mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cgh/CGHDataModel/ICircleViewerModel.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2  * ICircleViewerModel.java
2 26 Feb 07 jari 3  *
2 26 Feb 07 jari 4  * Created on May 1, 2003, 1:16 PM
2 26 Feb 07 jari 5  */
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 package org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHDataModel;
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 import org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHDataObj.CGHClone;
2 26 Feb 07 jari 12 /**
2 26 Feb 07 jari 13  *
2 26 Feb 07 jari 14  * @author  Adam Margolin
2 26 Feb 07 jari 15  * @author Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 16  */
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 public interface ICircleViewerModel {
2 26 Feb 07 jari 19     public int getNumChromosomes();
2 26 Feb 07 jari 20
2 26 Feb 07 jari 21     public int getNumDataPointsInChrom(int chrom);
2 26 Feb 07 jari 22
2 26 Feb 07 jari 23     public Color getDataPointColor(int chrom, int bac, int experimentIndex);
2 26 Feb 07 jari 24
2 26 Feb 07 jari 25     public CGHClone getCloneAt(int cloneIndex, int chromosomeIndex);
2 26 Feb 07 jari 26 }