mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/cast/CASTInfoViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2004, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: CASTInfoViewer.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.6 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2006/03/24 15:49:58 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: eleanorahowe $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.cast;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.GridBagConstraints;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 import javax.swing.JComponent;
2 26 Feb 07 jari 21 import javax.swing.JLabel;
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.JTextArea;
2 26 Feb 07 jari 24
2 26 Feb 07 jari 25 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.ViewerAdapter;
2 26 Feb 07 jari 26
2 26 Feb 07 jari 27 public class CASTInfoViewer extends ViewerAdapter implements java.io.Serializable {
2 26 Feb 07 jari 28 //    public static final long serialVersionUID = 202001010001L;
2 26 Feb 07 jari 29     
2 26 Feb 07 jari 30     private JComponent header;
2 26 Feb 07 jari 31     private JTextArea  content;
2 26 Feb 07 jari 32     private boolean clusterGenes;
2 26 Feb 07 jari 33     
2 26 Feb 07 jari 34     /**
2 26 Feb 07 jari 35      * Constructs a <code>CASTInfoViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 36      * clusters and number of genes.
2 26 Feb 07 jari 37      */
2 26 Feb 07 jari 38     public CASTInfoViewer(int[][] clusters, int genes) {
2 26 Feb 07 jari 39         header  = createHeader();
2 26 Feb 07 jari 40         this.clusterGenes = true;
2 26 Feb 07 jari 41         content = createContent(clusters, genes);
2 26 Feb 07 jari 42         setMaxWidth(content, header);        
2 26 Feb 07 jari 43     }
2 26 Feb 07 jari 44     /**
2 26 Feb 07 jari 45      * state-saving constructor
2 26 Feb 07 jari 46      * @param content
2 26 Feb 07 jari 47      * @param header
2 26 Feb 07 jari 48      */
2 26 Feb 07 jari 49     public CASTInfoViewer(JTextArea content, JComponent header){
2 26 Feb 07 jari 50       this.content = content;
2 26 Feb 07 jari 51       this.header = header;
2 26 Feb 07 jari 52         this.clusterGenes = true;
2 26 Feb 07 jari 53       setMaxWidth(content, header);
2 26 Feb 07 jari 54     }
2 26 Feb 07 jari 55     
2 26 Feb 07 jari 56     /**
2 26 Feb 07 jari 57      * Constructs a <code>CASTInfoViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 58      * clusters and number of genes.
2 26 Feb 07 jari 59      */
2 26 Feb 07 jari 60     public CASTInfoViewer(int[][] clusters, int genes, boolean clusterGenes) {
2 26 Feb 07 jari 61         header  = createHeader();
2 26 Feb 07 jari 62         this.clusterGenes = clusterGenes;
2 26 Feb 07 jari 63         content = createContent(clusters, genes);
2 26 Feb 07 jari 64         setMaxWidth(content, header);
2 26 Feb 07 jari 65     }
2 26 Feb 07 jari 66     
2 26 Feb 07 jari 67     /**
2 26 Feb 07 jari 68      * Returns component to be inserted into the framework scroll pane.
2 26 Feb 07 jari 69      */
2 26 Feb 07 jari 70     public JComponent getContentComponent() {
2 26 Feb 07 jari 71         return content;
2 26 Feb 07 jari 72     }
2 26 Feb 07 jari 73     
2 26 Feb 07 jari 74     /**
2 26 Feb 07 jari 75      * Returns the viewer header.
2 26 Feb 07 jari 76      */
2 26 Feb 07 jari 77     public JComponent getHeaderComponent() {
2 26 Feb 07 jari 78         return header;
2 26 Feb 07 jari 79     }
2 26 Feb 07 jari 80     
2 26 Feb 07 jari 81     /**
2 26 Feb 07 jari 82      * Creates the viewer header.
