mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cgh/CGHDataObj/Cluster/Experiment/CGHExperiment.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2  * CGHExperiment.java
2 26 Feb 07 jari 3  *
2 26 Feb 07 jari 4  * Created on June 1, 2003, 3:28 AM
2 26 Feb 07 jari 5  */
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 package org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHDataObj.Cluster.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 10 import org.tigr.util.FloatMatrix;
2 26 Feb 07 jari 11
2 26 Feb 07 jari 12 /**
2 26 Feb 07 jari 13  *
2 26 Feb 07 jari 14  * @author  Adam Margolin
2 26 Feb 07 jari 15  * @author Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 16  */
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 public class CGHExperiment extends Experiment{
2 26 Feb 07 jari 19     String[] annotations;
2 26 Feb 07 jari 20
2 26 Feb 07 jari 21     public CGHExperiment(FloatMatrix matrix, int[] columns, String[] annotations) {
2 26 Feb 07 jari 22         super(matrix, columns);
2 26 Feb 07 jari 23         this.annotations = annotations;
2 26 Feb 07 jari 24     }
2 26 Feb 07 jari 25
2 26 Feb 07 jari 26     /**
2 26 Feb 07 jari 27      * Constructs an <code>Experiment</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 28      * matrix of ratio values, columns indices, and row indices
2 26 Feb 07 jari 29      */
2 26 Feb 07 jari 30     public CGHExperiment(FloatMatrix matrix, int[] columns, int[] rows){
2 26 Feb 07 jari 31         super(matrix, columns, rows);
2 26 Feb 07 jari 32         this.annotations = annotations;
2 26 Feb 07 jari 33     }
2 26 Feb 07 jari 34
2 26 Feb 07 jari 35     /** Getter for property annotations.
2 26 Feb 07 jari 36      * @return Value of property annotations.
2 26 Feb 07 jari 37      */
2 26 Feb 07 jari 38     public java.lang.String[] getAnnotations() {
2 26 Feb 07 jari 39         return this.annotations;
2 26 Feb 07 jari 40     }
2 26 Feb 07 jari 41
2 26 Feb 07 jari 42     /** Setter for property annotations.
2 26 Feb 07 jari 43      * @param annotations New value of property annotations.
2 26 Feb 07 jari 44      */
2 26 Feb 07 jari 45     public void setAnnotations(java.lang.String[] annotations) {
2 26 Feb 07 jari 46         this.annotations = annotations;
2 26 Feb 07 jari 47     }
2 26 Feb 07 jari 48
2 26 Feb 07 jari 49 }

Generated on Thu Jul 20 09:24:48 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)