mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dam/DAMExperimentViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2005, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * DAMExperimentViewer.java
2 26 Feb 07 jari 7  * 
2 26 Feb 07 jari 8  */
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.dam;
2 26 Feb 07 jari 11
2 26 Feb 07 jari 12 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 13 import java.awt.Frame;
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 import javax.swing.JColorChooser;
2 26 Feb 07 jari 21 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 23
2 26 Feb 07 jari 24 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 25 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.CentroidViewer;
2 26 Feb 07 jari 26 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentHeader;
2 26 Feb 07 jari 27 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentViewer;
2 26 Feb 07 jari 28
2 26 Feb 07 jari 29 public class DAMExperimentViewer extends ExperimentViewer {
2 26 Feb 07 jari 30         
2 26 Feb 07 jari 31     private JPopupMenu popup;
2 26 Feb 07 jari 32     
2 26 Feb 07 jari 33     /**
2 26 Feb 07 jari 34      * Constructs a <code>KMCExperimentViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 35      * experiment and clusters.
2 26 Feb 07 jari 36      */
2 26 Feb 07 jari 37     public DAMExperimentViewer(Experiment experiment, int[][] clusters) {
2 26 Feb 07 jari 38   super(experiment, clusters);
2 26 Feb 07 jari 39   Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 40   this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 41   getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 42   getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 43     }
2 26 Feb 07 jari 44     
2 26 Feb 07 jari 45     /**
2 26 Feb 07 jari 46      * @inheritDoc
2 26 Feb 07 jari 47      */ 
2 26 Feb 07 jari 48     public DAMExperimentViewer(Experiment e, int[][] clusters, int[] samplesOrder, boolean drawAnnotations, ExperimentHeader header, Insets insets) {
2 26 Feb 07 jari 49       super(e, clusters, samplesOrder, drawAnnotations, header, insets);
2 26 Feb 07 jari 50     }
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     /**
2 26 Feb 07 jari 53      * Creates a popup menu.
2 26 Feb 07 jari 54      */
2 26 Feb 07 jari 55     private JPopupMenu createJPopupMenu(Listener listener) {
2 26 Feb 07 jari 56   JPopupMenu popup = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 57   addMenuItems(popup, listener);
2 26 Feb 07 jari 58   return popup;
2 26 Feb 07 jari 59     }    
2 26 Feb 07 jari 60     
2 26 Feb 07 jari 61     /**
2 26 Feb 07 jari 62      * Saves clusters.
2 26 Feb 07 jari 63      */
2 26 Feb 07 jari 64     private void onSaveClusters() {
2 26 Feb 07 jari 65   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 66   try {
2 26 Feb 07 jari 67       saveClusters(frame);
2 26 Feb 07 jari 68   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 69       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save clusters!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 70       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 71   }
2 26 Feb 07 jari 72     }
2 26 Feb 07 jari 73     
2 26 Feb 07 jari 74     /**
2 26 Feb 07 jari 75      * Save the viewer cluster.
2 26 Feb 07 jari 76      */
2 26 Feb 07 jari 77     private void onSaveCluster() {
2 26 Feb 07 jari 78   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 79   try {
2 26 Feb 07 jari 80       saveCluster(frame);
2 26 Feb 07 jari 81   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 82       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save cluster!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 83       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 84   }
2 26 Feb 07 jari 85     }
2 26 Feb 07 jari 86     
2 26 Feb 07 jari 87     /**
2 26 Feb 07 jari 88      * Sets a public color.
2 26 Feb 07 jari 89      */
2 26 Feb 07 jari 90     private void onSetColor() {
2 26 Feb 07 jari 91   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 92   Color newColor = JColorChooser.showDialog(frame, "Choose color", CentroidViewer.DEF_CLUSTER_COLOR);
2 26 Feb 07 jari 93   if (newColor != null) {
2 26 Feb 07 jari 94       setClusterColor(newColor);
2 26 Feb 07 jari 95   }
2 26 Feb 07 jari 96     }
2 26 Feb 07 jari 97     
2 26 Feb 07 jari 98     /**
2 26 Feb 07 jari 99      * Removes a public color.
2 26 Feb 07 jari 100      */
2 26 Feb 07 jari 101     private void onSetDefaultColor() {
2 26 Feb 07 jari 102   setClusterColor(null);
2 26 Feb 07 jari 103     }
2 26 Feb 07 jari 104     
2 26 Feb 07 jari 105     /**
2 26 Feb 07 jari 106      * The class to listen to mouse and action events.
2 26 Feb 07 jari 107      */
2 26 Feb 07 jari 108     private class Listener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 109   
2 26 Feb 07 jari 110   public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 111       String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 112       if (command.equals(SAVE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 113     onSaveCluster();
2 26 Feb 07 jari 114       } else if (command.equals(SAVE_ALL_CLUSTERS_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 115     onSaveClusters();
2 26 Feb 07 jari 116       } else if (command.equals(STORE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 117     storeCluster();
2 26 Feb 07 jari 118       } else if (command.equals(SET_DEF_COLOR_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 119     onSetDefaultColor();
2 26 Feb 07 jari 120       } else if(command.equals(LAUNCH_NEW_SESSION_CMD)){
2 26 Feb 07 jari 121                 launchNewSession();
2 26 Feb 07 jari 122             }
2 26 Feb 07 jari 123   }
2 26 Feb 07 jari 124   
2 26 Feb 07 jari 125   public void mouseReleased(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 126       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 127   }
2 26 Feb 07 jari 128   
2 26 Feb 07 jari 129   public void mousePressed(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 130       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 131   }
2 26 Feb 07 jari 132   
2 26 Feb 07 jari 133   private void maybeShowPopup(MouseEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 134       
2 26 Feb 07 jari 135       if (!e.isPopupTrigger() || getCluster() == null || getCluster().length == 0) {
2 26 Feb 07 jari 136     return;
2 26 Feb 07 jari 137       }
2 26 Feb 07 jari 138       popup.show(e.getComponent(), e.getX(), e.getY());
2 26 Feb 07 jari 139   }
2 26 Feb 07 jari 140     }
2 26 Feb 07 jari 141 }
2 26 Feb 07 jari 142

Generated on Thu Jul 20 09:26:21 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)