mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/PaperReferences.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html><body>
2 26 Feb 07 jari 2 <p><font size = +1><b>HCL</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 3 <b>Hierarchical Clustering</b> 
2 26 Feb 07 jari 4 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=9843981&query_hl=4&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 5 <br>Eisen, M.B., P.T. Spellman, P.O. Brown, and D. Botstein (1998)  
2 26 Feb 07 jari 6 </a> 
2 26 Feb 07 jari 7 Cluster analysis and display of genome-wide expression patterns.  
2 26 Feb 07 jari 8 <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA </i>  
2 26 Feb 07 jari 9 95:14863-14868. 
2 26 Feb 07 jari 10         
2 26 Feb 07 jari 11 <br><p><font size = +1><b>ST</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 12 <b>Support trees (Bootstrapping)</b> 
2 26 Feb 07 jari 13 <br>Graur, D., and W.-H. Li. 2000.  
2 26 Feb 07 jari 14 <i>Fundamentals of Molecular Evolution. Second Edition.</i> 
2 26 Feb 07 jari 15 Sinauer Associates, Sunderland, MA. pp 209-210 
2 26 Feb 07 jari 16         
2 26 Feb 07 jari 17 <br><p><font size = +1><b>SOTA</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 18         
2 26 Feb 07 jari 19 <b>Self-organizing trees</b> 
2 26 Feb 07 jari 20         
2 26 Feb 07 jari 21 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11238068&query_hl=7&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 22 <br>Herrero J., A. Valencia, J. Dopazo (2001). 
2 26 Feb 07 jari 23 </a> 
2 26 Feb 07 jari 24 A hierarchical unsupervised growing neural network for clustering gene 
2 26 Feb 07 jari 25 expression patterns.  <i>Bioinformatics</i> 17(2):126-136. 
2 26 Feb 07 jari 26         
2 26 Feb 07 jari 27 <br><p><a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=9069183&query_hl=9&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 28 Dopazo, J., and J. M. Carazo (1997). 
2 26 Feb 07 jari 29 </a> 
2 26 Feb 07 jari 30 Phylogenetic reconstruction using an unsupervised growing neural network that adopts the topology  
2 26 Feb 07 jari 31 of a phylogenetic tree.  <i>Journal of Molecular Evolution</i> 44:226-233. 
2 26 Feb 07 jari 32  
2 26 Feb 07 jari 33 <br><p><font size = +1><b>KMC</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 34 <b>K-Means</b> 
2 26 Feb 07 jari 35 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10783168&query_hl=11&itool=pubmed_docsum\""> 
2 26 Feb 07 jari 36 <br>Soukas, A., P. Cohen, N.D. Socci, and J.M. Friedman (2000)  
2 26 Feb 07 jari 37 </a> 
2 26 Feb 07 jari 38 Leptin-specific patterns of gene expression in white adipose tissue.  
2 26 Feb 07 jari 39 <i>Genes and Development</i> 14:963-980. 
2 26 Feb 07 jari 40         
2 26 Feb 07 jari 41 <br><p><font size = +1><b>SOM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 42 <b>Self-Organizing Maps</b> 
2 26 Feb 07 jari 43 <br>Kohonen, T. (1982)   
2 26 Feb 07 jari 44 Self-organized formation of topologically correct feature maps. <i>Biological Cybernetics</i> 43:59-69 
2 26 Feb 07 jari 45 <br><p><a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10077610&query_hl=20&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 46 Tamayo, P., D. Slonim, J. Masirov, Q. Zhu, S. Kitareewan,  
2 26 Feb 07 jari 47 </a> 
2 26 Feb 07 jari 48 E. Dmitrovsky, E.S. Lander, and T.R. Golub (1999)   
2 26 Feb 07 jari 49 Interpreting patterns of gene expression with self-organizing maps: Methods and application  
2 26 Feb 07 jari 50 to hematopoietic differentiation. <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA </i>  
2 26 Feb 07 jari 51 96:2907-2912.
