mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/HistoryViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2004, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4  */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: HistoryViewer.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.7 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2006/03/24 15:49:44 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: eleanorahowe $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 /*
2 26 Feb 07 jari 13  * HistoryViewer.java
2 26 Feb 07 jari 14  *
2 26 Feb 07 jari 15  * Created on February 3, 2004, 10:47 PM
2 26 Feb 07 jari 16  */
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 package org.tigr.microarray.mev;
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 21 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 22 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 23 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 24 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 25 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 26 import java.io.File;
2 26 Feb 07 jari 27 import java.io.FileWriter;
2 26 Feb 07 jari 28 import java.io.IOException;
2 26 Feb 07 jari 29 import java.io.ObjectInputStream;
2 26 Feb 07 jari 30 import java.io.ObjectOutputStream;
2 26 Feb 07 jari 31 import java.io.PrintWriter;
2 26 Feb 07 jari 32 import java.text.DateFormat;
2 26 Feb 07 jari 33 import java.util.Date;
2 26 Feb 07 jari 34 import java.util.StringTokenizer;
2 26 Feb 07 jari 35 import java.util.TimeZone;
2 26 Feb 07 jari 36
2 26 Feb 07 jari 37 import javax.swing.JComponent;
2 26 Feb 07 jari 38 import javax.swing.JFileChooser;
2 26 Feb 07 jari 39 import javax.swing.JMenuItem;
2 26 Feb 07 jari 40 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 41 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 42 import javax.swing.JTextArea;
2 26 Feb 07 jari 43
2 26 Feb 07 jari 44 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.GUIFactory;
2 26 Feb 07 jari 45 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.ViewerAdapter;
2 26 Feb 07 jari 46
2 26 Feb 07 jari 47 /** The HistoryViewer records analysis events in text
2 26 Feb 07 jari 48  * format.  For each event a time stamp and an event
2 26 Feb 07 jari 49  * text entry is made for the event.
2 26 Feb 07 jari 50  *
2 26 Feb 07 jari 51  * @author braisted
2 26 Feb 07 jari 52  */
2 26 Feb 07 jari 53 public class HistoryViewer extends ViewerAdapter {
2 26 Feb 07 jari 54     
2 26 Feb 07 jari 55     /** Contains the text contents of the viewer.
2 26 Feb 07 jari 56      */    
2 26 Feb 07 jari 57     private JTextArea content;
2 26 Feb 07 jari 58     /** Context menu.
2 26 Feb 07 jari 59      */    
2 26 Feb 07 jari 60     private JPopupMenu menu;
2 26 Feb 07 jari 61     
2 26 Feb 07 jari 62     /** Creates a new instance of HistoryViewer */
2 26 Feb 07 jari 63     public HistoryViewer() {
2 26 Feb 07 jari 64         initContent();        
2 26 Feb 07 jari 65         addHistory("Open Multiple Array Viewer");
2 26 Feb 07 jari 66         initMenu();
2 26 Feb 07 jari 67         content.addMouseListener(new HistoryListener());
2 26 Feb 07 jari 68     }
2 26 Feb 07 jari 69     
2 26 Feb 07 jari 70     public HistoryViewer(JTextArea content, JComponent header){
2 26 Feb 07 jari 71       this.content = content;
2 26 Feb 07 jari 72         initMenu();
2 26 Feb 07 jari 73         content.addMouseListener(new HistoryListener());
2 26 Feb 07 jari 74     }
2 26 Feb 07 jari 75     
2 26 Feb 07 jari 76     /** Initialized the viewer's content.
2 26 Feb 07 jari 77      */    
2 26 Feb 07 jari 78     private void initContent() {
2 26 Feb 07 jari 79         content = new JTextArea();
2 26 Feb 07 jari 80         content.setEditable(false);
2 26 Feb 07 jari 81         content.setMargin(new Insets(10,10,10,10));
2 26 Feb 07 jari 82         content.setBackground(new Color(252,255,168));        
2 26 Feb 07 jari 83     }
2 26 Feb 07 jari 84     
2 26 Feb 07 jari 85     /** Initializes the <CODE> JPopupMenu</CODE>.
