mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/GenePixCutoffDialog.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2004, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  by wwang
2 26 Feb 07 jari 7  */
2 26 Feb 07 jari 8 package org.tigr.microarray.mev;
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 11 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 12 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 13 import java.awt.Toolkit;
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 15
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.event.KeyEvent;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.KeyListener;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.event.WindowAdapter;
2 26 Feb 07 jari 21 import java.awt.event.WindowEvent;
2 26 Feb 07 jari 22
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.BorderFactory;
2 26 Feb 07 jari 24 import javax.swing.JCheckBox;
2 26 Feb 07 jari 25 import javax.swing.JFrame;
2 26 Feb 07 jari 26 import javax.swing.JLabel;
2 26 Feb 07 jari 27 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 28 import javax.swing.JTextField;
2 26 Feb 07 jari 29 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 30
2 26 Feb 07 jari 31 import org.tigr.util.awt.GBA;
2 26 Feb 07 jari 32
2 26 Feb 07 jari 33 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.AlgorithmDialog;
2 26 Feb 07 jari 34 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.dialogHelpUtil.HelpWindow;
2 26 Feb 07 jari 35
2 26 Feb 07 jari 36
2 26 Feb 07 jari 37 public class GenePixCutoffDialog extends AlgorithmDialog {
2 26 Feb 07 jari 38     
2 26 Feb 07 jari 39     private float originalValue;
2 26 Feb 07 jari 40     private int result;
2 26 Feb 07 jari 41     private JTextField textField;
2 26 Feb 07 jari 42     private JCheckBox enableCheckBox;
2 26 Feb 07 jari 43     private JLabel percentageLabel;
2 26 Feb 07 jari 44     
2 26 Feb 07 jari 45     public GenePixCutoffDialog(JFrame parent, float percentage) {
2 26 Feb 07 jari 46   super(parent, "Set GenePix Flags Filter", true);  
2 26 Feb 07 jari 47   Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 48   originalValue = percentage;
2 26 Feb 07 jari 49         
2 26 Feb 07 jari 50   GBA gba = new GBA();
2 26 Feb 07 jari 51   
2 26 Feb 07 jari 52         enableCheckBox = new JCheckBox("Enable GenePix Flags Filter", true);
2 26 Feb 07 jari 53         enableCheckBox.setActionCommand("enable-check-box-command");
2 26 Feb 07 jari 54         enableCheckBox.setOpaque(false);
2 26 Feb 07 jari 55         enableCheckBox.setFocusPainted(false);        
2 26 Feb 07 jari 56         enableCheckBox.addActionListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 57         
2 26 Feb 07 jari 58   percentageLabel = new JLabel("Above Percentage((samples with negative flags) /(total samples)) for each gene");
2 26 Feb 07 jari 59   percentageLabel.setHorizontalTextPosition(JLabel.RIGHT);
2 26 Feb 07 jari 60         percentageLabel.setHorizontalAlignment(JLabel.RIGHT);
2 26 Feb 07 jari 61    
2 26 Feb 07 jari 62   textField = new JTextField(10);
2 26 Feb 07 jari 63         textField.setText(String.valueOf(percentage));
2 26 Feb 07 jari 64         textField.selectAll();
2 26 Feb 07 jari 65   textField.addKeyListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 66
2 26 Feb 07 jari 67         JPanel panel = new JPanel(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 68         panel.setBackground(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 69         panel.setBorder(BorderFactory.createLineBorder(Color.black));
2 26 Feb 07 jari 70
2 26 Feb 07 jari 71         gba.add(panel, enableCheckBox, 0, 0, 2, 1, 0, 0, GBA.V, GBA.C, new Insets(25, 5, 0, 5), 0, 0);
2 26 Feb 07 jari 72   gba.add(panel, percentageLabel, 0, 1, 1, 1, 1, 0, GBA.B, GBA.E, new Insets(10, 5, 35, 5), 0, 0);
2 26 Feb 07 jari 73   gba.add(panel, textField, 1, 1, 1, 1, 1, 0, GBA.NONE, GBA.W, new Insets(10, 5, 35, 5), 0, 0);
2 26 Feb 07 jari 74
2 26 Feb 07 jari 75         addContent(panel);
2 26 Feb 07 jari 76         setActionListeners(listener);
2 26 Feb 07 jari 77         addWindowListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 78   pack();
2 26 Feb 07 jari 79   setResizable(false);
2 26 Feb 07 jari 80   textField.grabFocus();        
2 26 Feb 07 jari 81     }
2 26 Feb 07 jari 82     
2 26 Feb 07 jari 83     public int showModal() {
2 26 Feb 07 jari 84   Dimension screenSize = Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
2 26 Feb 07 jari 85   setLocation((screenSize.width - getSize().width)/2, (screenSize.height - getSize().height)/2);
