mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/cluster_save_parameters.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2     <body bgcolor = "#FFFFCC"><basefont face = "Arial">
2 26 Feb 07 jari 3   <h1>Cluster Archive Initialization</h1> <h2> Parameter Information</h2>
2 26 Feb 07 jari 4             <hr size = 10>
2 26 Feb 07 jari 5
2 26 Feb 07 jari 6 <h2> Analysis Node </h2>
2 26 Feb 07 jari 7 This non-editable field displays the algorithm node including the result index
2 26 Feb 07 jari 8 from the result navigation tree.  This is unique for an algorithm execution.
2 26 Feb 07 jari 9 <br>
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 <h2> Cluster Node </h2>
2 26 Feb 07 jari 12 This non-editable field identifies the result cluster node from the navigation
2 26 Feb 07 jari 13 tree which contains the members of the cluster.  Note that it is a child node under
2 26 Feb 07 jari 14 the Analysis Node.  Note that different viewers identifying the same cluster
2 26 Feb 07 jari 15 will have the same Cluster Node label.  Since they represent the same elements
2 26 Feb 07 jari 16 the user is given the option of modifying the cluster attributes when attempting
2 26 Feb 07 jari 17 to save a cluster for a second time.
2 26 Feb 07 jari 18 <br>
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 <h2> Cluster Label  </h2>
2 26 Feb 07 jari 21 Cluster Label is an optional field that can be used to designate a descriptive label
2 26 Feb 07 jari 22 for the stored cluster.
2 26 Feb 07 jari 23 <br>
2 26 Feb 07 jari 24
2 26 Feb 07 jari 25 <h2> Remarks </h2>
2 26 Feb 07 jari 26 The Remarks text area provides a means to give a more descriptive account of the nature of
2 26 Feb 07 jari 27 the cluster or the algorithm and parameters used to generate the cluster.
2 26 Feb 07 jari 28 <br>
2 26 Feb 07 jari 29
2 26 Feb 07 jari 30 <h2> Select Color and Color Preview </h2>
2 26 Feb 07 jari 31 The Select Color button presents a user interface to select a color for the cluster.
2 26 Feb 07 jari 32 All cluster member elements will be assigned this color.  This color will propagate to
2 26 Feb 07 jari 33 all cluster viewers and is the main means of qualitatively determining clustering
2 26 Feb 07 jari 34 consensus between algorithm methods or parameter selections.
2 26 Feb 07 jari 35 <br><br>
2 26 Feb 07 jari 36 The Reset button will return the dialog to it's initial state.  If the form was presented
2 26 Feb 07 jari 37 for modifying the attributes of an existing cluster these values are those of the initial
2 26 Feb 07 jari 38 cluster.  The Cancel button terminates the cluster storage or modification.
2 26 Feb 07 jari 39 <br>
2 26 Feb 07 jari 40         </basefont>
2 26 Feb 07 jari 41     </body>
2 26 Feb 07 jari 42 </html>

Generated on Thu Jul 20 09:26:30 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)