jari 279     
2 26 Feb 07 jari 280 }

Generated on Thu Jul 20 09:30:50 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)