mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/SpotInformationData.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2  * SpotInfomationData.java
2 26 Feb 07 jari 3  *
2 26 Feb 07 jari 4  * Created on July 1, 2003, 10:13 AM
2 26 Feb 07 jari 5  */
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 package org.tigr.microarray.mev;
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 public class SpotInformationData implements java.io.Serializable {
2 26 Feb 07 jari 10     public static final long serialVersionUID = 100010201090001L;
2 26 Feb 07 jari 11
2 26 Feb 07 jari 12     private String [] columnHeaders;
2 26 Feb 07 jari 13     private String [][] spotData;
2 26 Feb 07 jari 14     
2 26 Feb 07 jari 15     /** Creates new SpotInfomationData */
2 26 Feb 07 jari 16     public SpotInformationData(String [] columnHeaders, String [][] spotData) {
2 26 Feb 07 jari 17         this.columnHeaders = columnHeaders;
2 26 Feb 07 jari 18         this.spotData = spotData;
2 26 Feb 07 jari 19     }
2 26 Feb 07 jari 20     
2 26 Feb 07 jari 21     public String [] getSpotInformationArray(int index){
2 26 Feb 07 jari 22         if(index < 0 || index > spotData.length)
2 26 Feb 07 jari 23             return null;
2 26 Feb 07 jari 24         else 
2 26 Feb 07 jari 25             return spotData[index];
2 26 Feb 07 jari 26     }
2 26 Feb 07 jari 27   
2 26 Feb 07 jari 28     public String getSpotInformation(String key, int index){
2 26 Feb 07 jari 29         int columnIndex = getColumnIndex(key);
2 26 Feb 07 jari 30         if(isLegalColumn(columnIndex))
2 26 Feb 07 jari 31             return spotData[index][columnIndex];
2 26 Feb 07 jari 32         else
2 26 Feb 07 jari 33             return null;
2 26 Feb 07 jari 34     }
2 26 Feb 07 jari 35     
2 26 Feb 07 jari 36     private int getColumnIndex(String key){
2 26 Feb 07 jari 37         for(int i = 0; i < columnHeaders.length; i++){
2 26 Feb 07 jari 38             if(columnHeaders[i].equalsIgnoreCase(key))
2 26 Feb 07 jari 39                 return i;
2 26 Feb 07 jari 40         }
2 26 Feb 07 jari 41         return -1;
2 26 Feb 07 jari 42     }
2 26 Feb 07 jari 43     
2 26 Feb 07 jari 44     private boolean isLegalColumn(int col){
2 26 Feb 07 jari 45         return (col >= 0 && col < spotData[0].length); 
2 26 Feb 07 jari 46     }
2 26 Feb 07 jari 47     
2 26 Feb 07 jari 48     public String [] getSpotInformationHeader(){
2 26 Feb 07 jari 49         return columnHeaders;
2 26 Feb 07 jari 50     }
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     public int getSize() {
2 26 Feb 07 jari 53         return this.spotData.length;
2 26 Feb 07 jari 54     }
2 26 Feb 07 jari 55 }

Generated on Thu Jul 20 09:31:08 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)