mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/NodeValueList.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: NodeValueList.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 20:16:48 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.util.ArrayList;
2 26 Feb 07 jari 15
2 26 Feb 07 jari 16 /**
2 26 Feb 07 jari 17  * The list of a cluster node values.
2 26 Feb 07 jari 18  *
2 26 Feb 07 jari 19  * @version 1.0
2 26 Feb 07 jari 20  * @author Aleksey D.Rezantsev
2 26 Feb 07 jari 21  */
2 26 Feb 07 jari 22 public class NodeValueList {
2 26 Feb 07 jari 23     
2 26 Feb 07 jari 24     private ArrayList list;
2 26 Feb 07 jari 25     
2 26 Feb 07 jari 26     /**
2 26 Feb 07 jari 27      * Constructs a <code>NodeValueList</code> with default capacity.
2 26 Feb 07 jari 28      */
2 26 Feb 07 jari 29     public NodeValueList() {
2 26 Feb 07 jari 30   this(10);
2 26 Feb 07 jari 31     }
2 26 Feb 07 jari 32     
2 26 Feb 07 jari 33     /**
2 26 Feb 07 jari 34      * Constructs a <code>NodeValueList</code> with specified capacity.
2 26 Feb 07 jari 35      *
2 26 Feb 07 jari 36      * @param initialCapacity the desired capacity.
2 26 Feb 07 jari 37      */
2 26 Feb 07 jari 38     public NodeValueList(int initialCapacity) {
2 26 Feb 07 jari 39   list = new ArrayList(initialCapacity);
2 26 Feb 07 jari 40     }
2 26 Feb 07 jari 41     
2 26 Feb 07 jari 42     /**
2 26 Feb 07 jari 43      * Returns node value by specified index.
2 26 Feb 07 jari 44      * @param index the index of node.
2 26 Feb 07 jari 45      */
2 26 Feb 07 jari 46     public NodeValue getNodeValue(int index) {
2 26 Feb 07 jari 47   return(NodeValue)list.get(index);
2 26 Feb 07 jari 48     }
2 26 Feb 07 jari 49     
2 26 Feb 07 jari 50     /**
2 26 Feb 07 jari 51      * Adds node value to the list.
2 26 Feb 07 jari 52      * @param nodeValue the value to be added.
2 26 Feb 07 jari 53      */
2 26 Feb 07 jari 54     public void addNodeValue(NodeValue nodeValue) {
2 26 Feb 07 jari 55   list.add(nodeValue);
2 26 Feb 07 jari 56     }
2 26 Feb 07 jari 57     
2 26 Feb 07 jari 58     /**
2 26 Feb 07 jari 59      * Removes node value by specified index.
2 26 Feb 07 jari 60      * @param index the index of node to be removed.
2 26 Feb 07 jari 61      */
2 26 Feb 07 jari 62     public NodeValue remove(int index) {
2 26 Feb 07 jari 63   return(NodeValue)list.remove(index);
2 26 Feb 07 jari 64     }
2 26 Feb 07 jari 65     
2 26 Feb 07 jari 66     /**
2 26 Feb 07 jari 67      * Returns size of the list.
2 26 Feb 07 jari 68      */
2 26 Feb 07 jari 69     public int getSize() {
2 26 Feb 07 jari 70   return list.size();
2 26 Feb 07 jari 71     }
2 26 Feb 07 jari 72     
2 26 Feb 07 jari 73     /**
2 26 Feb 07 jari 74      * Removes all of the values from this list.
2 26 Feb 07 jari 75      */
2 26 Feb 07 jari 76     public void clear() {
2 26 Feb 07 jari 77   list.clear();
2 26 Feb 07 jari 78     }
2 26 Feb 07 jari 79     
2 26 Feb 07 jari 80 }
2 26 Feb 07 jari 81