2 26 Feb 07 jari 52         
2 26 Feb 07 jari 53 <br><p><font size = +1><b>CAST</b></font> - 
2 26 Feb 07 jari 54 <b>Clustering Affinity Search Technique</b>
2 26 Feb 07 jari 55 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10582567&query_hl=23&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 56 <br>Ben-Dor, A., R. Shamir, and Z. Yakhini (1999) 
2 26 Feb 07 jari 57 </a>
2 26 Feb 07 jari 58 Clustering gene expression patterns. 
2 26 Feb 07 jari 59 <i>Journal of Computational Biology</i> 6:281-297.
2 26 Feb 07 jari 60         
2 26 Feb 07 jari 61 <br><p><font size = +1><b>QTC</b></font> - 
2 26 Feb 07 jari 62 <b>Jackknife Clustering</b>
2 26 Feb 07 jari 63 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10568750&query_hl=26&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 64 >
2 26 Feb 07 jari 65 <br>Heyer, L.J., S. Kruglyak, and S. Yooseph (1999) 
2 26 Feb 07 jari 66 </a>
2 26 Feb 07 jari 67 Exploring expression data: identification and analysis of coexpressed genes. 
2 26 Feb 07 jari 68 <i>Genome Research</i> 9:1106-1115.
2 26 Feb 07 jari 69         
2 26 Feb 07 jari 70 <br><p><font size = +1><b>GSH</b></font> - 
2 26 Feb 07 jari 71 <b>Gene shaving</b>
2 26 Feb 07 jari 72 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11178228&query_hl=28&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 73 <br>Hastie, T. et al. (2000).
2 26 Feb 07 jari 74 </a>
2 26 Feb 07 jari 75 'Gene shaving' as a method for identifying distinct sets of genes with similar expression patterns 
2 26 Feb 07 jari 76 Genome Biology 1(2):research0003.1-0003.21. 
2 26 Feb 07 jari 77         
2 26 Feb 07 jari 78 <br><p><font size = +1><b>FOM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 79 <b>Figures of Merit</b> 
2 26 Feb 07 jari 80 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11301299&query_hl=31&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 81 <br>Yeung, K.Y., D.R. Haynor, and W.L. Ruzzo (2001)  
2 26 Feb 07 jari 82 </a> 
2 26 Feb 07 jari 83 Validating clustering for gene expression data.  
2 26 Feb 07 jari 84 <i>Bioinformatics</i> 17:309-318. 
2 26 Feb 07 jari 85         
2 26 Feb 07 jari 86 <br><p><font size = +1><b>PCA</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 87 <b>Principal Components Analysis</b> 
2 26 Feb 07 jari 88 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10902193&query_hl=33&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 89
2 26 Feb 07 jari 90 <br>Raychaudhuri, S.,  J. M. Stuart, & R. B. Altman (2000)  
2 26 Feb 07 jari 91 </a> 
2 26 Feb 07 jari 92 Principal components analysis to summarize microarray experiments:  
2 26 Feb 07 jari 93 application to sporulation time series.  
2 26 Feb 07 jari 94 <i>Pacific Symposium on Biocomputing 2000, Honolulu, Hawaii,</i> 452-463.  
2 26 Feb 07 jari 95 Available at http://smi-web.stanford.edu/pubs/SMI_Abstracts/SMI-1999-0804.html 
2 26 Feb 07 jari 96         
2 26 Feb 07 jari 97 <br><p><font size = +1><b>COA</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 98 <b>Correspondence Analysis</b> 
2 26 Feb 07 jari 99 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11535808&query_hl=35&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 100 <br>Fellenberg K. et al. (2001)  
2 26 Feb 07 jari 101 </a> 
2 26 Feb 07 jari 102 Correspondence analysis applied to microarray data.  
2 26 Feb 07 jari 103 <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA</i> 98: 10781-10786 
2 26 Feb 07 jari 104 <br><p><a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=12490444&query_hl=37&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 105 Culhane A.C. et al. (2002)  
2 26 Feb 07 jari 106 </a> 
2 26 Feb 07 jari 107 Between-group analysis of microarray data.  
2 26 Feb 07 jari 108 <i>Bioinformatics</i> 18:1600-1608. 
