mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/GCOS.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2 <h3>Affymetrix GCOS File Format</h3>
2 26 Feb 07 jari 3 A Affymetrix GCOS file is a tab-delimited text file that contains Affymetric Gene chip ID and several experiment datum. In each experiment data it contains one column of intensity, one column of detection call and one column of p-value. The first line is head line. 
2 26 Feb 07 jari 4
2 26 Feb 07 jari 5 <br>
2 26 Feb 07 jari 6 A sample data file is displayed as following.<br>
2 26 Feb 07 jari 7 <table border=2 >
2 26 Feb 07 jari 8 <font size=3><tr><th><b>GeneID</th><th><b>Sample1-Intensity</th><th><b>Sample1-detection call(optional)</th><th><b>Sample1-pvalue(optional)</th><th><b>Sample2-Intensity</th><th><b>Sample2-detection call(optional)</th><th><b>Sample2-pvalue(optional)</th></tr></font>        
2 26 Feb 07 jari 9 <tr valign=top><td>gene1</td>
2 26 Feb 07 jari 10 <td>0.22</td>
2 26 Feb 07 jari 11 <td>p</td>
2 26 Feb 07 jari 12 <td>0.001</td>
2 26 Feb 07 jari 13 <td>0.42</td>
2 26 Feb 07 jari 14 <td>A</td>
2 26 Feb 07 jari 15 <td>0.5</td>
2 26 Feb 07 jari 16 </tr>
2 26 Feb 07 jari 17 </html>

Generated on Thu Jul 20 09:26:27 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)