mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cgh/CGHGuiObj/CGHPositionGraph/CGHPositionGraphCombinedHeader.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4
2 26 Feb 07 jari 5 This software is provided "AS IS".  TIGR makes no warranties, express
2 26 Feb 07 jari 6 or implied, including no representation or warranty with respect to
2 26 Feb 07 jari 7 the performance of the software and derivatives or their safety,
2 26 Feb 07 jari 8 effectiveness, or commercial viability.  TIGR does not warrant the
2 26 Feb 07 jari 9 merchantability or fitness of the software and derivatives for any
2 26 Feb 07 jari 10 particular purpose, or that they may be exploited without infringing
2 26 Feb 07 jari 11 the copyrights, patent rights or property rights of others. TIGR shall
2 26 Feb 07 jari 12 not be liable for any claim, demand or action for any loss, harm,
2 26 Feb 07 jari 13 illness or other damage or injury arising from access to or use of the
2 26 Feb 07 jari 14 software or associated information, including without limitation any
2 26 Feb 07 jari 15 direct, indirect, incidental, exemplary, special or consequential
2 26 Feb 07 jari 16 damages.
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 This software program may not be sold, leased, transferred, exported
2 26 Feb 07 jari 19 or otherwise disclaimed to anyone, in whole or in part, without the
2 26 Feb 07 jari 20 prior written consent of TIGR.
2 26 Feb 07 jari 21  */
2 26 Feb 07 jari 22 /*
2 26 Feb 07 jari 23  * $RCSfile: CGHPositionGraphCombinedHeader.java,v $
2 26 Feb 07 jari 24  * $Revision: 1.1 $
2 26 Feb 07 jari 25  * $Date: 2006/02/03 14:36:29 $
2 26 Feb 07 jari 26  * $Author: raktim $
2 26 Feb 07 jari 27  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 28  */
2 26 Feb 07 jari 29 package org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHGuiObj.CGHPositionGraph;
2 26 Feb 07 jari 30
2 26 Feb 07 jari 31 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 32 import java.awt.FontMetrics;
2 26 Feb 07 jari 33 import java.awt.Graphics;
2 26 Feb 07 jari 34 import java.awt.Graphics2D;
2 26 Feb 07 jari 35 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 36 import java.awt.RenderingHints;
2 26 Feb 07 jari 37
2 26 Feb 07 jari 38 /**
2 26 Feb 07 jari 39  * @author Adam Margolin
2 26 Feb 07 jari 40  * @author Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 41  *
2 26 Feb 07 jari 42  */
2 26 Feb 07 jari 43 public class CGHPositionGraphCombinedHeader extends CGHPositionGraphHeader {
2 26 Feb 07 jari 44
2 26 Feb 07 jari 45
2 26 Feb 07 jari 46     /**
2 26 Feb 07 jari 47      * Constructs a <code>MultipleArrayHeader</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 48      * insets and trace space.
2 26 Feb 07 jari 49      */
2 26 Feb 07 jari 50     public CGHPositionGraphCombinedHeader(Insets insets) {
2 26 Feb 07 jari 51         super(insets);
2 26 Feb 07 jari 52     }
2 26 Feb 07 jari 53
2 26 Feb 07 jari 54     /**
2 26 Feb 07 jari 55      * Paints the header into specified graphics.