2 26 Feb 07 jari 83      */
2 26 Feb 07 jari 84     private JComponent createHeader() {
2 26 Feb 07 jari 85         JPanel panel = new JPanel(new GridBagLayout());
2 26 Feb 07 jari 86         panel.setBackground(Color.white);
2 26 Feb 07 jari 87         GridBagConstraints gbc = new GridBagConstraints();
2 26 Feb 07 jari 88         gbc.fill = GridBagConstraints.HORIZONTAL;
2 26 Feb 07 jari 89         gbc.insets = new Insets(10, 0, 10, 0);
2 26 Feb 07 jari 90         panel.add(new JLabel("<html><body bgcolor='#FFFFFF'><font face='serif' size='5' color='#000080'><b>Cluster Information</b></font></body></html>"), gbc);
2 26 Feb 07 jari 91         return panel;
2 26 Feb 07 jari 92     }
2 26 Feb 07 jari 93     
2 26 Feb 07 jari 94     /**
2 26 Feb 07 jari 95      * Creates the viewer content component.
2 26 Feb 07 jari 96      */
2 26 Feb 07 jari 97     private JTextArea createContent(int[][] clusters, int genes) {
2 26 Feb 07 jari 98         JTextArea area = new JTextArea(clusters.length*3, 20);
2 26 Feb 07 jari 99         area.setEditable(false);
2 26 Feb 07 jari 100         area.setMargin(new Insets(0, 10, 0, 0));
2 26 Feb 07 jari 101         StringBuffer sb = new StringBuffer(clusters.length*3*10);
2 26 Feb 07 jari 102         if(clusterGenes){
2 26 Feb 07 jari 103             for (int counter = 0; counter < clusters.length; counter++) {
2 26 Feb 07 jari 104                 sb.append("Cluster "+(counter+1));
2 26 Feb 07 jari 105                 sb.append("\t");
2 26 Feb 07 jari 106                 sb.append("# of Genes in Cluster: "+clusters[counter].length);
2 26 Feb 07 jari 107                 sb.append("\n\t");
2 26 Feb 07 jari 108                 sb.append("% of Genes in Cluster: "+Math.round((float)clusters[counter].length/(float)genes*100f)+"%");
2 26 Feb 07 jari 109                 sb.append("\n\n");
2 26 Feb 07 jari 110             }
2 26 Feb 07 jari 111         }
2 26 Feb 07 jari 112         else{
2 26 Feb 07 jari 113             for (int counter = 0; counter < clusters.length; counter++) {
2 26 Feb 07 jari 114                 sb.append("Cluster "+(counter+1));
2 26 Feb 07 jari 115                 sb.append("\t");
2 26 Feb 07 jari 116                 sb.append("# of Experiments in Cluster: "+clusters[counter].length);
2 26 Feb 07 jari 117                 sb.append("\n\t");
2 26 Feb 07 jari 118                 sb.append("% of Experiments in Cluster: "+Math.round((float)clusters[counter].length/(float)genes*100f)+"%");
2 26 Feb 07 jari 119                 sb.append("\n\n");
2 26 Feb 07 jari 120             }
2 26 Feb 07 jari 121         }
2 26 Feb 07 jari 122         area.setText(sb.toString());
2 26 Feb 07 jari 123         area.setCaretPosition(0);
2 26 Feb 07 jari 124         return area;
2 26 Feb 07 jari 125     }
2 26 Feb 07 jari 126     
2 26 Feb 07 jari 127     /**
2 26 Feb 07 jari 128      * Synchronize content and header sizes.
2 26 Feb 07 jari 129      */
2 26 Feb 07 jari 130     private void setMaxWidth(JComponent content, JComponent header) {
2 26 Feb 07 jari 131         int c_width = content.getPreferredSize().width;
2 26 Feb 07 jari 132         int h_width = header.getPreferredSize().width;
2 26 Feb 07 jari 133         if (c_width > h_width) {
2 26 Feb 07 jari 134             header.setPreferredSize(new Dimension(c_width, header.getPreferredSize().height));
2 26 Feb 07 jari 135         } else {
2 26 Feb 07 jari 136             content.setPreferredSize(new Dimension(h_width, content.getPreferredSize().height));
2 26 Feb 07 jari 137         }
2 26 Feb 07 jari 138     }
2 26 Feb 07 jari 139     
2 26 Feb 07 jari 140     /** Returns a component to be inserted into the scroll pane row header
2 26 Feb 07 jari 141      */
2 26 Feb 07 jari 142     public JComponent getRowHeaderComponent() {
2 26 Feb 07 jari 143         return null;
2 26 Feb 07 jari 144     }
2 26 Feb 07 jari 145     
2 26 Feb 07 jari 146 }

Generated on Thu Jul 20 09:26:12 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)