mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cgh/CGHAlgorithms/NumberOfAlterations/CloneAlterations/CloneDeletions.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2  * CloneDeletions.java
2 26 Feb 07 jari 3  *
2 26 Feb 07 jari 4  * Created on May 19, 2003, 2:06 AM
2 26 Feb 07 jari 5  */
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 package org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHAlgorithms.NumberOfAlterations.CloneAlterations;
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.IData;
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 //import org.abramson.microarray.cgh.CGHFcdObj.CGHMultipleArrayDataFcd;
2 26 Feb 07 jari 12 /**
2 26 Feb 07 jari 13  *
2 26 Feb 07 jari 14  * @author  Adam Margolin
2 26 Feb 07 jari 15  * @author Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 16  */
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 public class CloneDeletions extends CloneAlterations{
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20
2 26 Feb 07 jari 21     /** Creates a new instance of CloneDeletions */
2 26 Feb 07 jari 22     public CloneDeletions() {
2 26 Feb 07 jari 23         nodeName = "CloneDeletions";
2 26 Feb 07 jari 24     }
2 26 Feb 07 jari 25
2 26 Feb 07 jari 26     protected boolean isAltered(int copyNumber) {
2 26 Feb 07 jari 27         if(copyNumber < 0 && copyNumber != IData.BAD_CLONE && copyNumber != IData.NO_COPY_CHANGE){
2 26 Feb 07 jari 28             return true;
2 26 Feb 07 jari 29         }else{
2 26 Feb 07 jari 30             return false;
2 26 Feb 07 jari 31         }
2 26 Feb 07 jari 32     }
2 26 Feb 07 jari 33
2 26 Feb 07 jari 34 }

Generated on Thu Jul 20 09:24:32 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)