mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/clusterUtil/submit/ClusterArchiveSelectionDialog.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2004, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4  */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: ClusterArchiveSelectionDialog.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 15:48:03 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 /*
2 26 Feb 07 jari 13  * ClusterArchiveSelectionDialog.java
2 26 Feb 07 jari 14  *
2 26 Feb 07 jari 15  * Created on June 25, 2004, 10:09 AM
2 26 Feb 07 jari 16  */
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 package org.tigr.microarray.mev.cluster.clusterUtil.submit;
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 21 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 22 import java.awt.GridBagConstraints;
2 26 Feb 07 jari 23 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 24 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 25 import java.awt.Toolkit;
2 26 Feb 07 jari 26 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 27 import java.awt.event.WindowEvent;
2 26 Feb 07 jari 28
2 26 Feb 07 jari 29 import javax.swing.BorderFactory;
2 26 Feb 07 jari 30 import javax.swing.JFrame;
2 26 Feb 07 jari 31 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 32 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 33 import javax.swing.JScrollPane;
2 26 Feb 07 jari 34 import javax.swing.JTabbedPane;
2 26 Feb 07 jari 35 import javax.swing.JTextPane;
2 26 Feb 07 jari 36 import javax.swing.event.ChangeListener;
2 26 Feb 07 jari 37
2 26 Feb 07 jari 38 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.AlgorithmDialog;
2 26 Feb 07 jari 39 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.DialogListener;
2 26 Feb 07 jari 40 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dialogs.dialogHelpUtil.HelpWindow;
2 26 Feb 07 jari 41
2 26 Feb 07 jari 42 /**
2 26 Feb 07 jari 43  *
2 26 Feb 07 jari 44  * @author  braisted
2 26 Feb 07 jari 45  */
2 26 Feb 07 jari 46 public class ClusterArchiveSelectionDialog extends AlgorithmDialog {
2 26 Feb 07 jari 47     
2 26 Feb 07 jari 48     private RepositoryConfigParser parser;
2 26 Feb 07 jari 49     private RepositoryPane repPane;
2 26 Feb 07 jari 50     int result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     /** Creates a new instance of ClusterArchiveSelectionDialog */
2 26 Feb 07 jari 53     public ClusterArchiveSelectionDialog(RepositoryConfigParser parser) {
2 26 Feb 07 jari 54         super(new JFrame(), "Cluster Archive Selection Dialog", true);
2 26 Feb 07 jari 55         this.parser = parser;
2 26 Feb 07 jari 56         
2 26 Feb 07 jari 57         okButton.setText("Submit");
2 26 Feb 07 jari 58         okButton.setEnabled(false);
2 26 Feb 07 jari 59         validate();
2 26 Feb 07 jari 60         repPane = new RepositoryPane();        
2 26 Feb 07 jari 61         addContent(repPane);
2 26 Feb 07 jari 62         setActionListeners(new Listener());
2 26 Feb 07 jari 63     }
2 26 Feb 07 jari 64     
2 26 Feb 07 jari 65     /** Creates a new instance of ClusterArchiveSelectionDialog */
2 26 Feb 07 jari 66     public ClusterArchiveSelectionDialog() {
2 26 Feb 07 jari 67         super(new JFrame(), "Cluster Archive Selection Dialog", true);
2 26 Feb 07 jari 68         JPanel panel = new JPanel();
2 26 Feb 07 jari 69         repPane = new RepositoryPane();
2 26 Feb 07 jari 70         panel.add(repPane);
2 26 Feb 07 jari 71         //       setContent(new RepositoryPane());
2 26 Feb 07 jari 72         pack();
2 26 Feb 07 jari 73     }
2 26 Feb 07 jari 74     
2 26 Feb 07 jari 75     
2 26 Feb 07 jari 76     /**
2 26 Feb 07 jari 77      * Shows the dialog.
