mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/sam/SAMPreDialog.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2005, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * SAMPreDialog.java
2 26 Feb 07 jari 7  *
2 26 Feb 07 jari 8  * Created on January 31, 2003, 1:45 PM
2 26 Feb 07 jari 9  */
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.sam;
2 26 Feb 07 jari 12
2 26 Feb 07 jari 13 import java.awt.Dimension;
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.GridBagConstraints;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.GridBagLayout;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.Toolkit;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.event.ItemEvent;
2 26 Feb 07 jari 20 import java.awt.event.ItemListener;
2 26 Feb 07 jari 21
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.ButtonGroup;
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.JButton;
2 26 Feb 07 jari 24 import javax.swing.JCheckBox;
2 26 Feb 07 jari 25 import javax.swing.JFrame;
2 26 Feb 07 jari 26 import javax.swing.JPanel;
2 26 Feb 07 jari 27 import javax.swing.JRadioButton;
2 26 Feb 07 jari 28
2 26 Feb 07 jari 29 import org.tigr.util.awt.ActionInfoDialog;
2 26 Feb 07 jari 30
2 26 Feb 07 jari 31 /**
2 26 Feb 07 jari 32  *
2 26 Feb 07 jari 33  * @author  nbhagaba
2 26 Feb 07 jari 34  * @version 
2 26 Feb 07 jari 35  */
2 26 Feb 07 jari 36 public class SAMPreDialog extends ActionInfoDialog {
2 26 Feb 07 jari 37     
2 26 Feb 07 jari 38     JRadioButton previousButton, newButton; 
2 26 Feb 07 jari 39     JButton okButton, cancelButton;
2 26 Feb 07 jari 40     JCheckBox drawTreesBox;
2 26 Feb 07 jari 41     private JRadioButton sigOnly, allClusters;    
2 26 Feb 07 jari 42     boolean okPressed = false;
2 26 Feb 07 jari 43
2 26 Feb 07 jari 44     /** Creates new SAMPreDialog */
2 26 Feb 07 jari 45     public SAMPreDialog(JFrame parentFrame, boolean modality) {
2 26 Feb 07 jari 46         super(parentFrame, "SAM Initialization", modality);
2 26 Feb 07 jari 47   setBounds(0, 0, 350, 150);
2 26 Feb 07 jari 48   setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
2 26 Feb 07 jari 49   GridBagLayout gridbag = new GridBagLayout();
2 26 Feb 07 jari 50   GridBagConstraints constraints = new GridBagConstraints();
2 26 Feb 07 jari 51   //constraints.fill = GridBagConstraints.BOTH;
2 26 Feb 07 jari 52   JPanel pane = new JPanel();
2 26 Feb 07 jari 53   pane.setLayout(gridbag); 
2 26 Feb 07 jari 54         
2 26 Feb 07 jari 55         constraints.anchor = GridBagConstraints.WEST;
2 26 Feb 07 jari 56
2 26 Feb 07 jari 57         previousButton = new JRadioButton("Use SAM Graph and input parameters from last run", true);
2 26 Feb 07 jari 58         newButton = new JRadioButton("Start new analysis", false);
2 26 Feb 07 jari 59         ButtonGroup choosePrevOrNew = new ButtonGroup();
2 26 Feb 07 jari 60         choosePrevOrNew.add(previousButton);
2 26 Feb 07 jari 61         choosePrevOrNew.add(newButton);
2 26 Feb 07 jari 62         
2 26 Feb 07 jari 63         sigOnly = new JRadioButton("Significant genes only", true);        
2 26 Feb 07 jari 64         allClusters = new JRadioButton("All clusters", false);
2 26 Feb 07 jari 65         
2 26 Feb 07 jari 66         sigOnly.setEnabled(false);
2 26 Feb 07 jari 67         allClusters.setEnabled(false);
2 26 Feb 07 jari 68         
2 26 Feb 07 jari 69         ButtonGroup allOrSig = new ButtonGroup();
2 26 Feb 07 jari 70         allOrSig.add(sigOnly);
2 26 Feb 07 jari 71         allOrSig.add(allClusters);        
2 26 Feb 07 jari 72         
2 26 Feb 07 jari 73   buildConstraints(constraints, 0, 0, 2, 1, 0, 30);
2 26 Feb 07 jari 74   gridbag.setConstraints(previousButton, constraints);
2 26 Feb 07 jari 75   pane.add(previousButton); 
2 26 Feb 07 jari 76         
2 26 Feb 07 jari 77   buildConstraints(constraints, 0, 1, 2, 1, 0, 30);
2 26 Feb 07 jari 78   gridbag.setConstraints(newButton, constraints);
2 26 Feb 07 jari 79   pane.add(newButton);  
2 26 Feb 07 jari 80         
2 26 Feb 07 jari 81         drawTreesBox = new JCheckBox("Draw Hierarchichal Trees for: ", false);
2 26 Feb 07 jari 82         
2 26 Feb 07 jari 83         drawTreesBox.addItemListener(new ItemListener() {
2 26 Feb 07 jari 84             public void itemStateChanged(ItemEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 85                 if (e.getStateChange() == ItemEvent.DESELECTED) {
2 26 Feb 07 jari 86                     sigOnly.setEnabled(false);
2 26 Feb 07 jari 87                     allClusters.setEnabled(false);
2 26 Feb 07 jari 88                 } else {
2 26 Feb 07 jari 89                     sigOnly.setEnabled(true);
