mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/sam_script_delta_dialog.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2     <body bgcolor = "#FFFFCC"><basefont face = "Arial">
2 26 Feb 07 jari 3   <h1>SAM: Delta Selection</h1> <h2>Script Creation</h2>
2 26 Feb 07 jari 4             <hr size = 10>
2 26 Feb 07 jari 5
2 26 Feb 07 jari 6 <h2> Delta Value </h2>
2 26 Feb 07 jari 7 Typical SAM runs provide an interactive graph and delta slider
2 26 Feb 07 jari 8 for selection of a delta value and associated false discovery rate.
2 26 Feb 07 jari 9 During SAM parameter selection for script creation this dialog permits
2 26 Feb 07 jari 10 the user to enter a delta value directly.  This eliminates the interactive
2 26 Feb 07 jari 11 graph which can be desirable during long script executions.
2 26 Feb 07 jari 12 <br><br>
2 26 Feb 07 jari 13 Alternatively, one can select the check box to enable the SAM graph
2 26 Feb 07 jari 14 interaction.  If this is selected the script will execute up until
2 26 Feb 07 jari 15 the graph is displayed.  Once the graph is used for delta selection
2 26 Feb 07 jari 16 and dismissed, the algorithm and subsequent algorithms in the script will
2 26 Feb 07 jari 17 be executed.
2 26 Feb 07 jari 18 <br>
2 26 Feb 07 jari 19         </basefont>
2 26 Feb 07 jari 20     </body>
2 26 Feb 07 jari 21 </html>