mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/algorithm/impl/RelNetComparator.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: RelNetComparator.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 15:45:20 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster.algorithm.impl;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import org.tigr.microarray.mev.cluster.algorithm.impl.util.IntComparator;
2 26 Feb 07 jari 15
2 26 Feb 07 jari 16 public class RelNetComparator implements IntComparator {
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18     private double[] entropy;
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20     /**
2 26 Feb 07 jari 21      * Constructs a <code>RelNetComparator</code> with specified entropy.
2 26 Feb 07 jari 22      */
2 26 Feb 07 jari 23     public RelNetComparator(double[] entropy) {
2 26 Feb 07 jari 24         this.entropy = entropy;
2 26 Feb 07 jari 25     }
2 26 Feb 07 jari 26
2 26 Feb 07 jari 27     /** 
2 26 Feb 07 jari 28      * Compare entropy with specified indices.
2 26 Feb 07 jari 29      */
2 26 Feb 07 jari 30     public int compare(int index1, int index2) {
2 26 Feb 07 jari 31         double e1 = entropy[index1];
2 26 Feb 07 jari 32         double e2 = entropy[index2];
2 26 Feb 07 jari 33         return e1 < e2 ? 1 : (e1 > e2 ? -1 : 0);
2 26 Feb 07 jari 34     }
2 26 Feb 07 jari 35 }