2 26 Feb 07 jari 109         
2 26 Feb 07 jari 110 <br><p><font size = +1><b>RN</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 111 <b>Relevance networks</b> 
2 26 Feb 07 jari 112 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11027309&query_hl=39&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 113
2 26 Feb 07 jari 114 <br>Butte, A.J., P. Tamayo, D. Slonim, T.R. Golub and I.S. Kohane (2000)  
2 26 Feb 07 jari 115 </a> 
2 26 Feb 07 jari 116 Discovering functional relationships between RNA expression and chemotherapautic  
2 26 Feb 07 jari 117 susceptibility using relevance networks. 
2 26 Feb 07 jari 118 <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA</i> 97: 12182-12186 
2 26 Feb 07 jari 119         
2 26 Feb 07 jari 120 <br><p><font size = +1><b>PTM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 121 <b>Template Matching</b> 
2 26 Feb 07 jari 122 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11597334&query_hl=42&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 123
2 26 Feb 07 jari 124 <br>Pavlidis, P., and W.S. Noble (2001)  
2 26 Feb 07 jari 125 </a> 
2 26 Feb 07 jari 126 Analysis of strain and regional variation in gene expression in mouse brain.  
2 26 Feb 07 jari 127 <i>Genome Biology</i> 2:research0042.1-0042.15 
2 26 Feb 07 jari 128         
2 26 Feb 07 jari 129 <br><p><font size = +1><b>SAM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 130 <b>Significance Analysis of Microarrays</b> 
2 26 Feb 07 jari 131 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11309499&query_hl=44&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 132
2 26 Feb 07 jari 133 <br>Tusher, V.G., R. Tibshirani and G. Chu. (2001)  
2 26 Feb 07 jari 134 </a> 
2 26 Feb 07 jari 135 Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response.  
2 26 Feb 07 jari 136 <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA</i> 98: 5116-5121. 
2 26 Feb 07 jari 137         
2 26 Feb 07 jari 138 <br><p><a href="http://www-stat.stanford.edu/~tibs/SAM/">
2 26 Feb 07 jari 139 Chu, G., B. Narasimhan, R. Tibshirani and V. Tusher (2002).
2 26 Feb 07 jari 140 </a> 
2 26 Feb 07 jari 141 SAM \"Significance Analysis of Microarrays\" Users Guide and Technical Document. 
2 26 Feb 07 jari 142 http://www-stat.stanford.edu/~tibs/SAM/ 
2 26 Feb 07 jari 143
2 26 Feb 07 jari 144 <br><p><font size = +1><b>ANOVA</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 145 <b>One-way Analysis of Variance</b>   
2 26 Feb 07 jari 146         
2 26 Feb 07 jari 147 <br>Zar, J.H. 1999. Biostatistical Analysis. 4th ed. Prentice Hall, NJ. 
2 26 Feb 07 jari 148         
2 26 Feb 07 jari 149 <br><p><font size = +1><b>TTEST</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 150 <b>T-Tests</b> 
2 26 Feb 07 jari 151 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=12016052&query_hl=48&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 152
2 26 Feb 07 jari 153 <br>Pan, W. (2002).   
2 26 Feb 07 jari 154 </a> 
2 26 Feb 07 jari 155 A comparative review of statistical methods for discovering differentially expressed genes in replicated microarray experiments  
2 26 Feb 07 jari 156 <i>Bioinformatics</i> 18: 546-554. 
2 26 Feb 07 jari 157         
2 26 Feb 07 jari 158 <br><p>Dudoit, S., Y.H. Yang, M.J. Callow, and T. Speed (2000). 
2 26 Feb 07 jari 159 Statistical methods for identifying differentially expressed genes  
2 26 Feb 07 jari 160 in replicated cDNA microarray experiments. <i>Technical report 2000</i>  
2 26 Feb 07 jari 161 Statistics Department, University of California, Berkeley. 
2 26 Feb 07 jari 162
2 26 Feb 07 jari 163 <br><p>Welch, B.L. (1947). 
2 26 Feb 07 jari 164 The generalization of ‘students’ problem when several different population variances are involved.  
2 26 Feb 07 jari 165 <i>Biometrika</i> 34: 28-35. 
