mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/dialogs/dialogHelpUtil/dialogHelpPages/search_init_parameters.html

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <html>
2 26 Feb 07 jari 2     <body bgcolor = "#FFFFCC"><basefont face = "Arial">
2 26 Feb 07 jari 3   <h1>Search Initialization Parameters</h1> <h2>Parameter Information</h2>
2 26 Feb 07 jari 4             <hr size = 10>
2 26 Feb 07 jari 5
2 26 Feb 07 jari 6 <h2> Search Mode Selection </h2>
2 26 Feb 07 jari 7 The search mode options permit searching for genes or samples.
2 26 Feb 07 jari 8 <br>
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10 <h2>Search Term and Match Criteria</h2>
2 26 Feb 07 jari 11 The <i>Search Term</i> text field permits the input of the term to search for within the
2 26 Feb 07 jari 12 gene or sample annotation.  The <i>Case Sensitive</i> option insures that all matches contain the search term
2 26 Feb 07 jari 13 including matching the case of each letter. The <i>Exact Match</i> option insures that
2 26 Feb 07 jari 14 all matching annotation contains the search term and no extra characters.  If this option
2 26 Feb 07 jari 15 is in the default (off) mode then the annotation matches only need to contain the search term within
2 26 Feb 07 jari 16 the annotation. (e.g. If the search term is <i>proton</i> then valid matches could be <i>proton transport</i>, 
2 26 Feb 07 jari 17 <i>proton pump</i>, or any other annotation term containing <i>proton</i>.
2 26 Feb 07 jari 18 <br>
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 <h2>Searchable Fields</h2>
2 26 Feb 07 jari 21 This lists the annotation fields that can be searched and permits the selection of specific fields.
2 26 Feb 07 jari 22 Note that the fields are gene or sample specific and are tailored to the loaded annotation.
2 26 Feb 07 jari 23 Selection of specific fields will permit the you to target the search.  The <i>Select All Fields</i>
2 26 Feb 07 jari 24 and the <i>Reset Selection</i> are used to assist in annotation field selection.
2 26 Feb 07 jari 25 <br>
2 26 Feb 07 jari 26         </basefont>
2 26 Feb 07 jari 27     </body>
2 26 Feb 07 jari 28 </html>

Generated on Thu Jul 20 09:26:49 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)