2 26 Feb 07 jari 86      */    
2 26 Feb 07 jari 87     private void initMenu() {
2 26 Feb 07 jari 88         menu = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 89         JMenuItem saveItem = new JMenuItem("Save History to File", GUIFactory.getIcon("save16.gif"));
2 26 Feb 07 jari 90         saveItem.setActionCommand("save");
2 26 Feb 07 jari 91         saveItem.addActionListener(new HistoryListener());
2 26 Feb 07 jari 92         menu.add(saveItem);
2 26 Feb 07 jari 93     }
2 26 Feb 07 jari 94     
2 26 Feb 07 jari 95     /** Adds a history entry
2 26 Feb 07 jari 96      * @param msg Messge to add to history.
2 26 Feb 07 jari 97      */    
2 26 Feb 07 jari 98     public void addHistory(String msg) {
2 26 Feb 07 jari 99         content.append(getDateStamp()+msg+"\n\n");
2 26 Feb 07 jari 100     }
2 26 Feb 07 jari 101
2 26 Feb 07 jari 102     /** Returns the current date/time stamp in <CODE>String</CODE>
2 26 Feb 07 jari 103      * format.
2 26 Feb 07 jari 104      */    
2 26 Feb 07 jari 105     private String getDateStamp() {
2 26 Feb 07 jari 106         Date date = new Date(System.currentTimeMillis());
2 26 Feb 07 jari 107         DateFormat format = DateFormat.getDateTimeInstance();
2 26 Feb 07 jari 108         format.setTimeZone(TimeZone.getDefault());
2 26 Feb 07 jari 109         return format.format(date) + " -- ";
2 26 Feb 07 jari 110     }
2 26 Feb 07 jari 111     
2 26 Feb 07 jari 112     /** Returns the viewers content.
2 26 Feb 07 jari 113      * @return
2 26 Feb 07 jari 114      */    
2 26 Feb 07 jari 115     public JComponent getContentComponent() {
2 26 Feb 07 jari 116         return content;
2 26 Feb 07 jari 117     }
2 26 Feb 07 jari 118         
2 26 Feb 07 jari 119     /** Writes the HistoryViewer to an <CODE>ObjectOutputStream</CODE>
2 26 Feb 07 jari 120      * @param oos ObjectOutputStream
2 26 Feb 07 jari 121      * @throws IOException
2 26 Feb 07 jari 122      */    
2 26 Feb 07 jari 123     private void writeObject(ObjectOutputStream oos) throws IOException {
2 26 Feb 07 jari 124         oos.writeObject(content.getText());
2 26 Feb 07 jari 125     }
2 26 Feb 07 jari 126     
2 26 Feb 07 jari 127     /** Reads the HistoryViewer to an <CODE>ObjectOuputStream</CODE>
2 26 Feb 07 jari 128      *
2 26 Feb 07 jari 129      * @param ois ObjectInputStream
2 26 Feb 07 jari 130      * @throws IOException
2 26 Feb 07 jari 131      * @throws ClassNotFoundException
2 26 Feb 07 jari 132      */    
2 26 Feb 07 jari 133     private void readObject(ObjectInputStream ois) throws IOException, ClassNotFoundException {
2 26 Feb 07 jari 134         String text = (String)ois.readObject();
2 26 Feb 07 jari 135         initContent();
2 26 Feb 07 jari 136         content.append(text);
2 26 Feb 07 jari 137         addHistory("Load Analysis From File");
2 26 Feb 07 jari 138         initMenu();
2 26 Feb 07 jari 139         content.addMouseListener(new HistoryListener());
2 26 Feb 07 jari 140     }
2 26 Feb 07 jari 141     
2 26 Feb 07 jari 142     /** Saves the history to file.