2 26 Feb 07 jari 166 <br><p> <a href=\"http://linus.nci.nih.gov/~brb/TechReport.htm\" 
2 26 Feb 07 jari 167
2 26 Feb 07 jari 168 Korn, E.L., J.F. Troendle, L.M. McShane, R. Simon (2001). 
2 26 Feb 07 jari 169 </a> 
2 26 Feb 07 jari 170 Controlling the number of false discoveries: application to high-dimensional genomic data  
2 26 Feb 07 jari 171 <i> Technical report 003</i>, Biometric Research Branch, National Cancer Institute. http://linus.nci.nih.gov/~brb/TechReport.htm            
2 26 Feb 07 jari 172         
2 26 Feb 07 jari 173 <br><p>Korn, E.L., J.F. Troendle, L.M. McShane, R. Simon (2004). 
2 26 Feb 07 jari 174 Controlling the number of false discoveries: application to high-dimensional genomic data  
2 26 Feb 07 jari 175 <i>Journal of Statistical Planning and Inference</i> 124: 379-398.       
2 26 Feb 07 jari 176
2 26 Feb 07 jari 177 <br><p><font size = +1><b>TFA</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 178 <b>Two Factor ANOVA</b> 
2 26 Feb 07 jari 179         
2 26 Feb 07 jari 180 <br>Keppel, G., and S. Zedeck. (1989). Data Analysis for Research Designs. W. H. Freeman and Co., NY.                
2 26 Feb 07 jari 181 <br><p>Manly, B.F.J. (1997). Randomization, Bootstrap and Monte Carlo Methods in Biology. 2nd ed. Chapman and Hall / CRC , FL.        
2 26 Feb 07 jari 182 <br><p>Zar, J.H. 1999. Biostatistical Analysis. 4th ed. Prentice Hall, NJ.   
2 26 Feb 07 jari 183                 
2 26 Feb 07 jari 184 <br><p><font size = +1><b>SVM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 185 <b>Support Vector Machines</b> 
2 26 Feb 07 jari 186 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=10618406&query_hl=86&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 187 <br>Brown, M.P., W.N. Grundy, D. Lin, N. Cristianini, C.W. Sugnet,  
2 26 Feb 07 jari 188 T.S. Furey, M. Ares, Jr., and D. Haussler (2000)  
2 26 Feb 07 jari 189 </a> 
2 26 Feb 07 jari 190 Knowledge-based analysis of microarray gene expression data by using support vector machines.  
2 26 Feb 07 jari 191 <i>Proceedings of the National Academy of Sciences USA</i> 97: 262-267. 
2 26 Feb 07 jari 192         
2 26 Feb 07 jari 193 <br><p><font size = +1><b>KNNC</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 194 <b>K-Nearest Neighbor Classification</b> 
2 26 Feb 07 jari 195 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11779842&query_hl=75&itool=pubmed_docsum\" 
2 26 Feb 07 jari 196
2 26 Feb 07 jari 197 <br>Theilhaber, J., Connolly, S. Roman-Roman, S. Bushnell, A. Jackson, K. Call, T. Garcia, R. Baron (2002)    
2 26 Feb 07 jari 198 </a> 
2 26 Feb 07 jari 199 Finding Genes in the C2Cl2 Osteogenic Pathway by K-Nearest-Neighbor Classification of Expression Data. 
2 26 Feb 07 jari 200 <i>Genome Research</i> 12:165-176 
2 26 Feb 07 jari 201
2 26 Feb 07 jari 202 <br><p><font size = +1><b>DAM</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 203 <b>Discriminant Analysis Module</b> 
2 26 Feb 07 jari 204 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=12217913&query_hl=78&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 205 <br>Nguyen, D.V., D.M. Rocke.  
2 26 Feb 07 jari 206 </a> 
2 26 Feb 07 jari 207 Multi-class Cancer Classification via Partial Least Squares with Gene Expression Profiles. 
