mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cgh/CGHGuiObj/CGHPositionGraph/CGHPositionGraphHeader.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1
2 26 Feb 07 jari 2 package org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHGuiObj.CGHPositionGraph;
2 26 Feb 07 jari 3
2 26 Feb 07 jari 4 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 5 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 6 import java.awt.Font;
2 26 Feb 07 jari 7 import java.awt.FontMetrics;
2 26 Feb 07 jari 8 import java.awt.Graphics2D;
2 26 Feb 07 jari 9 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 10 import java.awt.RenderingHints;
2 26 Feb 07 jari 11 import java.awt.image.BufferedImage;
2 26 Feb 07 jari 12
2 26 Feb 07 jari 13 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 14
2 26 Feb 07 jari 15 import org.tigr.microarray.mev.cgh.CGHDataModel.CGHPositionGraphDataModel;
2 26 Feb 07 jari 16 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.IDisplayMenu;
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 /*
2 26 Feb 07 jari 19  *
2 26 Feb 07 jari 20  * @author Adam Margolin
2 26 Feb 07 jari 21  * @author Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 22  */
2 26 Feb 07 jari 23
2 26 Feb 07 jari 24 public class CGHPositionGraphHeader extends JPanel {
2 26 Feb 07 jari 25
2 26 Feb 07 jari 26     protected Insets insets;
2 26 Feb 07 jari 27     protected int contentWidth;
2 26 Feb 07 jari 28     protected int elementWidth;
2 26 Feb 07 jari 29     protected boolean isAntiAliasing = true;
2 26 Feb 07 jari 30     protected boolean isTracing = false;
2 26 Feb 07 jari 31     protected int tracespace;
2 26 Feb 07 jari 32     protected final int RECT_HEIGHT = 15;
2 26 Feb 07 jari 33
2 26 Feb 07 jari 34     BufferedImage negColorImage;
2 26 Feb 07 jari 35     BufferedImage posColorImage;
2 26 Feb 07 jari 36     protected float maxValue;
2 26 Feb 07 jari 37     protected float minValue;
2 26 Feb 07 jari 38
2 26 Feb 07 jari 39     CGHPositionGraphDataModel model;
2 26 Feb 07 jari 40
2 26 Feb 07 jari 41     int rectSpacing = 5;
2 26 Feb 07 jari 42
2 26 Feb 07 jari 43     /**
2 26 Feb 07 jari 44      * Constructs a <code>MultipleArrayHeader</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 45      * insets and trace space.
2 26 Feb 07 jari 46      */
2 26 Feb 07 jari 47     public CGHPositionGraphHeader(Insets insets) {
2 26 Feb 07 jari 48         setBackground(Color.black);
2 26 Feb 07 jari 49         setSize(200,200);
2 26 Feb 07 jari 50         setPreferredSize(new Dimension(200,200));
2 26 Feb 07 jari 51         this.insets = insets;
2 26 Feb 07 jari 52         //this.tracespace = tracespace;
2 26 Feb 07 jari 53         this.maxValue = 3.0f;
2 26 Feb 07 jari 54         this.minValue = 0.0f;
2 26 Feb 07 jari 55     }
2 26 Feb 07 jari 56
2 26 Feb 07 jari 57     /**
2 26 Feb 07 jari 58      * Sets the anti-aliasing attribute.
2 26 Feb 07 jari 59      */
2 26 Feb 07 jari 60     public void setAntiAliasing(boolean isAntiAliasing) {
2 26 Feb 07 jari 61         this.isAntiAliasing = isAntiAliasing;
2 26 Feb 07 jari 62     }
2 26 Feb 07 jari 63
2 26 Feb 07 jari 64     /**
2 26 Feb 07 jari 65      * Sets the element width attribute.
2 26 Feb 07 jari 66      */
2 26 Feb 07 jari 67     void setElementWidth(int width) {
2 26 Feb 07 jari 68         this.elementWidth = width;
2 26 Feb 07 jari 69         setFontSize(width);
2 26 Feb 07 jari 70         updateSize();
2 26 Feb 07 jari 71         this.repaint();
2 26 Feb 07 jari 72     }
2 26 Feb 07 jari 73
2 26 Feb 07 jari 74     /**
2 26 Feb 07 jari 75      * Sets the content width attribute.
