mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/ICGHCloneValueMenu.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2  * ICGHCloneValueMenu.java
2 26 Feb 07 jari 3  *
2 26 Feb 07 jari 4  * Created on Sept 29, 2005
2 26 Feb 07 jari 5  */
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui;
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 /**
2 26 Feb 07 jari 10  *
2 26 Feb 07 jari 11  * @author  Raktim Sinha
2 26 Feb 07 jari 12  */
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 public interface ICGHCloneValueMenu {
2 26 Feb 07 jari 15     public static final int CLONE_VALUE_DISCRETE_DETERMINATION = 0;
2 26 Feb 07 jari 16     public static final int CLONE_VALUE_LOG_AVERAGE_INVERTED = 1;
2 26 Feb 07 jari 17     public static final int CLONE_VALUE_LOG_CLONE_DISTRIBUTION = 2;
2 26 Feb 07 jari 18     public static final int CLONE_VALUE_THRESHOLD_OR_CLONE_DISTRIBUTION = 3;
2 26 Feb 07 jari 19     
2 26 Feb 07 jari 20     public static final int FLANKING_REGIONS_BY_THRESHOLD = 0;
2 26 Feb 07 jari 21     public static final int FLANKING_REGIONS_BY_LOG_CLONE_DISTRIBUTION = 1;
2 26 Feb 07 jari 22     public static final int FLANKING_REGIONS_BY_THRESHOLD_OR_CLONE_DISTRIBUTION = 2;
2 26 Feb 07 jari 23     
2 26 Feb 07 jari 24     public int getCloneValueType();
2 26 Feb 07 jari 25     public int getFlankingRegionType();
2 26 Feb 07 jari 26     public void setCloneValueType(int cloneValue);
2 26 Feb 07 jari 27     public float getClonePThresh();
2 26 Feb 07 jari 28     
2 26 Feb 07 jari 29     public float getAmpThresh();
2 26 Feb 07 jari 30     public float getDelThresh();
2 26 Feb 07 jari 31     public float getAmpThresh2Copy();
2 26 Feb 07 jari 32     public float getDelThresh2Copy();
2 26 Feb 07 jari 33     
2 26 Feb 07 jari 34     public void setAmpThresh(float thresh);
2 26 Feb 07 jari 35     public void setDelThresh(float thresh);
2 26 Feb 07 jari 36     public void setAmpThresh2Copy(float thresh);
2 26 Feb 07 jari 37     public void setDelThresh2Copy(float thresh);
2 26 Feb 07 jari 38     
2 26 Feb 07 jari 39 }

Generated on Thu Jul 20 09:29:36 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)