2 26 Feb 07 jari 208 <i>Bioinformatics</i> 18(9):1216-1226, 2002 
2 26 Feb 07 jari 209        
2 26 Feb 07 jari 210 <br><p><font size = +1><b>TRN</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 211 <b>Expression Terrain Maps</b> 
2 26 Feb 07 jari 212 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=11557892&query_hl=82&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 213 <br>Kim, S.K., J. Lund, M. Kiraly, K. Duke, M. Jiang, J.M. Stuart, A. Eizinger, 
2 26 Feb 07 jari 214 B.N. Wylie, and G.S. Davidson (2001)  
2 26 Feb 07 jari 215 </a> 
2 26 Feb 07 jari 216 A Gene Expression Map for Caenorhabditis elegans.  
2 26 Feb 07 jari 217 <i>Science</i> 293: 2087-2092. 
2 26 Feb 07 jari 218
2 26 Feb 07 jari 219 <br><p><font size = +1><b>EASE</b></font> -  
2 26 Feb 07 jari 220 <b>Expression Analysis Systematic Explorer</b> 
2 26 Feb 07 jari 221 <a href=\"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=14519205&query_hl=84&itool=pubmed_docsum\"> 
2 26 Feb 07 jari 222 <br>Hosack, D.A., G. Dennis Jr., B.T. Sherman, H.C. Lane, R.A. Lempicki. (2001) 
2 26 Feb 07 jari 223 </a> 
2 26 Feb 07 jari 224 Identifying biological themes within lists of genes with EASE. 
2 26 Feb 07 jari 225 <i>Genome Biol.</i> 4:R70-R70.8, 2003.
2 26 Feb 07 jari 226
2 26 Feb 07 jari 227 <br><p><font size = +1><b>TEASE</b></font> -
2 26 Feb 07 jari 228 <b>Tree EASE</b><p>
2 26 Feb 07 jari 229 Gottardo R, Raftery A.E, Yeung K.Y, and R.E. Bumgarner, Quality Control and Robust Estimation for cDNA Microarrays with Replicates, accepted for publication in The Journal of the American Statistical Association
2 26 Feb 07 jari 230 <br><p>
2 26 Feb 07 jari 231 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=16542223&query_hl=84&itool=pubmed_docsum\">
2 26 Feb 07 jari 232 Gottardo R, Raftery AE, Yee Yeung K, Bumgarner RE. 2006. Bayesian robust inference for differential gene expression in microarrays with multiple samples.</a>
2 26 Feb 07 jari 233 Biometrics. 62(1):10-8.
2 26 Feb 07 jari 234
2 26 Feb 07 jari 235 <br><p><font size = +1><b>USC</b></font> -
2 26 Feb 07 jari 236 <b>Uncorrelated Shrunken Centroid</b><p>
2 26 Feb 07 jari 237 Yeung KY, Bumgarner RE.  
2 26 Feb 07 jari 238 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=14659020&query_hl=84&itool=pubmed_docsum">Multiclass classification of microarray data with repeated measurements: application to cancer.</a>
2 26 Feb 07 jari 239  Genome Biol. 2003;4(12):R83. Epub 2003 Nov 24.
2 26 Feb 07 jari 240 <br><p>
2 26 Feb 07 jari 241 Yeung KY, Bumgarner RE. 
2 26 Feb 07 jari 242 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=16420685&query_hl=84&itool=pubmed_docsum">Correction: Multiclass classification of microarray data with repeated measurements: application to cancer.</a>
2 26 Feb 07 jari 243  Genome Biol. 2005;6(13):405. Epub 2006 Jan 3.
2 26 Feb 07 jari 244
2 26 Feb 07 jari 245
2 26 Feb 07 jari 246 <br><p><font size = +1><b>CGH</b></font> -
2 26 Feb 07 jari 247 <b>Comparitive Genomic Hybridization</b><p>
2 26 Feb 07 jari 248 Margolin AA, Greshock J, Naylor TL, Mosse Y, Maris JM, Bignell G, Saeed AI, Quackenbush J, Weber BL. 
2 26 Feb 07 jari 249 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=15905276&query_hl=84&itool=pubmed_docsum">CGHAnalyzer: a stand-alone software package for cancer genome analysis using array-based DNA copy number data.</a> 
2 26 Feb 07 jari 250 <i>Bioinformatics.</i> 2005 Aug 1;21(15):3308-11.
2 26 Feb 07 jari 251