2 26 Feb 07 jari 86   show();
2 26 Feb 07 jari 87   return result;
2 26 Feb 07 jari 88     }
2 26 Feb 07 jari 89     
2 26 Feb 07 jari 90     public boolean isCutoffFilterEnabled() {
2 26 Feb 07 jari 91         return enableCheckBox.isSelected();
2 26 Feb 07 jari 92     }
2 26 Feb 07 jari 93     
2 26 Feb 07 jari 94     public float getPercentageCutoff() {
2 26 Feb 07 jari 95   return Float.parseFloat(textField.getText());
2 26 Feb 07 jari 96     }
2 26 Feb 07 jari 97     
2 26 Feb 07 jari 98     public static void main(String [] args) {
2 26 Feb 07 jari 99         GenePixCutoffDialog dialog = new GenePixCutoffDialog(new JFrame(), 0f);
2 26 Feb 07 jari 100         dialog.showModal();
2 26 Feb 07 jari 101     }
2 26 Feb 07 jari 102     
2 26 Feb 07 jari 103     private class Listener extends WindowAdapter implements ActionListener, KeyListener {
2 26 Feb 07 jari 104   public void actionPerformed(ActionEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 105       String command = event.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 106       if (command.equals("ok-command")) {
2 26 Feb 07 jari 107     try {
2 26 Feb 07 jari 108         Float.parseFloat(textField.getText());
2 26 Feb 07 jari 109         result = JOptionPane.OK_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 110     } catch (Exception exception) {
2 26 Feb 07 jari 111         result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 112     }
2 26 Feb 07 jari 113     dispose();
2 26 Feb 07 jari 114       } else if (command.equals("cancel-command")) {
2 26 Feb 07 jari 115     result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 116     dispose();
2 26 Feb 07 jari 117       } else if (command.equals("reset-command")) {
2 26 Feb 07 jari 118                 enableCheckBox.setSelected(true);
2 26 Feb 07 jari 119                 textField.setEnabled(true);
2 26 Feb 07 jari 120                 percentageLabel.setEnabled(true);
2 26 Feb 07 jari 121                 textField.setText(String.valueOf(originalValue));
2 26 Feb 07 jari 122                 textField.selectAll();
2 26 Feb 07 jari 123                 textField.grabFocus();
2 26 Feb 07 jari 124             } else if (command.equals("info-command")){
2 26 Feb 07 jari 125                 HelpWindow hw = new HelpWindow(GenePixCutoffDialog.this, "Set Percentage Cutoff");
2 26 Feb 07 jari 126                 result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 127                 if(hw.getWindowContent()){
2 26 Feb 07 jari 128                     hw.setSize(450,600);
2 26 Feb 07 jari 129                     hw.setLocation();
2 26 Feb 07 jari 130                     hw.show();
2 26 Feb 07 jari 131                     return;
2 26 Feb 07 jari 132                 }
2 26 Feb 07 jari 133                 else {
2 26 Feb 07 jari 134                     hw.setVisible(false);
2 26 Feb 07 jari 135                     hw.dispose();
2 26 Feb 07 jari 136                     return;
2 26 Feb 07 jari 137                 }
2 26 Feb 07 jari 138             } else if (command.equals("enable-check-box-command")) {
2 26 Feb 07 jari 139                 boolean enabled = enableCheckBox.isSelected();
2 26 Feb 07 jari 140                 percentageLabel.setEnabled(enabled);
2 26 Feb 07 jari 141                 textField.setEnabled(enabled);
2 26 Feb 07 jari 142             }
2 26 Feb 07 jari 143   }
2 26 Feb 07 jari 144   
2 26 Feb 07 jari 145   public void windowClosing(WindowEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 146       result = JOptionPane.CLOSED_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 147       dispose();
2 26 Feb 07 jari 148   }
2 26 Feb 07 jari 149   
2 26 Feb 07 jari 150   public void keyPressed(KeyEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 151       if (event.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER) {
2 26 Feb 07 jari 152     try {
2 26 Feb 07 jari 153         Float.parseFloat(textField.getText());
2 26 Feb 07 jari 154         result = JOptionPane.OK_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 155     } catch (Exception exception) {
2 26 Feb 07 jari 156         result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 157     }
2 26 Feb 07 jari 158     dispose();
2 26 Feb 07 jari 159       }
2 26 Feb 07 jari 160   }
2 26 Feb 07 jari 161   
2 26 Feb 07 jari 162   public void keyReleased(KeyEvent event) {;}
2 26 Feb 07 jari 163   public void keyTyped(KeyEvent event) {;}
2 26 Feb 07 jari 164     }
2 26 Feb 07 jari 165 }

Generated on Thu Jul 20 09:30:53 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)