2 26 Feb 07 jari 78      */
2 26 Feb 07 jari 79     public int showModal() {
2 26 Feb 07 jari 80         Dimension screenSize = Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
2 26 Feb 07 jari 81         setSize((int)(screenSize.width/2), (int)(screenSize.height/1.6));
2 26 Feb 07 jari 82         setLocation((screenSize.width - getSize().width)/2, (screenSize.height - getSize().height)/2);
2 26 Feb 07 jari 83         show();
2 26 Feb 07 jari 84         return result;
2 26 Feb 07 jari 85     }
2 26 Feb 07 jari 86     
2 26 Feb 07 jari 87     private void resetControls() {
2 26 Feb 07 jari 88         repPane.setSelectedIndex(0);
2 26 Feb 07 jari 89     }
2 26 Feb 07 jari 90     
2 26 Feb 07 jari 91     /** Returns the selected repository name
2 26 Feb 07 jari 92      */
2 26 Feb 07 jari 93     public String getSelectedRepositoryName() {
2 26 Feb 07 jari 94         return repPane.getSelectedRepositoryName();
2 26 Feb 07 jari 95     }
2 26 Feb 07 jari 96     
2 26 Feb 07 jari 97     
2 26 Feb 07 jari 98     private class RepositoryPane extends JTabbedPane {
2 26 Feb 07 jari 99         
2 26 Feb 07 jari 100         String [] repNames;
2 26 Feb 07 jari 101         
2 26 Feb 07 jari 102         public RepositoryPane() {
2 26 Feb 07 jari 103             super();            //get names
2 26 Feb 07 jari 104             // String [] repNames = parser.getRepositoryNames();
2 26 Feb 07 jari 105             
2 26 Feb 07 jari 106             //construct intro panel
2 26 Feb 07 jari 107             this.addTab("Introduction", constructIntroPanel());
2 26 Feb 07 jari 108             this.addChangeListener(new Listener());
2 26 Feb 07 jari 109             
2 26 Feb 07 jari 110             //get description for each pane
2 26 Feb 07 jari 111             repNames = parser.getRepositoryNames();
2 26 Feb 07 jari 112             
2 26 Feb 07 jari 113             for(int i = 0; i < repNames.length; i++) {
2 26 Feb 07 jari 114                 this.addTab(repNames[i], new RepositoryPanel(repNames[i]));
2 26 Feb 07 jari 115             }
2 26 Feb 07 jari 116             
2 26 Feb 07 jari 117             
2 26 Feb 07 jari 118         }
2 26 Feb 07 jari 119         
2 26 Feb 07 jari 120         public String getSelectedRepositoryName() {
2 26 Feb 07 jari 121             return getTitleAt(getSelectedIndex());
2 26 Feb 07 jari 122         }
2 26 Feb 07 jari 123         
2 26 Feb 07 jari 124         
2 26 Feb 07 jari 125     }
2 26 Feb 07 jari 126     
2 26 Feb 07 jari 127     private JPanel constructIntroPanel() {
2 26 Feb 07 jari 128         JPanel panel = new JPanel(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 129         panel.setBorder(BorderFactory.createLineBorder(Color.black));
2 26 Feb 07 jari 130         JTextPane pane = new JTextPane();
2 26 Feb 07 jari 131         pane.setEditable(false);
2 26 Feb 07 jari 132         pane.setMargin(new Insets(10,15,10,15));
2 26 Feb 07 jari 133         pane.setContentType("text/html");
2 26 Feb 07 jari 134         String text = new String();
2 26 Feb 07 jari 135         text += "<html><h2>External Cluster Repository Submission</h2><hr size=3>";
2 26 Feb 07 jari 136         text += "Welcome to MeV's cluster submission process.  Select a repository using the ";
2 26 Feb 07 jari 137         text += "tabbed panes in this dialog. ";
2 26 Feb 07 jari 138         text += "Information on each page will indicate the suitability of a repository for your gene list. ";
2 26 Feb 07 jari 139         text += "After selection of a repository, hit submit to be lead through the submission process. ";
2 26 Feb 07 jari 140         text += "<br><br>";
2 26 Feb 07 jari 141         text += "For first time submissions it might be required to register at the repostitory web site and ";
2 26 Feb 07 jari 142         text += "to use the user name and password during the cluster submission (See manual for details)</html>";
2 26 Feb 07 jari 143         
2 26 Feb 07 jari 144         pane.setText(text);
2 26 Feb 07 jari 145         panel.add(pane, new GridBagConstraints(0,0,1,1,1.0,1.0,GridBagConstraints.CENTER, GridBagConstraints.BOTH, new Insets(0,0,0,0), 0,0));
2 26 Feb 07 jari 146         return panel;
2 26 Feb 07 jari 147     }
2 26 Feb 07 jari 148     
2 26 Feb 07 jari 149     /*
2 26 Feb 07 jari 150     public static void main(String [] args) {
2 26 Feb 07 jari 151         ClusterArchiveSelectionDialog dialog = new ClusterArchiveSelectionDialog(null);
2 26 Feb 07 jari 152         dialog.showModal();
