mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/NodeList.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: NodeList.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 20:16:48 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.util.ArrayList;
2 26 Feb 07 jari 15
2 26 Feb 07 jari 16 /**
2 26 Feb 07 jari 17  * This class is used to store cluster child nodes.
2 26 Feb 07 jari 18  *
2 26 Feb 07 jari 19  * @version 1.0
2 26 Feb 07 jari 20  * @author Aleksey D.Rezantsev
2 26 Feb 07 jari 21  */
2 26 Feb 07 jari 22 public class NodeList {
2 26 Feb 07 jari 23     
2 26 Feb 07 jari 24     private ArrayList list;
2 26 Feb 07 jari 25     
2 26 Feb 07 jari 26     /**
2 26 Feb 07 jari 27      * Constructs a <code>NodeList</code>
2 26 Feb 07 jari 28      */
2 26 Feb 07 jari 29     public NodeList() {
2 26 Feb 07 jari 30   list = new ArrayList();
2 26 Feb 07 jari 31     }
2 26 Feb 07 jari 32     
2 26 Feb 07 jari 33     /**
2 26 Feb 07 jari 34      * Returns a node by specified index.
2 26 Feb 07 jari 35      * @param index the node index.
2 26 Feb 07 jari 36      */
2 26 Feb 07 jari 37     public Node getNode(int index) {
2 26 Feb 07 jari 38   return(Node)list.get(index);
2 26 Feb 07 jari 39     }
2 26 Feb 07 jari 40     
2 26 Feb 07 jari 41     /**
2 26 Feb 07 jari 42      * Adds specified node to the list.
2 26 Feb 07 jari 43      * @param node the node to be added.
2 26 Feb 07 jari 44      */
2 26 Feb 07 jari 45     public void addNode(Node node) {
2 26 Feb 07 jari 46   list.add(node);
2 26 Feb 07 jari 47     }
2 26 Feb 07 jari 48     
2 26 Feb 07 jari 49     /**
2 26 Feb 07 jari 50      * Removes node from the list by specified index.
2 26 Feb 07 jari 51      * @param index the index of node to be removed.
2 26 Feb 07 jari 52      */
2 26 Feb 07 jari 53     public Node remove(int index) {
2 26 Feb 07 jari 54   return(Node)list.remove(index);
2 26 Feb 07 jari 55     }
2 26 Feb 07 jari 56     
2 26 Feb 07 jari 57     /**
2 26 Feb 07 jari 58      * Returns size of the node list.
2 26 Feb 07 jari 59      */
2 26 Feb 07 jari 60     public int getSize() {
2 26 Feb 07 jari 61   return list.size();
2 26 Feb 07 jari 62     }
2 26 Feb 07 jari 63     
2 26 Feb 07 jari 64     /**
2 26 Feb 07 jari 65      * Increases the capacity of this <code>NodeList</code> instance, if
2 26 Feb 07 jari 66      * necessary, to ensure that it can hold at least the number of elements
2 26 Feb 07 jari 67      * specified by the minimum capacity argument.
2 26 Feb 07 jari 68      *
2 26 Feb 07 jari 69      * @param minCapacity the desired minimum capacity.
2 26 Feb 07 jari 70      */
2 26 Feb 07 jari 71     public void ensureCapacity(int minCapacity) {
2 26 Feb 07 jari 72   list.ensureCapacity(minCapacity);
2 26 Feb 07 jari 73     }
2 26 Feb 07 jari 74 }

Generated on Thu Jul 20 09:29:42 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)