mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/kmcs/KMCSuppExperimentViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: KMCSuppExperimentViewer.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.7 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2006/05/02 16:56:57 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: eleanorahowe $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.kmcs;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.Frame;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.Insets;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 21
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.JColorChooser;
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 24 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 25
2 26 Feb 07 jari 26 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 27 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.CentroidViewer;
2 26 Feb 07 jari 28 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentHeader;
2 26 Feb 07 jari 29 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentViewer;
2 26 Feb 07 jari 30
2 26 Feb 07 jari 31
2 26 Feb 07 jari 32 public class KMCSuppExperimentViewer extends ExperimentViewer {
2 26 Feb 07 jari 33     
2 26 Feb 07 jari 34     private JPopupMenu popup;
2 26 Feb 07 jari 35     
2 26 Feb 07 jari 36     /**
2 26 Feb 07 jari 37      * Reconstitute a saved instance of this class from an XML file.
2 26 Feb 07 jari 38      * 
2 26 Feb 07 jari 39      * 
2 26 Feb 07 jari 40      * @param experiment
2 26 Feb 07 jari 41      * @param clusters
2 26 Feb 07 jari 42      * @param samplesOrder
2 26 Feb 07 jari 43      * @param drawAnnotations
2 26 Feb 07 jari 44      * @param header
2 26 Feb 07 jari 45      * @param insets
2 26 Feb 07 jari 46      */
2 26 Feb 07 jari 47     public KMCSuppExperimentViewer(Experiment e, int[][] clusters, int[] samplesOrder,
2 26 Feb 07 jari 48         Boolean drawAnnotations, ExperimentHeader header, Insets insets) {
2 26 Feb 07 jari 49       super(e, clusters, samplesOrder, drawAnnotations.booleanValue(), header, insets);
2 26 Feb 07 jari 50     } 
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     /**
2 26 Feb 07 jari 53      * Constructs a <code>HJCExperimentViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 54      * experiment and clusters.
2 26 Feb 07 jari 55      */
2 26 Feb 07 jari 56     public KMCSuppExperimentViewer(Experiment experiment, int[][] clusters) {
2 26 Feb 07 jari 57   super(experiment, clusters);
2 26 Feb 07 jari 58   Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 59   this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 60   getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 61   getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 62     }
2 26 Feb 07 jari 63     
2 26 Feb 07 jari 64     
2 26 Feb 07 jari 65     /**
2 26 Feb 07 jari 66      * Creates a popup menu.
2 26 Feb 07 jari 67      */
2 26 Feb 07 jari 68     private JPopupMenu createJPopupMenu(Listener listener) {
2 26 Feb 07 jari 69   JPopupMenu popup = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 70   addMenuItems(popup, listener);
2 26 Feb 07 jari 71   return popup;
2 26 Feb 07 jari 72     }
2 26 Feb 07 jari 73     
2 26 Feb 07 jari 74     
2 26 Feb 07 jari 75     /**
2 26 Feb 07 jari 76      * Saves clusters.
2 26 Feb 07 jari 77      */
2 26 Feb 07 jari 78     private void onSaveClusters() {
2 26 Feb 07 jari 79   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 80   try {
2 26 Feb 07 jari 81       saveClusters(frame);
2 26 Feb 07 jari 82   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 83       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save clusters!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 84       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 85   }
2 26 Feb 07 jari 86     }
2 26 Feb 07 jari 87     
2 26 Feb 07 jari 88     /**
2 26 Feb 07 jari 89      * Save the viewer cluster.
2 26 Feb 07 jari 90      */
2 26 Feb 07 jari 91     private void onSaveCluster() {
2 26 Feb 07 jari 92   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 93   try {
2 26 Feb 07 jari 94       saveCluster(frame);
2 26 Feb 07 jari 95   } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 96       JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save cluster!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 97       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 98   }
2 26 Feb 07 jari 99     }
2 26 Feb 07 jari 100     
2 26 Feb 07 jari 101     /**
2 26 Feb 07 jari 102      * Sets a public color.
2 26 Feb 07 jari 103      */
2 26 Feb 07 jari 104     private void onSetColor() {
2 26 Feb 07 jari 105   Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 106   Color newColor = JColorChooser.showDialog(frame, "Choose color", CentroidViewer.DEF_CLUSTER_COLOR);
2 26 Feb 07 jari 107   if (newColor != null) {
2 26 Feb 07 jari 108       setClusterColor(newColor);
2 26 Feb 07 jari 109   }
2 26 Feb 07 jari 110     }
2 26 Feb 07 jari 111     
2 26 Feb 07 jari 112     /**
2 26 Feb 07 jari 113      * Removes a public color.
2 26 Feb 07 jari 114      */
2 26 Feb 07 jari 115     private void onSetDefaultColor() {
2 26 Feb 07 jari 116   setClusterColor(null);
2 26 Feb 07 jari 117     }
2 26 Feb 07 jari 118     
2 26 Feb 07 jari 119     /**
2 26 Feb 07 jari 120      * The class to listen to mouse and action events.
2 26 Feb 07 jari 121      */
2 26 Feb 07 jari 122     private class Listener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 123   
2 26 Feb 07 jari 124   public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 125       String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 126       if (command.equals(SAVE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 127     onSaveCluster();
2 26 Feb 07 jari 128       } else if (command.equals(SAVE_ALL_CLUSTERS_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 129     onSaveClusters();
2 26 Feb 07 jari 130       } else if (command.equals(SET_DEF_COLOR_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 131     onSetDefaultColor();
2 26 Feb 07 jari 132       } else if (command.equals(STORE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 133     storeCluster();
2 26 Feb 07 jari 134       } else if(command.equals(LAUNCH_NEW_SESSION_CMD)){
2 26 Feb 07 jari 135                 launchNewSession();
2 26 Feb 07 jari 136             }
2 26 Feb 07 jari 137   }
2 26 Feb 07 jari 138   
2 26 Feb 07 jari 139   public void mouseReleased(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 140       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 141   }
2 26 Feb 07 jari 142   
2 26 Feb 07 jari 143   public void mousePressed(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 144       maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 145   }
2 26 Feb 07 jari 146   
2 26 Feb 07 jari 147   private void maybeShowPopup(MouseEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 148       
2 26 Feb 07 jari 149       if (!e.isPopupTrigger() || getCluster() == null || getCluster().length == 0) {
2 26 Feb 07 jari 150     return;
2 26 Feb 07 jari 151       }
2 26 Feb 07 jari 152       popup.show(e.getComponent(), e.getX(), e.getY());
2 26 Feb 07 jari 153   }
2 26 Feb 07 jari 154     }
2 26 Feb 07 jari 155 }

Generated on Thu Jul 20 09:27:44 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)