2 26 Feb 07 jari 153     }
2 26 Feb 07 jari 154      */
2 26 Feb 07 jari 155     
2 26 Feb 07 jari 156     private class RepositoryPanel extends JPanel {
2 26 Feb 07 jari 157         
2 26 Feb 07 jari 158         private String repositoryName;
2 26 Feb 07 jari 159         
2 26 Feb 07 jari 160         public RepositoryPanel(String repName) {
2 26 Feb 07 jari 161             super(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 162             repositoryName = repName;
2 26 Feb 07 jari 163             constructContent(repName);
2 26 Feb 07 jari 164         }
2 26 Feb 07 jari 165         
2 26 Feb 07 jari 166         private void constructContent(String repName) {
2 26 Feb 07 jari 167             String page = parser.getRepositoryPage(repName);
2 26 Feb 07 jari 168             
2 26 Feb 07 jari 169             JTextPane pane = new JTextPane();
2 26 Feb 07 jari 170             pane.setEditable(false);
2 26 Feb 07 jari 171             pane.setMargin(new Insets(10,15,10,15));
2 26 Feb 07 jari 172             pane.setContentType("text/html");
2 26 Feb 07 jari 173             
2 26 Feb 07 jari 174             pane.setText(page);
2 26 Feb 07 jari 175             JScrollPane scroll = new JScrollPane(pane);
2 26 Feb 07 jari 176             add(scroll, new GridBagConstraints(0,0,1,1,1.0,1.0,GridBagConstraints.CENTER, GridBagConstraints.BOTH, new Insets(0,0,0,0), 0,0));            
2 26 Feb 07 jari 177             pane.setCaretPosition(0);
2 26 Feb 07 jari 178         }
2 26 Feb 07 jari 179         
2 26 Feb 07 jari 180     }
2 26 Feb 07 jari 181     /**
2 26 Feb 07 jari 182      * The class to listen to the dialog and check boxes items events.
2 26 Feb 07 jari 183      */
2 26 Feb 07 jari 184     private class Listener extends DialogListener implements ChangeListener {
2 26 Feb 07 jari 185         
2 26 Feb 07 jari 186         public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 187             String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 188             if (command.equals("ok-command")) {
2 26 Feb 07 jari 189                 result = JOptionPane.OK_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 190                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 191             } else if (command.equals("cancel-command")) {
2 26 Feb 07 jari 192                 result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 193                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 194             }
2 26 Feb 07 jari 195             else if (command.equals("reset-command")){
2 26 Feb 07 jari 196                 resetControls();
2 26 Feb 07 jari 197                 result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 198                 return;
2 26 Feb 07 jari 199             }
2 26 Feb 07 jari 200             else if (command.equals("info-command")){
2 26 Feb 07 jari 201                 HelpWindow hw = new HelpWindow(ClusterArchiveSelectionDialog.this, "Cluster Archive Submission");
2 26 Feb 07 jari 202                 result = JOptionPane.CANCEL_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 203                 if(hw.getWindowContent()){
2 26 Feb 07 jari 204                     hw.setSize(450,600);
2 26 Feb 07 jari 205                     hw.setLocation();
2 26 Feb 07 jari 206                     hw.show();
2 26 Feb 07 jari 207                     return;
2 26 Feb 07 jari 208                 }
2 26 Feb 07 jari 209                 else {
2 26 Feb 07 jari 210                     hw.setVisible(false);
2 26 Feb 07 jari 211                     hw.dispose();
2 26 Feb 07 jari 212                     return;
2 26 Feb 07 jari 213                 }
2 26 Feb 07 jari 214             }
2 26 Feb 07 jari 215             dispose();
2 26 Feb 07 jari 216         }
2 26 Feb 07 jari 217         
2 26 Feb 07 jari 218         public void windowClosing(WindowEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 219             result = JOptionPane.CLOSED_OPTION;
2 26 Feb 07 jari 220             dispose();
2 26 Feb 07 jari 221         }
2 26 Feb 07 jari 222         
2 26 Feb 07 jari 223         public void stateChanged(javax.swing.event.ChangeEvent changeEvent) {
2 26 Feb 07 jari 224             okButton.setEnabled(repPane.getSelectedIndex() != 0);
2 26 Feb 07 jari 225         }
2 26 Feb 07 jari 226         
2 26 Feb 07 jari 227     }
2 26 Feb 07 jari 228     
2 26 Feb 07 jari 229     
2 26 Feb 07 jari 230 }

Generated on Thu Jul 20 09:25:47 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)