2 26 Feb 07 jari 90                     allClusters.setEnabled(true);                    
2 26 Feb 07 jari 91                 }
2 26 Feb 07 jari 92             }
2 26 Feb 07 jari 93         }); 
2 26 Feb 07 jari 94         
2 26 Feb 07 jari 95   buildConstraints(constraints, 0, 2, 2, 1, 0, 30);
2 26 Feb 07 jari 96   gridbag.setConstraints(drawTreesBox, constraints);
2 26 Feb 07 jari 97   pane.add(drawTreesBox);         
2 26 Feb 07 jari 98         
2 26 Feb 07 jari 99         constraints.anchor = GridBagConstraints.CENTER;
2 26 Feb 07 jari 100         
2 26 Feb 07 jari 101   buildConstraints(constraints, 0, 3, 1, 1, 50, 10);
2 26 Feb 07 jari 102         gridbag.setConstraints(sigOnly, constraints);
2 26 Feb 07 jari 103         pane.add(sigOnly);
2 26 Feb 07 jari 104         
2 26 Feb 07 jari 105   buildConstraints(constraints, 1, 3, 1, 1, 50, 10);
2 26 Feb 07 jari 106         gridbag.setConstraints(allClusters, constraints);
2 26 Feb 07 jari 107         pane.add(allClusters);        
2 26 Feb 07 jari 108         
2 26 Feb 07 jari 109         okButton = new JButton("OK");
2 26 Feb 07 jari 110   buildConstraints(constraints, 0, 4, 1, 1, 50, 10);
2 26 Feb 07 jari 111   gridbag.setConstraints(okButton, constraints);
2 26 Feb 07 jari 112         okButton.addActionListener(new ActionListener(){
2 26 Feb 07 jari 113             public void actionPerformed(ActionEvent evt) {
2 26 Feb 07 jari 114                 okPressed = true;
2 26 Feb 07 jari 115                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 116             }
2 26 Feb 07 jari 117         });
2 26 Feb 07 jari 118   pane.add(okButton); 
2 26 Feb 07 jari 119         
2 26 Feb 07 jari 120         cancelButton = new JButton("Cancel");
2 26 Feb 07 jari 121   buildConstraints(constraints, 1, 4, 1, 1, 50, 0);
2 26 Feb 07 jari 122   gridbag.setConstraints(cancelButton, constraints);
2 26 Feb 07 jari 123         cancelButton.addActionListener(new ActionListener(){
2 26 Feb 07 jari 124             public void actionPerformed(ActionEvent evt) {            
2 26 Feb 07 jari 125                 okPressed = false;
2 26 Feb 07 jari 126                 dispose();
2 26 Feb 07 jari 127             }
2 26 Feb 07 jari 128         });
2 26 Feb 07 jari 129   pane.add(cancelButton); 
2 26 Feb 07 jari 130         
2 26 Feb 07 jari 131         setContentPane(pane);
2 26 Feb 07 jari 132     }
2 26 Feb 07 jari 133     
2 26 Feb 07 jari 134     public void setVisible(boolean visible) {
2 26 Feb 07 jari 135   Dimension screenSize = Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
2 26 Feb 07 jari 136   setLocation((screenSize.width - getSize().width)/2, (screenSize.height - getSize().height)/2);
2 26 Feb 07 jari 137   
2 26 Feb 07 jari 138   super.setVisible(visible);
2 26 Feb 07 jari 139   
2 26 Feb 07 jari 140   if (visible) {
2 26 Feb 07 jari 141       //bPanel.okButton.requestFocus(); //UNCOMMMENT THIS LATER
2 26 Feb 07 jari 142   }
2 26 Feb 07 jari 143     }
2 26 Feb 07 jari 144     
2 26 Feb 07 jari 145     void buildConstraints(GridBagConstraints gbc, int gx, int gy,
2 26 Feb 07 jari 146     int gw, int gh, int wx, int wy) {
2 26 Feb 07 jari 147   
2 26 Feb 07 jari 148   gbc.gridx = gx;
2 26 Feb 07 jari 149   gbc.gridy = gy;
2 26 Feb 07 jari 150   gbc.gridwidth = gw;
2 26 Feb 07 jari 151   gbc.gridheight = gh;
2 26 Feb 07 jari 152   gbc.weightx = wx;
2 26 Feb 07 jari 153   gbc.weighty = wy;
2 26 Feb 07 jari 154     }  
2 26 Feb 07 jari 155     
2 26 Feb 07 jari 156     
2 26 Feb 07 jari 157     public boolean isOkPressed() {
2 26 Feb 07 jari 158   return okPressed;
2 26 Feb 07 jari 159     }  
2 26 Feb 07 jari 160     
2 26 Feb 07 jari 161     public boolean usePrevious() {
2 26 Feb 07 jari 162         return previousButton.isSelected();
2 26 Feb 07 jari 163     }
2 26 Feb 07 jari 164     
2 26 Feb 07 jari 165     public boolean drawTrees() {
2 26 Feb 07 jari 166         return drawTreesBox.isSelected();
2 26 Feb 07 jari 167     }
2 26 Feb 07 jari 168     
2 26 Feb 07 jari 169     public boolean drawSigTreesOnly() {
2 26 Feb 07 jari 170         return sigOnly.isSelected();
2 26 Feb 07 jari 171     }    
2 26 Feb 07 jari 172     
2 26 Feb 07 jari 173     public static void main(String[] args) {
2 26 Feb 07 jari 174         
2 26 Feb 07 jari 175   JFrame dummyFrame = new JFrame();
2 26 Feb 07 jari 176   SAMPreDialog sDialog = new SAMPreDialog(dummyFrame, true);
2 26 Feb 07 jari 177   sDialog.setVisible(true);
2 26 Feb 07 jari 178     }    
2 26 Feb 07 jari 179
2 26 Feb 07 jari 180 }

Generated on Thu Jul 20 09:28:32 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)