2 26 Feb 07 jari 76      */
2 26 Feb 07 jari 77     void setContentWidth(int width) {
2 26 Feb 07 jari 78         this.contentWidth = width;
2 26 Feb 07 jari 79         this.repaint();
2 26 Feb 07 jari 80     }
2 26 Feb 07 jari 81
2 26 Feb 07 jari 82     /**
2 26 Feb 07 jari 83      * Sets min and max ratio values
2 26 Feb 07 jari 84      */
2 26 Feb 07 jari 85     public void setMinAndMaxRatios(float min, float max){
2 26 Feb 07 jari 86         this.minValue = min;
2 26 Feb 07 jari 87         this.maxValue = max;
2 26 Feb 07 jari 88         this.repaint();
2 26 Feb 07 jari 89     }
2 26 Feb 07 jari 90
2 26 Feb 07 jari 91     /**
2 26 Feb 07 jari 92      * Sets positive and negative color images
2 26 Feb 07 jari 93      */
2 26 Feb 07 jari 94     //public void setNegativeAndPositiveColorImages(BufferedImage neg, BufferedImage pos){
2 26 Feb 07 jari 95     //    this.negColorImage = neg;
2 26 Feb 07 jari 96     //    this.posColorImage = pos;
2 26 Feb 07 jari 97     //}
2 26 Feb 07 jari 98
2 26 Feb 07 jari 99     /**
2 26 Feb 07 jari 100      * Sets the isTracing attribute.
2 26 Feb 07 jari 101      */
2 26 Feb 07 jari 102     void setTracing(boolean isTracing) {
2 26 Feb 07 jari 103         this.isTracing = isTracing;
2 26 Feb 07 jari 104     }
2 26 Feb 07 jari 105
2 26 Feb 07 jari 106     /**
2 26 Feb 07 jari 107      * Returns a trace space value.
2 26 Feb 07 jari 108      */
2 26 Feb 07 jari 109     private int getSpacing() {
2 26 Feb 07 jari 110         /*
2 26 Feb 07 jari 111         if (isTracing) {
2 26 Feb 07 jari 112             return tracespace;
2 26 Feb 07 jari 113         }
2 26 Feb 07 jari 114         return 0;
2 26 Feb 07 jari 115          */
2 26 Feb 07 jari 116         return rectSpacing;
2 26 Feb 07 jari 117     }
2 26 Feb 07 jari 118
2 26 Feb 07 jari 119     /**
2 26 Feb 07 jari 120      * Sets the component font size.
2 26 Feb 07 jari 121      */
2 26 Feb 07 jari 122     private void setFontSize(int width) {
2 26 Feb 07 jari 123         if (width > 12) {
2 26 Feb 07 jari 124             width = 12;
2 26 Feb 07 jari 125         }
2 26 Feb 07 jari 126         setFont(new Font("monospaced", Font.PLAIN, width));
2 26 Feb 07 jari 127     }
2 26 Feb 07 jari 128
2 26 Feb 07 jari 129     /**
2 26 Feb 07 jari 130      * Updates the header size.