2 26 Feb 07 jari 56      */
2 26 Feb 07 jari 57     public void paint(Graphics g1D) {
2 26 Feb 07 jari 58         super.paint(g1D);
2 26 Feb 07 jari 59         if (this.model == null || this.model.getNumExperiments() == 0) {
2 26 Feb 07 jari 60             return;
2 26 Feb 07 jari 61         }
2 26 Feb 07 jari 62
2 26 Feb 07 jari 63         Graphics2D g = (Graphics2D)g1D;
2 26 Feb 07 jari 64         int width;
2 26 Feb 07 jari 65         if(!this.isTracing)
2 26 Feb 07 jari 66             width = this.model.getNumExperiments() * this.elementWidth;
2 26 Feb 07 jari 67         else
2 26 Feb 07 jari 68             width = (this.model.getNumExperiments() - 1) * (this.elementWidth + rectSpacing) + this.elementWidth ;
2 26 Feb 07 jari 69         //g.drawImage(this.negColorImage, insets.left, 0, (int)(width/2f), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 70         //g.drawImage(this.posColorImage, (int)(width/2f)+insets.left, 0, (int)(width/2.0), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 71         //System.out.println("header draw image");
2 26 Feb 07 jari 72         //BufferedImage negColorImage = model.getNegColorImage();
2 26 Feb 07 jari 73         //int rgb = negColorImage.getRGB(255, 0);
2 26 Feb 07 jari 74         //System.out.println("RGB = " + rgb);
2 26 Feb 07 jari 75
2 26 Feb 07 jari 76         width = model.getNumExperiments() * (elementWidth + rectSpacing);// + insets.left;
2 26 Feb 07 jari 77
2 26 Feb 07 jari 78         g.drawImage(model.getNegColorImage(), insets.left, 0, (int)(width/2f), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 79         g.drawImage(model.getPosColorImage(), (int)(width/2f)+insets.left, 0, (int)(width/2.0), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 80         //g.drawImage(model.getNegColorImage(), insets.left, 0, (int)(width), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 81         //g.drawImage(model.getPosColorImage(), (int)(width/2f)+insets.left, 0, (int)(width), RECT_HEIGHT, null);
2 26 Feb 07 jari 82
2 26 Feb 07 jari 83         FontMetrics hfm = g.getFontMetrics();
2 26 Feb 07 jari 84         int descent = hfm.getDescent();
2 26 Feb 07 jari 85         int fHeight = hfm.getHeight();
2 26 Feb 07 jari 86
2 26 Feb 07 jari 87         g.setColor(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 88         if (isAntiAliasing) {
2 26 Feb 07 jari 89             g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_OFF);
2 26 Feb 07 jari 90             g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_TEXT_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_TEXT_ANTIALIAS_ON);
2 26 Feb 07 jari 91         }
2 26 Feb 07 jari 92         int textWidth;
2 26 Feb 07 jari 93         g.drawString(String.valueOf(this.minValue), insets.left, RECT_HEIGHT+fHeight);
2 26 Feb 07 jari 94         //g.drawString(String.valueOf(model.getMinRatioScale()), insets.left, RECT_HEIGHT+fHeight);
2 26 Feb 07 jari 95
2 26 Feb 07 jari 96         textWidth = hfm.stringWidth("0:0");
2 26 Feb 07 jari 97         g.drawString("0:0", (int)(width/2f)-textWidth/2 + insets.left, RECT_HEIGHT+fHeight);
2 26 Feb 07 jari 98
2 26 Feb 07 jari 99         textWidth = hfm.stringWidth(String.valueOf(this.maxValue));
2 26 Feb 07 jari 100         g.drawString(String.valueOf(this.maxValue), (width-textWidth)+insets.left, RECT_HEIGHT+fHeight);
2 26 Feb 07 jari 101
2 26 Feb 07 jari 102
2 26 Feb 07 jari 103         drawColumnHeaders(g);
2 26 Feb 07 jari 104     }
2 26 Feb 07 jari 105
2 26 Feb 07 jari 106     /**
2 26 Feb 07 jari 107      * Draws microarrays names.
2 26 Feb 07 jari 108      */
2 26 Feb 07 jari 109     private void drawColumnHeaders(Graphics2D g) {
2 26 Feb 07 jari 110         final int size = model.getNumExperiments();
2 26 Feb 07 jari 111         if (size == 0) {
2 26 Feb 07 jari 112             return;
2 26 Feb 07 jari 113         }
2 26 Feb 07 jari 114
2 26 Feb 07 jari 115         FontMetrics hfm = g.getFontMetrics();
2 26 Feb 07 jari 116         int descent = hfm.getDescent();
2 26 Feb 07 jari 117         g.rotate(-Math.PI/2);
2 26 Feb 07 jari 118         String name;
2 26 Feb 07 jari 119         for (int feature = 0; feature < size; feature++) {
2 26 Feb 07 jari 120             name = model.getExperimentName(model.getExperimentIndexAt(feature));
2 26 Feb 07 jari 121             int xCoord = feature * (elementWidth + rectSpacing) + elementWidth / 2 + insets.left;
2 26 Feb 07 jari 122             xCoord += descent;
2 26 Feb 07 jari 123             //g.drawString(name, insets.bottom - getSize().height +5, insets.left + descent + (elementWidth+getSpacing())*feature + elementWidth/2);
2 26 Feb 07 jari 124             g.drawString(name, insets.bottom - getSize().height +5, xCoord);
2 26 Feb 07 jari 125         }
2 26 Feb 07 jari 126         g.rotate(Math.PI/2);
2 26 Feb 07 jari 127     }
2 26 Feb 07 jari 128
2 26 Feb 07 jari 129
2 26 Feb 07 jari 130 }

Generated on Thu Jul 20 09:25:04 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)