mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dam/DAMExperimentClusterViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2005, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * DAMExperimentClusterViewer.java
2 26 Feb 07 jari 7  *
2 26 Feb 07 jari 8  */
2 26 Feb 07 jari 9 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dam;
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 12 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 13 import java.awt.Frame;
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 18
2 26 Feb 07 jari 19 import javax.swing.JColorChooser;
2 26 Feb 07 jari 20 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 21 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 22
2 26 Feb 07 jari 23 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 24 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.CentroidViewer;
2 26 Feb 07 jari 25 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentClusterHeader;
2 26 Feb 07 jari 26 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentClusterViewer;
2 26 Feb 07 jari 27
2 26 Feb 07 jari 28 public class DAMExperimentClusterViewer extends ExperimentClusterViewer {
2 26 Feb 07 jari 29         
2 26 Feb 07 jari 30     private JPopupMenu popup;
2 26 Feb 07 jari 31     
2 26 Feb 07 jari 32     /**
2 26 Feb 07 jari 33      * Constructs a <code>KMCExperimentViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 34      * experiment and clusters.
2 26 Feb 07 jari 35      */
2 26 Feb 07 jari 36     public DAMExperimentClusterViewer(Experiment experiment, int[][] clusters) {
2 26 Feb 07 jari 37   super(experiment, clusters);
2 26 Feb 07 jari 38   Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 39   this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 40   getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 41   getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 42     }
2 26 Feb 07 jari 43     /**
2 26 Feb 07 jari 44      * @inheritDoc
2 26 Feb 07 jari 45      */
2 26 Feb 07 jari 46     public DAMExperimentClusterViewer(Experiment e, int[][] clusters, int[] genesOrder, Boolean drawAnnotations, 
2 26 Feb 07 jari 47         Integer offset){
2 26 Feb 07 jari 48         super(e, clusters, genesOrder, drawAnnotations, offset);
2 26 Feb 07 jari 49         Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 50         this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 51         getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 52         getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 53     }
2 26 Feb 07 jari 54     
2 26 Feb 07 jari 55     /**
2 26 Feb 07 jari 56      * Creates a popup menu.
2 26 Feb 07 jari 57      */
2 26 Feb 07 jari 58     private JPopupMenu createJPopupMenu(Listener listener) {
2 26 Feb 07 jari 59   JPopupMenu popup = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 60   addMenuItems(popup, listener);
2 26 Feb 07 jari 61   return popup;
2 26 Feb 07 jari 62     }
2 26 Feb 07 jari 63     
2 26 Feb 07 jari 64     
2 26 Feb 07 jari 65     /**
2 26 Feb 07 jari 66      * Saves clusters.
2 26 Feb 07 jari 67      */
2 26 Feb 07 jari 68     private void onSaveClusters() {
2 26 Feb 07 jari 69   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 70   try {
2 26 Feb 07 jari 71       saveClusters(frame);
2 26 Feb 07 jari 72   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 73       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save clusters!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 74       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 75   }
2 26 Feb 07 jari 76     }
2 26 Feb 07 jari 77     
2 26 Feb 07 jari 78     /**
2 26 Feb 07 jari 79      * Save the viewer cluster.
2 26 Feb 07 jari 80      */
2 26 Feb 07 jari 81     private void onSaveCluster() {
2 26 Feb 07 jari 82   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 83   try {
2 26 Feb 07 jari 84       saveCluster(frame);
2 26 Feb 07 jari 85   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 86       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save cluster!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 87       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 88   }
2 26 Feb 07 jari 89     }
2 26 Feb 07 jari 90     
2 26 Feb 07 jari 91     /**
2 26 Feb 07 jari 92      * Sets a public color.
2 26 Feb 07 jari 93      */
2 26 Feb 07 jari 94     private void onSetColor() {
2 26 Feb 07 jari 95   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 96   Color newColor = JColorChooser.showDialog(frame, "Choose color", CentroidViewer.DEF_CLUSTER_COLOR);
2 26 Feb 07 jari 97   if (newColor != null) {
2 26 Feb 07 jari 98       setClusterColor(newColor);
2 26 Feb 07 jari 99   }
2 26 Feb 07 jari 100     }
2 26 Feb 07 jari 101     
2 26 Feb 07 jari 102     /**
2 26 Feb 07 jari 103      * Removes a public color.
2 26 Feb 07 jari 104      */
2 26 Feb 07 jari 105     private void onSetDefaultColor() {
2 26 Feb 07 jari 106   setClusterColor(null);
2 26 Feb 07 jari 107     }
2 26 Feb 07 jari 108     
2 26 Feb 07 jari 109     /**
2 26 Feb 07 jari 110      * The class to listen to mouse and action events.
2 26 Feb 07 jari 111      */
2 26 Feb 07 jari 112     private class Listener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 113   
2 26 Feb 07 jari 114   public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 115       String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 116       if (command.equals(SAVE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 117     onSaveCluster();
2 26 Feb 07 jari 118       } else if (command.equals(SAVE_ALL_CLUSTERS_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 119     onSaveClusters();
2 26 Feb 07 jari 120       } else if (command.equals(STORE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 121     storeCluster();
2 26 Feb 07 jari 122       } else if (command.equals(SET_DEF_COLOR_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 123     onSetDefaultColor();
2 26 Feb 07 jari 124       } else if(command.equals(LAUNCH_NEW_SESSION_CMD)){
2 26 Feb 07 jari 125                 launchNewSession();
2 26 Feb 07 jari 126             }
2 26 Feb 07 jari 127   }
2 26 Feb 07 jari 128   
2 26 Feb 07 jari 129   public void mouseReleased(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 130       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 131   }
2 26 Feb 07 jari 132   
2 26 Feb 07 jari 133   public void mousePressed(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 134       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 135   }
2 26 Feb 07 jari 136   
2 26 Feb 07 jari 137   private void maybeShowPopup(MouseEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 138       
2 26 Feb 07 jari 139       if (!e.isPopupTrigger() || getCluster() == null || getCluster().length == 0) {
2 26 Feb 07 jari 140     return;
2 26 Feb 07 jari 141       }
2 26 Feb 07 jari 142       popup.show(e.getComponent(), e.getX(), e.getY());
2 26 Feb 07 jari 143   }
2 26 Feb 07 jari 144     }
2 26 Feb 07 jari 145 }
2 26 Feb 07 jari 146

Generated on Thu Jul 20 09:26:20 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)