2 26 Feb 07 jari 131      */
2 26 Feb 07 jari 132     void updateSize() {
2 26 Feb 07 jari 133
2 26 Feb 07 jari 134         Graphics2D g = (Graphics2D)getGraphics();
2 26 Feb 07 jari 135         if (g == null) {
2 26 Feb 07 jari 136             return;
2 26 Feb 07 jari 137         }
2 26 Feb 07 jari 138         if (isAntiAliasing) {
2 26 Feb 07 jari 139             g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_OFF);
2 26 Feb 07 jari 140             g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_TEXT_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_TEXT_ANTIALIAS_ON);
2 26 Feb 07 jari 141         }
2 26 Feb 07 jari 142         FontMetrics hfm = g.getFontMetrics();
2 26 Feb 07 jari 143         int maxHeight = 0;
2 26 Feb 07 jari 144         String name;
2 26 Feb 07 jari 145         //final int size = model.getNumExperiments();
2 26 Feb 07 jari 146         final int size = model.getNumExperiments();
2 26 Feb 07 jari 147         for (int feature = 0; feature < size; feature++) {
2 26 Feb 07 jari 148             name = model.getExperimentName(feature);
2 26 Feb 07 jari 149             if(name == null){
2 26 Feb 07 jari 150                 maxHeight = 1;
2 26 Feb 07 jari 151             }else{
2 26 Feb 07 jari 152                 maxHeight = Math.max(maxHeight, hfm.stringWidth(name));
2 26 Feb 07 jari 153             }
2 26 Feb 07 jari 154         }
2 26 Feb 07 jari 155
2 26 Feb 07 jari 156   /*      if(!this.isTracing)
2 26 Feb 07 jari 157         contentWidth = this.model.getNumExperiments() * this.elementWidth;
2 26 Feb 07 jari 158        else
2 26 Feb 07 jari 159       contentWidth = (this.model.getNumExperiments() - 1) * (this.elementWidth + getSpacing()) + this.elementWidth ;
2 26 Feb 07 jari 160     */
2 26 Feb 07 jari 161         setSize(contentWidth, maxHeight+10+this.RECT_HEIGHT+hfm.getHeight());
2 26 Feb 07 jari 162         setPreferredSize(new Dimension(contentWidth, maxHeight+10+this.RECT_HEIGHT+hfm.getHeight()));
2 26 Feb 07 jari 163     }
2 26 Feb 07 jari 164
2 26 Feb 07 jari 165     /** Getter for property model.
2 26 Feb 07 jari 166      * @return Value of property model.
2 26 Feb 07 jari 167      */
2 26 Feb 07 jari 168     public CGHPositionGraphDataModel getModel() {
2 26 Feb 07 jari 169         return model;
2 26 Feb 07 jari 170     }
2 26 Feb 07 jari 171
2 26 Feb 07 jari 172     /** Setter for property model.
2 26 Feb 07 jari 173      * @param model New value of property model.
2 26 Feb 07 jari 174      */
2 26 Feb 07 jari 175     public void setModel(CGHPositionGraphDataModel model) {
2 26 Feb 07 jari 176         this.model = model;
2 26 Feb 07 jari 177         this.negColorImage = model.getNegColorImage();
2 26 Feb 07 jari 178         this.posColorImage = model.getPosColorImage();
2 26 Feb 07 jari 179     }
2 26 Feb 07 jari 180
2 26 Feb 07 jari 181     /** Getter for property insets.
2 26 Feb 07 jari 182      * @return Value of property insets.
2 26 Feb 07 jari 183      */
2 26 Feb 07 jari 184     public java.awt.Insets getInsets() {
2 26 Feb 07 jari 185         return insets;
2 26 Feb 07 jari 186     }
2 26 Feb 07 jari 187
2 26 Feb 07 jari 188     /** Setter for property insets.
2 26 Feb 07 jari 189      * @param insets New value of property insets.
2 26 Feb 07 jari 190      */
2 26 Feb 07 jari 191     public void setInsets(java.awt.Insets insets) {
2 26 Feb 07 jari 192         this.insets = insets;
2 26 Feb 07 jari 193     }
2 26 Feb 07 jari 194
2 26 Feb 07 jari 195     public void onMenuChanged(IDisplayMenu menu) {
2 26 Feb 07 jari 196         //this.negColorImage = menu.getNegativeGradientImage();
2 26 Feb 07 jari 197         //this.posColorImage = menu.getPositiveGradientImage();
2 26 Feb 07 jari 198         model.setNegColorImage(menu.getNegativeGradientImage());
2 26 Feb 07 jari 199         model.setPosColorImage(menu.getPositiveGradientImage());
2 26 Feb 07 jari 200
2 26 Feb 07 jari 201         setMinAndMaxRatios(menu.getMinRatioScale(), menu.getMaxRatioScale());
2 26 Feb 07 jari 202     }
2 26 Feb 07 jari 203
2 26 Feb 07 jari 204 }

Generated on Thu Jul 20 09:25:05 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)