mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/hcl/HCLExperimentViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4  */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: HCLExperimentViewer.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.4 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2006/03/24 15:50:40 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: eleanorahowe $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.hcl;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.Frame;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 20
2 26 Feb 07 jari 21 import javax.swing.JColorChooser;
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 24
2 26 Feb 07 jari 25 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 26 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.CentroidViewer;
2 26 Feb 07 jari 27 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentViewer;
2 26 Feb 07 jari 28
2 26 Feb 07 jari 29 public class HCLExperimentViewer extends ExperimentViewer {
2 26 Feb 07 jari 30     
2 26 Feb 07 jari 31     private JPopupMenu popup; 
2 26 Feb 07 jari 32     
2 26 Feb 07 jari 33     /**
2 26 Feb 07 jari 34      * XMLEncoder/Decoder constructor
2 26 Feb 07 jari 35      * @param experiment
2 26 Feb 07 jari 36      * @param clusters
2 26 Feb 07 jari 37      */
2 26 Feb 07 jari 38     public HCLExperimentViewer(){
2 26 Feb 07 jari 39       super();
2 26 Feb 07 jari 40     }
2 26 Feb 07 jari 41     /**
2 26 Feb 07 jari 42      * Constructs a <code>HCLExperimentViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 43      * experiment and clusters.
2 26 Feb 07 jari 44      */
2 26 Feb 07 jari 45     public HCLExperimentViewer(Experiment experiment, int[][] clusters) {
2 26 Feb 07 jari 46         super(experiment, clusters);
2 26 Feb 07 jari 47         Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 48         this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 49         getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 50         getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 51     }
2 26 Feb 07 jari 52     
2 26 Feb 07 jari 53     /**
2 26 Feb 07 jari 54      * Creates a popup menu.
2 26 Feb 07 jari 55      */
2 26 Feb 07 jari 56     private JPopupMenu createJPopupMenu(Listener listener) {
2 26 Feb 07 jari 57         JPopupMenu popup = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 58         addMenuItems(popup, listener);
2 26 Feb 07 jari 59         return popup;
2 26 Feb 07 jari 60     }
2 26 Feb 07 jari 61     
2 26 Feb 07 jari 62     /**
2 26 Feb 07 jari 63      * Saves clusters.
2 26 Feb 07 jari 64      */
2 26 Feb 07 jari 65     private void onSaveClusters() {
2 26 Feb 07 jari 66         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 67         try {
2 26 Feb 07 jari 68             saveClusters(frame);
2 26 Feb 07 jari 69         } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 70             JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save clusters!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 71             e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 72         }
2 26 Feb 07 jari 73     }
2 26 Feb 07 jari 74     
2 26 Feb 07 jari 75     /**
2 26 Feb 07 jari 76      * Save the viewer cluster.
2 26 Feb 07 jari 77      */
2 26 Feb 07 jari 78     private void onSaveCluster() {
2 26 Feb 07 jari 79         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 80         try {
2 26 Feb 07 jari 81             saveCluster(frame);
2 26 Feb 07 jari 82         } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 83             JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save cluster!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 84             e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 85         }
2 26 Feb 07 jari 86     }
2 26 Feb 07 jari 87     
2 26 Feb 07 jari 88     /**
2 26 Feb 07 jari 89      * Sets a public color.
2 26 Feb 07 jari 90      */
2 26 Feb 07 jari 91     private void onSetColor() {
2 26 Feb 07 jari 92         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 93         Color newColor = JColorChooser.showDialog(frame, "Choose color", CentroidViewer.DEF_CLUSTER_COLOR);
2 26 Feb 07 jari 94         if (newColor != null) {
2 26 Feb 07 jari 95             setClusterColor(newColor);
2 26 Feb 07 jari 96         }
2 26 Feb 07 jari 97     }
2 26 Feb 07 jari 98     
2 26 Feb 07 jari 99     /**
2 26 Feb 07 jari 100      * Removes a public color.
2 26 Feb 07 jari 101      */
2 26 Feb 07 jari 102     private void onSetDefaultColor() {
2 26 Feb 07 jari 103         setClusterColor(null);
2 26 Feb 07 jari 104     }
2 26 Feb 07 jari 105     
2 26 Feb 07 jari 106     /**
2 26 Feb 07 jari 107      * The class to listen to mouse and action events.
2 26 Feb 07 jari 108      */
2 26 Feb 07 jari 109     private class Listener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 110         
2 26 Feb 07 jari 111         public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 112             String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 113             if (command.equals(SAVE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 114                 onSaveCluster();
2 26 Feb 07 jari 115             } else if (command.equals(SAVE_ALL_CLUSTERS_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 116                 onSaveClusters();
2 26 Feb 07 jari 117             } else if (command.equals(STORE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 118                 storeCluster();
2 26 Feb 07 jari 119             } else if (command.equals(SET_DEF_COLOR_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 120                 onSetDefaultColor();
2 26 Feb 07 jari 121             } else if(command.equals(LAUNCH_NEW_SESSION_CMD)){
2 26 Feb 07 jari 122                 launchNewSession();
2 26 Feb 07 jari 123             }
2 26 Feb 07 jari 124         }
2 26 Feb 07 jari 125         
2 26 Feb 07 jari 126         public void mouseReleased(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 127             maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 128         }
2 26 Feb 07 jari 129         
2 26 Feb 07 jari 130         public void mousePressed(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 131             maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 132         }
2 26 Feb 07 jari 133         
2 26 Feb 07 jari 134         private void maybeShowPopup(MouseEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 135             
2 26 Feb 07 jari 136             if (!e.isPopupTrigger() || getCluster() == null || getCluster().length == 0) {
2 26 Feb 07 jari 137                 return;
2 26 Feb 07 jari 138             }
2 26 Feb 07 jari 139             popup.show(e.getComponent(), e.getX(), e.getY());
2 26 Feb 07 jari 140         }
2 26 Feb 07 jari 141     }
2 26 Feb 07 jari 142 }

Generated on Thu Jul 20 09:27:31 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)