2 26 Feb 07 jari 143      */    
2 26 Feb 07 jari 144     private void saveHistory() {
2 26 Feb 07 jari 145         String sep = System.getProperty("file.separator");
2 26 Feb 07 jari 146         String dataPath = TMEV.getDataPath();
2 26 Feb 07 jari 147         File fileLoc = TMEV.getFile("data/");
2 26 Feb 07 jari 148         // if the data path is null go to default, if not null and not exist then to to default
2 26 Feb 07 jari 149         // else use the dataPath     
2 26 Feb 07 jari 150         if(dataPath != null) {
2 26 Feb 07 jari 151             fileLoc = new File(dataPath);
2 26 Feb 07 jari 152             if(!fileLoc.exists()) {
2 26 Feb 07 jari 153                 fileLoc = TMEV.getFile("data/");
2 26 Feb 07 jari 154             }
2 26 Feb 07 jari 155         }
2 26 Feb 07 jari 156         JFileChooser chooser = new JFileChooser(fileLoc);
2 26 Feb 07 jari 157         
2 26 Feb 07 jari 158         if(chooser.showSaveDialog(content) == JOptionPane.OK_OPTION) {
2 26 Feb 07 jari 159             try {
2 26 Feb 07 jari 160                 File file = chooser.getSelectedFile();
2 26 Feb 07 jari 161                 PrintWriter bfr = new PrintWriter(new FileWriter(file));
2 26 Feb 07 jari 162
2 26 Feb 07 jari 163                 StringTokenizer stok = new StringTokenizer(content.getText(), "\n\n");
2 26 Feb 07 jari 164                 
2 26 Feb 07 jari 165                 while(stok.hasMoreTokens()){
2 26 Feb 07 jari 166                     bfr.println(stok.nextToken());
2 26 Feb 07 jari 167                 }
2 26 Feb 07 jari 168                 
2 26 Feb 07 jari 169                 bfr.flush();
2 26 Feb 07 jari 170                 bfr.close();
2 26 Feb 07 jari 171      
2 26 Feb 07 jari 172             } catch (IOException ioe) {
2 26 Feb 07 jari 173                 String msg = ioe.getMessage();
2 26 Feb 07 jari 174                 JOptionPane.showMessageDialog(content, "An error occurred while saving history. \nMessage: "+msg, "Error Saving History", JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 175             }
2 26 Feb 07 jari 176         }            
2 26 Feb 07 jari 177     }
2 26 Feb 07 jari 178     
2 26 Feb 07 jari 179     
2 26 Feb 07 jari 180     /** HistoryListener is responsible for listening to mouse
2 26 Feb 07 jari 181      * and menu events
2 26 Feb 07 jari 182      */    
2 26 Feb 07 jari 183     public class HistoryListener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 184         /** Responds to press events.
2 26 Feb 07 jari 185          */        
2 26 Feb 07 jari 186         public void mousePressed(MouseEvent me) {
2 26 Feb 07 jari 187             if(me.isPopupTrigger()) {
2 26 Feb 07 jari 188                 menu.show(content, me.getX(), me.getY());
2 26 Feb 07 jari 189             }
2 26 Feb 07 jari 190         }
2 26 Feb 07 jari 191         
2 26 Feb 07 jari 192         /** Responds to mouse released events.
2 26 Feb 07 jari 193          */        
2 26 Feb 07 jari 194         public void mouseReleased(MouseEvent me) {
2 26 Feb 07 jari 195             if(me.isPopupTrigger()) {
2 26 Feb 07 jari 196                 menu.show(content, me.getX(), me.getY());
2 26 Feb 07 jari 197             }
2 26 Feb 07 jari 198         }
2 26 Feb 07 jari 199         /** Responds to menu events.
2 26 Feb 07 jari 200          */        
2 26 Feb 07 jari 201         public void actionPerformed(ActionEvent ae) {
2 26 Feb 07 jari 202             if(ae.getActionCommand().equals("save")){
2 26 Feb 07 jari 203                 saveHistory();
2 26 Feb 07 jari 204             }
2 26 Feb 07 jari 205         }
2 26 Feb 07 jari 206     }
2 26 Feb 07 jari 207
2 26 Feb 07 jari 208 }

Generated on Thu Jul 20 09:30:53 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)