mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/dChip.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2 <h3>dChip File Format</h3>
2 26 Feb 07 jari 3 <br>
2 26 Feb 07 jari 4 Each dChip data output file contains one experiment data. It’s a tab delimited file which records a lot of information for the experiment. 
2 26 Feb 07 jari 5 Right now only chip ID, intensity, detection and detection p-value are read into Mev for the analysis.  
2 26 Feb 07 jari 6
2 26 Feb 07 jari 7 <br>
2 26 Feb 07 jari 8 A sample data file is displayed as following.<br>
2 26 Feb 07 jari 9 <table border=2 >
2 26 Feb 07 jari 10 <font size=3>
2 26 Feb 07 jari 11 <tr><th><b>Expression Analysis: Metrics Tab</th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b>...</th></tr></font>  
2 26 Feb 07 jari 12 <tr><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b></th><th><b>...</th></tr>
2 26 Feb 07 jari 13 <tr><th><b></th><th><b>Analysis Name</th><th><b>Probe Set Name</th><th><b>Stat Pairs</th><th><b>Stat Pairs</th><th><b>Signal</th><th><b>Detection</th><th><b>Detection p-value</th><th><b>...</th></tr></font>        
2 26 Feb 07 jari 14 <tr valign=top>
2 26 Feb 07 jari 15 <td>1</td>
2 26 Feb 07 jari 16 <td>RS2003082124A</td>
2 26 Feb 07 jari 17 <td>AFFX-BioB-5_at</td>
2 26 Feb 07 jari 18 <td>20</td>
2 26 Feb 07 jari 19 <td>20</td>
2 26 Feb 07 jari 20 <td>0.42</td>
2 26 Feb 07 jari 21 <td>p</td>
2 26 Feb 07 jari 22 <td>0.001</td>
2 26 Feb 07 jari 23 <td>...</td>
2 26 Feb 07 jari 24 </tr>
2 26 Feb 07 jari 25 </html>

Generated on Thu Jul 20 09:26:31 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)