mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/gdm_parameters.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2     <body bgcolor = "#FFFFCC"><basefont face = "Arial">
2 26 Feb 07 jari 3   <h1>GDM: Gene Distance Matrix</h1> <h2>Parameter Information</h2>
2 26 Feb 07 jari 4             <hr size = 10>
2 26 Feb 07 jari 5 The Distance Matrix is used to view distances between elements in the data set.
2 26 Feb 07 jari 6 All clustering algorithms partition the data based on these computed distances and this
2 26 Feb 07 jari 7 viewer can provide a direct view of these distances.
2 26 Feb 07 jari 8
2 26 Feb 07 jari 9 <h2>Sample Selection</h2>
2 26 Feb 07 jari 10 The sample selection option indicates whether to display a matrix of gene distances or experiment distances.
2 26 Feb 07 jari 11 <br>
2 26 Feb 07 jari 12
2 26 Feb 07 jari 13 <h2>Show Every</h2>
2 26 Feb 07 jari 14 This allows a user to only display distances for a smaller sampling of the data by skipping
2 26 Feb 07 jari 15 (not including) distances by the increment given.  This option is useful when one doesn't need
2 26 Feb 07 jari 16 or want to create a full size matrix which is organized by cluster membership.
2 26 Feb 07 jari 17 In this case the user can use the matrix with a few representatives from each cluster
2 26 Feb 07 jari 18 to get a feel for intra-cluster distances.
2 26 Feb 07 jari 19 <br>
2 26 Feb 07 jari 20         </basefont>
2 26 Feb 07 jari 21     </body>
2 26 Feb 07 jari 22 </html>
2 26 Feb 07 jari 23

Generated on Thu Jul 20 09:26:35 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)